More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0184 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4089  alpha amylase catalytic region  62.45 
 
 		 540 aa  643    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1891  alpha amylase, catalytic region  66.73 
 
 		 544 aa  708    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.687574  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0184  alpha amylase, catalytic region  100 
 
 		 547 aa  1106    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.341726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2736  alpha amylase, catalytic region  63.87 
 
 		 543 aa  657    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.70509  normal  0.436177 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3304  alpha amylase, catalytic region  52.9 
 
 		 550 aa  537  1e-151  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.251779  normal  0.854548 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0358  alpha amylase catalytic region  48.24 
 
 		 550 aa  525  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.404275 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1889  alpha amylase, catalytic region  49.81 
 
 		 541 aa  527  1e-148  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0390  alpha amylase catalytic region  50.2 
 
 		 550 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.622906  normal  0.263526 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1662  alpha amylase, catalytic region  49.72 
 
 		 544 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.723863  normal  0.697753 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3300  alpha-glucosidase  49.7 
 
 		 555 aa  512  1e-144  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1649  alpha-glucosidase  50.39 
 
 		 552 aa  510  1e-143  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.856905  hitchhiker  0.000000195123 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2086  alpha amylase catalytic region  48 
 
 		 540 aa  508  1e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2039  alpha amylase catalytic region  48.19 
 
 		 540 aa  509  1e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.535933  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1949  alpha amylase protein  50 
 
 		 553 aa  509  1e-143  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.342567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2299  alpha amylase catalytic region  48 
 
 		 540 aa  509  1e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.495294  normal  0.823743 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0416  alpha amylase catalytic region  52.68 
 
 		 557 aa  509  1e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0295  alpha amylase catalytic region  51.2 
 
 		 551 aa  505  9.999999999999999e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4573  hypothetical protein  47.62 
 
 		 540 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2287  alpha amylase catalytic region  47.62 
 
 		 540 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0984  alpha amylase family protein  46.69 
 
 		 538 aa  502  1e-141  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2213  oligo-1,6-glucosidase  47.8 
 
 		 540 aa  503  1e-141  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2311  alpha amylase, catalytic region  47.51 
 
 		 540 aa  504  1e-141  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.679266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2133  alpha amylase, catalytic region  49.19 
 
 		 540 aa  499  1e-140  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1788  alpha amylase, catalytic region  47.65 
 
 		 544 aa  501  1e-140  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.606639  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2320  alpha amylase catalytic region  49.7 
 
 		 547 aa  500  1e-140  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.80263 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3102  alpha amylase catalytic region  49.01 
 
 		 548 aa  495  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.355967  normal  0.289712 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2833  alpha amylase catalytic region  48.41 
 
 		 548 aa  496  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.518671  normal  0.538121 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0261  alpha amylase  47.58 
 
 		 537 aa  495  1e-139  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2209  alpha amylase, catalytic region  48.99 
 
 		 540 aa  498  1e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3112  alpha amylase protein  50 
 
 		 535 aa  494  9.999999999999999e-139  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.364914  normal  0.605124 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1017  alpha amylase catalytic region  49.06 
 
 		 537 aa  493  9.999999999999999e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.487933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0788  alpha-glucosidase  50 
 
 		 550 aa  493  9.999999999999999e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2088  alpha amylase catalytic region  47.47 
 
 		 541 aa  489  1e-137  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.800572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0601  alpha-glucosidase  45.98 
 
 		 540 aa  487  1e-136  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.642438 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2028  alpha amylase, catalytic region  47.98 
 
 		 557 aa  488  1e-136  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2210  alpha amylase catalytic region  47.86 
 
 		 586 aa  484  1e-135  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.408019  hitchhiker  0.00161183 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0021  alpha amylase catalytic region  46.77 
 
 		 530 aa  480  1e-134  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193993  normal  0.266827 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3128  alpha amylase, catalytic region  52.44 
 
 		 542 aa  476  1e-133  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209805  normal  0.0115348 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3325  alpha amylase catalytic region  48.3 
 
 		 556 aa  475  1e-132  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2620  alpha amylase catalytic region  50.68 
 
 		 560 aa  469  1.0000000000000001e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3326  alpha amylase catalytic region  46.68 
 
 		 547 aa  470  1.0000000000000001e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4341  alpha amylase catalytic region  47.06 
 
 		 539 aa  468  9.999999999999999e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2954  alpha amylase catalytic region  44.46 
 
 		 549 aa  465  1e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0067439 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0029  alpha amylase, catalytic region  45.47 
 
 		 536 aa  455  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1370  alpha amylase domain-containing protein  45.45 
 
 		 536 aa  449  1e-125  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0039  alpha amylase, catalytic region  45.27 
 
 		 536 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1475  alpha amylase catalytic region  43.85 
 
 		 553 aa  415  9.999999999999999e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5528  alpha amylase catalytic region  42.75 
 
 		 545 aa  406  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.283745  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4274  alpha amylase catalytic region  45.56 
 
 		 529 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0835  alpha amylase catalytic region  42.83 
 
 		 549 aa  405  1e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3169  alpha amylase, catalytic region  43.31 
 
 		 530 aa  399  9.999999999999999e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4891  alpha amylase, catalytic region  44.22 
 
 		 538 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1969  alpha amylase catalytic region  43.37 
 
 		 536 aa  390  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.786718  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5268  alpha amylase catalytic region  44.17 
 
 		 540 aa  389  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0107  alpha amylase catalytic region  41.09 
 
 		 543 aa  389  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0636933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3863  alpha amylase catalytic region  45.01 
 
 		 541 aa  386  1e-106  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00249861  normal  0.684332 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1931  alpha amylase, catalytic region  44.87 
 
 		 541 aa  385  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.126366  normal  0.0171494 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3687  alpha amylase, catalytic region  42.89 
 
 		 540 aa  382  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0226  alpha amylase catalytic region  44.69 
 
 		 537 aa  383  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.547651 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0307  alpha amylase catalytic subunit  44.63 
 
 		 525 aa  383  1e-105  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0810  alpha amylase, catalytic region  44.66 
 
 		 540 aa  381  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.553058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3077  alpha amylase catalytic region  44.11 
 
 		 535 aa  381  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5242  alpha amylase catalytic region  44.53 
 
 		 538 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5769  alpha amylase catalytic region  41.6 
 
 		 535 aa  376  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0672  alpha amylase, catalytic region  42.57 
 
 		 533 aa  375  1e-103  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.227468 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0942  oligo-1,6-glucosidase, putative  42.18 
 
 		 539 aa  374  1e-102  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5238  alpha amylase catalytic region  42.19 
 
 		 524 aa  372  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0394755 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1595  alpha amylase catalytic region  45.86 
 
 		 528 aa  375  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0451037 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0917  alpha amylase, catalytic region  44.25 
 
 		 542 aa  371  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0777  alpha amylase catalytic region  43.03 
 
 		 532 aa  368  1e-100  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.876516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0921  alpha amylase  41.1 
 
 		 568 aa  369  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0194055 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0356  alpha amylase, catalytic region  38.39 
 
 		 564 aa  363  3e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171609  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2303  alpha amylase catalytic region  45.35 
 
 		 448 aa  363  4e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.190789 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1988  alpha amylase catalytic region  43.86 
 
 		 546 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3310  alpha amylase, catalytic region  41.41 
 
 		 575 aa  354  2.9999999999999997e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4167  alpha amylase catalytic region  40.49 
 
 		 574 aa  352  1e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.718668  hitchhiker  0.00459901 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7974  alpha amylase catalytic region  40.15 
 
 		 547 aa  347  3e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2381  alpha-D-1,4-glucosidase  38.22 
 
 		 568 aa  343  2.9999999999999997e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3898  alpha amylase catalytic region  40.11 
 
 		 526 aa  341  2e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.237178 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09460  alpha amylase catalytic region  38.21 
 
 		 563 aa  341  2e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0188478  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0354  alpha amylase catalytic region  36.75 
 
 		 554 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2294  Alpha amylase, catalytic region  44.03 
 
 		 542 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.960991  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2302  alpha amylase catalytic region  43.51 
 
 		 518 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4891  glycosyl hydrolase family protein  34.47 
 
 		 554 aa  335  9e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000186881  normal  0.167059 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3323  alpha amylase catalytic region  37.81 
 
 		 570 aa  334  2e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0481  glycosyl hydrolase family protein  34.65 
 
 		 554 aa  333  5e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000250656  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0899  trehalose-6-phosphate hydrolase  35.39 
 
 		 560 aa  333  5e-90  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0427  glycosyl hydrolase family protein  34.29 
 
 		 554 aa  333  6e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000114694  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0470  glycosyl hydrolase family protein  34.35 
 
 		 554 aa  332  1e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3009  alpha amylase catalytic region  38.75 
 
 		 555 aa  330  3e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0343  alpha-glucosidase  34.53 
 
 		 554 aa  330  3e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000029424  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1154  alpha amylase catalytic region  39.66 
 
 		 577 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.144841  decreased coverage  0.0000326761 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4926  alpha amylase catalytic region  39.47 
 
 		 578 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0357  glycosyl hydrolase family protein  34.35 
 
 		 554 aa  327  3e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000071861  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0347  alpha-glucosidase  34.35 
 
 		 554 aa  327  3e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000225343  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0371  glycosyl hydrolase family protein  34.35 
 
 		 554 aa  327  3e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000236448  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0413  glycosyl hydrolase family protein  34.35 
 
 		 554 aa  327  3e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000830485 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3104  trehalose-6-phosphate hydrolase  44 
 
 		 515 aa  326  7e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0986221  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0352  alpha amylase catalytic region  34.11 
 
 		 554 aa  325  1e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00857994  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0526  alpha amylase catalytic region  34.36 
 
 		 562 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>