More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2030 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1390  alpha amylase catalytic region  71.46 
 
 		 533 aa  774    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.794681  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2030  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 587 aa  1181    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3611  alpha amylase, catalytic region  65.03 
 
 		 539 aa  649    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.275383  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3684  alpha amylase, catalytic region  65.03 
 
 		 539 aa  649    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.942466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1134  alpha amylase catalytic region  67.3 
 
 		 531 aa  720    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.746257  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12496  alpha-glucosidase aglA (maltase)  64.76 
 
 		 546 aa  665    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.447411  normal  0.123805 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3616  alpha amylase, catalytic region  65.03 
 
 		 539 aa  650    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.381116 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1532  alpha amylase catalytic region  60.15 
 
 		 532 aa  612  9.999999999999999e-175  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0833  alpha-glucosidase  57.36 
 
 		 544 aa  552  1e-156  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11590  glycosidase  56.55 
 
 		 522 aa  553  1e-156  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2176  alpha amylase catalytic region  52.81 
 
 		 567 aa  531  1e-149  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.374326  normal  0.160369 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3342  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  52.84 
 
 		 538 aa  527  1e-148  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.292623  normal  0.0532512 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0695  alpha amylase catalytic region  51.98 
 
 		 533 aa  523  1e-147  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.497083 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5893  alpha amylase catalytic region  53.54 
 
 		 507 aa  523  1e-147  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.186774 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1739  alpha amylase catalytic region  53.41 
 
 		 550 aa  513  1e-144  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000285446  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1883  alpha amylase catalytic region  53.35 
 
 		 538 aa  507  9.999999999999999e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.681572 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3700  alpha amylase catalytic region  50 
 
 		 560 aa  500  1e-140  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.715458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2981  alpha amylase catalytic region  52.35 
 
 		 540 aa  501  1e-140  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000947876  normal  0.0148383 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3708  alpha amylase catalytic region  51.95 
 
 		 549 aa  495  1e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0503251  hitchhiker  0.00685051 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3302  alpha amylase catalytic region  49.07 
 
 		 566 aa  497  1e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.15105  normal  0.0149256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8467  alpha amylase catalytic region  50.18 
 
 		 544 aa  492  9.999999999999999e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0947398 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2164  alpha amylase catalytic region  48.93 
 
 		 571 aa  487  1e-136  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.126804  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3695  alpha amylase catalytic region  49.62 
 
 		 524 aa  483  1e-135  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.660519  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2111  alpha amylase catalytic region  50.84 
 
 		 555 aa  485  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13840  glycosidase  47.03 
 
 		 605 aa  483  1e-135  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7356  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  52.37 
 
 		 511 aa  482  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2546  alpha amylase, catalytic region  50.81 
 
 		 561 aa  485  1e-135  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6925  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  50 
 
 		 545 aa  475  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179369  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3357  alpha amylase catalytic region  48.53 
 
 		 539 aa  473  1e-132  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.925027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0801  alpha amylase, catalytic region  50.19 
 
 		 543 aa  473  1e-132  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.235668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1529  alpha amylase catalytic region  48.11 
 
 		 593 aa  469  1.0000000000000001e-131  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.331611  normal  0.956497 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02470  Alpha-glucosidase  48.04 
 
 		 576 aa  469  1.0000000000000001e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.914818  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0775  alpha amylase, catalytic region  48.26 
 
 		 534 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0745  alpha amylase catalytic region  49.07 
 
 		 543 aa  464  1e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.215044  hitchhiker  0.000627206 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5859  alpha amylase catalytic region  48.11 
 
 		 558 aa  462  1e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.63248 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5406  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  49.91 
 
 		 512 aa  456  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12260  glycosidase  47.34 
 
 		 563 aa  457  1e-127  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.203639  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3849  alpha amylase, catalytic region  48.07 
 
 		 554 aa  457  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0257835 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1785  alpha amylase catalytic region  48.72 
 
 		 599 aa  454  1.0000000000000001e-126  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.326803 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0062  alpha amylase catalytic region  46.81 
 
 		 553 aa  452  1e-125  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.3547  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0622  alpha amylase catalytic region  45.7 
 
 		 609 aa  449  1e-125  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.653551 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1150  alpha amylase, catalytic region  47.95 
 
 		 634 aa  451  1e-125  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27360  glycosidase  49.35 
 
 		 554 aa  449  1e-125  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.155559  normal  0.548604 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3603  alpha amylase catalytic region  46.43 
 
 		 572 aa  450  1e-125  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2798  alpha amylase catalytic region  49.81 
 
 		 548 aa  450  1e-125  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08990  glycosidase  46.97 
 
 		 570 aa  446  1.0000000000000001e-124  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.134217  normal  0.0194138 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5316  alpha amylase catalytic region  48.2 
 
 		 594 aa  446  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0561676  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3038  alpha amylase, catalytic region  46.31 
 
 		 568 aa  447  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51470  Alpha-glucosidase  48.62 
 
 		 565 aa  447  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2746  alpha amylase catalytic region  46.67 
 
 		 570 aa  444  1e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00507625 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3538  alpha amylase catalytic region  47.69 
 
 		 546 aa  439  9.999999999999999e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.489113  normal  0.592754 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01920  glycosidase  44.73 
 
 		 607 aa  440  9.999999999999999e-123  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0743  alpha amylase, catalytic region  46.95 
 
 		 573 aa  440  9.999999999999999e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.802881  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3300  alpha amylase catalytic region  45.39 
 
 		 560 aa  432  1e-120  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.522775  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1495  glycosidase  44.5 
 
 		 556 aa  431  1e-119  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6968  alpha amylase catalytic region  45.97 
 
 		 561 aa  425  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.144872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0412  alpha amylase, catalytic region  45.2 
 
 		 640 aa  425  1e-117  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2158  alpha amylase catalytic region  47.04 
 
 		 542 aa  424  1e-117  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22590  glycosidase  46.86 
 
 		 555 aa  419  1e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.144788  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1017  alpha amylase catalytic region  45.16 
 
 		 544 aa  419  1e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.503917 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24650  glycosidase  46.87 
 
 		 567 aa  416  9.999999999999999e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4692  alpha amylase catalytic region  47.01 
 
 		 580 aa  407  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.375992  normal  0.284886 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1794  alpha amylase catalytic region  45.92 
 
 		 543 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.209676  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00610  alpha-glucosidase, putative  42.2 
 
 		 563 aa  402  9.999999999999999e-111  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.260556  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1323  alpha-amylase  40.96 
 
 		 604 aa  398  1e-109  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2119  alpha amylase catalytic region  45.9 
 
 		 560 aa  398  1e-109  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4117  alpha amylase catalytic region  45.16 
 
 		 548 aa  371  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.357071  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3687  alpha amylase, catalytic region  42.59 
 
 		 540 aa  351  3e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0777  alpha amylase catalytic region  41.97 
 
 		 532 aa  345  2e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.876516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0307  alpha amylase catalytic subunit  41.92 
 
 		 525 aa  345  2e-93  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3104  trehalose-6-phosphate hydrolase  44.31 
 
 		 515 aa  343  4e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0986221  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1475  alpha amylase catalytic region  41.86 
 
 		 553 aa  342  1e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5769  alpha amylase catalytic region  40.08 
 
 		 535 aa  342  1e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2302  alpha amylase catalytic region  44.2 
 
 		 518 aa  341  2.9999999999999998e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1017  alpha amylase catalytic region  40.33 
 
 		 537 aa  340  5.9999999999999996e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.487933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4274  alpha amylase catalytic region  40.19 
 
 		 529 aa  333  4e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2088  alpha amylase catalytic region  38.09 
 
 		 541 aa  333  6e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.800572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0261  alpha amylase  40.8 
 
 		 537 aa  331  2e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2213  oligo-1,6-glucosidase  39.92 
 
 		 540 aa  331  3e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3863  alpha amylase catalytic region  44.3 
 
 		 541 aa  329  9e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00249861  normal  0.684332 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1969  alpha amylase catalytic region  41.7 
 
 		 536 aa  328  1.0000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.786718  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3307  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  42.57 
 
 		 735 aa  327  4.0000000000000003e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.081208  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5528  alpha amylase catalytic region  39.66 
 
 		 545 aa  327  5e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.283745  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0107  alpha amylase catalytic region  39.11 
 
 		 543 aa  325  1e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0636933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4891  alpha amylase, catalytic region  40.08 
 
 		 538 aa  325  2e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3077  alpha amylase catalytic region  43.95 
 
 		 535 aa  323  4e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2209  alpha amylase, catalytic region  40.4 
 
 		 540 aa  323  5e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1931  alpha amylase, catalytic region  43.14 
 
 		 541 aa  323  6e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.126366  normal  0.0171494 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0835  alpha amylase catalytic region  40.94 
 
 		 549 aa  323  6e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1662  alpha amylase, catalytic region  37.8 
 
 		 544 aa  323  6e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.723863  normal  0.697753 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3300  alpha-glucosidase  38.51 
 
 		 555 aa  323  7e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2311  alpha amylase, catalytic region  39.41 
 
 		 540 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.679266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0921  alpha amylase  37.4 
 
 		 568 aa  321  1.9999999999999998e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0194055 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2833  alpha amylase catalytic region  38.07 
 
 		 548 aa  320  3e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.518671  normal  0.538121 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2294  Alpha amylase, catalytic region  41.15 
 
 		 542 aa  320  5e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.960991  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0672  alpha amylase, catalytic region  40.07 
 
 		 533 aa  320  6e-86  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.227468 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0601  alpha-glucosidase  38.73 
 
 		 540 aa  319  7e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.642438 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2736  alpha amylase, catalytic region  39.96 
 
 		 543 aa  319  7e-86  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.70509  normal  0.436177 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2133  alpha amylase, catalytic region  40 
 
 		 540 aa  319  7.999999999999999e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2303  alpha amylase catalytic region  44.98 
 
 		 448 aa  319  1e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.190789 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>