More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_2287 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0984  alpha amylase family protein  65.99 
 
 		 538 aa  758    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2299  alpha amylase catalytic region  99.26 
 
 		 540 aa  1117    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.495294  normal  0.823743 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2213  oligo-1,6-glucosidase  85.71 
 
 		 540 aa  980    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0601  alpha-glucosidase  62.94 
 
 		 540 aa  718    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.642438 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2028  alpha amylase, catalytic region  71.61 
 
 		 557 aa  833    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2039  alpha amylase catalytic region  98.89 
 
 		 540 aa  1114    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.535933  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2086  alpha amylase catalytic region  98.52 
 
 		 540 aa  1110    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2133  alpha amylase, catalytic region  88.15 
 
 		 540 aa  1003    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2209  alpha amylase, catalytic region  88.15 
 
 		 540 aa  1004    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1788  alpha amylase, catalytic region  76.98 
 
 		 544 aa  884    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.606639  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2210  alpha amylase catalytic region  72.98 
 
 		 586 aa  854    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.408019  hitchhiker  0.00161183 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2311  alpha amylase, catalytic region  88.15 
 
 		 540 aa  1003    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.679266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1662  alpha amylase, catalytic region  71.92 
 
 		 544 aa  813    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.723863  normal  0.697753 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1017  alpha amylase catalytic region  63.31 
 
 		 537 aa  726    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.487933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4573  hypothetical protein  100 
 
 		 540 aa  1122    Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2287  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 540 aa  1122    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1889  alpha amylase, catalytic region  75.88 
 
 		 541 aa  871    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2088  alpha amylase catalytic region  58.55 
 
 		 541 aa  629  1e-179  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.800572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2620  alpha amylase catalytic region  54.17 
 
 		 560 aa  621  1e-177  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0261  alpha amylase  55.51 
 
 		 537 aa  624  1e-177  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3128  alpha amylase, catalytic region  61.12 
 
 		 542 aa  620  1e-176  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209805  normal  0.0115348 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3300  alpha-glucosidase  54.88 
 
 		 555 aa  603  1.0000000000000001e-171  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3325  alpha amylase catalytic region  50.55 
 
 		 556 aa  603  1.0000000000000001e-171  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4341  alpha amylase catalytic region  51.11 
 
 		 539 aa  600  1e-170  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3102  alpha amylase catalytic region  53.26 
 
 		 548 aa  592  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.355967  normal  0.289712 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3326  alpha amylase catalytic region  50.83 
 
 		 547 aa  594  1e-168  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2833  alpha amylase catalytic region  53.26 
 
 		 548 aa  589  1e-167  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.518671  normal  0.538121 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0358  alpha amylase catalytic region  52.51 
 
 		 550 aa  589  1e-167  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.404275 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0416  alpha amylase catalytic region  53.97 
 
 		 557 aa  587  1e-166  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3304  alpha amylase, catalytic region  53.51 
 
 		 550 aa  587  1e-166  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.251779  normal  0.854548 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0390  alpha amylase catalytic region  51.96 
 
 		 550 aa  585  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.622906  normal  0.263526 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2320  alpha amylase catalytic region  52.31 
 
 		 547 aa  583  1.0000000000000001e-165  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.80263 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0295  alpha amylase catalytic region  53.26 
 
 		 551 aa  580  1e-164  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0788  alpha-glucosidase  51.57 
 
 		 550 aa  573  1.0000000000000001e-162  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1649  alpha-glucosidase  53.28 
 
 		 552 aa  563  1.0000000000000001e-159  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.856905  hitchhiker  0.000000195123 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1949  alpha amylase protein  53.31 
 
 		 553 aa  561  1e-158  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.342567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0021  alpha amylase catalytic region  51.5 
 
 		 530 aa  541  1e-153  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193993  normal  0.266827 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1370  alpha amylase domain-containing protein  50.75 
 
 		 536 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0039  alpha amylase, catalytic region  50.75 
 
 		 536 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4089  alpha amylase catalytic region  53.16 
 
 		 540 aa  535  1e-151  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0029  alpha amylase, catalytic region  49.81 
 
 		 536 aa  536  1e-151  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3112  alpha amylase protein  51.9 
 
 		 535 aa  513  1e-144  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.364914  normal  0.605124 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0184  alpha amylase, catalytic region  47.62 
 
 		 547 aa  503  1e-141  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.341726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1891  alpha amylase, catalytic region  47.61 
 
 		 544 aa  496  1e-139  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.687574  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2736  alpha amylase, catalytic region  49.49 
 
 		 543 aa  497  1e-139  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.70509  normal  0.436177 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2954  alpha amylase catalytic region  46.51 
 
 		 549 aa  480  1e-134  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0067439 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0835  alpha amylase catalytic region  42.63 
 
 		 549 aa  430  1e-119  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4891  alpha amylase, catalytic region  43.92 
 
 		 538 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1475  alpha amylase catalytic region  41.67 
 
 		 553 aa  429  1e-119  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0107  alpha amylase catalytic region  43.18 
 
 		 543 aa  427  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0636933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5242  alpha amylase catalytic region  43.99 
 
 		 538 aa  425  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3687  alpha amylase, catalytic region  42.74 
 
 		 540 aa  415  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1931  alpha amylase, catalytic region  43.1 
 
 		 541 aa  412  1e-113  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.126366  normal  0.0171494 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0356  alpha amylase, catalytic region  40.11 
 
 		 564 aa  409  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171609  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3863  alpha amylase catalytic region  42.86 
 
 		 541 aa  407  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00249861  normal  0.684332 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5528  alpha amylase catalytic region  41.1 
 
 		 545 aa  405  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.283745  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0810  alpha amylase, catalytic region  43.75 
 
 		 540 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.553058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0917  alpha amylase, catalytic region  43.77 
 
 		 542 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0921  alpha amylase  39.07 
 
 		 568 aa  406  1.0000000000000001e-112  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0194055 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0672  alpha amylase, catalytic region  42.71 
 
 		 533 aa  407  1.0000000000000001e-112  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.227468 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5769  alpha amylase catalytic region  41.46 
 
 		 535 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4274  alpha amylase catalytic region  42.51 
 
 		 529 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0307  alpha amylase catalytic subunit  43.86 
 
 		 525 aa  404  1e-111  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1969  alpha amylase catalytic region  39.47 
 
 		 536 aa  399  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.786718  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3169  alpha amylase, catalytic region  42.63 
 
 		 530 aa  390  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0777  alpha amylase catalytic region  42.24 
 
 		 532 aa  389  1e-106  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.876516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5238  alpha amylase catalytic region  41.85 
 
 		 524 aa  388  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0394755 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0942  oligo-1,6-glucosidase, putative  39.31 
 
 		 539 aa  380  1e-104  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2303  alpha amylase catalytic region  44.15 
 
 		 448 aa  379  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.190789 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3310  alpha amylase, catalytic region  38.18 
 
 		 575 aa  380  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4167  alpha amylase catalytic region  38.81 
 
 		 574 aa  377  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.718668  hitchhiker  0.00459901 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2294  Alpha amylase, catalytic region  41.7 
 
 		 542 aa  377  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.960991  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3077  alpha amylase catalytic region  40.15 
 
 		 535 aa  374  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5268  alpha amylase catalytic region  41.08 
 
 		 540 aa  375  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09460  alpha amylase catalytic region  38.64 
 
 		 563 aa  366  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0188478  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1595  alpha amylase catalytic region  41.65 
 
 		 528 aa  362  1e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0451037 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1988  alpha amylase catalytic region  43.21 
 
 		 546 aa  361  2e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7974  alpha amylase catalytic region  37.4 
 
 		 547 aa  360  3e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0526  alpha amylase catalytic region  37.57 
 
 		 562 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0226  alpha amylase catalytic region  40.08 
 
 		 537 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.547651 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3898  alpha amylase catalytic region  41.12 
 
 		 526 aa  354  2.9999999999999997e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.237178 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1251  Alpha amylase, catalytic region  37.28 
 
 		 561 aa  352  1e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3104  trehalose-6-phosphate hydrolase  41.13 
 
 		 515 aa  351  2e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0986221  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1406  alpha amylase catalytic region  38.08 
 
 		 555 aa  345  1e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0354  alpha amylase catalytic region  38.93 
 
 		 554 aa  344  2e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2302  alpha amylase catalytic region  38 
 
 		 518 aa  342  8e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0481  glycosyl hydrolase family protein  36.92 
 
 		 554 aa  342  1e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000250656  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3009  alpha amylase catalytic region  36.56 
 
 		 555 aa  342  1e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4891  glycosyl hydrolase family protein  36.92 
 
 		 554 aa  342  1e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000186881  normal  0.167059 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0427  glycosyl hydrolase family protein  37.12 
 
 		 554 aa  342  1e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000114694  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0165  alpha amylase catalytic region  36.42 
 
 		 557 aa  340  2.9999999999999998e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000167663  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1621  alpha,alpha-phosphotrehalase  36.04 
 
 		 563 aa  340  5e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.459004  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0601  alpha amylase catalytic region  38.29 
 
 		 554 aa  339  8e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199149  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0343  alpha-glucosidase  36.73 
 
 		 554 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000029424  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1497  glycosidase  35.7 
 
 		 606 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.990687  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0470  glycosyl hydrolase family protein  36.9 
 
 		 554 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0352  alpha amylase catalytic region  36.76 
 
 		 554 aa  337  3.9999999999999995e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00857994  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2716  alpha amylase catalytic region  34.39 
 
 		 559 aa  337  3.9999999999999995e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0292835  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2048  alpha amylase catalytic region  38.93 
 
 		 572 aa  335  1e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.105277  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0357  glycosyl hydrolase family protein  37.26 
 
 		 554 aa  335  2e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000071861  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>