More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3302 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_2164  alpha amylase catalytic region  63.69 
 
 		 571 aa  678    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.126804  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1529  alpha amylase catalytic region  59.79 
 
 		 593 aa  669    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.331611  normal  0.956497 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08990  glycosidase  62.03 
 
 		 570 aa  670    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.134217  normal  0.0194138 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13840  glycosidase  61.76 
 
 		 605 aa  721    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3302  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 566 aa  1148    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.15105  normal  0.0149256 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2176  alpha amylase catalytic region  67.37 
 
 		 567 aa  740    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.374326  normal  0.160369 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12260  glycosidase  58.96 
 
 		 563 aa  634  1e-180  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.203639  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1785  alpha amylase catalytic region  62.5 
 
 		 599 aa  626  1e-178  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.326803 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02470  Alpha-glucosidase  60.55 
 
 		 576 aa  624  1e-177  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.914818  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51470  Alpha-glucosidase  61.76 
 
 		 565 aa  624  1e-177  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0622  alpha amylase catalytic region  56.09 
 
 		 609 aa  617  1e-175  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.653551 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0833  alpha-glucosidase  62.06 
 
 		 544 aa  610  1e-173  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0695  alpha amylase catalytic region  57.97 
 
 		 533 aa  598  1e-169  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.497083 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3538  alpha amylase catalytic region  59.48 
 
 		 546 aa  597  1e-169  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.489113  normal  0.592754 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01920  glycosidase  54.79 
 
 		 607 aa  593  1e-168  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0412  alpha amylase, catalytic region  56.05 
 
 		 640 aa  594  1e-168  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0743  alpha amylase, catalytic region  56.45 
 
 		 573 aa  589  1e-167  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.802881  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5893  alpha amylase catalytic region  56.24 
 
 		 507 aa  569  1e-161  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.186774 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2981  alpha amylase catalytic region  55.05 
 
 		 540 aa  561  1e-158  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000947876  normal  0.0148383 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3038  alpha amylase, catalytic region  52.53 
 
 		 568 aa  560  1e-158  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0775  alpha amylase, catalytic region  55.3 
 
 		 534 aa  560  1e-158  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1739  alpha amylase catalytic region  57.35 
 
 		 550 aa  552  1e-156  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000285446  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2111  alpha amylase catalytic region  56.12 
 
 		 555 aa  548  1e-155  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3700  alpha amylase catalytic region  51.88 
 
 		 560 aa  550  1e-155  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.715458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11590  glycosidase  55.01 
 
 		 522 aa  547  1e-154  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0745  alpha amylase catalytic region  55.43 
 
 		 543 aa  546  1e-154  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.215044  hitchhiker  0.000627206 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8467  alpha amylase catalytic region  53.68 
 
 		 544 aa  548  1e-154  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0947398 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3342  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  54.23 
 
 		 538 aa  546  1e-154  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.292623  normal  0.0532512 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3300  alpha amylase catalytic region  55.58 
 
 		 560 aa  541  9.999999999999999e-153  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.522775  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2546  alpha amylase, catalytic region  53.47 
 
 		 561 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3849  alpha amylase, catalytic region  53.06 
 
 		 554 aa  541  9.999999999999999e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0257835 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0801  alpha amylase, catalytic region  54.68 
 
 		 543 aa  541  9.999999999999999e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.235668  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3357  alpha amylase catalytic region  52.81 
 
 		 539 aa  530  1e-149  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.925027  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1883  alpha amylase catalytic region  55.96 
 
 		 538 aa  529  1e-149  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.681572 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2746  alpha amylase catalytic region  52.6 
 
 		 570 aa  531  1e-149  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00507625 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1134  alpha amylase catalytic region  53.22 
 
 		 531 aa  530  1e-149  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.746257  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6925  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  53.49 
 
 		 545 aa  529  1e-149  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7356  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  55.37 
 
 		 511 aa  524  1e-147  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3603  alpha amylase catalytic region  51.56 
 
 		 572 aa  513  1e-144  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3695  alpha amylase catalytic region  51 
 
 		 524 aa  512  1e-144  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.660519  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1390  alpha amylase catalytic region  49.64 
 
 		 533 aa  509  1e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.794681  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0062  alpha amylase catalytic region  50.18 
 
 		 553 aa  509  1e-143  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.3547  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24650  glycosidase  51.73 
 
 		 567 aa  505  9.999999999999999e-143  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3708  alpha amylase catalytic region  51.39 
 
 		 549 aa  504  1e-141  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0503251  hitchhiker  0.00685051 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00610  alpha-glucosidase, putative  47.85 
 
 		 563 aa  500  1e-140  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.260556  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5859  alpha amylase catalytic region  48.21 
 
 		 558 aa  499  1e-140  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.63248 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2119  alpha amylase catalytic region  53.83 
 
 		 560 aa  495  1e-139  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2030  alpha amylase catalytic region  49.07 
 
 		 587 aa  498  1e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27360  glycosidase  52.02 
 
 		 554 aa  492  9.999999999999999e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.155559  normal  0.548604 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22590  glycosidase  57.3 
 
 		 555 aa  493  9.999999999999999e-139  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.144788  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2798  alpha amylase catalytic region  52.84 
 
 		 548 aa  493  9.999999999999999e-139  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12496  alpha-glucosidase aglA (maltase)  49.63 
 
 		 546 aa  491  1e-137  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.447411  normal  0.123805 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2158  alpha amylase catalytic region  50.65 
 
 		 542 aa  488  1e-136  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5406  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  51.29 
 
 		 512 aa  482  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1532  alpha amylase catalytic region  51.66 
 
 		 532 aa  476  1e-133  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1150  alpha amylase, catalytic region  51.39 
 
 		 634 aa  472  1e-132  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1495  glycosidase  46.75 
 
 		 556 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3611  alpha amylase, catalytic region  48.56 
 
 		 539 aa  462  1e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.275383  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3684  alpha amylase, catalytic region  48.56 
 
 		 539 aa  462  1e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.942466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3616  alpha amylase, catalytic region  48.38 
 
 		 539 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.381116 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1323  alpha-amylase  44.94 
 
 		 604 aa  455  1e-127  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6968  alpha amylase catalytic region  47.15 
 
 		 561 aa  458  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.144872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1017  alpha amylase catalytic region  45.5 
 
 		 544 aa  451  1e-125  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.503917 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5316  alpha amylase catalytic region  48.3 
 
 		 594 aa  450  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0561676  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4117  alpha amylase catalytic region  51.37 
 
 		 548 aa  442  1e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.357071  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4692  alpha amylase catalytic region  47.67 
 
 		 580 aa  440  9.999999999999999e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.375992  normal  0.284886 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1794  alpha amylase catalytic region  46.91 
 
 		 543 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.209676  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3687  alpha amylase, catalytic region  42.13 
 
 		 540 aa  348  2e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3102  alpha amylase catalytic region  41.25 
 
 		 548 aa  347  3e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.355967  normal  0.289712 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2833  alpha amylase catalytic region  40.04 
 
 		 548 aa  343  5.999999999999999e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.518671  normal  0.538121 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3300  alpha-glucosidase  41.6 
 
 		 555 aa  342  9e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1475  alpha amylase catalytic region  42.63 
 
 		 553 aa  340  4e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2320  alpha amylase catalytic region  41.81 
 
 		 547 aa  336  7.999999999999999e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.80263 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0307  alpha amylase catalytic subunit  40.22 
 
 		 525 aa  334  3e-90  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0777  alpha amylase catalytic region  40.44 
 
 		 532 aa  331  2e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.876516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4274  alpha amylase catalytic region  41.86 
 
 		 529 aa  326  6e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3104  trehalose-6-phosphate hydrolase  43.78 
 
 		 515 aa  324  3e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0986221  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2736  alpha amylase, catalytic region  40.86 
 
 		 543 aa  320  5e-86  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.70509  normal  0.436177 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3325  alpha amylase catalytic region  40.3 
 
 		 556 aa  318  2e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0672  alpha amylase, catalytic region  41.43 
 
 		 533 aa  318  2e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.227468 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1649  alpha-glucosidase  38.66 
 
 		 552 aa  317  3e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.856905  hitchhiker  0.000000195123 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1017  alpha amylase catalytic region  41.28 
 
 		 537 aa  317  3e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.487933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2294  Alpha amylase, catalytic region  41.81 
 
 		 542 aa  317  4e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.960991  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5528  alpha amylase catalytic region  39.02 
 
 		 545 aa  317  5e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.283745  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4089  alpha amylase catalytic region  39.47 
 
 		 540 aa  316  6e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2088  alpha amylase catalytic region  36.86 
 
 		 541 aa  315  9e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.800572  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0942  oligo-1,6-glucosidase, putative  39.59 
 
 		 539 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5268  alpha amylase catalytic region  41.93 
 
 		 540 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4891  alpha amylase, catalytic region  39.36 
 
 		 538 aa  312  1e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3304  alpha amylase, catalytic region  40.37 
 
 		 550 aa  312  1e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.251779  normal  0.854548 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0416  alpha amylase catalytic region  41.89 
 
 		 557 aa  311  2e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0358  alpha amylase catalytic region  38.6 
 
 		 550 aa  311  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.404275 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0390  alpha amylase catalytic region  38.24 
 
 		 550 aa  310  5e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.622906  normal  0.263526 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2302  alpha amylase catalytic region  39.89 
 
 		 518 aa  306  6e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3077  alpha amylase catalytic region  43.05 
 
 		 535 aa  306  6e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2299  alpha amylase catalytic region  37.57 
 
 		 540 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.495294  normal  0.823743 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2039  alpha amylase catalytic region  37.55 
 
 		 540 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.535933  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0788  alpha-glucosidase  40 
 
 		 550 aa  304  2.0000000000000002e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0021  alpha amylase catalytic region  37.45 
 
 		 530 aa  304  2.0000000000000002e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193993  normal  0.266827 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2287  alpha amylase catalytic region  37.57 
 
 		 540 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>