More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7356 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7356  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  100 
 
 		 511 aa  1032    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0775  alpha amylase, catalytic region  58.98 
 
 		 534 aa  593  1e-168  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11590  glycosidase  59.81 
 
 		 522 aa  585  1e-166  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0695  alpha amylase catalytic region  57.94 
 
 		 533 aa  577  1.0000000000000001e-163  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.497083 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5893  alpha amylase catalytic region  57.83 
 
 		 507 aa  568  1e-161  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.186774 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3342  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  58.78 
 
 		 538 aa  567  1e-160  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.292623  normal  0.0532512 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6925  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  59.42 
 
 		 545 aa  562  1.0000000000000001e-159  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0833  alpha-glucosidase  60.94 
 
 		 544 aa  560  1e-158  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0801  alpha amylase, catalytic region  57.22 
 
 		 543 aa  556  1e-157  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.235668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1134  alpha amylase catalytic region  58.1 
 
 		 531 aa  553  1e-156  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.746257  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1739  alpha amylase catalytic region  59.92 
 
 		 550 aa  551  1e-156  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000285446  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1883  alpha amylase catalytic region  59.13 
 
 		 538 aa  548  1e-155  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.681572 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3302  alpha amylase catalytic region  55.37 
 
 		 566 aa  546  1e-154  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.15105  normal  0.0149256 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2176  alpha amylase catalytic region  54.79 
 
 		 567 aa  543  1e-153  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.374326  normal  0.160369 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2981  alpha amylase catalytic region  56.9 
 
 		 540 aa  542  1e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000947876  normal  0.0148383 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0745  alpha amylase catalytic region  57.12 
 
 		 543 aa  543  1e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.215044  hitchhiker  0.000627206 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3700  alpha amylase catalytic region  52.87 
 
 		 560 aa  532  1e-150  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.715458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5859  alpha amylase catalytic region  53.62 
 
 		 558 aa  531  1e-150  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.63248 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3695  alpha amylase catalytic region  52.67 
 
 		 524 aa  522  1e-147  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.660519  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3708  alpha amylase catalytic region  54.02 
 
 		 549 aa  522  1e-147  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0503251  hitchhiker  0.00685051 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8467  alpha amylase catalytic region  53.87 
 
 		 544 aa  520  1e-146  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0947398 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2111  alpha amylase catalytic region  57.04 
 
 		 555 aa  517  1.0000000000000001e-145  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51470  Alpha-glucosidase  54.05 
 
 		 565 aa  514  1e-144  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1529  alpha amylase catalytic region  49.56 
 
 		 593 aa  513  1e-144  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.331611  normal  0.956497 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2164  alpha amylase catalytic region  53.3 
 
 		 571 aa  506  9.999999999999999e-143  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.126804  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12260  glycosidase  52.55 
 
 		 563 aa  503  1e-141  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.203639  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5406  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  52.44 
 
 		 512 aa  502  1e-141  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08990  glycosidase  53.89 
 
 		 570 aa  503  1e-141  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.134217  normal  0.0194138 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2030  alpha amylase catalytic region  52.37 
 
 		 587 aa  501  1e-140  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2546  alpha amylase, catalytic region  52.37 
 
 		 561 aa  499  1e-140  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3849  alpha amylase, catalytic region  52.55 
 
 		 554 aa  495  1e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0257835 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3538  alpha amylase catalytic region  53.72 
 
 		 546 aa  495  1e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.489113  normal  0.592754 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13840  glycosidase  49.21 
 
 		 605 aa  496  1e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0062  alpha amylase catalytic region  51.85 
 
 		 553 aa  492  9.999999999999999e-139  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.3547  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3357  alpha amylase catalytic region  52.58 
 
 		 539 aa  492  9.999999999999999e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.925027  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02470  Alpha-glucosidase  50.56 
 
 		 576 aa  494  9.999999999999999e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.914818  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27360  glycosidase  53.9 
 
 		 554 aa  485  1e-136  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.155559  normal  0.548604 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1150  alpha amylase, catalytic region  53.73 
 
 		 634 aa  488  1e-136  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0622  alpha amylase catalytic region  50.18 
 
 		 609 aa  487  1e-136  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.653551 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1390  alpha amylase catalytic region  52.08 
 
 		 533 aa  488  1e-136  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.794681  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1532  alpha amylase catalytic region  55.36 
 
 		 532 aa  481  1e-135  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5316  alpha amylase catalytic region  53.83 
 
 		 594 aa  484  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0561676  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3038  alpha amylase, catalytic region  50.09 
 
 		 568 aa  483  1e-135  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12496  alpha-glucosidase aglA (maltase)  52.83 
 
 		 546 aa  479  1e-134  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.447411  normal  0.123805 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2798  alpha amylase catalytic region  52.81 
 
 		 548 aa  476  1e-133  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2158  alpha amylase catalytic region  51.84 
 
 		 542 aa  472  1e-132  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6968  alpha amylase catalytic region  49.02 
 
 		 561 aa  471  1.0000000000000001e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.144872  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1785  alpha amylase catalytic region  51.15 
 
 		 599 aa  467  9.999999999999999e-131  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.326803 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3300  alpha amylase catalytic region  50.37 
 
 		 560 aa  465  1e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.522775  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24650  glycosidase  50.45 
 
 		 567 aa  463  1e-129  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3611  alpha amylase, catalytic region  52.61 
 
 		 539 aa  462  1e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.275383  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3684  alpha amylase, catalytic region  52.61 
 
 		 539 aa  462  1e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.942466  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01920  glycosidase  50.37 
 
 		 607 aa  462  1e-129  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3603  alpha amylase catalytic region  50.27 
 
 		 572 aa  461  9.999999999999999e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22590  glycosidase  50.66 
 
 		 555 aa  460  9.999999999999999e-129  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.144788  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0743  alpha amylase, catalytic region  49.45 
 
 		 573 aa  461  9.999999999999999e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.802881  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3616  alpha amylase, catalytic region  52.61 
 
 		 539 aa  461  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.381116 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0412  alpha amylase, catalytic region  46.64 
 
 		 640 aa  456  1e-127  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00610  alpha-glucosidase, putative  46.59 
 
 		 563 aa  449  1e-125  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.260556  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4692  alpha amylase catalytic region  49.82 
 
 		 580 aa  448  1.0000000000000001e-124  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.375992  normal  0.284886 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1794  alpha amylase catalytic region  50.96 
 
 		 543 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.209676  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2746  alpha amylase catalytic region  48.47 
 
 		 570 aa  443  1e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00507625 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4117  alpha amylase catalytic region  52.23 
 
 		 548 aa  440  9.999999999999999e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.357071  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1017  alpha amylase catalytic region  48.08 
 
 		 544 aa  431  1e-119  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.503917 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2119  alpha amylase catalytic region  51.67 
 
 		 560 aa  431  1e-119  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1495  glycosidase  50.61 
 
 		 556 aa  427  1e-118  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1323  alpha-amylase  43.05 
 
 		 604 aa  421  1e-116  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0777  alpha amylase catalytic region  42.07 
 
 		 532 aa  362  1e-98  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.876516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3687  alpha amylase, catalytic region  45.65 
 
 		 540 aa  355  1e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0307  alpha amylase catalytic subunit  41.99 
 
 		 525 aa  351  2e-95  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1969  alpha amylase catalytic region  41.35 
 
 		 536 aa  350  4e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.786718  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3104  trehalose-6-phosphate hydrolase  47.56 
 
 		 515 aa  347  4e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0986221  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1017  alpha amylase catalytic region  43.76 
 
 		 537 aa  346  5e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.487933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4891  alpha amylase, catalytic region  42.74 
 
 		 538 aa  345  1e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1662  alpha amylase, catalytic region  39.19 
 
 		 544 aa  343  4e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.723863  normal  0.697753 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2210  alpha amylase catalytic region  40.66 
 
 		 586 aa  341  2e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.408019  hitchhiker  0.00161183 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3077  alpha amylase catalytic region  44.68 
 
 		 535 aa  341  2e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5268  alpha amylase catalytic region  42.8 
 
 		 540 aa  341  2e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0672  alpha amylase, catalytic region  42.75 
 
 		 533 aa  340  2.9999999999999998e-92  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.227468 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3863  alpha amylase catalytic region  45.98 
 
 		 541 aa  339  7e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00249861  normal  0.684332 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1931  alpha amylase, catalytic region  45.31 
 
 		 541 aa  337  1.9999999999999998e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.126366  normal  0.0171494 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2303  alpha amylase catalytic region  46.81 
 
 		 448 aa  333  5e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.190789 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1595  alpha amylase catalytic region  43.05 
 
 		 528 aa  333  6e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0451037 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2213  oligo-1,6-glucosidase  39.61 
 
 		 540 aa  330  5.0000000000000004e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0226  alpha amylase catalytic region  42.8 
 
 		 537 aa  329  9e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.547651 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0921  alpha amylase  42.26 
 
 		 568 aa  328  1.0000000000000001e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0194055 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2209  alpha amylase, catalytic region  41.22 
 
 		 540 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0835  alpha amylase catalytic region  39.96 
 
 		 549 aa  327  2.0000000000000001e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0021  alpha amylase catalytic region  37.98 
 
 		 530 aa  328  2.0000000000000001e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193993  normal  0.266827 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4274  alpha amylase catalytic region  42.02 
 
 		 529 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1889  alpha amylase, catalytic region  39.84 
 
 		 541 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0942  oligo-1,6-glucosidase, putative  42.67 
 
 		 539 aa  327  3e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1475  alpha amylase catalytic region  42.47 
 
 		 553 aa  327  3e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5528  alpha amylase catalytic region  39.11 
 
 		 545 aa  326  6e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.283745  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3300  alpha-glucosidase  39.53 
 
 		 555 aa  326  7e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0358  alpha amylase catalytic region  40.07 
 
 		 550 aa  326  7e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.404275 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2086  alpha amylase catalytic region  40.59 
 
 		 540 aa  325  9e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0390  alpha amylase catalytic region  39.81 
 
 		 550 aa  325  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.622906  normal  0.263526 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2299  alpha amylase catalytic region  41.1 
 
 		 540 aa  325  1e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.495294  normal  0.823743 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2088  alpha amylase catalytic region  39.3 
 
 		 541 aa  324  2e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.800572  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>