More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2176 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012803  Mlut_01920  glycosidase  59.9 
 
 		 607 aa  650    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2164  alpha amylase catalytic region  70.93 
 
 		 571 aa  759    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.126804  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2176  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 567 aa  1124    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.374326  normal  0.160369 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02470  Alpha-glucosidase  62.34 
 
 		 576 aa  657    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.914818  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1529  alpha amylase catalytic region  63.11 
 
 		 593 aa  727    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.331611  normal  0.956497 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0622  alpha amylase catalytic region  59.63 
 
 		 609 aa  652    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.653551 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12260  glycosidase  59.13 
 
 		 563 aa  635    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.203639  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08990  glycosidase  62.81 
 
 		 570 aa  674    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.134217  normal  0.0194138 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1785  alpha amylase catalytic region  68.37 
 
 		 599 aa  697    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.326803 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3538  alpha amylase catalytic region  65.76 
 
 		 546 aa  655    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.489113  normal  0.592754 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13840  glycosidase  67.85 
 
 		 605 aa  794    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0412  alpha amylase, catalytic region  61.01 
 
 		 640 aa  655    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3302  alpha amylase catalytic region  67.37 
 
 		 566 aa  740    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.15105  normal  0.0149256 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51470  Alpha-glucosidase  62.66 
 
 		 565 aa  638    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0695  alpha amylase catalytic region  60.04 
 
 		 533 aa  617  1e-175  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.497083 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5893  alpha amylase catalytic region  58.76 
 
 		 507 aa  605  9.999999999999999e-173  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.186774 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0833  alpha-glucosidase  60.78 
 
 		 544 aa  598  1e-169  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0743  alpha amylase, catalytic region  59.68 
 
 		 573 aa  597  1e-169  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.802881  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1883  alpha amylase catalytic region  60.26 
 
 		 538 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.681572 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3342  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  58.21 
 
 		 538 aa  568  1e-161  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.292623  normal  0.0532512 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11590  glycosidase  58.51 
 
 		 522 aa  570  1e-161  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0775  alpha amylase, catalytic region  57.55 
 
 		 534 aa  567  1e-160  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3700  alpha amylase catalytic region  54.51 
 
 		 560 aa  568  1e-160  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.715458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1739  alpha amylase catalytic region  57.6 
 
 		 550 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000285446  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2981  alpha amylase catalytic region  56.99 
 
 		 540 aa  562  1.0000000000000001e-159  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000947876  normal  0.0148383 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0801  alpha amylase, catalytic region  55.81 
 
 		 543 aa  555  1e-157  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.235668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8467  alpha amylase catalytic region  54.22 
 
 		 544 aa  552  1e-156  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0947398 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0745  alpha amylase catalytic region  56.01 
 
 		 543 aa  549  1e-155  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.215044  hitchhiker  0.000627206 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2546  alpha amylase, catalytic region  55.94 
 
 		 561 aa  550  1e-155  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5859  alpha amylase catalytic region  54.42 
 
 		 558 aa  546  1e-154  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.63248 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22590  glycosidase  54.84 
 
 		 555 aa  544  1e-153  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.144788  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3038  alpha amylase, catalytic region  52.26 
 
 		 568 aa  542  1e-153  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3849  alpha amylase, catalytic region  55.42 
 
 		 554 aa  543  1e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0257835 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6925  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  57.28 
 
 		 545 aa  541  9.999999999999999e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2111  alpha amylase catalytic region  56.25 
 
 		 555 aa  537  1e-151  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1134  alpha amylase catalytic region  53.92 
 
 		 531 aa  533  1e-150  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.746257  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2030  alpha amylase catalytic region  52.81 
 
 		 587 aa  531  1e-150  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3695  alpha amylase catalytic region  52.96 
 
 		 524 aa  522  1e-147  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.660519  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7356  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  54.79 
 
 		 511 aa  522  1e-147  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27360  glycosidase  54.38 
 
 		 554 aa  520  1e-146  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.155559  normal  0.548604 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3357  alpha amylase catalytic region  54.18 
 
 		 539 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.925027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0062  alpha amylase catalytic region  51.4 
 
 		 553 aa  516  1.0000000000000001e-145  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.3547  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5406  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  54.01 
 
 		 512 aa  514  1e-144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2158  alpha amylase catalytic region  53.35 
 
 		 542 aa  513  1e-144  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2746  alpha amylase catalytic region  51.03 
 
 		 570 aa  514  1e-144  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00507625 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3603  alpha amylase catalytic region  50.34 
 
 		 572 aa  511  1e-143  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00610  alpha-glucosidase, putative  47.89 
 
 		 563 aa  505  9.999999999999999e-143  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.260556  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1532  alpha amylase catalytic region  54.53 
 
 		 532 aa  508  9.999999999999999e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3708  alpha amylase catalytic region  52.91 
 
 		 549 aa  508  9.999999999999999e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0503251  hitchhiker  0.00685051 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12496  alpha-glucosidase aglA (maltase)  51.62 
 
 		 546 aa  503  1e-141  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.447411  normal  0.123805 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1390  alpha amylase catalytic region  50.36 
 
 		 533 aa  503  1e-141  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.794681  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2798  alpha amylase catalytic region  54.98 
 
 		 548 aa  501  1e-140  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24650  glycosidase  51.97 
 
 		 567 aa  500  1e-140  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3300  alpha amylase catalytic region  51.58 
 
 		 560 aa  489  1e-137  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.522775  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6968  alpha amylase catalytic region  49.82 
 
 		 561 aa  486  1e-136  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.144872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3616  alpha amylase, catalytic region  52.38 
 
 		 539 aa  486  1e-136  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.381116 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3611  alpha amylase, catalytic region  52.2 
 
 		 539 aa  484  1e-135  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.275383  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3684  alpha amylase, catalytic region  52.2 
 
 		 539 aa  484  1e-135  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.942466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2119  alpha amylase catalytic region  54.23 
 
 		 560 aa  476  1e-133  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4692  alpha amylase catalytic region  49.08 
 
 		 580 aa  472  1e-132  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.375992  normal  0.284886 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1150  alpha amylase, catalytic region  51.99 
 
 		 634 aa  471  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1495  glycosidase  49.73 
 
 		 556 aa  466  9.999999999999999e-131  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1323  alpha-amylase  46.46 
 
 		 604 aa  464  1e-129  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4117  alpha amylase catalytic region  52.88 
 
 		 548 aa  451  1e-125  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.357071  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5316  alpha amylase catalytic region  55.03 
 
 		 594 aa  437  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0561676  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1017  alpha amylase catalytic region  45.22 
 
 		 544 aa  431  1e-119  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.503917 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1794  alpha amylase catalytic region  47.38 
 
 		 543 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.209676  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3687  alpha amylase, catalytic region  42.62 
 
 		 540 aa  338  9.999999999999999e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1475  alpha amylase catalytic region  40.22 
 
 		 553 aa  335  1e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0777  alpha amylase catalytic region  42.34 
 
 		 532 aa  334  3e-90  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.876516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4274  alpha amylase catalytic region  41.59 
 
 		 529 aa  333  7.000000000000001e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3104  trehalose-6-phosphate hydrolase  44.15 
 
 		 515 aa  333  7.000000000000001e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0986221  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2320  alpha amylase catalytic region  42.01 
 
 		 547 aa  329  9e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.80263 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1595  alpha amylase catalytic region  44.01 
 
 		 528 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0451037 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0307  alpha amylase catalytic subunit  40.22 
 
 		 525 aa  327  5e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0672  alpha amylase, catalytic region  41.94 
 
 		 533 aa  324  3e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.227468 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3307  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  41.28 
 
 		 735 aa  323  6e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.081208  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1969  alpha amylase catalytic region  39.68 
 
 		 536 aa  322  9.999999999999999e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.786718  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3863  alpha amylase catalytic region  44.18 
 
 		 541 aa  321  1.9999999999999998e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00249861  normal  0.684332 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5528  alpha amylase catalytic region  40.73 
 
 		 545 aa  320  3.9999999999999996e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.283745  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2303  alpha amylase catalytic region  44.17 
 
 		 448 aa  320  6e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.190789 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3300  alpha-glucosidase  39.77 
 
 		 555 aa  318  1e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2302  alpha amylase catalytic region  41.49 
 
 		 518 aa  318  1e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2736  alpha amylase, catalytic region  40.62 
 
 		 543 aa  318  1e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.70509  normal  0.436177 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5769  alpha amylase catalytic region  39.71 
 
 		 535 aa  318  2e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1931  alpha amylase, catalytic region  43.74 
 
 		 541 aa  317  3e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.126366  normal  0.0171494 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3304  alpha amylase, catalytic region  41.82 
 
 		 550 aa  316  6e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.251779  normal  0.854548 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0942  oligo-1,6-glucosidase, putative  41.47 
 
 		 539 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2833  alpha amylase catalytic region  39.07 
 
 		 548 aa  313  4.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.518671  normal  0.538121 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4089  alpha amylase catalytic region  41.89 
 
 		 540 aa  313  5.999999999999999e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0416  alpha amylase catalytic region  39.5 
 
 		 557 aa  310  4e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3169  alpha amylase, catalytic region  42.39 
 
 		 530 aa  310  4e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4891  alpha amylase, catalytic region  39.04 
 
 		 538 aa  309  6.999999999999999e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3102  alpha amylase catalytic region  38.33 
 
 		 548 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.355967  normal  0.289712 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2294  Alpha amylase, catalytic region  41.76 
 
 		 542 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.960991  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0107  alpha amylase catalytic region  38.17 
 
 		 543 aa  306  8.000000000000001e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0636933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5268  alpha amylase catalytic region  42.34 
 
 		 540 aa  302  1e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2088  alpha amylase catalytic region  36.42 
 
 		 541 aa  302  1e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.800572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1988  alpha amylase catalytic region  44.47 
 
 		 546 aa  301  2e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0226  alpha amylase catalytic region  42.61 
 
 		 537 aa  301  2e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.547651 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>