More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3538 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_2164  alpha amylase catalytic region  64.34 
 
 		 571 aa  667    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.126804  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2176  alpha amylase catalytic region  65.76 
 
 		 567 aa  687    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.374326  normal  0.160369 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13840  glycosidase  58.67 
 
 		 605 aa  655    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3538  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 546 aa  1073    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.489113  normal  0.592754 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08990  glycosidase  62.31 
 
 		 570 aa  634  1e-180  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.134217  normal  0.0194138 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1529  alpha amylase catalytic region  55.56 
 
 		 593 aa  629  1e-179  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.331611  normal  0.956497 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3302  alpha amylase catalytic region  59.27 
 
 		 566 aa  630  1e-179  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.15105  normal  0.0149256 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51470  Alpha-glucosidase  61.11 
 
 		 565 aa  613  9.999999999999999e-175  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02470  Alpha-glucosidase  59.04 
 
 		 576 aa  609  1e-173  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.914818  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1785  alpha amylase catalytic region  61.21 
 
 		 599 aa  604  1.0000000000000001e-171  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.326803 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0622  alpha amylase catalytic region  56.42 
 
 		 609 aa  598  1e-170  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.653551 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5893  alpha amylase catalytic region  58.05 
 
 		 507 aa  592  1e-168  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.186774 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01920  glycosidase  55.57 
 
 		 607 aa  580  1e-164  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0745  alpha amylase catalytic region  58.77 
 
 		 543 aa  577  1.0000000000000001e-163  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.215044  hitchhiker  0.000627206 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0412  alpha amylase, catalytic region  55.96 
 
 		 640 aa  573  1.0000000000000001e-162  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0801  alpha amylase, catalytic region  58.51 
 
 		 543 aa  573  1.0000000000000001e-162  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.235668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12260  glycosidase  55.8 
 
 		 563 aa  573  1.0000000000000001e-162  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.203639  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2981  alpha amylase catalytic region  56.78 
 
 		 540 aa  570  1e-161  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000947876  normal  0.0148383 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0695  alpha amylase catalytic region  55.8 
 
 		 533 aa  567  1e-160  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.497083 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6925  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  57.2 
 
 		 545 aa  560  1e-158  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3342  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  56.72 
 
 		 538 aa  556  1e-157  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.292623  normal  0.0532512 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3700  alpha amylase catalytic region  55.04 
 
 		 560 aa  557  1e-157  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.715458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0775  alpha amylase, catalytic region  56.57 
 
 		 534 aa  553  1e-156  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11590  glycosidase  58.9 
 
 		 522 aa  546  1e-154  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0743  alpha amylase, catalytic region  57.84 
 
 		 573 aa  541  9.999999999999999e-153  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.802881  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2546  alpha amylase, catalytic region  55.65 
 
 		 561 aa  538  9.999999999999999e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0833  alpha-glucosidase  57.12 
 
 		 544 aa  536  1e-151  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1883  alpha amylase catalytic region  57.06 
 
 		 538 aa  535  1e-150  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.681572 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3357  alpha amylase catalytic region  55.17 
 
 		 539 aa  535  1e-150  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.925027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3849  alpha amylase, catalytic region  55.23 
 
 		 554 aa  534  1e-150  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0257835 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1739  alpha amylase catalytic region  55.88 
 
 		 550 aa  528  1e-148  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000285446  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2111  alpha amylase catalytic region  54.97 
 
 		 555 aa  521  1e-147  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3038  alpha amylase, catalytic region  50.63 
 
 		 568 aa  518  1e-146  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24650  glycosidase  54.04 
 
 		 567 aa  517  1.0000000000000001e-145  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00610  alpha-glucosidase, putative  47.58 
 
 		 563 aa  511  1e-144  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.260556  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5406  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  54.21 
 
 		 512 aa  512  1e-144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7356  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  53.97 
 
 		 511 aa  511  1e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0062  alpha amylase catalytic region  52.84 
 
 		 553 aa  510  1e-143  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.3547  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8467  alpha amylase catalytic region  53.37 
 
 		 544 aa  511  1e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0947398 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1134  alpha amylase catalytic region  50.75 
 
 		 531 aa  505  9.999999999999999e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.746257  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2158  alpha amylase catalytic region  54.03 
 
 		 542 aa  504  1e-141  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27360  glycosidase  53.68 
 
 		 554 aa  499  1e-140  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.155559  normal  0.548604 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3695  alpha amylase catalytic region  50.92 
 
 		 524 aa  498  1e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.660519  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22590  glycosidase  53.1 
 
 		 555 aa  495  1e-139  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.144788  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2746  alpha amylase catalytic region  49.12 
 
 		 570 aa  496  1e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00507625 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5859  alpha amylase catalytic region  52.34 
 
 		 558 aa  494  9.999999999999999e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.63248 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1532  alpha amylase catalytic region  53.32 
 
 		 532 aa  494  9.999999999999999e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3300  alpha amylase catalytic region  53.05 
 
 		 560 aa  490  1e-137  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.522775  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2119  alpha amylase catalytic region  53.64 
 
 		 560 aa  478  1e-134  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1390  alpha amylase catalytic region  47.82 
 
 		 533 aa  479  1e-134  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.794681  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3708  alpha amylase catalytic region  50.28 
 
 		 549 aa  478  1e-133  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0503251  hitchhiker  0.00685051 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2798  alpha amylase catalytic region  52.55 
 
 		 548 aa  471  1.0000000000000001e-131  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4692  alpha amylase catalytic region  51.58 
 
 		 580 aa  471  1.0000000000000001e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.375992  normal  0.284886 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3603  alpha amylase catalytic region  49.02 
 
 		 572 aa  471  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2030  alpha amylase catalytic region  47.69 
 
 		 587 aa  468  9.999999999999999e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12496  alpha-glucosidase aglA (maltase)  48.82 
 
 		 546 aa  462  1e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.447411  normal  0.123805 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1495  glycosidase  47.21 
 
 		 556 aa  456  1e-127  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1323  alpha-amylase  44.59 
 
 		 604 aa  458  1e-127  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3611  alpha amylase, catalytic region  48.92 
 
 		 539 aa  449  1e-125  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.275383  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3684  alpha amylase, catalytic region  48.92 
 
 		 539 aa  449  1e-125  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.942466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3616  alpha amylase, catalytic region  48.92 
 
 		 539 aa  448  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.381116 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1150  alpha amylase, catalytic region  52.91 
 
 		 634 aa  444  1e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6968  alpha amylase catalytic region  47.69 
 
 		 561 aa  444  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.144872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4117  alpha amylase catalytic region  54.38 
 
 		 548 aa  441  9.999999999999999e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.357071  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1017  alpha amylase catalytic region  46.11 
 
 		 544 aa  440  9.999999999999999e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.503917 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5316  alpha amylase catalytic region  54.51 
 
 		 594 aa  433  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0561676  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1794  alpha amylase catalytic region  45.72 
 
 		 543 aa  399  9.999999999999999e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.209676  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0777  alpha amylase catalytic region  42.01 
 
 		 532 aa  338  1.9999999999999998e-91  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.876516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4274  alpha amylase catalytic region  45.3 
 
 		 529 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1475  alpha amylase catalytic region  41.55 
 
 		 553 aa  331  2e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0942  oligo-1,6-glucosidase, putative  42.17 
 
 		 539 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3104  trehalose-6-phosphate hydrolase  45.07 
 
 		 515 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0986221  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4891  alpha amylase, catalytic region  40.53 
 
 		 538 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3687  alpha amylase, catalytic region  40.59 
 
 		 540 aa  328  2.0000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1969  alpha amylase catalytic region  39.63 
 
 		 536 aa  317  3e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.786718  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0672  alpha amylase, catalytic region  40.22 
 
 		 533 aa  313  3.9999999999999997e-84  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.227468 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2320  alpha amylase catalytic region  40.45 
 
 		 547 aa  310  2.9999999999999997e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.80263 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2736  alpha amylase, catalytic region  39.41 
 
 		 543 aa  310  2.9999999999999997e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.70509  normal  0.436177 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5769  alpha amylase catalytic region  39.11 
 
 		 535 aa  310  5e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0835  alpha amylase catalytic region  40.48 
 
 		 549 aa  309  1.0000000000000001e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2302  alpha amylase catalytic region  42.32 
 
 		 518 aa  307  3e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3102  alpha amylase catalytic region  39.63 
 
 		 548 aa  306  7e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.355967  normal  0.289712 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2833  alpha amylase catalytic region  39.44 
 
 		 548 aa  306  8.000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.518671  normal  0.538121 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0307  alpha amylase catalytic subunit  38.46 
 
 		 525 aa  305  1.0000000000000001e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5242  alpha amylase catalytic region  41.63 
 
 		 538 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1595  alpha amylase catalytic region  41.74 
 
 		 528 aa  300  5e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0451037 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0810  alpha amylase, catalytic region  39.63 
 
 		 540 aa  298  2e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.553058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3863  alpha amylase catalytic region  41.65 
 
 		 541 aa  297  3e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00249861  normal  0.684332 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3307  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  41.09 
 
 		 735 aa  297  4e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.081208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1931  alpha amylase, catalytic region  41.43 
 
 		 541 aa  296  5e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.126366  normal  0.0171494 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0226  alpha amylase catalytic region  42.5 
 
 		 537 aa  295  1e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.547651 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2303  alpha amylase catalytic region  43.07 
 
 		 448 aa  295  1e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.190789 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5528  alpha amylase catalytic region  38.68 
 
 		 545 aa  294  3e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.283745  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0356  alpha amylase, catalytic region  36.9 
 
 		 564 aa  293  4e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171609  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3300  alpha-glucosidase  38.59 
 
 		 555 aa  293  4e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2294  Alpha amylase, catalytic region  42.37 
 
 		 542 aa  293  5e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.960991  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0107  alpha amylase catalytic region  35.96 
 
 		 543 aa  292  1e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0636933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1370  alpha amylase domain-containing protein  39.54 
 
 		 536 aa  292  1e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0917  alpha amylase, catalytic region  41.54 
 
 		 542 aa  292  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0039  alpha amylase, catalytic region  39.31 
 
 		 536 aa  291  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>