More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_22590 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_22590  glycosidase  100 
 
 		 555 aa  1112    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.144788  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2176  alpha amylase catalytic region  55.89 
 
 		 567 aa  590  1e-167  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.374326  normal  0.160369 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2164  alpha amylase catalytic region  54.66 
 
 		 571 aa  567  1e-160  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.126804  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12260  glycosidase  54.18 
 
 		 563 aa  556  1e-157  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.203639  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1529  alpha amylase catalytic region  50.95 
 
 		 593 aa  551  1e-156  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.331611  normal  0.956497 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08990  glycosidase  51.87 
 
 		 570 aa  551  1e-156  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.134217  normal  0.0194138 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13840  glycosidase  50.08 
 
 		 605 aa  554  1e-156  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5893  alpha amylase catalytic region  54.03 
 
 		 507 aa  546  1e-154  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.186774 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3302  alpha amylase catalytic region  52.29 
 
 		 566 aa  539  9.999999999999999e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.15105  normal  0.0149256 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0622  alpha amylase catalytic region  51.23 
 
 		 609 aa  537  1e-151  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.653551 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11590  glycosidase  55.45 
 
 		 522 aa  535  1e-151  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02470  Alpha-glucosidase  52.04 
 
 		 576 aa  538  1e-151  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.914818  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1785  alpha amylase catalytic region  56.09 
 
 		 599 aa  531  1e-149  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.326803 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6925  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  56.67 
 
 		 545 aa  525  1e-148  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179369  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51470  Alpha-glucosidase  52.88 
 
 		 565 aa  521  1e-147  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0833  alpha-glucosidase  55.17 
 
 		 544 aa  519  1e-146  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3342  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  52.55 
 
 		 538 aa  520  1e-146  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.292623  normal  0.0532512 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1739  alpha amylase catalytic region  53.78 
 
 		 550 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000285446  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0695  alpha amylase catalytic region  51.45 
 
 		 533 aa  512  1e-144  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.497083 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3538  alpha amylase catalytic region  53.73 
 
 		 546 aa  514  1e-144  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.489113  normal  0.592754 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0745  alpha amylase catalytic region  53.57 
 
 		 543 aa  512  1e-144  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.215044  hitchhiker  0.000627206 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0801  alpha amylase, catalytic region  52.85 
 
 		 543 aa  513  1e-144  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.235668  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01920  glycosidase  48.98 
 
 		 607 aa  509  1e-143  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0775  alpha amylase, catalytic region  51.54 
 
 		 534 aa  509  1e-143  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1883  alpha amylase catalytic region  57.03 
 
 		 538 aa  505  1e-141  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.681572 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0412  alpha amylase, catalytic region  49.4 
 
 		 640 aa  504  1e-141  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2981  alpha amylase catalytic region  50.82 
 
 		 540 aa  498  1e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000947876  normal  0.0148383 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0743  alpha amylase, catalytic region  49.83 
 
 		 573 aa  491  1e-137  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.802881  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3300  alpha amylase catalytic region  51.72 
 
 		 560 aa  487  1e-136  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.522775  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3038  alpha amylase, catalytic region  47.99 
 
 		 568 aa  487  1e-136  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7356  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  51.22 
 
 		 511 aa  483  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1134  alpha amylase catalytic region  49.72 
 
 		 531 aa  484  1e-135  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.746257  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3700  alpha amylase catalytic region  48.73 
 
 		 560 aa  483  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.715458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3695  alpha amylase catalytic region  49.27 
 
 		 524 aa  475  1e-133  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.660519  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5859  alpha amylase catalytic region  49.91 
 
 		 558 aa  475  1e-133  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.63248 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2746  alpha amylase catalytic region  48.2 
 
 		 570 aa  472  1e-132  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00507625 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3357  alpha amylase catalytic region  49.82 
 
 		 539 aa  472  1e-132  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.925027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2111  alpha amylase catalytic region  51.09 
 
 		 555 aa  471  1.0000000000000001e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1390  alpha amylase catalytic region  48.71 
 
 		 533 aa  471  1.0000000000000001e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.794681  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3849  alpha amylase, catalytic region  48.18 
 
 		 554 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0257835 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2546  alpha amylase, catalytic region  49.55 
 
 		 561 aa  468  9.999999999999999e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3708  alpha amylase catalytic region  48.63 
 
 		 549 aa  465  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0503251  hitchhiker  0.00685051 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5406  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  49.16 
 
 		 512 aa  464  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3603  alpha amylase catalytic region  47.86 
 
 		 572 aa  461  9.999999999999999e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00610  alpha-glucosidase, putative  44.36 
 
 		 563 aa  460  9.999999999999999e-129  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.260556  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24650  glycosidase  49.46 
 
 		 567 aa  461  9.999999999999999e-129  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2030  alpha amylase catalytic region  47.33 
 
 		 587 aa  461  9.999999999999999e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0062  alpha amylase catalytic region  46.68 
 
 		 553 aa  455  1e-127  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.3547  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8467  alpha amylase catalytic region  47.11 
 
 		 544 aa  455  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0947398 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2119  alpha amylase catalytic region  49.36 
 
 		 560 aa  446  1.0000000000000001e-124  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1532  alpha amylase catalytic region  50.09 
 
 		 532 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1323  alpha-amylase  44.15 
 
 		 604 aa  444  1e-123  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2798  alpha amylase catalytic region  48.11 
 
 		 548 aa  439  9.999999999999999e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1495  glycosidase  47.71 
 
 		 556 aa  439  9.999999999999999e-123  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2158  alpha amylase catalytic region  47.53 
 
 		 542 aa  436  1e-121  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6968  alpha amylase catalytic region  47.16 
 
 		 561 aa  433  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.144872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3616  alpha amylase, catalytic region  47.22 
 
 		 539 aa  431  1e-119  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.381116 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3611  alpha amylase, catalytic region  47.22 
 
 		 539 aa  428  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.275383  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3684  alpha amylase, catalytic region  47.22 
 
 		 539 aa  428  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.942466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1017  alpha amylase catalytic region  44.48 
 
 		 544 aa  424  1e-117  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.503917 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12496  alpha-glucosidase aglA (maltase)  45.72 
 
 		 546 aa  422  1e-117  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.447411  normal  0.123805 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4692  alpha amylase catalytic region  46.02 
 
 		 580 aa  416  9.999999999999999e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.375992  normal  0.284886 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5316  alpha amylase catalytic region  51.55 
 
 		 594 aa  416  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0561676  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27360  glycosidase  45.17 
 
 		 554 aa  415  1e-114  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.155559  normal  0.548604 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1150  alpha amylase, catalytic region  50.63 
 
 		 634 aa  409  1e-113  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4117  alpha amylase catalytic region  48.82 
 
 		 548 aa  403  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.357071  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1794  alpha amylase catalytic region  43.93 
 
 		 543 aa  393  1e-108  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.209676  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3687  alpha amylase, catalytic region  40.52 
 
 		 540 aa  358  1.9999999999999998e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1969  alpha amylase catalytic region  42.26 
 
 		 536 aa  357  2.9999999999999997e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.786718  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0307  alpha amylase catalytic subunit  42.12 
 
 		 525 aa  353  5.9999999999999994e-96  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2320  alpha amylase catalytic region  43.07 
 
 		 547 aa  352  1e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.80263 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4274  alpha amylase catalytic region  42.83 
 
 		 529 aa  351  2e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0777  alpha amylase catalytic region  45.47 
 
 		 532 aa  346  5e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.876516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3300  alpha-glucosidase  41.51 
 
 		 555 aa  344  2e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1475  alpha amylase catalytic region  41.26 
 
 		 553 aa  342  8e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4891  alpha amylase, catalytic region  41.19 
 
 		 538 aa  336  5e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0107  alpha amylase catalytic region  37.81 
 
 		 543 aa  335  1e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0636933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2833  alpha amylase catalytic region  41.67 
 
 		 548 aa  334  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.518671  normal  0.538121 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0942  oligo-1,6-glucosidase, putative  41.45 
 
 		 539 aa  333  3e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3102  alpha amylase catalytic region  41.43 
 
 		 548 aa  333  3e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.355967  normal  0.289712 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5769  alpha amylase catalytic region  40.54 
 
 		 535 aa  333  5e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3104  trehalose-6-phosphate hydrolase  44.42 
 
 		 515 aa  333  5e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0986221  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5268  alpha amylase catalytic region  46.19 
 
 		 540 aa  332  1e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2294  Alpha amylase, catalytic region  42.43 
 
 		 542 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.960991  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0810  alpha amylase, catalytic region  45.91 
 
 		 540 aa  325  9e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.553058  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5528  alpha amylase catalytic region  39.96 
 
 		 545 aa  324  2e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.283745  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3304  alpha amylase, catalytic region  42.14 
 
 		 550 aa  324  2e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.251779  normal  0.854548 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1931  alpha amylase, catalytic region  44.54 
 
 		 541 aa  323  4e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.126366  normal  0.0171494 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3077  alpha amylase catalytic region  46.1 
 
 		 535 aa  322  8e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3863  alpha amylase catalytic region  44.16 
 
 		 541 aa  322  1.9999999999999998e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00249861  normal  0.684332 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1649  alpha-glucosidase  41.54 
 
 		 552 aa  320  6e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.856905  hitchhiker  0.000000195123 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0261  alpha amylase  41.92 
 
 		 537 aa  318  1e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0021  alpha amylase catalytic region  38.85 
 
 		 530 aa  318  2e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193993  normal  0.266827 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0917  alpha amylase, catalytic region  44.37 
 
 		 542 aa  317  4e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0921  alpha amylase  36.61 
 
 		 568 aa  317  4e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0194055 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0672  alpha amylase, catalytic region  42.56 
 
 		 533 aa  316  5e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.227468 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2210  alpha amylase catalytic region  38.13 
 
 		 586 aa  316  6e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.408019  hitchhiker  0.00161183 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2088  alpha amylase catalytic region  37.96 
 
 		 541 aa  315  1.9999999999999998e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.800572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2302  alpha amylase catalytic region  40.3 
 
 		 518 aa  314  2.9999999999999996e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5242  alpha amylase catalytic region  43.53 
 
 		 538 aa  314  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>