More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_13840 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1785  alpha amylase catalytic region  62.52 
 
 		 599 aa  662    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.326803 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08990  glycosidase  56.73 
 
 		 570 aa  642    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.134217  normal  0.0194138 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0622  alpha amylase catalytic region  57.14 
 
 		 609 aa  664    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.653551 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3302  alpha amylase catalytic region  61.76 
 
 		 566 aa  721    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.15105  normal  0.0149256 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13840  glycosidase  100 
 
 		 605 aa  1222    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1529  alpha amylase catalytic region  69.31 
 
 		 593 aa  839    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.331611  normal  0.956497 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2164  alpha amylase catalytic region  65.06 
 
 		 571 aa  730    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.126804  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2176  alpha amylase catalytic region  67.85 
 
 		 567 aa  794    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.374326  normal  0.160369 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02470  Alpha-glucosidase  55.7 
 
 		 576 aa  632  1e-180  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.914818  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0412  alpha amylase, catalytic region  58.66 
 
 		 640 aa  632  1e-180  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3538  alpha amylase catalytic region  58.67 
 
 		 546 aa  624  1e-177  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.489113  normal  0.592754 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51470  Alpha-glucosidase  55.81 
 
 		 565 aa  609  1e-173  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12260  glycosidase  54.53 
 
 		 563 aa  600  1e-170  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.203639  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01920  glycosidase  53.67 
 
 		 607 aa  596  1e-169  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0695  alpha amylase catalytic region  55.03 
 
 		 533 aa  582  1.0000000000000001e-165  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.497083 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0743  alpha amylase, catalytic region  57.37 
 
 		 573 aa  578  1e-164  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.802881  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0833  alpha-glucosidase  56.75 
 
 		 544 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5893  alpha amylase catalytic region  52.89 
 
 		 507 aa  564  1.0000000000000001e-159  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.186774 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11590  glycosidase  54.17 
 
 		 522 aa  560  1e-158  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0775  alpha amylase, catalytic region  53.5 
 
 		 534 aa  553  1e-156  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1739  alpha amylase catalytic region  52.94 
 
 		 550 aa  548  1e-154  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000285446  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3342  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  50.43 
 
 		 538 aa  540  9.999999999999999e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.292623  normal  0.0532512 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1883  alpha amylase catalytic region  53.7 
 
 		 538 aa  537  1e-151  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.681572 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0801  alpha amylase, catalytic region  51.38 
 
 		 543 aa  533  1e-150  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.235668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2981  alpha amylase catalytic region  51.9 
 
 		 540 aa  531  1e-149  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000947876  normal  0.0148383 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0745  alpha amylase catalytic region  50.75 
 
 		 543 aa  530  1e-149  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.215044  hitchhiker  0.000627206 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3357  alpha amylase catalytic region  50.78 
 
 		 539 aa  523  1e-147  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.925027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8467  alpha amylase catalytic region  49.31 
 
 		 544 aa  518  1.0000000000000001e-145  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0947398 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3849  alpha amylase, catalytic region  50.77 
 
 		 554 aa  515  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0257835 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2111  alpha amylase catalytic region  52.08 
 
 		 555 aa  514  1e-144  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22590  glycosidase  49.83 
 
 		 555 aa  513  1e-144  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.144788  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3038  alpha amylase, catalytic region  48.42 
 
 		 568 aa  509  1e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3700  alpha amylase catalytic region  46.99 
 
 		 560 aa  506  9.999999999999999e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.715458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2546  alpha amylase, catalytic region  50.52 
 
 		 561 aa  508  9.999999999999999e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6925  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  48.34 
 
 		 545 aa  502  1e-141  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5859  alpha amylase catalytic region  49.14 
 
 		 558 aa  496  1e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.63248 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3695  alpha amylase catalytic region  47.84 
 
 		 524 aa  491  1e-137  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.660519  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3300  alpha amylase catalytic region  49.66 
 
 		 560 aa  491  1e-137  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.522775  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1134  alpha amylase catalytic region  48.51 
 
 		 531 aa  489  1e-137  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.746257  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3708  alpha amylase catalytic region  50.54 
 
 		 549 aa  487  1e-136  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0503251  hitchhiker  0.00685051 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00610  alpha-glucosidase, putative  45.41 
 
 		 563 aa  486  1e-136  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.260556  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27360  glycosidase  49.22 
 
 		 554 aa  488  1e-136  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.155559  normal  0.548604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5406  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  48.26 
 
 		 512 aa  484  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2030  alpha amylase catalytic region  47.03 
 
 		 587 aa  483  1e-135  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2746  alpha amylase catalytic region  47.02 
 
 		 570 aa  479  1e-134  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00507625 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2798  alpha amylase catalytic region  51.04 
 
 		 548 aa  481  1e-134  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24650  glycosidase  48.72 
 
 		 567 aa  481  1e-134  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0062  alpha amylase catalytic region  46.33 
 
 		 553 aa  476  1e-133  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.3547  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7356  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  49.21 
 
 		 511 aa  474  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1532  alpha amylase catalytic region  50.44 
 
 		 532 aa  473  1e-132  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2158  alpha amylase catalytic region  47.65 
 
 		 542 aa  471  1.0000000000000001e-131  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3603  alpha amylase catalytic region  46.61 
 
 		 572 aa  470  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1390  alpha amylase catalytic region  45.26 
 
 		 533 aa  467  9.999999999999999e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.794681  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12496  alpha-glucosidase aglA (maltase)  46.77 
 
 		 546 aa  467  9.999999999999999e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.447411  normal  0.123805 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6968  alpha amylase catalytic region  47.12 
 
 		 561 aa  464  1e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.144872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1323  alpha-amylase  43.87 
 
 		 604 aa  465  1e-129  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1495  glycosidase  45.58 
 
 		 556 aa  461  9.999999999999999e-129  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2119  alpha amylase catalytic region  48.17 
 
 		 560 aa  457  1e-127  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3611  alpha amylase, catalytic region  48.18 
 
 		 539 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.275383  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3684  alpha amylase, catalytic region  48.18 
 
 		 539 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.942466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3616  alpha amylase, catalytic region  48.27 
 
 		 539 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.381116 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1150  alpha amylase, catalytic region  46.97 
 
 		 634 aa  440  9.999999999999999e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5316  alpha amylase catalytic region  46.36 
 
 		 594 aa  440  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0561676  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1017  alpha amylase catalytic region  44.24 
 
 		 544 aa  432  1e-120  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.503917 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4692  alpha amylase catalytic region  44.92 
 
 		 580 aa  420  1e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.375992  normal  0.284886 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4117  alpha amylase catalytic region  47.92 
 
 		 548 aa  397  1e-109  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.357071  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1794  alpha amylase catalytic region  42.53 
 
 		 543 aa  379  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.209676  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3687  alpha amylase, catalytic region  38.36 
 
 		 540 aa  338  9.999999999999999e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3104  trehalose-6-phosphate hydrolase  40.44 
 
 		 515 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0986221  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0777  alpha amylase catalytic region  39.08 
 
 		 532 aa  326  7e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.876516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4274  alpha amylase catalytic region  39.52 
 
 		 529 aa  319  1e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1475  alpha amylase catalytic region  39.49 
 
 		 553 aa  318  2e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0307  alpha amylase catalytic subunit  37.14 
 
 		 525 aa  311  2e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3307  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  37.54 
 
 		 735 aa  308  2.0000000000000002e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.081208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3863  alpha amylase catalytic region  38.67 
 
 		 541 aa  305  2.0000000000000002e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00249861  normal  0.684332 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0942  oligo-1,6-glucosidase, putative  37.77 
 
 		 539 aa  304  4.0000000000000003e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1595  alpha amylase catalytic region  39.22 
 
 		 528 aa  302  1e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0451037 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0226  alpha amylase catalytic region  39.04 
 
 		 537 aa  301  3e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.547651 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3169  alpha amylase, catalytic region  37.32 
 
 		 530 aa  300  4e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1931  alpha amylase, catalytic region  38.31 
 
 		 541 aa  300  4e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.126366  normal  0.0171494 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0107  alpha amylase catalytic region  34.23 
 
 		 543 aa  300  8e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0636933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5769  alpha amylase catalytic region  35.22 
 
 		 535 aa  299  9e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0672  alpha amylase, catalytic region  39.02 
 
 		 533 aa  299  1e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.227468 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1017  alpha amylase catalytic region  38.62 
 
 		 537 aa  296  6e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.487933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2303  alpha amylase catalytic region  39.8 
 
 		 448 aa  295  1e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.190789 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2736  alpha amylase, catalytic region  38.31 
 
 		 543 aa  295  1e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.70509  normal  0.436177 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1988  alpha amylase catalytic region  41.2 
 
 		 546 aa  295  2e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4891  alpha amylase, catalytic region  36.16 
 
 		 538 aa  295  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0303  alpha amylase catalytic region  37.39 
 
 		 557 aa  293  4e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2320  alpha amylase catalytic region  39.57 
 
 		 547 aa  294  4e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.80263 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2833  alpha amylase catalytic region  36 
 
 		 548 aa  294  4e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.518671  normal  0.538121 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0810  alpha amylase, catalytic region  36.43 
 
 		 540 aa  292  1e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.553058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2302  alpha amylase catalytic region  35.95 
 
 		 518 aa  292  1e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3077  alpha amylase catalytic region  38.32 
 
 		 535 aa  291  2e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0416  alpha amylase catalytic region  38.79 
 
 		 557 aa  291  2e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0917  alpha amylase, catalytic region  36.44 
 
 		 542 aa  291  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2620  alpha amylase catalytic region  36.64 
 
 		 560 aa  291  3e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3102  alpha amylase catalytic region  36.16 
 
 		 548 aa  291  3e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.355967  normal  0.289712 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4089  alpha amylase catalytic region  37.16 
 
 		 540 aa  290  8e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3300  alpha-glucosidase  37.57 
 
 		 555 aa  289  8e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>