More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNF00610 on replicon NC_006691
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3603  alpha amylase catalytic region  57.02 
 
 		 572 aa  638    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00610  alpha-glucosidase, putative  100 
 
 		 563 aa  1162    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.260556  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2746  alpha amylase catalytic region  57.98 
 
 		 570 aa  652    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00507625 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3038  alpha amylase, catalytic region  59.61 
 
 		 568 aa  683    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24650  glycosidase  57.87 
 
 		 567 aa  626  1e-178  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3300  alpha amylase catalytic region  55.86 
 
 		 560 aa  607  9.999999999999999e-173  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.522775  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2119  alpha amylase catalytic region  55.99 
 
 		 560 aa  587  1e-166  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1323  alpha-amylase  48.51 
 
 		 604 aa  536  1e-151  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3357  alpha amylase catalytic region  48.28 
 
 		 539 aa  523  1e-147  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.925027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2164  alpha amylase catalytic region  49.4 
 
 		 571 aa  518  1.0000000000000001e-145  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.126804  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2176  alpha amylase catalytic region  47.89 
 
 		 567 aa  505  9.999999999999999e-143  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.374326  normal  0.160369 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1529  alpha amylase catalytic region  46.19 
 
 		 593 aa  504  1e-141  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.331611  normal  0.956497 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3302  alpha amylase catalytic region  47.85 
 
 		 566 aa  500  1e-140  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.15105  normal  0.0149256 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08990  glycosidase  46.98 
 
 		 570 aa  495  1e-139  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.134217  normal  0.0194138 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5893  alpha amylase catalytic region  48.28 
 
 		 507 aa  496  1e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.186774 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51470  Alpha-glucosidase  49.37 
 
 		 565 aa  491  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13840  glycosidase  45.41 
 
 		 605 aa  486  1e-136  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2981  alpha amylase catalytic region  46 
 
 		 540 aa  479  1e-134  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000947876  normal  0.0148383 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12260  glycosidase  46.94 
 
 		 563 aa  479  1e-134  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.203639  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02470  Alpha-glucosidase  46.5 
 
 		 576 aa  478  1e-134  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.914818  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0062  alpha amylase catalytic region  44.35 
 
 		 553 aa  476  1e-133  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.3547  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3538  alpha amylase catalytic region  47.04 
 
 		 546 aa  478  1e-133  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.489113  normal  0.592754 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0775  alpha amylase, catalytic region  47 
 
 		 534 aa  477  1e-133  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0622  alpha amylase catalytic region  44.52 
 
 		 609 aa  472  1e-132  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.653551 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1495  glycosidase  46.06 
 
 		 556 aa  473  1e-132  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0833  alpha-glucosidase  48.67 
 
 		 544 aa  468  9.999999999999999e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0695  alpha amylase catalytic region  45.57 
 
 		 533 aa  463  1e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.497083 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01920  glycosidase  43.7 
 
 		 607 aa  456  1e-127  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0745  alpha amylase catalytic region  46.06 
 
 		 543 aa  451  1e-125  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.215044  hitchhiker  0.000627206 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0743  alpha amylase, catalytic region  45.26 
 
 		 573 aa  450  1e-125  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.802881  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0801  alpha amylase, catalytic region  46.41 
 
 		 543 aa  449  1e-125  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.235668  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1785  alpha amylase catalytic region  45.3 
 
 		 599 aa  447  1.0000000000000001e-124  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.326803 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1739  alpha amylase catalytic region  45.65 
 
 		 550 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000285446  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1134  alpha amylase catalytic region  45.5 
 
 		 531 aa  443  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.746257  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8467  alpha amylase catalytic region  44.35 
 
 		 544 aa  442  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0947398 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1532  alpha amylase catalytic region  45.71 
 
 		 532 aa  442  1e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6925  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  45.16 
 
 		 545 aa  442  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3849  alpha amylase, catalytic region  46.51 
 
 		 554 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0257835 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0412  alpha amylase, catalytic region  43.95 
 
 		 640 aa  437  1e-121  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3342  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  44.44 
 
 		 538 aa  433  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.292623  normal  0.0532512 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3700  alpha amylase catalytic region  42.4 
 
 		 560 aa  433  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.715458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11590  glycosidase  45.88 
 
 		 522 aa  429  1e-119  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7356  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  46.59 
 
 		 511 aa  429  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1883  alpha amylase catalytic region  44.86 
 
 		 538 aa  424  1e-117  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.681572 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2546  alpha amylase, catalytic region  44.44 
 
 		 561 aa  424  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27360  glycosidase  43.92 
 
 		 554 aa  421  1e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.155559  normal  0.548604 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22590  glycosidase  47.8 
 
 		 555 aa  419  1e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.144788  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5859  alpha amylase catalytic region  43.38 
 
 		 558 aa  416  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.63248 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2158  alpha amylase catalytic region  42.88 
 
 		 542 aa  412  1e-114  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5406  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  43.35 
 
 		 512 aa  409  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2111  alpha amylase catalytic region  41.9 
 
 		 555 aa  408  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1390  alpha amylase catalytic region  42.29 
 
 		 533 aa  407  1.0000000000000001e-112  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.794681  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3695  alpha amylase catalytic region  39.08 
 
 		 524 aa  404  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.660519  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2030  alpha amylase catalytic region  42.2 
 
 		 587 aa  402  9.999999999999999e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3708  alpha amylase catalytic region  43.79 
 
 		 549 aa  399  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0503251  hitchhiker  0.00685051 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6968  alpha amylase catalytic region  41.93 
 
 		 561 aa  396  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.144872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4692  alpha amylase catalytic region  42.25 
 
 		 580 aa  392  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.375992  normal  0.284886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3616  alpha amylase, catalytic region  42.53 
 
 		 539 aa  393  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.381116 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12496  alpha-glucosidase aglA (maltase)  41.29 
 
 		 546 aa  391  1e-107  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.447411  normal  0.123805 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3611  alpha amylase, catalytic region  43.57 
 
 		 539 aa  391  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.275383  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3684  alpha amylase, catalytic region  43.57 
 
 		 539 aa  391  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.942466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1017  alpha amylase catalytic region  38.74 
 
 		 544 aa  374  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.503917 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2798  alpha amylase catalytic region  40.53 
 
 		 548 aa  372  1e-101  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1150  alpha amylase, catalytic region  40.51 
 
 		 634 aa  369  1e-101  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1794  alpha amylase catalytic region  41.04 
 
 		 543 aa  363  5.0000000000000005e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.209676  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4117  alpha amylase catalytic region  42.17 
 
 		 548 aa  353  5.9999999999999994e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.357071  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5316  alpha amylase catalytic region  43.5 
 
 		 594 aa  352  8e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0561676  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3102  alpha amylase catalytic region  37.06 
 
 		 548 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.355967  normal  0.289712 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0356  alpha amylase, catalytic region  36.21 
 
 		 564 aa  303  6.000000000000001e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171609  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0672  alpha amylase, catalytic region  36.14 
 
 		 533 aa  303  8.000000000000001e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.227468 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1475  alpha amylase catalytic region  35.98 
 
 		 553 aa  301  3e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2833  alpha amylase catalytic region  36.33 
 
 		 548 aa  299  9e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.518671  normal  0.538121 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0777  alpha amylase catalytic region  36.98 
 
 		 532 aa  296  9e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.876516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3687  alpha amylase, catalytic region  36.12 
 
 		 540 aa  295  2e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2320  alpha amylase catalytic region  37.27 
 
 		 547 aa  293  4e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.80263 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0358  alpha amylase catalytic region  36.94 
 
 		 550 aa  290  6e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.404275 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4891  alpha amylase, catalytic region  34.4 
 
 		 538 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0921  alpha amylase  34.68 
 
 		 568 aa  287  2.9999999999999996e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0194055 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3300  alpha-glucosidase  36.43 
 
 		 555 aa  286  1.0000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4274  alpha amylase catalytic region  36.44 
 
 		 529 aa  283  5.000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0788  alpha-glucosidase  36.01 
 
 		 550 aa  283  5.000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3104  trehalose-6-phosphate hydrolase  35.93 
 
 		 515 aa  283  7.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0986221  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0390  alpha amylase catalytic region  37.27 
 
 		 550 aa  283  8.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.622906  normal  0.263526 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1969  alpha amylase catalytic region  32.93 
 
 		 536 aa  282  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.786718  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3304  alpha amylase, catalytic region  34.85 
 
 		 550 aa  280  5e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.251779  normal  0.854548 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1649  alpha-glucosidase  36.04 
 
 		 552 aa  279  8e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.856905  hitchhiker  0.000000195123 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1949  alpha amylase protein  34.12 
 
 		 553 aa  278  2e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.342567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1889  alpha amylase, catalytic region  34.9 
 
 		 541 aa  276  6e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0307  alpha amylase catalytic subunit  33.88 
 
 		 525 aa  275  1.0000000000000001e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2294  Alpha amylase, catalytic region  34.57 
 
 		 542 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.960991  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2088  alpha amylase catalytic region  34.62 
 
 		 541 aa  273  4.0000000000000004e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.800572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3863  alpha amylase catalytic region  37 
 
 		 541 aa  273  5.000000000000001e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00249861  normal  0.684332 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1931  alpha amylase, catalytic region  37 
 
 		 541 aa  271  2e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.126366  normal  0.0171494 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0107  alpha amylase catalytic region  34.02 
 
 		 543 aa  271  2.9999999999999997e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0636933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4089  alpha amylase catalytic region  33.98 
 
 		 540 aa  271  2.9999999999999997e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5242  alpha amylase catalytic region  34.75 
 
 		 538 aa  270  4e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1017  alpha amylase catalytic region  33.99 
 
 		 537 aa  270  7e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.487933  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2213  oligo-1,6-glucosidase  33.64 
 
 		 540 aa  270  7e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2736  alpha amylase, catalytic region  33.93 
 
 		 543 aa  269  1e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.70509  normal  0.436177 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0021  alpha amylase catalytic region  32.96 
 
 		 530 aa  266  7e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193993  normal  0.266827 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>