More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12496 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12496  alpha-glucosidase aglA (maltase)  100 
 
 
546 aa  1094    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.447411  normal  0.123805 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3611  alpha amylase, catalytic region  71.4 
 
 
539 aa  725    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.275383  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1390  alpha amylase catalytic region  63.45 
 
 
533 aa  688    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.794681  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2030  alpha amylase catalytic region  64.76 
 
 
587 aa  693    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3684  alpha amylase, catalytic region  71.4 
 
 
539 aa  725    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.942466  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1134  alpha amylase catalytic region  63.08 
 
 
531 aa  659    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.746257  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3616  alpha amylase, catalytic region  71.4 
 
 
539 aa  725    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.381116 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1532  alpha amylase catalytic region  60.71 
 
 
532 aa  593  1e-168  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0695  alpha amylase catalytic region  55.51 
 
 
533 aa  556  1e-157  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.497083 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11590  glycosidase  56.98 
 
 
522 aa  551  1e-155  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0833  alpha-glucosidase  57.71 
 
 
544 aa  545  1e-154  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5893  alpha amylase catalytic region  54.83 
 
 
507 aa  533  1e-150  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.186774 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2176  alpha amylase catalytic region  51.98 
 
 
567 aa  528  1e-148  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.374326  normal  0.160369 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1739  alpha amylase catalytic region  55.73 
 
 
550 aa  520  1e-146  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000285446  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3342  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  54.2 
 
 
538 aa  521  1e-146  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.292623  normal  0.0532512 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3302  alpha amylase catalytic region  49.63 
 
 
566 aa  510  1e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.15105  normal  0.0149256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8467  alpha amylase catalytic region  51.01 
 
 
544 aa  506  9.999999999999999e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0947398 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2164  alpha amylase catalytic region  50.45 
 
 
571 aa  501  1e-140  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.126804  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1883  alpha amylase catalytic region  52.91 
 
 
538 aa  494  9.999999999999999e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.681572 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0775  alpha amylase, catalytic region  50.28 
 
 
534 aa  493  9.999999999999999e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1529  alpha amylase catalytic region  47.71 
 
 
593 aa  488  1e-137  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.331611  normal  0.956497 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0801  alpha amylase, catalytic region  50.36 
 
 
543 aa  488  1e-137  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.235668  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3708  alpha amylase catalytic region  51.58 
 
 
549 aa  486  1e-136  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0503251  hitchhiker  0.00685051 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2981  alpha amylase catalytic region  50.92 
 
 
540 aa  487  1e-136  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000947876  normal  0.0148383 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13840  glycosidase  46.77 
 
 
605 aa  486  1e-136  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384787  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7356  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  53.4 
 
 
511 aa  487  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3700  alpha amylase catalytic region  48.8 
 
 
560 aa  480  1e-134  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.715458  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6925  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  51.53 
 
 
545 aa  477  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179369  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3695  alpha amylase catalytic region  50.09 
 
 
524 aa  478  1e-133  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.660519  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2111  alpha amylase catalytic region  51.7 
 
 
555 aa  473  1e-132  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2546  alpha amylase, catalytic region  49.64 
 
 
561 aa  473  1e-132  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0745  alpha amylase catalytic region  48.54 
 
 
543 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.215044  hitchhiker  0.000627206 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02470  Alpha-glucosidase  47.24 
 
 
576 aa  468  9.999999999999999e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.914818  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5859  alpha amylase catalytic region  49.37 
 
 
558 aa  467  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.63248 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3038  alpha amylase, catalytic region  45.92 
 
 
568 aa  468  9.999999999999999e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08990  glycosidase  46.55 
 
 
570 aa  462  1e-129  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.134217  normal  0.0194138 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3849  alpha amylase, catalytic region  48.81 
 
 
554 aa  464  1e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0257835 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0062  alpha amylase catalytic region  47.37 
 
 
553 aa  459  9.999999999999999e-129  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.3547  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5316  alpha amylase catalytic region  50.36 
 
 
594 aa  461  9.999999999999999e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0561676  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1150  alpha amylase, catalytic region  50 
 
 
634 aa  455  1e-127  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2798  alpha amylase catalytic region  49.72 
 
 
548 aa  457  1e-127  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3603  alpha amylase catalytic region  45.85 
 
 
572 aa  456  1e-127  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12260  glycosidase  45.99 
 
 
563 aa  457  1e-127  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.203639  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5406  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  48.51 
 
 
512 aa  457  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3357  alpha amylase catalytic region  47.45 
 
 
539 aa  453  1.0000000000000001e-126  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.925027  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3538  alpha amylase catalytic region  48.91 
 
 
546 aa  454  1.0000000000000001e-126  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.489113  normal  0.592754 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51470  Alpha-glucosidase  46.79 
 
 
565 aa  453  1.0000000000000001e-126  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01920  glycosidase  45.22 
 
 
607 aa  452  1.0000000000000001e-126  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1785  alpha amylase catalytic region  48.66 
 
 
599 aa  449  1e-125  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.326803 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6968  alpha amylase catalytic region  47.5 
 
 
561 aa  444  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.144872  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2746  alpha amylase catalytic region  44.07 
 
 
570 aa  445  1e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00507625 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27360  glycosidase  48.61 
 
 
554 aa  437  1e-121  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.155559  normal  0.548604 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3300  alpha amylase catalytic region  48.63 
 
 
560 aa  432  1e-120  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.522775  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0622  alpha amylase catalytic region  45.58 
 
 
609 aa  429  1e-119  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.653551 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0412  alpha amylase, catalytic region  45.25 
 
 
640 aa  430  1e-119  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2158  alpha amylase catalytic region  46.34 
 
 
542 aa  429  1e-119  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0743  alpha amylase, catalytic region  44.71 
 
 
573 aa  426  1e-118  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.802881  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1794  alpha amylase catalytic region  47.72 
 
 
543 aa  420  1e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.209676  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1017  alpha amylase catalytic region  45.77 
 
 
544 aa  416  9.999999999999999e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.503917 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00610  alpha-glucosidase, putative  41.29 
 
 
563 aa  412  1e-114  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.260556  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24650  glycosidase  46.13 
 
 
567 aa  415  1e-114  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1495  glycosidase  44.73 
 
 
556 aa  411  1e-113  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22590  glycosidase  48.84 
 
 
555 aa  405  1.0000000000000001e-112  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.144788  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1323  alpha-amylase  42.05 
 
 
604 aa  402  1e-111  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2119  alpha amylase catalytic region  45.29 
 
 
560 aa  398  1e-109  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4692  alpha amylase catalytic region  43.54 
 
 
580 aa  391  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.375992  normal  0.284886 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4117  alpha amylase catalytic region  46.69 
 
 
548 aa  384  1e-105  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.357071  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1017  alpha amylase catalytic region  42.16 
 
 
537 aa  345  1e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.487933  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3687  alpha amylase, catalytic region  41.75 
 
 
540 aa  342  8e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2833  alpha amylase catalytic region  40.11 
 
 
548 aa  341  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.518671  normal  0.538121 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3104  trehalose-6-phosphate hydrolase  44.56 
 
 
515 aa  340  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0986221  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1475  alpha amylase catalytic region  42.74 
 
 
553 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3307  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  42.66 
 
 
735 aa  337  2.9999999999999997e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.081208  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4274  alpha amylase catalytic region  42.69 
 
 
529 aa  337  5e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3102  alpha amylase catalytic region  39.44 
 
 
548 aa  334  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.355967  normal  0.289712 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0307  alpha amylase catalytic subunit  40.81 
 
 
525 aa  334  3e-90  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0777  alpha amylase catalytic region  41.13 
 
 
532 aa  333  4e-90  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.876516  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2320  alpha amylase catalytic region  40.79 
 
 
547 aa  329  7e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.80263 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0261  alpha amylase  40 
 
 
537 aa  327  4.0000000000000003e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4089  alpha amylase catalytic region  40.15 
 
 
540 aa  327  5e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1662  alpha amylase, catalytic region  38.49 
 
 
544 aa  326  6e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.723863  normal  0.697753 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0358  alpha amylase catalytic region  39.06 
 
 
550 aa  326  7e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.404275 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4891  alpha amylase, catalytic region  39.85 
 
 
538 aa  326  7e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5268  alpha amylase catalytic region  45.9 
 
 
540 aa  326  7e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0921  alpha amylase  40.26 
 
 
568 aa  324  2e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0194055 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0835  alpha amylase catalytic region  40.61 
 
 
549 aa  324  3e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0356  alpha amylase, catalytic region  38.92 
 
 
564 aa  324  3e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171609  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3300  alpha-glucosidase  39.64 
 
 
555 aa  323  4e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2088  alpha amylase catalytic region  38.3 
 
 
541 aa  323  6e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.800572  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0601  alpha-glucosidase  37.99 
 
 
540 aa  322  9.999999999999999e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.642438 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0390  alpha amylase catalytic region  38.49 
 
 
550 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.622906  normal  0.263526 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1889  alpha amylase, catalytic region  38.64 
 
 
541 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0672  alpha amylase, catalytic region  41.53 
 
 
533 aa  320  3e-86  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.227468 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2736  alpha amylase, catalytic region  39.39 
 
 
543 aa  319  7.999999999999999e-86  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.70509  normal  0.436177 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2302  alpha amylase catalytic region  42.59 
 
 
518 aa  319  7.999999999999999e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5769  alpha amylase catalytic region  39.72 
 
 
535 aa  318  1e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2213  oligo-1,6-glucosidase  40.04 
 
 
540 aa  318  2e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0984  alpha amylase family protein  37.92 
 
 
538 aa  317  3e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1595  alpha amylase catalytic region  45.15 
 
 
528 aa  317  5e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0451037 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3077  alpha amylase catalytic region  43.31 
 
 
535 aa  317  5e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0346516 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>