More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0412 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_2176  alpha amylase catalytic region  61.18 
 
 		 567 aa  691    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.374326  normal  0.160369 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13840  glycosidase  58.83 
 
 		 605 aa  669    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384787  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01920  glycosidase  59.7 
 
 		 607 aa  672    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0412  alpha amylase, catalytic region  100 
 
 		 640 aa  1281    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1529  alpha amylase catalytic region  58.29 
 
 		 593 aa  659    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.331611  normal  0.956497 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0622  alpha amylase catalytic region  75.33 
 
 		 609 aa  889    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.653551 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2164  alpha amylase catalytic region  59.93 
 
 		 571 aa  654    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.126804  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51470  Alpha-glucosidase  58.35 
 
 		 565 aa  625  1e-178  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3302  alpha amylase catalytic region  56.05 
 
 		 566 aa  623  1e-177  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.15105  normal  0.0149256 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02470  Alpha-glucosidase  57.04 
 
 		 576 aa  606  9.999999999999999e-173  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.914818  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1785  alpha amylase catalytic region  58.29 
 
 		 599 aa  603  1.0000000000000001e-171  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.326803 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08990  glycosidase  52.52 
 
 		 570 aa  580  1e-164  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.134217  normal  0.0194138 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12260  glycosidase  53.98 
 
 		 563 aa  577  1.0000000000000001e-163  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.203639  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0743  alpha amylase, catalytic region  54.65 
 
 		 573 aa  566  1e-160  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.802881  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3538  alpha amylase catalytic region  56.01 
 
 		 546 aa  560  1e-158  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.489113  normal  0.592754 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0695  alpha amylase catalytic region  51.84 
 
 		 533 aa  556  1e-157  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.497083 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5893  alpha amylase catalytic region  52.74 
 
 		 507 aa  545  1e-154  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.186774 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0833  alpha-glucosidase  53.15 
 
 		 544 aa  536  1e-151  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0775  alpha amylase, catalytic region  52.85 
 
 		 534 aa  532  1e-150  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11590  glycosidase  51.36 
 
 		 522 aa  520  1e-146  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2981  alpha amylase catalytic region  48.52 
 
 		 540 aa  510  1e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000947876  normal  0.0148383 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3038  alpha amylase, catalytic region  48.81 
 
 		 568 aa  510  1e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3342  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  49.66 
 
 		 538 aa  506  9.999999999999999e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.292623  normal  0.0532512 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1883  alpha amylase catalytic region  49.2 
 
 		 538 aa  503  1e-141  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.681572 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6925  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  49.06 
 
 		 545 aa  500  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2111  alpha amylase catalytic region  51.35 
 
 		 555 aa  501  1e-140  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3357  alpha amylase catalytic region  48.71 
 
 		 539 aa  501  1e-140  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.925027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1739  alpha amylase catalytic region  48.89 
 
 		 550 aa  500  1e-140  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000285446  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3700  alpha amylase catalytic region  47 
 
 		 560 aa  495  1e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.715458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2746  alpha amylase catalytic region  47.09 
 
 		 570 aa  491  1e-137  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00507625 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22590  glycosidase  51.83 
 
 		 555 aa  489  1e-137  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.144788  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3849  alpha amylase, catalytic region  48.54 
 
 		 554 aa  489  1e-137  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0257835 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0745  alpha amylase catalytic region  49.73 
 
 		 543 aa  488  1e-136  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.215044  hitchhiker  0.000627206 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2546  alpha amylase, catalytic region  49.66 
 
 		 561 aa  485  1e-136  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8467  alpha amylase catalytic region  46.99 
 
 		 544 aa  484  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0947398 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0801  alpha amylase, catalytic region  50.75 
 
 		 543 aa  482  1e-135  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.235668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3708  alpha amylase catalytic region  46.68 
 
 		 549 aa  480  1e-134  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0503251  hitchhiker  0.00685051 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3603  alpha amylase catalytic region  46.84 
 
 		 572 aa  481  1e-134  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1390  alpha amylase catalytic region  46.11 
 
 		 533 aa  478  1e-133  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.794681  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3695  alpha amylase catalytic region  47.99 
 
 		 524 aa  475  1e-133  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.660519  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1134  alpha amylase catalytic region  47.68 
 
 		 531 aa  470  1.0000000000000001e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.746257  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5859  alpha amylase catalytic region  46.7 
 
 		 558 aa  471  1.0000000000000001e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.63248 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24650  glycosidase  47.12 
 
 		 567 aa  466  9.999999999999999e-131  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27360  glycosidase  46.25 
 
 		 554 aa  463  1e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.155559  normal  0.548604 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0062  alpha amylase catalytic region  46.52 
 
 		 553 aa  464  1e-129  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.3547  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7356  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  47.33 
 
 		 511 aa  462  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00610  alpha-glucosidase, putative  43.95 
 
 		 563 aa  460  9.999999999999999e-129  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.260556  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3300  alpha amylase catalytic region  48.1 
 
 		 560 aa  457  1e-127  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.522775  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2030  alpha amylase catalytic region  45.55 
 
 		 587 aa  454  1.0000000000000001e-126  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2158  alpha amylase catalytic region  47.38 
 
 		 542 aa  450  1e-125  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6968  alpha amylase catalytic region  44.67 
 
 		 561 aa  445  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.144872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1532  alpha amylase catalytic region  48.97 
 
 		 532 aa  445  1e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1323  alpha-amylase  42.63 
 
 		 604 aa  433  1e-120  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2798  alpha amylase catalytic region  46.01 
 
 		 548 aa  432  1e-120  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5406  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  43.89 
 
 		 512 aa  432  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12496  alpha-glucosidase aglA (maltase)  45.77 
 
 		 546 aa  429  1e-119  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.447411  normal  0.123805 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3611  alpha amylase, catalytic region  45.45 
 
 		 539 aa  428  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.275383  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3684  alpha amylase, catalytic region  45.45 
 
 		 539 aa  428  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.942466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3616  alpha amylase, catalytic region  45.94 
 
 		 539 aa  428  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.381116 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1017  alpha amylase catalytic region  43.5 
 
 		 544 aa  425  1e-117  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.503917 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2119  alpha amylase catalytic region  47.03 
 
 		 560 aa  424  1e-117  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1495  glycosidase  42.71 
 
 		 556 aa  421  1e-116  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4692  alpha amylase catalytic region  44.08 
 
 		 580 aa  416  9.999999999999999e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.375992  normal  0.284886 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1150  alpha amylase, catalytic region  46.93 
 
 		 634 aa  407  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5316  alpha amylase catalytic region  46.41 
 
 		 594 aa  400  9.999999999999999e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0561676  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4117  alpha amylase catalytic region  46.14 
 
 		 548 aa  389  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.357071  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1794  alpha amylase catalytic region  42.03 
 
 		 543 aa  386  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.209676  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3687  alpha amylase, catalytic region  37.66 
 
 		 540 aa  338  1.9999999999999998e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0777  alpha amylase catalytic region  38.84 
 
 		 532 aa  336  7.999999999999999e-91  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.876516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1475  alpha amylase catalytic region  37.72 
 
 		 553 aa  333  5e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2833  alpha amylase catalytic region  38.3 
 
 		 548 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.518671  normal  0.538121 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4891  alpha amylase, catalytic region  38.38 
 
 		 538 aa  322  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0307  alpha amylase catalytic subunit  37.96 
 
 		 525 aa  320  7e-86  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2320  alpha amylase catalytic region  39.89 
 
 		 547 aa  319  7.999999999999999e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.80263 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5268  alpha amylase catalytic region  39.24 
 
 		 540 aa  318  2e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5769  alpha amylase catalytic region  35.76 
 
 		 535 aa  318  3e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0942  oligo-1,6-glucosidase, putative  38.91 
 
 		 539 aa  317  6e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3077  alpha amylase catalytic region  40.2 
 
 		 535 aa  314  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2736  alpha amylase, catalytic region  37.78 
 
 		 543 aa  313  4.999999999999999e-84  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.70509  normal  0.436177 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3102  alpha amylase catalytic region  38.84 
 
 		 548 aa  313  5.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.355967  normal  0.289712 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3104  trehalose-6-phosphate hydrolase  39.27 
 
 		 515 aa  312  1e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0986221  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0107  alpha amylase catalytic region  36.06 
 
 		 543 aa  308  2.0000000000000002e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0636933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3863  alpha amylase catalytic region  39.73 
 
 		 541 aa  308  2.0000000000000002e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00249861  normal  0.684332 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1931  alpha amylase, catalytic region  39.03 
 
 		 541 aa  307  5.0000000000000004e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.126366  normal  0.0171494 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0416  alpha amylase catalytic region  38.41 
 
 		 557 aa  306  7e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3300  alpha-glucosidase  36.48 
 
 		 555 aa  305  1.0000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5528  alpha amylase catalytic region  36.1 
 
 		 545 aa  305  1.0000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.283745  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1969  alpha amylase catalytic region  36.75 
 
 		 536 aa  305  1.0000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.786718  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0672  alpha amylase, catalytic region  38.18 
 
 		 533 aa  305  1.0000000000000001e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.227468 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0917  alpha amylase, catalytic region  38.67 
 
 		 542 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2303  alpha amylase catalytic region  39.89 
 
 		 448 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.190789 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4089  alpha amylase catalytic region  38.11 
 
 		 540 aa  303  8.000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1988  alpha amylase catalytic region  41.34 
 
 		 546 aa  302  1e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4274  alpha amylase catalytic region  38.69 
 
 		 529 aa  301  4e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1595  alpha amylase catalytic region  38.86 
 
 		 528 aa  300  8e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0451037 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0810  alpha amylase, catalytic region  39.41 
 
 		 540 aa  299  1e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.553058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0021  alpha amylase catalytic region  34.43 
 
 		 530 aa  296  1e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193993  normal  0.266827 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0261  alpha amylase  37.22 
 
 		 537 aa  294  3e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1949  alpha amylase protein  36.14 
 
 		 553 aa  294  4e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.342567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0226  alpha amylase catalytic region  36.03 
 
 		 537 aa  293  5e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.547651 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>