More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3603 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3300  alpha amylase catalytic region  61.9 
 
 		 560 aa  660    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.522775  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00610  alpha-glucosidase, putative  57.73 
 
 		 563 aa  655    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.260556  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24650  glycosidase  66.21 
 
 		 567 aa  717    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3603  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 572 aa  1159    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2746  alpha amylase catalytic region  73.65 
 
 		 570 aa  844    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00507625 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3038  alpha amylase, catalytic region  75.57 
 
 		 568 aa  880    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2119  alpha amylase catalytic region  60.79 
 
 		 560 aa  605  9.999999999999999e-173  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1323  alpha-amylase  50 
 
 		 604 aa  549  1e-155  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3357  alpha amylase catalytic region  51.62 
 
 		 539 aa  544  1e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.925027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3302  alpha amylase catalytic region  51.56 
 
 		 566 aa  534  1e-150  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.15105  normal  0.0149256 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2176  alpha amylase catalytic region  51.03 
 
 		 567 aa  525  1e-148  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.374326  normal  0.160369 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2164  alpha amylase catalytic region  51.13 
 
 		 571 aa  516  1.0000000000000001e-145  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.126804  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12260  glycosidase  50.69 
 
 		 563 aa  509  1e-143  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.203639  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0695  alpha amylase catalytic region  50.8 
 
 		 533 aa  510  1e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.497083 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0833  alpha-glucosidase  52.5 
 
 		 544 aa  510  1e-143  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5893  alpha amylase catalytic region  50.36 
 
 		 507 aa  505  9.999999999999999e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.186774 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0622  alpha amylase catalytic region  48.07 
 
 		 609 aa  505  9.999999999999999e-143  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.653551 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1529  alpha amylase catalytic region  47.36 
 
 		 593 aa  497  1e-139  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.331611  normal  0.956497 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2981  alpha amylase catalytic region  48.81 
 
 		 540 aa  493  9.999999999999999e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000947876  normal  0.0148383 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51470  Alpha-glucosidase  52.95 
 
 		 565 aa  489  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13840  glycosidase  46.61 
 
 		 605 aa  487  1e-136  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08990  glycosidase  48.4 
 
 		 570 aa  483  1e-135  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.134217  normal  0.0194138 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0743  alpha amylase, catalytic region  50.97 
 
 		 573 aa  484  1e-135  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.802881  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0062  alpha amylase catalytic region  46.92 
 
 		 553 aa  483  1e-135  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.3547  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02470  Alpha-glucosidase  49.13 
 
 		 576 aa  475  1e-133  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.914818  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5859  alpha amylase catalytic region  49.22 
 
 		 558 aa  478  1e-133  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.63248 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2111  alpha amylase catalytic region  47.96 
 
 		 555 aa  473  1e-132  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1495  glycosidase  47.37 
 
 		 556 aa  467  9.999999999999999e-131  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1134  alpha amylase catalytic region  48.31 
 
 		 531 aa  466  9.999999999999999e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.746257  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3700  alpha amylase catalytic region  46.52 
 
 		 560 aa  468  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.715458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11590  glycosidase  49.73 
 
 		 522 aa  464  1e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3849  alpha amylase, catalytic region  50.18 
 
 		 554 aa  463  1e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0257835 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01920  glycosidase  44.3 
 
 		 607 aa  460  9.999999999999999e-129  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3342  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  48.48 
 
 		 538 aa  461  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.292623  normal  0.0532512 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0412  alpha amylase, catalytic region  46.63 
 
 		 640 aa  461  9.999999999999999e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0745  alpha amylase catalytic region  48.12 
 
 		 543 aa  456  1e-127  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.215044  hitchhiker  0.000627206 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2030  alpha amylase catalytic region  46.79 
 
 		 587 aa  458  1e-127  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3538  alpha amylase catalytic region  49.02 
 
 		 546 aa  456  1e-127  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.489113  normal  0.592754 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0775  alpha amylase, catalytic region  47.03 
 
 		 534 aa  455  1e-127  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1739  alpha amylase catalytic region  48.63 
 
 		 550 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000285446  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1390  alpha amylase catalytic region  44.83 
 
 		 533 aa  452  1.0000000000000001e-126  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.794681  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7356  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  50.27 
 
 		 511 aa  454  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5406  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  47.94 
 
 		 512 aa  453  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8467  alpha amylase catalytic region  46.17 
 
 		 544 aa  454  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0947398 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3695  alpha amylase catalytic region  44.86 
 
 		 524 aa  452  1e-125  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.660519  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2546  alpha amylase, catalytic region  47.14 
 
 		 561 aa  449  1e-125  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27360  glycosidase  47.25 
 
 		 554 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.155559  normal  0.548604 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2158  alpha amylase catalytic region  47.14 
 
 		 542 aa  448  1.0000000000000001e-124  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6925  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  47.97 
 
 		 545 aa  447  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179369  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1785  alpha amylase catalytic region  47.22 
 
 		 599 aa  443  1e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.326803 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12496  alpha-glucosidase aglA (maltase)  46.39 
 
 		 546 aa  443  1e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.447411  normal  0.123805 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3708  alpha amylase catalytic region  47.08 
 
 		 549 aa  443  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0503251  hitchhiker  0.00685051 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0801  alpha amylase, catalytic region  48.34 
 
 		 543 aa  444  1e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.235668  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1883  alpha amylase catalytic region  48.5 
 
 		 538 aa  443  1e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.681572 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1532  alpha amylase catalytic region  46.69 
 
 		 532 aa  436  1e-121  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22590  glycosidase  51.77 
 
 		 555 aa  432  1e-120  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.144788  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6968  alpha amylase catalytic region  45.42 
 
 		 561 aa  416  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.144872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2798  alpha amylase catalytic region  45.45 
 
 		 548 aa  416  9.999999999999999e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3611  alpha amylase, catalytic region  45.78 
 
 		 539 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.275383  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3684  alpha amylase, catalytic region  45.78 
 
 		 539 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.942466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3616  alpha amylase, catalytic region  45.78 
 
 		 539 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.381116 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4692  alpha amylase catalytic region  43.64 
 
 		 580 aa  408  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.375992  normal  0.284886 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4117  alpha amylase catalytic region  49.64 
 
 		 548 aa  404  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.357071  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1150  alpha amylase, catalytic region  42.98 
 
 		 634 aa  375  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1017  alpha amylase catalytic region  38.46 
 
 		 544 aa  363  4e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.503917 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5316  alpha amylase catalytic region  41.83 
 
 		 594 aa  362  1e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0561676  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1794  alpha amylase catalytic region  42.07 
 
 		 543 aa  345  8.999999999999999e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.209676  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4891  alpha amylase, catalytic region  37.32 
 
 		 538 aa  326  8.000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3687  alpha amylase, catalytic region  36.84 
 
 		 540 aa  325  2e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1969  alpha amylase catalytic region  40.11 
 
 		 536 aa  323  4e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.786718  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0777  alpha amylase catalytic region  38.38 
 
 		 532 aa  317  3e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.876516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1475  alpha amylase catalytic region  37.52 
 
 		 553 aa  314  2.9999999999999996e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5528  alpha amylase catalytic region  38.77 
 
 		 545 aa  310  5e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.283745  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0307  alpha amylase catalytic subunit  36.36 
 
 		 525 aa  305  1.0000000000000001e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4274  alpha amylase catalytic region  38.72 
 
 		 529 aa  303  8.000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3102  alpha amylase catalytic region  37.39 
 
 		 548 aa  300  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.355967  normal  0.289712 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2833  alpha amylase catalytic region  37 
 
 		 548 aa  301  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.518671  normal  0.538121 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0107  alpha amylase catalytic region  35.58 
 
 		 543 aa  300  4e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0636933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2320  alpha amylase catalytic region  37.34 
 
 		 547 aa  298  2e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.80263 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3300  alpha-glucosidase  37.91 
 
 		 555 aa  298  2e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5242  alpha amylase catalytic region  37.14 
 
 		 538 aa  293  6e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0921  alpha amylase  36.57 
 
 		 568 aa  291  3e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0194055 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0810  alpha amylase, catalytic region  38.48 
 
 		 540 aa  290  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.553058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3863  alpha amylase catalytic region  37.21 
 
 		 541 aa  290  6e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00249861  normal  0.684332 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2294  Alpha amylase, catalytic region  40.57 
 
 		 542 aa  286  5.999999999999999e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.960991  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0184  alpha amylase, catalytic region  35.85 
 
 		 547 aa  286  7e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.341726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1931  alpha amylase, catalytic region  37.15 
 
 		 541 aa  285  1.0000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.126366  normal  0.0171494 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2303  alpha amylase catalytic region  40.45 
 
 		 448 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.190789 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1949  alpha amylase protein  36.69 
 
 		 553 aa  285  2.0000000000000002e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.342567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4089  alpha amylase catalytic region  36.02 
 
 		 540 aa  284  3.0000000000000004e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3304  alpha amylase, catalytic region  36.22 
 
 		 550 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.251779  normal  0.854548 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1649  alpha-glucosidase  36.36 
 
 		 552 aa  283  5.000000000000001e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.856905  hitchhiker  0.000000195123 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0021  alpha amylase catalytic region  33.69 
 
 		 530 aa  282  1e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193993  normal  0.266827 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0672  alpha amylase, catalytic region  35.75 
 
 		 533 aa  282  1e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.227468 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2736  alpha amylase, catalytic region  35 
 
 		 543 aa  282  1e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.70509  normal  0.436177 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5769  alpha amylase catalytic region  35.2 
 
 		 535 aa  281  2e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0788  alpha-glucosidase  34.74 
 
 		 550 aa  280  4e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0942  oligo-1,6-glucosidase, putative  36.09 
 
 		 539 aa  280  6e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2210  alpha amylase catalytic region  36.62 
 
 		 586 aa  279  1e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.408019  hitchhiker  0.00161183 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3104  trehalose-6-phosphate hydrolase  36.38 
 
 		 515 aa  278  2e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0986221  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>