More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_12260 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_2176  alpha amylase catalytic region  59.13 
 
 		 567 aa  635    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.374326  normal  0.160369 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12260  glycosidase  100 
 
 		 563 aa  1130    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.203639  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3302  alpha amylase catalytic region  58.96 
 
 		 566 aa  634  1e-180  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.15105  normal  0.0149256 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2164  alpha amylase catalytic region  59.36 
 
 		 571 aa  608  9.999999999999999e-173  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.126804  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08990  glycosidase  56.65 
 
 		 570 aa  599  1e-170  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.134217  normal  0.0194138 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13840  glycosidase  54.53 
 
 		 605 aa  600  1e-170  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1529  alpha amylase catalytic region  53.27 
 
 		 593 aa  592  1e-168  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.331611  normal  0.956497 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01920  glycosidase  53.72 
 
 		 607 aa  580  1e-164  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5893  alpha amylase catalytic region  55.41 
 
 		 507 aa  564  1.0000000000000001e-159  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.186774 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0695  alpha amylase catalytic region  55.22 
 
 		 533 aa  553  1e-156  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.497083 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1785  alpha amylase catalytic region  56.13 
 
 		 599 aa  553  1e-156  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.326803 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0622  alpha amylase catalytic region  53.46 
 
 		 609 aa  549  1e-155  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.653551 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0412  alpha amylase, catalytic region  53.98 
 
 		 640 aa  545  1e-154  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3538  alpha amylase catalytic region  55.8 
 
 		 546 aa  536  1e-151  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.489113  normal  0.592754 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3342  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  52.67 
 
 		 538 aa  530  1e-149  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.292623  normal  0.0532512 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0833  alpha-glucosidase  55.56 
 
 		 544 aa  530  1e-149  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0745  alpha amylase catalytic region  54 
 
 		 543 aa  528  1e-149  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.215044  hitchhiker  0.000627206 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0801  alpha amylase, catalytic region  54.2 
 
 		 543 aa  531  1e-149  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.235668  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02470  Alpha-glucosidase  52.5 
 
 		 576 aa  526  1e-148  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.914818  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1883  alpha amylase catalytic region  54.03 
 
 		 538 aa  521  1e-146  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.681572 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51470  Alpha-glucosidase  52.94 
 
 		 565 aa  520  1e-146  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3700  alpha amylase catalytic region  51.05 
 
 		 560 aa  518  1e-146  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.715458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0775  alpha amylase, catalytic region  51.25 
 
 		 534 aa  520  1e-146  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3038  alpha amylase, catalytic region  49.91 
 
 		 568 aa  517  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2981  alpha amylase catalytic region  51.96 
 
 		 540 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000947876  normal  0.0148383 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8467  alpha amylase catalytic region  51.89 
 
 		 544 aa  514  1e-144  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0947398 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11590  glycosidase  53.73 
 
 		 522 aa  513  1e-144  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3357  alpha amylase catalytic region  52.9 
 
 		 539 aa  509  1e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.925027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5859  alpha amylase catalytic region  51.43 
 
 		 558 aa  510  1e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.63248 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0743  alpha amylase, catalytic region  53.6 
 
 		 573 aa  511  1e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.802881  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22590  glycosidase  53.75 
 
 		 555 aa  508  9.999999999999999e-143  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.144788  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2111  alpha amylase catalytic region  53.62 
 
 		 555 aa  504  1e-141  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3300  alpha amylase catalytic region  52.02 
 
 		 560 aa  504  1e-141  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.522775  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1739  alpha amylase catalytic region  51.96 
 
 		 550 aa  503  1e-141  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000285446  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3603  alpha amylase catalytic region  50.52 
 
 		 572 aa  496  1e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2746  alpha amylase catalytic region  49.14 
 
 		 570 aa  495  9.999999999999999e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00507625 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1134  alpha amylase catalytic region  50.18 
 
 		 531 aa  486  1e-136  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.746257  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1390  alpha amylase catalytic region  48.46 
 
 		 533 aa  484  1e-135  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.794681  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24650  glycosidase  49.07 
 
 		 567 aa  483  1e-135  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7356  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  52.55 
 
 		 511 aa  483  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2546  alpha amylase, catalytic region  50.9 
 
 		 561 aa  483  1e-135  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00610  alpha-glucosidase, putative  46.94 
 
 		 563 aa  479  1e-134  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.260556  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6925  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  51.32 
 
 		 545 aa  479  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3695  alpha amylase catalytic region  50.09 
 
 		 524 aa  479  1e-134  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.660519  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3849  alpha amylase, catalytic region  49.37 
 
 		 554 aa  479  1e-134  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0257835 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3708  alpha amylase catalytic region  51.74 
 
 		 549 aa  474  1e-132  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0503251  hitchhiker  0.00685051 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2119  alpha amylase catalytic region  50.81 
 
 		 560 aa  472  1e-132  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0062  alpha amylase catalytic region  46.99 
 
 		 553 aa  474  1e-132  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.3547  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27360  glycosidase  49.74 
 
 		 554 aa  464  1e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.155559  normal  0.548604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5406  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  49.91 
 
 		 512 aa  462  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1323  alpha-amylase  46.45 
 
 		 604 aa  461  9.999999999999999e-129  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2030  alpha amylase catalytic region  47.34 
 
 		 587 aa  457  1e-127  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1532  alpha amylase catalytic region  49.47 
 
 		 532 aa  451  1e-125  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1017  alpha amylase catalytic region  45.57 
 
 		 544 aa  446  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.503917 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2798  alpha amylase catalytic region  50.36 
 
 		 548 aa  441  9.999999999999999e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2158  alpha amylase catalytic region  49.36 
 
 		 542 aa  442  9.999999999999999e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1495  glycosidase  47.85 
 
 		 556 aa  436  1e-121  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12496  alpha-glucosidase aglA (maltase)  45.99 
 
 		 546 aa  437  1e-121  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.447411  normal  0.123805 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6968  alpha amylase catalytic region  46.56 
 
 		 561 aa  430  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.144872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5316  alpha amylase catalytic region  52.17 
 
 		 594 aa  429  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0561676  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4692  alpha amylase catalytic region  46.71 
 
 		 580 aa  426  1e-118  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.375992  normal  0.284886 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3611  alpha amylase, catalytic region  45.42 
 
 		 539 aa  422  1e-117  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.275383  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3684  alpha amylase, catalytic region  45.42 
 
 		 539 aa  422  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.942466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3616  alpha amylase, catalytic region  45.42 
 
 		 539 aa  422  1e-117  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.381116 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1150  alpha amylase, catalytic region  45.77 
 
 		 634 aa  416  9.999999999999999e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4117  alpha amylase catalytic region  49.01 
 
 		 548 aa  400  9.999999999999999e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.357071  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1794  alpha amylase catalytic region  44.63 
 
 		 543 aa  367  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.209676  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0307  alpha amylase catalytic subunit  41.37 
 
 		 525 aa  340  4e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0777  alpha amylase catalytic region  42.36 
 
 		 532 aa  339  9.999999999999999e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.876516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2320  alpha amylase catalytic region  41.58 
 
 		 547 aa  338  1.9999999999999998e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.80263 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3300  alpha-glucosidase  41.05 
 
 		 555 aa  324  3e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3687  alpha amylase, catalytic region  41.02 
 
 		 540 aa  324  3e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1475  alpha amylase catalytic region  40.08 
 
 		 553 aa  318  2e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4891  alpha amylase, catalytic region  40 
 
 		 538 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2833  alpha amylase catalytic region  38.03 
 
 		 548 aa  314  2.9999999999999996e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.518671  normal  0.538121 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3102  alpha amylase catalytic region  38.59 
 
 		 548 aa  313  6.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.355967  normal  0.289712 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0021  alpha amylase catalytic region  38.48 
 
 		 530 aa  312  9e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193993  normal  0.266827 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0672  alpha amylase, catalytic region  42.5 
 
 		 533 aa  311  2.9999999999999997e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.227468 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0788  alpha-glucosidase  39.8 
 
 		 550 aa  310  2.9999999999999997e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5268  alpha amylase catalytic region  43.92 
 
 		 540 aa  309  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3307  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  39.96 
 
 		 735 aa  307  4.0000000000000004e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.081208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0917  alpha amylase, catalytic region  41.72 
 
 		 542 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0942  oligo-1,6-glucosidase, putative  38.55 
 
 		 539 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0029  alpha amylase, catalytic region  40.23 
 
 		 536 aa  303  6.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2088  alpha amylase catalytic region  38.09 
 
 		 541 aa  303  6.000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.800572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5769  alpha amylase catalytic region  38.03 
 
 		 535 aa  303  7.000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4274  alpha amylase catalytic region  40.82 
 
 		 529 aa  303  8.000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1370  alpha amylase domain-containing protein  41.29 
 
 		 536 aa  302  1e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3104  trehalose-6-phosphate hydrolase  42.43 
 
 		 515 aa  301  2e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0986221  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0390  alpha amylase catalytic region  38.72 
 
 		 550 aa  301  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.622906  normal  0.263526 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0039  alpha amylase, catalytic region  41.29 
 
 		 536 aa  301  2e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2736  alpha amylase, catalytic region  38.38 
 
 		 543 aa  300  3e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.70509  normal  0.436177 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0358  alpha amylase catalytic region  39.92 
 
 		 550 aa  300  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.404275 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1931  alpha amylase, catalytic region  41.28 
 
 		 541 aa  300  4e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.126366  normal  0.0171494 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1649  alpha-glucosidase  39.29 
 
 		 552 aa  299  8e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.856905  hitchhiker  0.000000195123 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0107  alpha amylase catalytic region  38.87 
 
 		 543 aa  299  1e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0636933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2303  alpha amylase catalytic region  41.45 
 
 		 448 aa  298  2e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.190789 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3863  alpha amylase catalytic region  41.59 
 
 		 541 aa  298  2e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00249861  normal  0.684332 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3304  alpha amylase, catalytic region  39.31 
 
 		 550 aa  297  3e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.251779  normal  0.854548 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3169  alpha amylase, catalytic region  42.18 
 
 		 530 aa  297  3e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>