More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4117 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4117  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 548 aa  1064    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.357071  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2546  alpha amylase, catalytic region  59.3 
 
 		 561 aa  585  1e-166  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3849  alpha amylase, catalytic region  57.8 
 
 		 554 aa  578  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0257835 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3700  alpha amylase catalytic region  53.03 
 
 		 560 aa  538  1e-151  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.715458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8467  alpha amylase catalytic region  55.06 
 
 		 544 aa  535  1e-151  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0947398 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5859  alpha amylase catalytic region  53.31 
 
 		 558 aa  532  1e-150  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.63248 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2176  alpha amylase catalytic region  52.88 
 
 		 567 aa  526  1e-148  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.374326  normal  0.160369 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3302  alpha amylase catalytic region  51.37 
 
 		 566 aa  519  1e-146  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.15105  normal  0.0149256 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0695  alpha amylase catalytic region  52.07 
 
 		 533 aa  514  1e-144  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.497083 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0833  alpha-glucosidase  55.11 
 
 		 544 aa  510  1e-143  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2981  alpha amylase catalytic region  52.45 
 
 		 540 aa  507  9.999999999999999e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000947876  normal  0.0148383 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7356  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  52.79 
 
 		 511 aa  503  1e-141  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0062  alpha amylase catalytic region  52.19 
 
 		 553 aa  504  1e-141  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.3547  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6925  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  52.01 
 
 		 545 aa  499  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3342  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  52.85 
 
 		 538 aa  499  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.292623  normal  0.0532512 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3038  alpha amylase, catalytic region  50.45 
 
 		 568 aa  495  1e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11590  glycosidase  53.47 
 
 		 522 aa  494  9.999999999999999e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0801  alpha amylase, catalytic region  51.79 
 
 		 543 aa  494  9.999999999999999e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.235668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2164  alpha amylase catalytic region  51.77 
 
 		 571 aa  491  1e-137  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.126804  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1739  alpha amylase catalytic region  52.15 
 
 		 550 aa  486  1e-136  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000285446  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51470  Alpha-glucosidase  51.1 
 
 		 565 aa  486  1e-136  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3708  alpha amylase catalytic region  51.58 
 
 		 549 aa  483  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0503251  hitchhiker  0.00685051 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27360  glycosidase  53.97 
 
 		 554 aa  484  1e-135  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.155559  normal  0.548604 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12260  glycosidase  49.01 
 
 		 563 aa  479  1e-134  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.203639  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02470  Alpha-glucosidase  49.63 
 
 		 576 aa  480  1e-134  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.914818  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0745  alpha amylase catalytic region  50.54 
 
 		 543 aa  480  1e-134  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.215044  hitchhiker  0.000627206 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1785  alpha amylase catalytic region  51.64 
 
 		 599 aa  476  1e-133  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.326803 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3695  alpha amylase catalytic region  49.44 
 
 		 524 aa  476  1e-133  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.660519  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2158  alpha amylase catalytic region  53.15 
 
 		 542 aa  477  1e-133  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3538  alpha amylase catalytic region  54.38 
 
 		 546 aa  478  1e-133  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.489113  normal  0.592754 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5406  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  51.85 
 
 		 512 aa  474  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2111  alpha amylase catalytic region  49.36 
 
 		 555 aa  474  1e-132  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13840  glycosidase  47.92 
 
 		 605 aa  472  1e-132  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3603  alpha amylase catalytic region  49.82 
 
 		 572 aa  472  1e-132  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1883  alpha amylase catalytic region  53.09 
 
 		 538 aa  474  1e-132  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.681572 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3300  alpha amylase catalytic region  51.71 
 
 		 560 aa  472  1e-132  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.522775  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5893  alpha amylase catalytic region  49.63 
 
 		 507 aa  471  1.0000000000000001e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.186774 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2798  alpha amylase catalytic region  52.47 
 
 		 548 aa  465  9.999999999999999e-131  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08990  glycosidase  49.54 
 
 		 570 aa  468  9.999999999999999e-131  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.134217  normal  0.0194138 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01920  glycosidase  46.21 
 
 		 607 aa  465  9.999999999999999e-131  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0622  alpha amylase catalytic region  45.7 
 
 		 609 aa  464  1e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.653551 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2746  alpha amylase catalytic region  48.5 
 
 		 570 aa  462  1e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00507625 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1529  alpha amylase catalytic region  45.31 
 
 		 593 aa  457  1e-127  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.331611  normal  0.956497 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1134  alpha amylase catalytic region  49.09 
 
 		 531 aa  453  1.0000000000000001e-126  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.746257  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3357  alpha amylase catalytic region  50.36 
 
 		 539 aa  450  1e-125  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.925027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0775  alpha amylase, catalytic region  48.29 
 
 		 534 aa  452  1e-125  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24650  glycosidase  49.29 
 
 		 567 aa  451  1e-125  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2030  alpha amylase catalytic region  46.88 
 
 		 587 aa  444  1e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0743  alpha amylase, catalytic region  49.81 
 
 		 573 aa  443  1e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.802881  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1532  alpha amylase catalytic region  51.65 
 
 		 532 aa  443  1e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0412  alpha amylase, catalytic region  45.97 
 
 		 640 aa  440  9.999999999999999e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22590  glycosidase  48.28 
 
 		 555 aa  437  1e-121  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.144788  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00610  alpha-glucosidase, putative  42.17 
 
 		 563 aa  433  1e-120  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.260556  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1390  alpha amylase catalytic region  45.42 
 
 		 533 aa  430  1e-119  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.794681  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12496  alpha-glucosidase aglA (maltase)  47.98 
 
 		 546 aa  429  1e-119  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.447411  normal  0.123805 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6968  alpha amylase catalytic region  48.01 
 
 		 561 aa  427  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.144872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5316  alpha amylase catalytic region  47.27 
 
 		 594 aa  427  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0561676  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1150  alpha amylase, catalytic region  47.47 
 
 		 634 aa  422  1e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4692  alpha amylase catalytic region  48.5 
 
 		 580 aa  421  1e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.375992  normal  0.284886 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1323  alpha-amylase  43.17 
 
 		 604 aa  413  1e-114  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2119  alpha amylase catalytic region  47.58 
 
 		 560 aa  412  1e-113  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3611  alpha amylase, catalytic region  46.36 
 
 		 539 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.275383  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3684  alpha amylase, catalytic region  46.36 
 
 		 539 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.942466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3616  alpha amylase, catalytic region  46.36 
 
 		 539 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.381116 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1794  alpha amylase catalytic region  46.98 
 
 		 543 aa  379  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.209676  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1495  glycosidase  44.22 
 
 		 556 aa  380  1e-104  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1017  alpha amylase catalytic region  43.06 
 
 		 544 aa  377  1e-103  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.503917 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0777  alpha amylase catalytic region  38 
 
 		 532 aa  314  1.9999999999999998e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.876516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0307  alpha amylase catalytic subunit  38.63 
 
 		 525 aa  308  1.0000000000000001e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1969  alpha amylase catalytic region  38.06 
 
 		 536 aa  294  2e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.786718  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2736  alpha amylase, catalytic region  38.03 
 
 		 543 aa  293  6e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.70509  normal  0.436177 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3687  alpha amylase, catalytic region  36.31 
 
 		 540 aa  292  1e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2302  alpha amylase catalytic region  41.42 
 
 		 518 aa  288  2e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0672  alpha amylase, catalytic region  38.3 
 
 		 533 aa  286  5e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.227468 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3300  alpha-glucosidase  36.78 
 
 		 555 aa  286  8e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0835  alpha amylase catalytic region  38.98 
 
 		 549 aa  284  3.0000000000000004e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5769  alpha amylase catalytic region  35.95 
 
 		 535 aa  281  3e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3104  trehalose-6-phosphate hydrolase  41.49 
 
 		 515 aa  280  4e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0986221  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3307  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  38.56 
 
 		 735 aa  279  8e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.081208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2320  alpha amylase catalytic region  39.52 
 
 		 547 aa  279  1e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.80263 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1475  alpha amylase catalytic region  36.6 
 
 		 553 aa  277  3e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4274  alpha amylase catalytic region  37.84 
 
 		 529 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4089  alpha amylase catalytic region  36.75 
 
 		 540 aa  275  2.0000000000000002e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0226  alpha amylase catalytic region  37.71 
 
 		 537 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.547651 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1595  alpha amylase catalytic region  40.18 
 
 		 528 aa  272  1e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0451037 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3102  alpha amylase catalytic region  35.5 
 
 		 548 aa  271  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.355967  normal  0.289712 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2303  alpha amylase catalytic region  40.66 
 
 		 448 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.190789 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5528  alpha amylase catalytic region  37.5 
 
 		 545 aa  270  5e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.283745  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0942  oligo-1,6-glucosidase, putative  36.1 
 
 		 539 aa  269  8.999999999999999e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1017  alpha amylase catalytic region  37.5 
 
 		 537 aa  269  1e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.487933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0788  alpha-glucosidase  35.04 
 
 		 550 aa  268  2e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2833  alpha amylase catalytic region  35.5 
 
 		 548 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.518671  normal  0.538121 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08330  sucrose isomerase  35.32 
 
 		 600 aa  266  5e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5268  alpha amylase catalytic region  39.27 
 
 		 540 aa  266  5.999999999999999e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3077  alpha amylase catalytic region  40.72 
 
 		 535 aa  266  8e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0021  alpha amylase catalytic region  32.96 
 
 		 530 aa  265  1e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193993  normal  0.266827 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0356  alpha amylase, catalytic region  34.35 
 
 		 564 aa  265  2e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171609  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2294  Alpha amylase, catalytic region  38.29 
 
 		 542 aa  264  3e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.960991  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0921  alpha amylase  34.85 
 
 		 568 aa  264  3e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0194055 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004234  trehalose-6-phosphate hydrolase  33.21 
 
 		 561 aa  263  4e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0161937  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>