More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2341 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1406  alpha amylase catalytic region  55.66 
 
 
555 aa  664    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0481  glycosyl hydrolase family protein  57.27 
 
 
554 aa  652    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000250656  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0357  glycosyl hydrolase family protein  57.45 
 
 
554 aa  656    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000071861  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0347  alpha-glucosidase  57.45 
 
 
554 aa  656    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000225343  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0343  alpha-glucosidase  57.45 
 
 
554 aa  654    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000029424  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0413  glycosyl hydrolase family protein  57.45 
 
 
554 aa  656    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000830485 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0354  alpha amylase catalytic region  56.36 
 
 
554 aa  649    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0371  glycosyl hydrolase family protein  57.45 
 
 
554 aa  656    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000236448  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0427  glycosyl hydrolase family protein  56.36 
 
 
554 aa  640    Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000114694  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2341  alpha amylase catalytic region  100 
 
 
554 aa  1149    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4891  glycosyl hydrolase family protein  56.55 
 
 
554 aa  642    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000186881  normal  0.167059 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0421  putative oligo-1,6-glucosidase  55.72 
 
 
554 aa  640    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.591118  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0417  oligo-1,6-glucosidase  55.9 
 
 
554 aa  643    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0601  alpha amylase catalytic region  56.91 
 
 
554 aa  659    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199149  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0470  glycosyl hydrolase family protein  57.45 
 
 
554 aa  656    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0352  alpha amylase catalytic region  56.18 
 
 
554 aa  643    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00857994  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2521  alpha amylase catalytic region  52 
 
 
556 aa  614  9.999999999999999e-175  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2381  alpha-D-1,4-glucosidase  52.24 
 
 
568 aa  605  9.999999999999999e-173  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1564  alpha-D-1,4-glucosidase  52.37 
 
 
549 aa  581  1e-164  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1595  alpha-D-1,4-glucosidase  52.37 
 
 
549 aa  581  1e-164  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1070  alpha-glucosidase  51.84 
 
 
551 aa  576  1.0000000000000001e-163  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.297332  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2048  alpha amylase catalytic region  49.18 
 
 
572 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.105277  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2716  alpha amylase catalytic region  48.65 
 
 
559 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0292835  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0526  alpha amylase catalytic region  48.11 
 
 
562 aa  535  1e-151  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0165  alpha amylase catalytic region  49.28 
 
 
557 aa  529  1e-149  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000167663  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4140  oligo-1,6-glucosidase  48.47 
 
 
558 aa  529  1e-149  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000871956  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4066  oligo-1,6-glucosidase  48.11 
 
 
558 aa  526  1e-148  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.828435  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22530  alpha amylase catalytic region  46.88 
 
 
562 aa  525  1e-148  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4034  oligo-1,6-glucosidase  48.29 
 
 
558 aa  526  1e-148  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3843  alpha amylase catalytic region  48.11 
 
 
558 aa  526  1e-148  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00167819  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1118  oligo-1,6-glucosidase  47.57 
 
 
558 aa  522  1e-147  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00264328  normal  0.397885 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3924  oligo-1,6-glucosidase  48.11 
 
 
558 aa  524  1e-147  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.12031  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3756  oligo-1,6-glucosidase  48.11 
 
 
558 aa  525  1e-147  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000260004  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3772  oligo-1,6-glucosidase  47.93 
 
 
558 aa  523  1e-147  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.719962  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4231  oligo-1,6-glucosidase  48.11 
 
 
558 aa  524  1e-147  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24722  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4121  oligo-1,6-glucosidase  47.39 
 
 
558 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00158128  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1621  alpha,alpha-phosphotrehalase  46.02 
 
 
563 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.459004  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2553  alpha,alpha-phosphotrehalase  45.1 
 
 
563 aa  487  1e-136  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4926  alpha amylase catalytic region  41.93 
 
 
578 aa  486  1e-136  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0899  trehalose-6-phosphate hydrolase  44.5 
 
 
560 aa  485  1e-136  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0897  trehalose-6-phosphate hydrolase  44.95 
 
 
556 aa  483  1e-135  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.175919  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3323  alpha amylase catalytic region  41.4 
 
 
570 aa  477  1e-133  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09460  alpha amylase catalytic region  44.01 
 
 
563 aa  473  1e-132  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0188478  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2932  alpha amylase catalytic region  41.67 
 
 
557 aa  466  9.999999999999999e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2342  alpha amylase catalytic region  43.92 
 
 
538 aa  463  1e-129  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0083  alpha amylase, catalytic region  43.35 
 
 
560 aa  465  1e-129  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0810365  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2519  alpha amylase  42.39 
 
 
582 aa  461  9.999999999999999e-129  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.252753 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2383  dextran glucosidase  42.75 
 
 
566 aa  460  9.999999999999999e-129  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0052  alpha amylase catalytic region  41.75 
 
 
577 aa  460  9.999999999999999e-129  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1154  alpha amylase catalytic region  41.62 
 
 
577 aa  457  1e-127  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.144841  decreased coverage  0.0000326761 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08330  sucrose isomerase  40.51 
 
 
600 aa  457  1e-127  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1851  trehalose-6-phosphate hydrolase  45.3 
 
 
531 aa  456  1e-127  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004234  trehalose-6-phosphate hydrolase  41.99 
 
 
561 aa  452  1.0000000000000001e-126  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0161937  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0913  alpha amylase, catalytic region  38.86 
 
 
622 aa  455  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0051  alpha amylase catalytic region  40.96 
 
 
590 aa  454  1.0000000000000001e-126  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.237414 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3009  alpha amylase catalytic region  40.72 
 
 
555 aa  455  1.0000000000000001e-126  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01206  hypothetical protein  41.39 
 
 
561 aa  450  1e-125  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2908  trehalose-6-phosphate hydrolase  41.86 
 
 
562 aa  449  1e-125  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.812493  normal  0.508935 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0222  trehalose-6-phosphate hydrolase  42.09 
 
 
538 aa  448  1.0000000000000001e-124  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000721173  hitchhiker  0.00000000000157233 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1378  alpha amylase catalytic region  43.27 
 
 
553 aa  443  1e-123  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000100533  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1924  glucan 1,6-alpha-glucosidase  42.52 
 
 
535 aa  441  9.999999999999999e-123  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4886  alpha amylase catalytic region  40.6 
 
 
571 aa  441  9.999999999999999e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0578  trehalose-6-phosphate hydrolase  42.22 
 
 
556 aa  438  1e-121  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0518  trehalose-6-phosphate hydrolase  40.29 
 
 
560 aa  437  1e-121  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000559563  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0433  trehalose-6-phosphate hydrolase  39.93 
 
 
562 aa  436  1e-121  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000180763  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0545  alpha,alpha-phosphotrehalase  41 
 
 
553 aa  431  1e-119  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0040  glucosidase  40.86 
 
 
556 aa  431  1e-119  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0828  trehalose-6-phosphate hydrolase  41.4 
 
 
556 aa  431  1e-119  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0959378  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1497  glycosidase  40.2 
 
 
606 aa  431  1e-119  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.990687  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3625  alpha amylase catalytic region  39.54 
 
 
571 aa  425  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0243  alpha amylase catalytic region  42.78 
 
 
536 aa  425  1e-117  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31510  glycosidase  39.79 
 
 
596 aa  423  1e-117  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.382371  normal  0.756128 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0303  alpha amylase catalytic region  41.29 
 
 
557 aa  424  1e-117  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0523  trehalose-6-phosphate hydrolase  39.96 
 
 
560 aa  424  1e-117  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2260  alpha amylase catalytic region  38.49 
 
 
552 aa  419  1e-116  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0144984  normal  0.633948 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2758  trehalose-6-phosphate hydrolase  39.16 
 
 
563 aa  419  1e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1848  alpha-glucosidase  41.53 
 
 
541 aa  419  1e-116  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0599  trehalose-6-phosphate hydrolase  41.23 
 
 
553 aa  414  1e-114  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0543  alpha,alpha-phosphotrehalase (trehalose-6-phosphate hydrolase)  41.23 
 
 
553 aa  414  1e-114  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0543  alpha,alpha-phosphotrehalase (trehalose-6-phosphate hydrolase)  41.41 
 
 
553 aa  414  1e-114  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2575  alpha amylase catalytic region  39.16 
 
 
604 aa  412  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.260702  normal  0.580332 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0528  trehalose-6-phosphate hydrolase  38.73 
 
 
554 aa  414  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.664084  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0632  trehalose-6-phosphate hydrolase  41.23 
 
 
553 aa  414  1e-114  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5761  trehalose-6-phosphate hydrolase  38.41 
 
 
551 aa  414  1e-114  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.748972  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0687  alpha,alpha-phosphotrehalase  40.94 
 
 
553 aa  414  1e-114  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0668  alpha,alpha-phosphotrehalase  41.08 
 
 
553 aa  409  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0761  alpha,alpha-phosphotrehalase  41.23 
 
 
553 aa  409  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4720  trehalose-6-phosphate hydrolase  37.91 
 
 
551 aa  409  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.782883 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4811  trehalose-6-phosphate hydrolase  38.41 
 
 
551 aa  409  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1934  alpha amylase catalytic region  39.05 
 
 
643 aa  409  1e-113  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3772  trehalose-6-phosphate hydrolase  38.59 
 
 
551 aa  411  1e-113  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4855  trehalose-6-phosphate hydrolase  38.55 
 
 
550 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0911834  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42120  alpha-glucosidase maltase  42.23 
 
 
572 aa  411  1e-113  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.217758  normal  0.25099 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4844  trehalose-6-phosphate hydrolase  38.52 
 
 
551 aa  410  1e-113  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.257097  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04107  trehalose-6-P hydrolase  38.04 
 
 
551 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29292  alpha-D-glucosidase (maltase) ( alpha-amylase) (MALT) (MAZS)  41.32 
 
 
573 aa  409  1.0000000000000001e-112  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.370606  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4834  trehalose-6-phosphate hydrolase  38.55 
 
 
550 aa  409  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4669  alpha,alpha-phosphotrehalase  40.94 
 
 
553 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.2503e-20 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0494  trehalose-6-phosphate hydrolase  38.69 
 
 
553 aa  407  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60352  alpha-glucosidase maltase  42.06 
 
 
572 aa  408  1.0000000000000001e-112  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>