More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3195 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3195  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  100 
 
 
1193 aa  2436    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0557  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  41.41 
 
 
1175 aa  960    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.641532  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1458  alpha amylase, catalytic region  50.47 
 
 
651 aa  630  1e-179  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0084  pullulanase  42.95 
 
 
606 aa  528  1e-148  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1046  4-alpha-glucanotransferase  37.82 
 
 
1145 aa  503  1e-140  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0433  4-alpha-glucanotransferase  47.11 
 
 
504 aa  459  1e-127  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.459094  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1459  4-alpha-glucanotransferase  45.54 
 
 
499 aa  442  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2645  4-alpha-glucanotransferase  44.46 
 
 
516 aa  430  1e-119  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.219759  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1708  4-alpha-glucanotransferase  43.41 
 
 
501 aa  425  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.24711  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1690  4-alpha-glucanotransferase  43.41 
 
 
501 aa  425  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  37.05 
 
 
1847 aa  423  1e-117  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1575  4-alpha-glucanotransferase  45.59 
 
 
512 aa  410  1e-113  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.737195  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1002  4-alpha-glucanotransferase  42 
 
 
514 aa  409  1.0000000000000001e-112  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0388229  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0729  amylopullulanase  37.7 
 
 
600 aa  407  1.0000000000000001e-112  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00401162  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2333  4-alpha-glucanotransferase  41.3 
 
 
497 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1822  4-alpha-glucanotransferase  42.01 
 
 
505 aa  399  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2912  4-alpha-glucanotransferase  40.55 
 
 
519 aa  398  1e-109  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2647  4-alpha-glucanotransferase  41.3 
 
 
497 aa  399  1e-109  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1468  4-alpha-glucanotransferase  41.09 
 
 
500 aa  399  1e-109  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00033046 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2921  4-alpha-glucanotransferase  41.4 
 
 
499 aa  393  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2811  4-alpha-glucanotransferase  40.85 
 
 
496 aa  394  1e-108  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000526525  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2764  4-alpha-glucanotransferase  41.5 
 
 
517 aa  394  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5282  malto-oligosyltrehalose synthase  39.16 
 
 
1411 aa  390  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.339944 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1121  4-alpha-glucanotransferase  40.95 
 
 
501 aa  390  1e-107  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.644339  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2874  alpha amylase catalytic region  34.71 
 
 
1299 aa  389  1e-106  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0155  malto-oligosyltrehalose synthase  38.12 
 
 
1405 aa  390  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1486  4-alpha-glucanotransferase  40.36 
 
 
509 aa  389  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.117914  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1296  4-alpha-glucanotransferase  40.26 
 
 
505 aa  388  1e-106  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.891573  normal  0.349432 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3452  4-alpha-glucanotransferase  40.33 
 
 
520 aa  387  1e-106  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00120069 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3250  4-alpha-glucanotransferase  41.76 
 
 
499 aa  388  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000256283  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0244  4-alpha-glucanotransferase  39.18 
 
 
504 aa  389  1e-106  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1705  4-alpha-glucanotransferase  39.74 
 
 
512 aa  383  1e-104  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3246  4-alpha-glucanotransferase  39.96 
 
 
495 aa  380  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2391  4-alpha-glucanotransferase  40.75 
 
 
496 aa  377  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000053446  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1019  4-alpha-glucanotransferase  41.51 
 
 
499 aa  379  1e-103  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.147534  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0251  amylomaltase  42.09 
 
 
483 aa  380  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1182  4-alpha-glucanotransferase  39.63 
 
 
493 aa  374  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.207388  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3264  4-alpha-glucanotransferase  41.76 
 
 
502 aa  375  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1014  4-alpha-glucanotransferase  39.59 
 
 
495 aa  371  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.129588  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0554  4-alpha-glucanotransferase  39.93 
 
 
501 aa  373  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0239247  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0514  4-alpha-glucanotransferase  40.48 
 
 
512 aa  373  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1055  4-alpha-glucanotransferase  39.96 
 
 
500 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.919868  hitchhiker  0.00474904 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0667  4-alpha-glucanotransferase  40.7 
 
 
503 aa  372  1e-101  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.485353  normal  0.13128 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3111  4-alpha-glucanotransferase  39.85 
 
 
503 aa  372  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.124455 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1186  4-alpha-glucanotransferase  41.67 
 
 
502 aa  369  1e-100  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2959  4-alpha-glucanotransferase  38.6 
 
 
502 aa  366  1e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0510  4-alpha-glucanotransferase  38.28 
 
 
504 aa  366  2e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.855301  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0816  4-alpha-glucanotransferase  38.13 
 
 
488 aa  365  3e-99  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0237  4-alpha-glucanotransferase  40.14 
 
 
503 aa  365  4e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0624172  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1410  4-alpha-glucanotransferase  40 
 
 
515 aa  361  4e-98  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0343019  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1738  4-alpha-glucanotransferase  39.78 
 
 
497 aa  360  9e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0219743  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5124  4-alpha-glucanotransferase  38.21 
 
 
525 aa  360  9.999999999999999e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.642325  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0608  4-alpha-glucanotransferase  37.66 
 
 
497 aa  359  1.9999999999999998e-97  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0630977 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2968  4-alpha-glucanotransferase  39.74 
 
 
525 aa  358  2.9999999999999997e-97  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.34566  decreased coverage  0.00000602964 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1263  4-alpha-glucanotransferase  37.78 
 
 
498 aa  358  2.9999999999999997e-97  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.572623  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4956  4-alpha-glucanotransferase  39.48 
 
 
498 aa  357  5e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1473  4-alpha-glucanotransferase  38.53 
 
 
494 aa  357  1e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3272  alpha amylase catalytic region  32.97 
 
 
1643 aa  356  1e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1505  4-alpha-glucanotransferase  39.37 
 
 
496 aa  356  1e-96  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.104049 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0906  4-alpha-glucanotransferase  39.44 
 
 
502 aa  355  4e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0786343  hitchhiker  0.000119798 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3896  4-alpha-glucanotransferase  38.66 
 
 
495 aa  353  1e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.979798 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0552  4-alpha-glucanotransferase  37.87 
 
 
497 aa  353  2e-95  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00709308  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1527  4-alpha-glucanotransferase  37.87 
 
 
489 aa  352  3e-95  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.969905  decreased coverage  0.0000210459 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2387  4-alpha-glucanotransferase  34.78 
 
 
540 aa  350  8e-95  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2041  4-alpha-glucanotransferase  40.07 
 
 
493 aa  350  9e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17020  glycosidase  38.05 
 
 
727 aa  350  1e-94  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1054  4-alpha-glucanotransferase  38.67 
 
 
499 aa  350  1e-94  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00164715  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1017  4-alpha-glucanotransferase  37.1 
 
 
493 aa  346  1e-93  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00219663  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0865  4-alpha-glucanotransferase  38.24 
 
 
522 aa  346  2e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3276  4-alpha-glucanotransferase  37.92 
 
 
535 aa  345  2.9999999999999997e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.433715  normal  0.229692 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1049  4-alpha-glucanotransferase  37.92 
 
 
495 aa  342  2e-92  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1108  4-alpha-glucanotransferase  37.2 
 
 
497 aa  341  5e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.204434  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1439  4-alpha-glucanotransferase  35.99 
 
 
498 aa  340  9.999999999999999e-92  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0142582  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0420  4-alpha-glucanotransferase  36.25 
 
 
498 aa  340  9.999999999999999e-92  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1102  4-alpha-glucanotransferase  37.8 
 
 
501 aa  337  7.999999999999999e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.399608  normal  0.584525 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1431  4-alpha-glucanotransferase  37.24 
 
 
490 aa  335  4e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44779  predicted protein  38.08 
 
 
560 aa  334  8e-90  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2349  4-alpha-glucanotransferase  35.04 
 
 
483 aa  331  5.0000000000000004e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2071  4-alpha-glucanotransferase  36.14 
 
 
495 aa  330  8e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0413  4-alpha-glucanotransferase  35.61 
 
 
507 aa  330  8e-89  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0206  4-alpha-glucanotransferase  39.07 
 
 
470 aa  326  2e-87  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.539313 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0041  4-alpha-glucanotransferase  36.58 
 
 
502 aa  325  3e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1316  4-alpha-glucanotransferase  38.63 
 
 
479 aa  321  6e-86  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3444  4-alpha-glucanotransferase  35.35 
 
 
497 aa  320  9e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81732e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0817  4-alpha-glucanotransferase  35.66 
 
 
497 aa  318  4e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.960729  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0235  4-alpha-glucanotransferase  38.63 
 
 
479 aa  316  1.9999999999999998e-84  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.788709  normal  0.23673 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3100  4-alpha-glucanotransferase  43.97 
 
 
518 aa  313  1e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.601917  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3201  4-alpha-glucanotransferase  43.7 
 
 
518 aa  312  2e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.127634  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17010  4-alpha-glucanotransferase  32.25 
 
 
856 aa  310  1.0000000000000001e-82  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2966  4-alpha-glucanotransferase  43.97 
 
 
508 aa  303  1e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0778  4-alpha-glucanotransferase  40.97 
 
 
490 aa  302  3e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.605175  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2452  alpha amylase, catalytic region  30.59 
 
 
1401 aa  301  5e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0187956  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0364  4-alpha-glucanotransferase  35.53 
 
 
494 aa  298  6e-79  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0768  4-alpha-glucanotransferase  34.32 
 
 
468 aa  297  8e-79  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0510  4-alpha-glucanotransferase  41.24 
 
 
454 aa  295  3e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2327  alpha amylase catalytic region  30.95 
 
 
1401 aa  295  4e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.775797  normal  0.294215 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2290  4-alpha-glucanotransferase  33.09 
 
 
499 aa  294  5e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.793425  normal  0.0727641 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4336  alpha amylase catalytic region  31.26 
 
 
914 aa  293  1e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4335  alpha amylase catalytic region  30.42 
 
 
1753 aa  290  1e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.167512  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3001  4-alpha-glucanotransferase  43.3 
 
 
518 aa  286  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>