More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0869 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0869  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 459 aa  949    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2541  alpha amylase catalytic region  42.86 
 
 		 467 aa  356  3.9999999999999996e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0134925 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01125  alpha-amylase, putative  40.05 
 
 		 434 aa  346  4e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2732  alpha amylase, catalytic region  39.82 
 
 		 463 aa  345  1e-93  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.839185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2810  alpha amylase, catalytic region  42.52 
 
 		 450 aa  343  5e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05105  alpha-amylase, putative  37.05 
 
 		 478 aa  311  1e-83  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.289074  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1813  alpha amylase catalytic region  37.37 
 
 		 459 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1210  alpha amylase, catalytic region  34.79 
 
 		 460 aa  296  7e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09700  alpha amylase  30.69 
 
 		 426 aa  213  9e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1179  alpha amylase catalytic region  31.83 
 
 		 422 aa  207  4e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1141  alpha amylase, catalytic region  31.67 
 
 		 422 aa  206  5e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1713  alpha amylase catalytic region  30.07 
 
 		 426 aa  206  7e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0746329  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1208  Ig domain-containing protein  31.11 
 
 		 1048 aa  204  2e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2906  Alpha amylase, catalytic region  35.07 
 
 		 524 aa  187  5e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3096  alpha amylase catalytic region  35.07 
 
 		 479 aa  185  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2991  alpha amylase catalytic region  34.58 
 
 		 479 aa  182  9.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1504  alpha amylase catalytic region  32.09 
 
 		 728 aa  160  5e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.496352 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0794  alpha amylase catalytic region  26.9 
 
 		 562 aa  158  2e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0827  alpha amylase catalytic region  29.53 
 
 		 687 aa  154  5e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2652  alpha amylase catalytic region  28.54 
 
 		 682 aa  152  1e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0544  alpha amylase catalytic region  30.36 
 
 		 758 aa  139  7.999999999999999e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1052  alpha amylase catalytic region  27.04 
 
 		 674 aa  134  3.9999999999999996e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3180  alpha amylase catalytic region  27.36 
 
 		 635 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000161809  normal  0.231974 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1856  Alpha amylase, catalytic region  27.76 
 
 		 586 aa  128  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  25.67 
 
 		 510 aa  127  6e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  24.78 
 
 		 499 aa  127  6e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0660  alpha amylase, catalytic region  30.53 
 
 		 484 aa  125  2e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0867  alpha amylase catalytic region  26.83 
 
 		 558 aa  124  3e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  25.51 
 
 		 511 aa  121  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3868  alpha amylase catalytic region  25.67 
 
 		 752 aa  120  6e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7546  trehalose synthase  27.23 
 
 		 1088 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.455626  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23200  alpha amylase  23.35 
 
 		 654 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000149088  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2835  trehalose synthase  27.23 
 
 		 1088 aa  117  5e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0758325  normal  0.0859996 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6807  trehalose synthase  27.03 
 
 		 1088 aa  117  6e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267695  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1279  alpha amylase catalytic region  26.34 
 
 		 560 aa  115  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2940  trehalose synthase  27.23 
 
 		 1088 aa  114  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795057 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2713  trehalose synthase  27.23 
 
 		 1088 aa  114  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.352676 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1598  trehalose synthase  26.29 
 
 		 1092 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0248685 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2869  alpha amylase catalytic region  26.92 
 
 		 578 aa  111  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3146  alpha amylase catalytic region  25.75 
 
 		 622 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.476414 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2022  trehalose synthase  26.4 
 
 		 1142 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0693  alpha amylase catalytic region  23.17 
 
 		 589 aa  110  5e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.544256  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0795  alpha amylase, catalytic region  24.41 
 
 		 575 aa  109  8.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0347  alpha amylase catalytic region  25.22 
 
 		 522 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.242051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0589  glycosidases-like  24.39 
 
 		 705 aa  108  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.361866  normal  0.0110561 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5383  trehalose synthase  22.89 
 
 		 1093 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0116468  normal  0.915163 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0851  Amylo-alpha-16-glucosidase  25.29 
 
 		 1433 aa  107  4e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.203263  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0549  alpha amylase catalytic region  28.38 
 
 		 537 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1342  alpha amylase catalytic region  22.6 
 
 		 493 aa  107  4e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2579  alpha amylase catalytic region  28.05 
 
 		 576 aa  107  5e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000456037  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1980  trehalose synthase  26.06 
 
 		 1109 aa  107  6e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0525025  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1154  alpha amylase catalytic region  30.08 
 
 		 752 aa  105  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0553  alpha amylase catalytic region  28.32 
 
 		 537 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2425  alpha amylase catalytic region  23.89 
 
 		 509 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144227  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5098  trehalose synthase  22.56 
 
 		 1093 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436768  decreased coverage  0.00978496 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4138  alpha amylase catalytic region  28.02 
 
 		 541 aa  104  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0433199 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2160  trehalose synthase-like  24.65 
 
 		 1112 aa  104  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1313  alpha amylase, catalytic domain protein  25.56 
 
 		 459 aa  103  5e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1613  alpha amylase, catalytic region  25.68 
 
 		 589 aa  103  7e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.050548  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2907  alpha amylase catalytic subunit  27.25 
 
 		 715 aa  103  7e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.245602 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0874  trehalose synthase  24.8 
 
 		 591 aa  103  8e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.847656  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0537  trehalose synthase-like protein  26.7 
 
 		 556 aa  103  9e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2341  alpha amylase catalytic region  23.66 
 
 		 554 aa  102  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0520  Alpha amylase  27.96 
 
 		 537 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1599  alpha amylase catalytic region  27.17 
 
 		 1126 aa  102  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.863275  hitchhiker  0.00182412 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36730  putative trehalose synthase  26.51 
 
 		 1100 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.631838 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1180  alpha amylase, catalytic region  25.4 
 
 		 526 aa  102  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000265218  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6808  alpha amylase catalytic region  27.11 
 
 		 1122 aa  102  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0740602  normal  0.515818 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4393  alpha amylase catalytic region  26.72 
 
 		 1144 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.573517  normal  0.10506 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1119  alpha-amylase  23.68 
 
 		 586 aa  101  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0181074  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1302  alpha amylase catalytic region  27.79 
 
 		 541 aa  102  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.312205 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3842  alpha amylase catalytic region  23.51 
 
 		 586 aa  102  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000752132  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4051  trehalose synthase  25 
 
 		 1164 aa  102  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1431  alpha amylase catalytic region  24.16 
 
 		 663 aa  101  2e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.246388  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2353  alpha amylase domain-containing protein  24.01 
 
 		 1110 aa  102  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.544253  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3154  putative trehalose synthase  26.62 
 
 		 1100 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3938  trehalose synthase  25 
 
 		 1164 aa  102  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.278548 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1502  alpha amylase  24.17 
 
 		 610 aa  101  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2834  alpha amylase catalytic region  29.33 
 
 		 1124 aa  101  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0564528 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1510  alpha amylase catalytic region  24.03 
 
 		 588 aa  101  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6822  trehalose synthase  24.64 
 
 		 1154 aa  101  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.615207 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7547  alpha amylase catalytic region  28.24 
 
 		 1122 aa  101  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250555  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1106  trehalose synthase  24.2 
 
 		 1123 aa  101  4e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4120  alpha-amylase  23.68 
 
 		 586 aa  101  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000171258  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6821  alpha amylase catalytic region  26.72 
 
 		 1151 aa  100  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.137668  normal  0.518409 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2934  alpha amylase, catalytic region  31.54 
 
 		 1022 aa  100  5e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.124614  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4167  alpha amylase catalytic region  24.16 
 
 		 574 aa  100  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.718668  hitchhiker  0.00459901 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0835  alpha amylase catalytic region  24.31 
 
 		 549 aa  100  5e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10330  trehalose synthase  25.28 
 
 		 588 aa  100  6e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.163589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2861  putative alpha-amylase-related protein  26.35 
 
 		 1146 aa  100  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2716  trehalose synthase  29.48 
 
 		 964 aa  100  6e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28000  trehalose synthase, maltokinase fusion protein  25.3 
 
 		 1108 aa  100  6e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2935  trehalose synthase  25.12 
 
 		 1110 aa  99.8  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.820681  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2090  trehalose synthase  25.95 
 
 		 1119 aa  99.4  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4274  alpha amylase catalytic region  27.22 
 
 		 529 aa  99.8  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2828  trehalose synthase  25.62 
 
 		 548 aa  99  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0601  alpha amylase catalytic region  22.29 
 
 		 554 aa  99.4  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199149  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16160  alpha amylase catalytic region  22.37 
 
 		 582 aa  99.8  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.135656  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3921  trehalose synthase  25.31 
 
 		 1085 aa  99.8  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1544  alpha-glucosidase  26.24 
 
 		 1131 aa  99  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>