More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1712 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1998  alpha amylase catalytic region  89.19 
 
 		 481 aa  890    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.722533  normal  0.515841 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1712  alpha amylase, catalytic region  100 
 
 		 481 aa  986    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2017  Alpha amylase, catalytic region  61.35 
 
 		 488 aa  607  9.999999999999999e-173  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00107336  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4625  alpha amylase catalytic region  61.24 
 
 		 481 aa  607  9.999999999999999e-173  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4343  alpha amylase catalytic region  59.59 
 
 		 481 aa  604  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4392  alpha amylase, catalytic region  58.38 
 
 		 493 aa  603  1.0000000000000001e-171  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.47907 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0534  alpha amylase catalytic region  66.67 
 
 		 487 aa  597  1e-169  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.595542  normal  0.941542 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1944  alpha amylase catalytic region  57.43 
 
 		 486 aa  564  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1971  alpha amylase catalytic region  57.03 
 
 		 486 aa  559  1e-158  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0248141  normal  0.0160527 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0611  alpha amylase, catalytic region  54.36 
 
 		 496 aa  518  1.0000000000000001e-145  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.132901 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1318  alpha amylase catalytic region  52.43 
 
 		 486 aa  468  9.999999999999999e-131  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.844059  normal  0.130735 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3073  alpha amylase catalytic region  50 
 
 		 477 aa  468  9.999999999999999e-131  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2092  alpha amylase catalytic subunit  49.37 
 
 		 484 aa  463  1e-129  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0253645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21691  glycoside hydrolase family protein  47.33 
 
 		 483 aa  380  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0470032 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2916  Alpha-amylase  43.45 
 
 		 472 aa  373  1e-102  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3419  hypothetical protein  45.11 
 
 		 481 aa  373  1e-102  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.488491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16160  alpha amylase catalytic region  42.5 
 
 		 582 aa  365  1e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.135656  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1856  Alpha amylase, catalytic region  42.62 
 
 		 586 aa  363  3e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1119  alpha-amylase  39.5 
 
 		 586 aa  362  6e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0181074  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3842  alpha amylase catalytic region  40.86 
 
 		 586 aa  362  1e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000752132  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4120  alpha-amylase  39.5 
 
 		 586 aa  362  1e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000171258  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0501  alpha amylase domain-containing protein  48.54 
 
 		 476 aa  360  3e-98  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.259034  normal  0.140596 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1187  alpha amylase, catalytic region  41.44 
 
 		 574 aa  360  3e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.649745  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3923  alpha-amylase  38.88 
 
 		 586 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.077221  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4230  alpha-amylase  38.88 
 
 		 586 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.300485  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4033  alpha-amylase  38.88 
 
 		 586 aa  357  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4065  alpha-amylase  38.67 
 
 		 586 aa  356  5e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00857502  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3771  neopullulanase  38.67 
 
 		 586 aa  355  8.999999999999999e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00823842  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3755  neopullulanase  38.67 
 
 		 586 aa  355  1e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000420185  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4139  alpha-amylase  38.88 
 
 		 586 aa  354  2e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00110847  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0693  alpha amylase catalytic region  41.31 
 
 		 589 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.544256  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1510  alpha amylase catalytic region  41.89 
 
 		 588 aa  350  2e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1834  alpha amylase domain-containing protein  47.17 
 
 		 480 aa  351  2e-95  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.108338  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2715  alpha amylase catalytic region  39.38 
 
 		 586 aa  345  8e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.783965  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0209  alpha amylase catalytic region  41.82 
 
 		 587 aa  337  1.9999999999999998e-91  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.214929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0802  glycosy hydrolase family protein  39.51 
 
 		 610 aa  334  2e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.124248  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0789  cymH protein  39.33 
 
 		 610 aa  333  3e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1431  alpha amylase catalytic region  35.35 
 
 		 663 aa  307  3e-82  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.246388  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0215  neopullulanase  40.9 
 
 		 574 aa  306  7e-82  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0425343  hitchhiker  0.000179088 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2350  alpha amylase catalytic region  36.85 
 
 		 583 aa  305  9.000000000000001e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0795  alpha amylase, catalytic region  34.68 
 
 		 575 aa  303  3.0000000000000004e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002973  maltodextrin glucosidase  38.53 
 
 		 608 aa  302  1e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1852  neopullulanase  36.21 
 
 		 584 aa  297  2e-79  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.496782  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2869  alpha amylase catalytic region  41.04 
 
 		 578 aa  296  4e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1613  alpha amylase, catalytic region  37.5 
 
 		 589 aa  295  1e-78  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.050548  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3705  alpha amylase catalytic region  37.57 
 
 		 617 aa  290  5.0000000000000004e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00647332  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1313  alpha amylase, catalytic domain protein  35.86 
 
 		 459 aa  289  7e-77  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2579  alpha amylase catalytic region  36.14 
 
 		 576 aa  288  1e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000456037  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2278  alpha amylase catalytic region  35.16 
 
 		 1307 aa  279  6e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.792883  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0969  alpha amylase, catalytic region  35.26 
 
 		 473 aa  276  5e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0987  alpha amylase catalytic region  35.26 
 
 		 473 aa  276  5e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2874  alpha amylase catalytic region  32.53 
 
 		 1299 aa  275  2.0000000000000002e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1049  maltodextrin glucosidase  37.32 
 
 		 607 aa  270  4e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0895639 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2327  alpha amylase catalytic region  34.26 
 
 		 1401 aa  267  2.9999999999999995e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.775797  normal  0.294215 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2452  alpha amylase, catalytic region  34.39 
 
 		 1401 aa  267  4e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0187956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2274  alpha amylase catalytic region  37 
 
 		 614 aa  266  5.999999999999999e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0525857 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0221  alpha amylase catalytic region  33.86 
 
 		 474 aa  266  8e-70  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1414  alpha amylase catalytic region  36.46 
 
 		 703 aa  265  1e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0623392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  33.04 
 
 		 1847 aa  262  1e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2907  alpha amylase catalytic subunit  35.5 
 
 		 715 aa  261  2e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.245602 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0586  alpha amylase catalytic region  33.27 
 
 		 479 aa  259  6e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.532649  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3271  maltodextrin glucosidase  36.8 
 
 		 609 aa  258  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3131  maltodextrin glucosidase  36.8 
 
 		 609 aa  258  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1580  alpha amylase, catalytic region  32.72 
 
 		 475 aa  257  3e-67  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0569736  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1458  alpha amylase, catalytic region  34.77 
 
 		 644 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.628846  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3272  alpha amylase catalytic region  30.77 
 
 		 1643 aa  249  6e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0433  maltodextrin glucosidase  35.42 
 
 		 605 aa  249  7e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0473  maltodextrin glucosidase  35.42 
 
 		 605 aa  249  7e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0480  maltodextrin glucosidase  35.99 
 
 		 604 aa  249  9e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0434  maltodextrin glucosidase  35.42 
 
 		 605 aa  249  9e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00351  maltodextrin glucosidase  35.99 
 
 		 605 aa  248  2e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3206  alpha amylase catalytic region  35.99 
 
 		 605 aa  248  2e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.608393  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00355  hypothetical protein  35.99 
 
 		 605 aa  248  2e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3230  maltodextrin glucosidase  35.99 
 
 		 605 aa  248  2e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000268324 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0871  maltodextrin glucosidase  35.42 
 
 		 605 aa  248  2e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1114  alpha amylase catalytic subunit  35.51 
 
 		 580 aa  246  6e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0144434  normal  0.666267 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0446  maltodextrin glucosidase  34.97 
 
 		 605 aa  244  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0501  maltodextrin glucosidase  34.97 
 
 		 605 aa  243  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.524518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0459  maltodextrin glucosidase  35.12 
 
 		 605 aa  243  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0440  maltodextrin glucosidase  35.39 
 
 		 605 aa  243  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1458  alpha amylase, catalytic region  32.12 
 
 		 651 aa  243  7e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0557  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  31.88 
 
 		 1175 aa  240  2.9999999999999997e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.641532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4336  alpha amylase catalytic region  30.66 
 
 		 914 aa  240  5e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3328  maltodextrin glucosidase  33.33 
 
 		 596 aa  239  6.999999999999999e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.307817 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4335  alpha amylase catalytic region  33.51 
 
 		 1753 aa  237  3e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.167512  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0729  amylopullulanase  33.26 
 
 		 600 aa  234  4.0000000000000004e-60  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00401162  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2159  alpha amylase catalytic region  37.55 
 
 		 647 aa  233  7.000000000000001e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.826727  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1046  4-alpha-glucanotransferase  33.97 
 
 		 1145 aa  232  1e-59  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0938  maltodextrin glucosidase  35.55 
 
 		 590 aa  232  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275177  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1167  alpha amylase catalytic region  33.47 
 
 		 576 aa  232  1e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.823071  normal  0.49953 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3195  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  31.89 
 
 		 1193 aa  231  3e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4682  alpha amylase catalytic region  33.73 
 
 		 609 aa  230  3e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1524  alpha amylase catalytic region  34.26 
 
 		 634 aa  230  5e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.383652 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0084  pullulanase  29.52 
 
 		 606 aa  227  3e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0286  alpha amylase catalytic region  29 
 
 		 611 aa  227  5.0000000000000005e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.109454  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0475  alpha amylase, catalytic region  36.3 
 
 		 608 aa  224  3e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.350663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0369  alpha amylase catalytic region  28.4 
 
 		 659 aa  222  9e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13890  glycosidase  33.04 
 
 		 624 aa  222  9.999999999999999e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.496833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0747  alpha amylase, catalytic region  32.91 
 
 		 655 aa  216  8e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.29476  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5858  alpha amylase catalytic region  33.89 
 
 		 569 aa  215  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.364305 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>