More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0747 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_0747  alpha amylase, catalytic region  100 
 
 		 655 aa  1318    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.29476  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4682  alpha amylase catalytic region  46.17 
 
 		 609 aa  489  1e-137  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13890  glycosidase  42.39 
 
 		 624 aa  475  1e-132  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.496833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2159  alpha amylase catalytic region  46.92 
 
 		 647 aa  466  9.999999999999999e-131  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.826727  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1524  alpha amylase catalytic region  42.91 
 
 		 634 aa  465  1e-129  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.383652 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3328  maltodextrin glucosidase  45.27 
 
 		 596 aa  447  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.307817 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2294  alpha amylase catalytic region  43.94 
 
 		 611 aa  433  1e-120  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0938  maltodextrin glucosidase  42.9 
 
 		 590 aa  406  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5858  alpha amylase catalytic region  43.54 
 
 		 569 aa  399  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.364305 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2274  alpha amylase catalytic region  36.15 
 
 		 614 aa  341  2e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0525857 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3705  alpha amylase catalytic region  33.08 
 
 		 617 aa  313  5.999999999999999e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00647332  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0446  maltodextrin glucosidase  35.34 
 
 		 605 aa  260  7e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0501  maltodextrin glucosidase  35.34 
 
 		 605 aa  259  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.524518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0459  maltodextrin glucosidase  34.83 
 
 		 605 aa  259  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0440  maltodextrin glucosidase  35.18 
 
 		 605 aa  259  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3206  alpha amylase catalytic region  34.29 
 
 		 605 aa  256  9e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.608393  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0480  maltodextrin glucosidase  33.94 
 
 		 604 aa  254  3e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00351  maltodextrin glucosidase  34.08 
 
 		 605 aa  254  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3230  maltodextrin glucosidase  34.08 
 
 		 605 aa  254  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000268324 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00355  hypothetical protein  34.08 
 
 		 605 aa  254  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0433  maltodextrin glucosidase  34.08 
 
 		 605 aa  254  5.000000000000001e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0473  maltodextrin glucosidase  34.08 
 
 		 605 aa  254  5.000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0434  maltodextrin glucosidase  34.29 
 
 		 605 aa  253  1e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0871  maltodextrin glucosidase  34.19 
 
 		 605 aa  248  2e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1049  maltodextrin glucosidase  33.51 
 
 		 607 aa  247  4e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0895639 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1114  alpha amylase catalytic subunit  34.24 
 
 		 580 aa  241  2.9999999999999997e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0144434  normal  0.666267 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3131  maltodextrin glucosidase  34.5 
 
 		 609 aa  232  1e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1167  alpha amylase catalytic region  33.4 
 
 		 576 aa  233  1e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.823071  normal  0.49953 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3271  maltodextrin glucosidase  34.5 
 
 		 609 aa  232  1e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002973  maltodextrin glucosidase  29.1 
 
 		 608 aa  227  5.0000000000000005e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1998  alpha amylase catalytic region  33.33 
 
 		 481 aa  221  3e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.722533  normal  0.515841 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0475  alpha amylase, catalytic region  29.33 
 
 		 608 aa  221  3.9999999999999997e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.350663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0611  alpha amylase, catalytic region  31.23 
 
 		 496 aa  218  2.9999999999999998e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.132901 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2092  alpha amylase catalytic subunit  32.48 
 
 		 484 aa  216  9.999999999999999e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0253645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1712  alpha amylase, catalytic region  32.91 
 
 		 481 aa  216  9.999999999999999e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0369  alpha amylase catalytic region  25 
 
 		 659 aa  205  2e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0534  alpha amylase catalytic region  31.85 
 
 		 487 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.595542  normal  0.941542 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4625  alpha amylase catalytic region  31.36 
 
 		 481 aa  198  3e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1318  alpha amylase catalytic region  31.33 
 
 		 486 aa  197  4.0000000000000005e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.844059  normal  0.130735 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4343  alpha amylase catalytic region  31.65 
 
 		 481 aa  197  7e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2017  Alpha amylase, catalytic region  31.07 
 
 		 488 aa  195  3e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00107336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4392  alpha amylase, catalytic region  29.54 
 
 		 493 aa  193  7e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.47907 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1971  alpha amylase catalytic region  29.78 
 
 		 486 aa  187  5e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0248141  normal  0.0160527 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1944  alpha amylase catalytic region  29.78 
 
 		 486 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0795  alpha amylase, catalytic region  27.21 
 
 		 575 aa  184  6e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0987  alpha amylase catalytic region  29.42 
 
 		 473 aa  183  8.000000000000001e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0969  alpha amylase, catalytic region  29.42 
 
 		 473 aa  183  8.000000000000001e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17020  glycosidase  31.17 
 
 		 727 aa  182  1e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1458  alpha amylase, catalytic region  25.93 
 
 		 651 aa  182  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1119  alpha-amylase  28.88 
 
 		 586 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0181074  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4065  alpha-amylase  28.66 
 
 		 586 aa  181  4e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00857502  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1510  alpha amylase catalytic region  30.02 
 
 		 588 aa  181  4e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3073  alpha amylase catalytic region  29.62 
 
 		 477 aa  181  4.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4120  alpha-amylase  28.88 
 
 		 586 aa  180  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000171258  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0084  pullulanase  24.44 
 
 		 606 aa  180  9e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4139  alpha-amylase  28.66 
 
 		 586 aa  179  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00110847  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3842  alpha amylase catalytic region  29.27 
 
 		 586 aa  179  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000752132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3755  neopullulanase  28.45 
 
 		 586 aa  178  3e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000420185  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3923  alpha-amylase  28.45 
 
 		 586 aa  177  4e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.077221  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3771  neopullulanase  28.45 
 
 		 586 aa  177  4e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00823842  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4230  alpha-amylase  28.45 
 
 		 586 aa  177  4e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.300485  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4033  alpha-amylase  28.23 
 
 		 586 aa  177  4e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0221  alpha amylase catalytic region  27.47 
 
 		 474 aa  176  9.999999999999999e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1580  alpha amylase, catalytic region  29.78 
 
 		 475 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0569736  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1852  neopullulanase  27.99 
 
 		 584 aa  174  3.9999999999999995e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.496782  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21691  glycoside hydrolase family protein  30.77 
 
 		 483 aa  174  5e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0470032 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1431  alpha amylase catalytic region  26.69 
 
 		 663 aa  173  9e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.246388  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  28.17 
 
 		 1847 aa  171  4e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1313  alpha amylase, catalytic domain protein  29.74 
 
 		 459 aa  170  7e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0215  neopullulanase  27.62 
 
 		 574 aa  169  1e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0425343  hitchhiker  0.000179088 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1613  alpha amylase, catalytic region  27.15 
 
 		 589 aa  169  1e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.050548  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2869  alpha amylase catalytic region  30.07 
 
 		 578 aa  169  2e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0693  alpha amylase catalytic region  25.92 
 
 		 589 aa  167  4e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.544256  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2715  alpha amylase catalytic region  27.53 
 
 		 586 aa  167  5e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.783965  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2579  alpha amylase catalytic region  27.6 
 
 		 576 aa  167  5e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000456037  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0557  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  25.98 
 
 		 1175 aa  164  5.0000000000000005e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.641532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0586  alpha amylase catalytic region  29.34 
 
 		 479 aa  162  2e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.532649  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0789  cymH protein  28.88 
 
 		 610 aa  162  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1834  alpha amylase domain-containing protein  30.79 
 
 		 480 aa  160  6e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.108338  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0802  glycosy hydrolase family protein  29.04 
 
 		 610 aa  160  7e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.124248  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0729  amylopullulanase  26.57 
 
 		 600 aa  159  1e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00401162  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1187  alpha amylase, catalytic region  26.2 
 
 		 574 aa  158  3e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.649745  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1856  Alpha amylase, catalytic region  27.8 
 
 		 586 aa  158  4e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2916  Alpha-amylase  27.59 
 
 		 472 aa  157  6e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1046  4-alpha-glucanotransferase  25.49 
 
 		 1145 aa  157  8e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0501  alpha amylase domain-containing protein  30.2 
 
 		 476 aa  156  9e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.259034  normal  0.140596 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3281  maltodextrin glucosidase  34.84 
 
 		 414 aa  156  1e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0122809 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3419  hypothetical protein  28.6 
 
 		 481 aa  155  2.9999999999999998e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.488491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3272  alpha amylase catalytic region  24.2 
 
 		 1643 aa  154  7e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2874  alpha amylase catalytic region  27.38 
 
 		 1299 aa  152  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2278  alpha amylase catalytic region  28.94 
 
 		 1307 aa  151  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.792883  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3195  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  24.24 
 
 		 1193 aa  150  8e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4335  alpha amylase catalytic region  27.7 
 
 		 1753 aa  149  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.167512  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2350  alpha amylase catalytic region  25.1 
 
 		 583 aa  149  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0209  alpha amylase catalytic region  28.35 
 
 		 587 aa  147  7.0000000000000006e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.214929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16160  alpha amylase catalytic region  25.13 
 
 		 582 aa  146  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.135656  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1414  alpha amylase catalytic region  26.71 
 
 		 703 aa  144  6e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0623392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1265  alpha amylase catalytic region  24.8 
 
 		 463 aa  143  9.999999999999999e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2452  alpha amylase, catalytic region  25.99 
 
 		 1401 aa  141  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0187956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0794  alpha amylase catalytic region  24.84 
 
 		 562 aa  140  4.999999999999999e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>