More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1458 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3195  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  50.47 
 
 		 1193 aa  644    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1458  alpha amylase, catalytic region  100 
 
 		 651 aa  1351    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0557  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  46.91 
 
 		 1175 aa  623  1e-177  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.641532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0084  pullulanase  48.92 
 
 		 606 aa  530  1e-149  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2874  alpha amylase catalytic region  38.84 
 
 		 1299 aa  469  1.0000000000000001e-131  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  37.59 
 
 		 1847 aa  436  1e-121  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1046  4-alpha-glucanotransferase  37.28 
 
 		 1145 aa  430  1e-119  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0729  amylopullulanase  39.62 
 
 		 600 aa  397  1e-109  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00401162  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17020  glycosidase  42.77 
 
 		 727 aa  360  4e-98  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3272  alpha amylase catalytic region  32.37 
 
 		 1643 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2452  alpha amylase, catalytic region  31.79 
 
 		 1401 aa  323  7e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0187956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2278  alpha amylase catalytic region  31.01 
 
 		 1307 aa  321  3e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.792883  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2327  alpha amylase catalytic region  31.79 
 
 		 1401 aa  318  2e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.775797  normal  0.294215 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4336  alpha amylase catalytic region  30.99 
 
 		 914 aa  292  1e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4335  alpha amylase catalytic region  31.76 
 
 		 1753 aa  289  1e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.167512  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1856  Alpha amylase, catalytic region  32.97 
 
 		 586 aa  277  5e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3073  alpha amylase catalytic region  33.41 
 
 		 477 aa  262  1e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00351  maltodextrin glucosidase  30.02 
 
 		 605 aa  257  4e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3230  maltodextrin glucosidase  30.02 
 
 		 605 aa  257  4e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000268324 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00355  hypothetical protein  30.02 
 
 		 605 aa  257  4e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3206  alpha amylase catalytic region  30.02 
 
 		 605 aa  257  5e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.608393  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0480  maltodextrin glucosidase  30.11 
 
 		 604 aa  257  6e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4343  alpha amylase catalytic region  32.92 
 
 		 481 aa  256  7e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0473  maltodextrin glucosidase  30.02 
 
 		 605 aa  255  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0433  maltodextrin glucosidase  29.86 
 
 		 605 aa  253  6e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0434  maltodextrin glucosidase  30.08 
 
 		 605 aa  252  2e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1510  alpha amylase catalytic region  32.89 
 
 		 588 aa  251  3e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1431  alpha amylase catalytic region  32.94 
 
 		 663 aa  248  3e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.246388  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1998  alpha amylase catalytic region  32 
 
 		 481 aa  247  4.9999999999999997e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.722533  normal  0.515841 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0446  maltodextrin glucosidase  32.75 
 
 		 605 aa  246  6.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0501  maltodextrin glucosidase  32.75 
 
 		 605 aa  246  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.524518  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0693  alpha amylase catalytic region  32.25 
 
 		 589 aa  244  3e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.544256  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16160  alpha amylase catalytic region  31.8 
 
 		 582 aa  243  7e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.135656  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1712  alpha amylase, catalytic region  31.94 
 
 		 481 aa  243  9e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1187  alpha amylase, catalytic region  33.4 
 
 		 574 aa  243  1e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.649745  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4392  alpha amylase, catalytic region  32.02 
 
 		 493 aa  243  1e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.47907 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2017  Alpha amylase, catalytic region  31.46 
 
 		 488 aa  242  2e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00107336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3705  alpha amylase catalytic region  32.49 
 
 		 617 aa  241  2.9999999999999997e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00647332  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0459  maltodextrin glucosidase  29.65 
 
 		 605 aa  239  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2274  alpha amylase catalytic region  27.98 
 
 		 614 aa  239  2e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0525857 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0440  maltodextrin glucosidase  32.36 
 
 		 605 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4625  alpha amylase catalytic region  31.09 
 
 		 481 aa  238  2e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3419  hypothetical protein  32.02 
 
 		 481 aa  238  2e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.488491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1971  alpha amylase catalytic region  30.27 
 
 		 486 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0248141  normal  0.0160527 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1944  alpha amylase catalytic region  30.27 
 
 		 486 aa  238  3e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0534  alpha amylase catalytic region  32.19 
 
 		 487 aa  236  8e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.595542  normal  0.941542 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0871  maltodextrin glucosidase  29.6 
 
 		 605 aa  236  9e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2092  alpha amylase catalytic subunit  31.95 
 
 		 484 aa  235  2.0000000000000002e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0253645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0611  alpha amylase, catalytic region  30.98 
 
 		 496 aa  235  2.0000000000000002e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.132901 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2715  alpha amylase catalytic region  30.14 
 
 		 586 aa  233  1e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.783965  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1049  maltodextrin glucosidase  28.75 
 
 		 607 aa  230  6e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0895639 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1119  alpha-amylase  31.13 
 
 		 586 aa  230  8e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0181074  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002973  maltodextrin glucosidase  32.7 
 
 		 608 aa  229  1e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3923  alpha-amylase  31.13 
 
 		 586 aa  228  2e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.077221  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4230  alpha-amylase  31.13 
 
 		 586 aa  228  2e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.300485  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4033  alpha-amylase  31.13 
 
 		 586 aa  228  2e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3771  neopullulanase  30.94 
 
 		 586 aa  227  4e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00823842  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4120  alpha-amylase  30.94 
 
 		 586 aa  227  6e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000171258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3755  neopullulanase  30.94 
 
 		 586 aa  226  7e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000420185  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4065  alpha-amylase  30.75 
 
 		 586 aa  225  2e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00857502  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3842  alpha amylase catalytic region  30.25 
 
 		 586 aa  225  2e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000752132  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1318  alpha amylase catalytic region  30.38 
 
 		 486 aa  225  2e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.844059  normal  0.130735 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4139  alpha-amylase  30.38 
 
 		 586 aa  223  6e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00110847  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1114  alpha amylase catalytic subunit  30.93 
 
 		 580 aa  223  7e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0144434  normal  0.666267 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2869  alpha amylase catalytic region  29.41 
 
 		 578 aa  223  9.999999999999999e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0221  alpha amylase catalytic region  30.27 
 
 		 474 aa  221  3.9999999999999997e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3131  maltodextrin glucosidase  28.4 
 
 		 609 aa  218  2.9999999999999998e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0987  alpha amylase catalytic region  31.02 
 
 		 473 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0969  alpha amylase, catalytic region  31.02 
 
 		 473 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3271  maltodextrin glucosidase  28.64 
 
 		 609 aa  217  5.9999999999999996e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0586  alpha amylase catalytic region  30.69 
 
 		 479 aa  215  1.9999999999999998e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.532649  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0369  alpha amylase catalytic region  28.57 
 
 		 659 aa  214  3.9999999999999995e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0209  alpha amylase catalytic region  32.57 
 
 		 587 aa  213  9e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.214929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0795  alpha amylase, catalytic region  31.77 
 
 		 575 aa  213  1e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0475  alpha amylase, catalytic region  29.24 
 
 		 608 aa  211  4e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.350663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2916  Alpha-amylase  32.9 
 
 		 472 aa  210  5e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1613  alpha amylase, catalytic region  31.19 
 
 		 589 aa  209  2e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.050548  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0802  glycosy hydrolase family protein  33.33 
 
 		 610 aa  207  4e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.124248  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1414  alpha amylase catalytic region  28.6 
 
 		 703 aa  207  4e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0623392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1580  alpha amylase, catalytic region  31.76 
 
 		 475 aa  206  8e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0569736  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0501  alpha amylase domain-containing protein  31.11 
 
 		 476 aa  206  1e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.259034  normal  0.140596 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0789  cymH protein  32.7 
 
 		 610 aa  206  1e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1167  alpha amylase catalytic region  31.03 
 
 		 576 aa  202  1.9999999999999998e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.823071  normal  0.49953 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2907  alpha amylase catalytic subunit  29.54 
 
 		 715 aa  202  1.9999999999999998e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.245602 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1852  neopullulanase  31.6 
 
 		 584 aa  201  3e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.496782  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0286  alpha amylase catalytic region  28.8 
 
 		 611 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.109454  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0215  neopullulanase  29.39 
 
 		 574 aa  197  3e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0425343  hitchhiker  0.000179088 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21691  glycoside hydrolase family protein  31.06 
 
 		 483 aa  197  7e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0470032 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2350  alpha amylase catalytic region  30.85 
 
 		 583 aa  194  6e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2579  alpha amylase catalytic region  27.61 
 
 		 576 aa  193  7e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000456037  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1313  alpha amylase, catalytic domain protein  31.38 
 
 		 459 aa  190  7e-47  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1834  alpha amylase domain-containing protein  30.63 
 
 		 480 aa  190  8e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.108338  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0747  alpha amylase, catalytic region  26.28 
 
 		 655 aa  186  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.29476  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1524  alpha amylase catalytic region  26.27 
 
 		 634 aa  186  2.0000000000000003e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.383652 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1265  alpha amylase catalytic region  27.33 
 
 		 463 aa  175  1.9999999999999998e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13890  glycosidase  23.71 
 
 		 624 aa  174  6.999999999999999e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.496833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3281  maltodextrin glucosidase  30.05 
 
 		 414 aa  167  5.9999999999999996e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0122809 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2294  alpha amylase catalytic region  25.88 
 
 		 611 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5858  alpha amylase catalytic region  25.55 
 
 		 569 aa  165  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.364305 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3146  alpha amylase catalytic region  29.42 
 
 		 622 aa  160  6e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.476414 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>