More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0586 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0586  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 479 aa  980    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.532649  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0221  alpha amylase catalytic region  59.11 
 
 		 474 aa  588  1e-167  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0987  alpha amylase catalytic region  58.17 
 
 		 473 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0969  alpha amylase, catalytic region  58.17 
 
 		 473 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1580  alpha amylase, catalytic region  55.72 
 
 		 475 aa  544  1e-153  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0569736  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4343  alpha amylase catalytic region  37.39 
 
 		 481 aa  272  8.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1998  alpha amylase catalytic region  34.58 
 
 		 481 aa  266  8e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.722533  normal  0.515841 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1712  alpha amylase, catalytic region  33.27 
 
 		 481 aa  259  6e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4625  alpha amylase catalytic region  36.28 
 
 		 481 aa  250  3e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1265  alpha amylase catalytic region  33.75 
 
 		 463 aa  249  8e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2274  alpha amylase catalytic region  33.74 
 
 		 614 aa  249  9e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0525857 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3705  alpha amylase catalytic region  33.54 
 
 		 617 aa  248  1e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00647332  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0871  maltodextrin glucosidase  36.84 
 
 		 605 aa  244  1.9999999999999999e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0480  maltodextrin glucosidase  37.72 
 
 		 604 aa  244  3e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1431  alpha amylase catalytic region  32.36 
 
 		 663 aa  244  3e-63  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.246388  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00351  maltodextrin glucosidase  37.93 
 
 		 605 aa  243  7e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3206  alpha amylase catalytic region  37.69 
 
 		 605 aa  243  7e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.608393  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3230  maltodextrin glucosidase  37.93 
 
 		 605 aa  243  7e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000268324 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00355  hypothetical protein  37.93 
 
 		 605 aa  243  7e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0433  maltodextrin glucosidase  37.93 
 
 		 605 aa  243  7e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0473  maltodextrin glucosidase  37.93 
 
 		 605 aa  243  7.999999999999999e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2092  alpha amylase catalytic subunit  33.63 
 
 		 484 aa  242  1e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0253645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0534  alpha amylase catalytic region  33.33 
 
 		 487 aa  242  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.595542  normal  0.941542 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0434  maltodextrin glucosidase  37.39 
 
 		 605 aa  242  1e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0611  alpha amylase, catalytic region  31.51 
 
 		 496 aa  238  2e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.132901 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4392  alpha amylase, catalytic region  35.08 
 
 		 493 aa  238  2e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.47907 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3073  alpha amylase catalytic region  32.17 
 
 		 477 aa  238  2e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2017  Alpha amylase, catalytic region  34.75 
 
 		 488 aa  237  4e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00107336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1049  maltodextrin glucosidase  33.2 
 
 		 607 aa  233  6e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0895639 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0446  maltodextrin glucosidase  35.28 
 
 		 605 aa  233  8.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2869  alpha amylase catalytic region  35.02 
 
 		 578 aa  232  1e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0501  maltodextrin glucosidase  35.28 
 
 		 605 aa  232  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.524518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0440  maltodextrin glucosidase  34.85 
 
 		 605 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1187  alpha amylase, catalytic region  34.1 
 
 		 574 aa  230  4e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.649745  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0459  maltodextrin glucosidase  34.42 
 
 		 605 aa  229  9e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2579  alpha amylase catalytic region  34.59 
 
 		 576 aa  226  9e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000456037  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0693  alpha amylase catalytic region  32.29 
 
 		 589 aa  225  1e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.544256  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1318  alpha amylase catalytic region  32.29 
 
 		 486 aa  225  1e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.844059  normal  0.130735 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002973  maltodextrin glucosidase  33 
 
 		 608 aa  225  2e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1856  Alpha amylase, catalytic region  30.52 
 
 		 586 aa  223  6e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1944  alpha amylase catalytic region  31.91 
 
 		 486 aa  222  9e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1971  alpha amylase catalytic region  31.91 
 
 		 486 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0248141  normal  0.0160527 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0084  pullulanase  30.65 
 
 		 606 aa  221  3e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1046  4-alpha-glucanotransferase  32.47 
 
 		 1145 aa  218  2e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3419  hypothetical protein  31.32 
 
 		 481 aa  217  2.9999999999999998e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.488491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  29.04 
 
 		 1847 aa  216  8e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3842  alpha amylase catalytic region  30.83 
 
 		 586 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000752132  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2715  alpha amylase catalytic region  31.12 
 
 		 586 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.783965  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1114  alpha amylase catalytic subunit  35.19 
 
 		 580 aa  213  7e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0144434  normal  0.666267 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4139  alpha-amylase  30.04 
 
 		 586 aa  211  3e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00110847  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1458  alpha amylase, catalytic region  30.5 
 
 		 651 aa  211  3e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3131  maltodextrin glucosidase  32.02 
 
 		 609 aa  210  4e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3271  maltodextrin glucosidase  32.02 
 
 		 609 aa  210  4e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0729  amylopullulanase  31.74 
 
 		 600 aa  210  4e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00401162  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3923  alpha-amylase  29.84 
 
 		 586 aa  210  5e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.077221  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3771  neopullulanase  29.84 
 
 		 586 aa  210  5e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00823842  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4033  alpha-amylase  29.84 
 
 		 586 aa  210  5e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4230  alpha-amylase  29.84 
 
 		 586 aa  210  5e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.300485  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1510  alpha amylase catalytic region  30.96 
 
 		 588 aa  209  8e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1119  alpha-amylase  29.05 
 
 		 586 aa  209  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0181074  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3755  neopullulanase  29.63 
 
 		 586 aa  208  2e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000420185  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4120  alpha-amylase  29.05 
 
 		 586 aa  208  2e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000171258  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3272  alpha amylase catalytic region  28.04 
 
 		 1643 aa  207  3e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16160  alpha amylase catalytic region  30.98 
 
 		 582 aa  207  4e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.135656  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4065  alpha-amylase  29.28 
 
 		 586 aa  206  7e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00857502  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21691  glycoside hydrolase family protein  33.41 
 
 		 483 aa  205  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0470032 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3328  maltodextrin glucosidase  32.94 
 
 		 596 aa  204  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.307817 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4336  alpha amylase catalytic region  28.73 
 
 		 914 aa  202  9e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1313  alpha amylase, catalytic domain protein  31.3 
 
 		 459 aa  201  1.9999999999999998e-50  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2916  Alpha-amylase  31.75 
 
 		 472 aa  200  5e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0795  alpha amylase, catalytic region  29.51 
 
 		 575 aa  199  9e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3195  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  28.07 
 
 		 1193 aa  197  3e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0209  alpha amylase catalytic region  31.94 
 
 		 587 aa  197  3e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.214929  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1167  alpha amylase catalytic region  32.47 
 
 		 576 aa  197  3e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.823071  normal  0.49953 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2350  alpha amylase catalytic region  32.88 
 
 		 583 aa  197  4.0000000000000005e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0501  alpha amylase domain-containing protein  32.4 
 
 		 476 aa  196  9e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.259034  normal  0.140596 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1852  neopullulanase  32.67 
 
 		 584 aa  194  2e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.496782  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0475  alpha amylase, catalytic region  30.69 
 
 		 608 aa  192  1e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.350663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13890  glycosidase  31.01 
 
 		 624 aa  190  4e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.496833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5858  alpha amylase catalytic region  32.16 
 
 		 569 aa  190  4e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.364305 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1613  alpha amylase, catalytic region  28.36 
 
 		 589 aa  190  5.999999999999999e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.050548  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2874  alpha amylase catalytic region  26.52 
 
 		 1299 aa  189  8e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1524  alpha amylase catalytic region  30.15 
 
 		 634 aa  189  1e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.383652 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1834  alpha amylase domain-containing protein  32.44 
 
 		 480 aa  187  4e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.108338  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0557  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  28.75 
 
 		 1175 aa  187  4e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.641532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0802  glycosy hydrolase family protein  32.08 
 
 		 610 aa  187  4e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.124248  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0938  maltodextrin glucosidase  29.57 
 
 		 590 aa  186  8e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0789  cymH protein  29.65 
 
 		 610 aa  186  8e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2327  alpha amylase catalytic region  28.17 
 
 		 1401 aa  185  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.775797  normal  0.294215 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0369  alpha amylase catalytic region  28.83 
 
 		 659 aa  184  4.0000000000000006e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17020  glycosidase  28.6 
 
 		 727 aa  183  7e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2278  alpha amylase catalytic region  28.88 
 
 		 1307 aa  182  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.792883  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2452  alpha amylase, catalytic region  27.64 
 
 		 1401 aa  181  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0187956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3146  alpha amylase catalytic region  31.4 
 
 		 622 aa  179  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.476414 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1458  alpha amylase, catalytic region  29.44 
 
 		 644 aa  178  2e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.628846  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3180  alpha amylase catalytic region  29.58 
 
 		 635 aa  177  3e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000161809  normal  0.231974 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4335  alpha amylase catalytic region  28.24 
 
 		 1753 aa  171  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.167512  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2294  alpha amylase catalytic region  28.51 
 
 		 611 aa  169  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2159  alpha amylase catalytic region  28.87 
 
 		 647 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.826727  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0215  neopullulanase  32.81 
 
 		 574 aa  166  8e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0425343  hitchhiker  0.000179088 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>