More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_3271 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00351  maltodextrin glucosidase  57.73 
 
 		 605 aa  727    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3206  alpha amylase catalytic region  57.57 
 
 		 605 aa  726    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.608393  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0434  maltodextrin glucosidase  58.36 
 
 		 605 aa  735    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0480  maltodextrin glucosidase  58.06 
 
 		 604 aa  733    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3230  maltodextrin glucosidase  57.73 
 
 		 605 aa  727    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000268324 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0440  maltodextrin glucosidase  58.55 
 
 		 605 aa  739    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00355  hypothetical protein  57.73 
 
 		 605 aa  727    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0446  maltodextrin glucosidase  58.88 
 
 		 605 aa  745    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0459  maltodextrin glucosidase  58.39 
 
 		 605 aa  736    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3281  maltodextrin glucosidase  99.75 
 
 		 414 aa  815    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0122809 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1049  maltodextrin glucosidase  72.8 
 
 		 607 aa  925    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0895639 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0501  maltodextrin glucosidase  59.05 
 
 		 605 aa  746    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.524518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3131  maltodextrin glucosidase  99.51 
 
 		 609 aa  1251    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3271  maltodextrin glucosidase  100 
 
 		 609 aa  1258    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0871  maltodextrin glucosidase  56.23 
 
 		 605 aa  703    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0473  maltodextrin glucosidase  58.06 
 
 		 605 aa  731    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0433  maltodextrin glucosidase  57.89 
 
 		 605 aa  730    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002973  maltodextrin glucosidase  40.77 
 
 		 608 aa  448  1.0000000000000001e-124  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3392  maltodextrin glucosidase  99.54 
 
 		 225 aa  445  1.0000000000000001e-124  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.739616 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2274  alpha amylase catalytic region  41.61 
 
 		 614 aa  390  1e-107  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0525857 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3705  alpha amylase catalytic region  36.41 
 
 		 617 aa  374  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00647332  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1167  alpha amylase catalytic region  35.65 
 
 		 576 aa  318  2e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.823071  normal  0.49953 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1114  alpha amylase catalytic subunit  38 
 
 		 580 aa  314  2.9999999999999996e-84  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0144434  normal  0.666267 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0475  alpha amylase, catalytic region  40.04 
 
 		 608 aa  300  4e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.350663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0611  alpha amylase, catalytic region  40.52 
 
 		 496 aa  281  3e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.132901 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1524  alpha amylase catalytic region  33.08 
 
 		 634 aa  266  1e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.383652 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1998  alpha amylase catalytic region  37.08 
 
 		 481 aa  265  2e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.722533  normal  0.515841 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4343  alpha amylase catalytic region  36.44 
 
 		 481 aa  260  5.0000000000000005e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2017  Alpha amylase, catalytic region  37.88 
 
 		 488 aa  258  2e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00107336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1431  alpha amylase catalytic region  35.03 
 
 		 663 aa  258  2e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.246388  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1712  alpha amylase, catalytic region  36.8 
 
 		 481 aa  258  2e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13890  glycosidase  31.03 
 
 		 624 aa  258  3e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.496833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4392  alpha amylase, catalytic region  35.46 
 
 		 493 aa  253  8.000000000000001e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.47907 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4682  alpha amylase catalytic region  31.57 
 
 		 609 aa  253  9.000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2092  alpha amylase catalytic subunit  34.42 
 
 		 484 aa  250  5e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0253645  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4625  alpha amylase catalytic region  35.67 
 
 		 481 aa  248  2e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0369  alpha amylase catalytic region  29.12 
 
 		 659 aa  247  4.9999999999999997e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2159  alpha amylase catalytic region  32.7 
 
 		 647 aa  247  4.9999999999999997e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.826727  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0534  alpha amylase catalytic region  36.27 
 
 		 487 aa  245  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.595542  normal  0.941542 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1944  alpha amylase catalytic region  33.79 
 
 		 486 aa  243  6e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1971  alpha amylase catalytic region  33.6 
 
 		 486 aa  242  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0248141  normal  0.0160527 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3328  maltodextrin glucosidase  30 
 
 		 596 aa  241  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.307817 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5858  alpha amylase catalytic region  30.53 
 
 		 569 aa  241  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.364305 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1510  alpha amylase catalytic region  34.93 
 
 		 588 aa  239  8e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1856  Alpha amylase, catalytic region  33.79 
 
 		 586 aa  239  1e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0209  alpha amylase catalytic region  34.92 
 
 		 587 aa  239  1e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.214929  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1318  alpha amylase catalytic region  33.8 
 
 		 486 aa  239  1e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.844059  normal  0.130735 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3923  alpha-amylase  33.33 
 
 		 586 aa  238  2e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.077221  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3771  neopullulanase  33.33 
 
 		 586 aa  238  2e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00823842  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4230  alpha-amylase  33.33 
 
 		 586 aa  238  2e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.300485  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4033  alpha-amylase  33.33 
 
 		 586 aa  238  2e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0938  maltodextrin glucosidase  30.81 
 
 		 590 aa  238  3e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275177  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3755  neopullulanase  33.14 
 
 		 586 aa  237  5.0000000000000005e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000420185  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3419  hypothetical protein  34.91 
 
 		 481 aa  236  6e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.488491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4139  alpha-amylase  33.53 
 
 		 586 aa  236  7e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00110847  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2294  alpha amylase catalytic region  31.68 
 
 		 611 aa  236  9e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4120  alpha-amylase  32.12 
 
 		 586 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000171258  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1187  alpha amylase, catalytic region  32.1 
 
 		 574 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.649745  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1119  alpha-amylase  32.12 
 
 		 586 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0181074  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0693  alpha amylase catalytic region  29.8 
 
 		 589 aa  234  4.0000000000000004e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.544256  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3842  alpha amylase catalytic region  33.27 
 
 		 586 aa  233  5e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000752132  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4065  alpha-amylase  32.94 
 
 		 586 aa  233  6e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00857502  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0747  alpha amylase, catalytic region  34.5 
 
 		 655 aa  232  1e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.29476  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0987  alpha amylase catalytic region  33.27 
 
 		 473 aa  230  6e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0969  alpha amylase, catalytic region  33.27 
 
 		 473 aa  230  6e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3073  alpha amylase catalytic region  34.74 
 
 		 477 aa  229  1e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0557  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  30.58 
 
 		 1175 aa  226  7e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.641532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16160  alpha amylase catalytic region  32.68 
 
 		 582 aa  226  9e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.135656  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2715  alpha amylase catalytic region  31.42 
 
 		 586 aa  226  1e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.783965  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0789  cymH protein  31.82 
 
 		 610 aa  225  2e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2916  Alpha-amylase  34.5 
 
 		 472 aa  221  1.9999999999999999e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1580  alpha amylase, catalytic region  35.32 
 
 		 475 aa  220  6e-56  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0569736  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0729  amylopullulanase  30.09 
 
 		 600 aa  219  7.999999999999999e-56  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00401162  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0802  glycosy hydrolase family protein  31.4 
 
 		 610 aa  219  1e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.124248  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3272  alpha amylase catalytic region  30.51 
 
 		 1643 aa  218  2e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1458  alpha amylase, catalytic region  28.64 
 
 		 651 aa  216  7e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1313  alpha amylase, catalytic domain protein  31.5 
 
 		 459 aa  215  1.9999999999999998e-54  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1613  alpha amylase, catalytic region  33.03 
 
 		 589 aa  215  1.9999999999999998e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.050548  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17020  glycosidase  32.32 
 
 		 727 aa  214  2.9999999999999995e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0795  alpha amylase, catalytic region  27.71 
 
 		 575 aa  214  2.9999999999999995e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2579  alpha amylase catalytic region  29.14 
 
 		 576 aa  212  2e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000456037  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2350  alpha amylase catalytic region  31.14 
 
 		 583 aa  211  4e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0084  pullulanase  29.05 
 
 		 606 aa  210  5e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0586  alpha amylase catalytic region  32.02 
 
 		 479 aa  210  5e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.532649  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0221  alpha amylase catalytic region  33.04 
 
 		 474 aa  210  6e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  32.09 
 
 		 1847 aa  209  9e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2278  alpha amylase catalytic region  31.39 
 
 		 1307 aa  207  4e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.792883  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2874  alpha amylase catalytic region  30.74 
 
 		 1299 aa  206  1e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1852  neopullulanase  32.71 
 
 		 584 aa  201  3e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.496782  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4336  alpha amylase catalytic region  27.61 
 
 		 914 aa  201  3.9999999999999996e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3195  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  28.78 
 
 		 1193 aa  201  3.9999999999999996e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21691  glycoside hydrolase family protein  34.8 
 
 		 483 aa  197  5.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0470032 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1458  alpha amylase, catalytic region  30.77 
 
 		 644 aa  196  7e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.628846  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0286  alpha amylase catalytic region  28.22 
 
 		 611 aa  196  9e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.109454  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2327  alpha amylase catalytic region  28.85 
 
 		 1401 aa  194  3e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.775797  normal  0.294215 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0215  neopullulanase  30.77 
 
 		 574 aa  193  6e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0425343  hitchhiker  0.000179088 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2452  alpha amylase, catalytic region  29.54 
 
 		 1401 aa  193  9e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0187956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1046  4-alpha-glucanotransferase  32.22 
 
 		 1145 aa  192  1e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4335  alpha amylase catalytic region  28.5 
 
 		 1753 aa  192  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.167512  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2869  alpha amylase catalytic region  32.27 
 
 		 578 aa  189  9e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>