More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4335 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4335  alpha amylase catalytic region  100 
 
 
1753 aa  3574    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.167512  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2452  alpha amylase, catalytic region  38.66 
 
 
1401 aa  764    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0187956  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2278  alpha amylase catalytic region  37.81 
 
 
1307 aa  728    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.792883  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2327  alpha amylase catalytic region  38.83 
 
 
1401 aa  735    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.775797  normal  0.294215 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  31.16 
 
 
1847 aa  538  1e-151  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3272  alpha amylase catalytic region  29.58 
 
 
1643 aa  484  1e-135  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4336  alpha amylase catalytic region  32.19 
 
 
914 aa  320  2e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2874  alpha amylase catalytic region  31.39 
 
 
1299 aa  318  8e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3195  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  30.42 
 
 
1193 aa  282  5e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1458  alpha amylase, catalytic region  31.63 
 
 
651 aa  280  2e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0557  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  26.37 
 
 
1175 aa  263  2e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.641532  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1187  alpha amylase, catalytic region  29.63 
 
 
574 aa  257  2.0000000000000002e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.649745  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17020  glycosidase  30.61 
 
 
727 aa  256  4.0000000000000004e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0084  pullulanase  28.38 
 
 
606 aa  253  3e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1046  4-alpha-glucanotransferase  29.42 
 
 
1145 aa  249  4.9999999999999997e-64  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1510  alpha amylase catalytic region  28.7 
 
 
588 aa  245  5e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2916  Alpha-amylase  33.39 
 
 
472 aa  244  7.999999999999999e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16160  alpha amylase catalytic region  28.85 
 
 
582 aa  243  2e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.135656  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1856  Alpha amylase, catalytic region  33.57 
 
 
586 aa  239  3e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1712  alpha amylase, catalytic region  33.51 
 
 
481 aa  237  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3073  alpha amylase catalytic region  31.56 
 
 
477 aa  234  1e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1431  alpha amylase catalytic region  29.06 
 
 
663 aa  233  2e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.246388  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0369  alpha amylase catalytic region  27.79 
 
 
659 aa  229  4e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1998  alpha amylase catalytic region  32.42 
 
 
481 aa  229  4e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.722533  normal  0.515841 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0209  alpha amylase catalytic region  30.23 
 
 
587 aa  227  2e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.214929  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1119  alpha-amylase  27.06 
 
 
586 aa  226  3e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0181074  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0802  glycosy hydrolase family protein  26.59 
 
 
610 aa  224  9.999999999999999e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.124248  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4343  alpha amylase catalytic region  31.98 
 
 
481 aa  224  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4120  alpha-amylase  27.06 
 
 
586 aa  223  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000171258  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3842  alpha amylase catalytic region  26.36 
 
 
586 aa  221  8.999999999999998e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000752132  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0871  maltodextrin glucosidase  32.95 
 
 
605 aa  220  2e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0795  alpha amylase, catalytic region  28.31 
 
 
575 aa  219  2.9999999999999998e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3419  hypothetical protein  32.3 
 
 
481 aa  219  4e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.488491  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1318  alpha amylase catalytic region  30.77 
 
 
486 aa  219  5e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.844059  normal  0.130735 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0446  maltodextrin glucosidase  31.6 
 
 
605 aa  217  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565903  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0693  alpha amylase catalytic region  27.6 
 
 
589 aa  218  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.544256  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0501  maltodextrin glucosidase  31.6 
 
 
605 aa  217  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.524518  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4392  alpha amylase, catalytic region  32.09 
 
 
493 aa  217  1.9999999999999998e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.47907 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4139  alpha-amylase  26.73 
 
 
586 aa  216  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00110847  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0434  maltodextrin glucosidase  32.58 
 
 
605 aa  216  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3755  neopullulanase  26.92 
 
 
586 aa  216  3.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000420185  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4065  alpha-amylase  27.01 
 
 
586 aa  215  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00857502  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4033  alpha-amylase  26.92 
 
 
586 aa  215  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2715  alpha amylase catalytic region  26.9 
 
 
586 aa  215  5.999999999999999e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.783965  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3923  alpha-amylase  26.78 
 
 
586 aa  214  1e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.077221  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4230  alpha-amylase  26.78 
 
 
586 aa  214  1e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.300485  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0789  cymH protein  27.17 
 
 
610 aa  214  1e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00351  maltodextrin glucosidase  32.39 
 
 
605 aa  213  2e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3206  alpha amylase catalytic region  32.39 
 
 
605 aa  213  2e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.608393  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0433  maltodextrin glucosidase  32.39 
 
 
605 aa  213  2e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3771  neopullulanase  26.78 
 
 
586 aa  213  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00823842  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0473  maltodextrin glucosidase  32.39 
 
 
605 aa  213  2e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00355  hypothetical protein  32.39 
 
 
605 aa  213  2e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3230  maltodextrin glucosidase  32.39 
 
 
605 aa  213  2e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000268324 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1049  maltodextrin glucosidase  31.03 
 
 
607 aa  213  4e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0895639 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0611  alpha amylase, catalytic region  32.14 
 
 
496 aa  212  5e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.132901 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0480  maltodextrin glucosidase  31.82 
 
 
604 aa  211  1e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0440  maltodextrin glucosidase  31.25 
 
 
605 aa  211  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2092  alpha amylase catalytic subunit  30.77 
 
 
484 aa  209  3e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0253645  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0459  maltodextrin glucosidase  30.9 
 
 
605 aa  209  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002973  maltodextrin glucosidase  27.83 
 
 
608 aa  207  2e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2017  Alpha amylase, catalytic region  32.36 
 
 
488 aa  205  5e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00107336  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0286  alpha amylase catalytic region  31.02 
 
 
611 aa  205  7e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.109454  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4625  alpha amylase catalytic region  30.68 
 
 
481 aa  205  8e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1613  alpha amylase, catalytic region  28.21 
 
 
589 aa  204  1.9999999999999998e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.050548  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0729  amylopullulanase  26.53 
 
 
600 aa  202  3.9999999999999996e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00401162  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0215  neopullulanase  29.35 
 
 
574 aa  202  3.9999999999999996e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0425343  hitchhiker  0.000179088 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2274  alpha amylase catalytic region  29.22 
 
 
614 aa  202  6e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0525857 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1852  neopullulanase  27.64 
 
 
584 aa  196  3e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.496782  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1944  alpha amylase catalytic region  29.57 
 
 
486 aa  195  6e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1971  alpha amylase catalytic region  29.57 
 
 
486 aa  194  9e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0248141  normal  0.0160527 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0534  alpha amylase catalytic region  31.32 
 
 
487 aa  194  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.595542  normal  0.941542 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3271  maltodextrin glucosidase  28.5 
 
 
609 aa  192  4e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3131  maltodextrin glucosidase  28.67 
 
 
609 aa  192  5e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4128  alpha amylase catalytic region  23.42 
 
 
1012 aa  190  2e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0625116  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1414  alpha amylase catalytic region  31.47 
 
 
703 aa  189  5e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0623392  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1313  alpha amylase, catalytic domain protein  30.34 
 
 
459 aa  188  8e-46  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2869  alpha amylase catalytic region  28.31 
 
 
578 aa  187  1.0000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3705  alpha amylase catalytic region  28.03 
 
 
617 aa  187  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00647332  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21691  glycoside hydrolase family protein  30.72 
 
 
483 aa  182  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0470032 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2350  alpha amylase catalytic region  27.24 
 
 
583 aa  182  5.999999999999999e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2907  alpha amylase catalytic subunit  30.36 
 
 
715 aa  181  9e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.245602 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1167  alpha amylase catalytic region  27.94 
 
 
576 aa  180  2e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.823071  normal  0.49953 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1393  alpha amylase catalytic region  23.03 
 
 
1016 aa  178  7e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1114  alpha amylase catalytic subunit  28.57 
 
 
580 aa  176  2.9999999999999996e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0144434  normal  0.666267 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0221  alpha amylase catalytic region  28.91 
 
 
474 aa  173  3e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3180  alpha amylase catalytic region  27.88 
 
 
635 aa  172  5e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000161809  normal  0.231974 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0501  alpha amylase domain-containing protein  30.63 
 
 
476 aa  172  7e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.259034  normal  0.140596 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0475  alpha amylase, catalytic region  29.21 
 
 
608 aa  171  1e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.350663  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0586  alpha amylase catalytic region  28.24 
 
 
479 aa  171  1e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.532649  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1580  alpha amylase, catalytic region  29.53 
 
 
475 aa  170  2.9999999999999998e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0569736  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1834  alpha amylase domain-containing protein  32.15 
 
 
480 aa  169  4e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.108338  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0969  alpha amylase, catalytic region  28.78 
 
 
473 aa  167  2.0000000000000002e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0987  alpha amylase catalytic region  28.78 
 
 
473 aa  167  2.0000000000000002e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1524  alpha amylase catalytic region  26.09 
 
 
634 aa  165  6e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.383652 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5858  alpha amylase catalytic region  26.85 
 
 
569 aa  164  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.364305 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13890  glycosidase  25 
 
 
624 aa  154  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.496833  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0794  alpha amylase catalytic region  25.33 
 
 
562 aa  152  8e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3146  alpha amylase catalytic region  27.2 
 
 
622 aa  151  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.476414 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4682  alpha amylase catalytic region  27.33 
 
 
609 aa  150  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>