More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1458 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_1458  alpha amylase, catalytic region  100 
 
 		 644 aa  1287    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.628846  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0795  alpha amylase, catalytic region  34.96 
 
 		 575 aa  296  7e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0802  glycosy hydrolase family protein  34.79 
 
 		 610 aa  276  1.0000000000000001e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.124248  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0693  alpha amylase catalytic region  32.04 
 
 		 589 aa  273  9e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.544256  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0789  cymH protein  33.92 
 
 		 610 aa  270  7e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1119  alpha-amylase  30.39 
 
 		 586 aa  267  4e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0181074  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4120  alpha-amylase  30.21 
 
 		 586 aa  264  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000171258  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1187  alpha amylase, catalytic region  31 
 
 		 574 aa  263  6e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.649745  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3842  alpha amylase catalytic region  30.39 
 
 		 586 aa  263  6.999999999999999e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000752132  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1510  alpha amylase catalytic region  31.81 
 
 		 588 aa  262  1e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0611  alpha amylase, catalytic region  36.23 
 
 		 496 aa  262  2e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.132901 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2715  alpha amylase catalytic region  30.54 
 
 		 586 aa  259  1e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.783965  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4065  alpha-amylase  30.04 
 
 		 586 aa  256  9e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00857502  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4139  alpha-amylase  29.68 
 
 		 586 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00110847  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1998  alpha amylase catalytic region  35.21 
 
 		 481 aa  255  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.722533  normal  0.515841 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16160  alpha amylase catalytic region  31.28 
 
 		 582 aa  254  5.000000000000001e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.135656  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1712  alpha amylase, catalytic region  34.77 
 
 		 481 aa  253  6e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3923  alpha-amylase  29.86 
 
 		 586 aa  253  8.000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.077221  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4230  alpha-amylase  29.86 
 
 		 586 aa  253  8.000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.300485  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3771  neopullulanase  29.86 
 
 		 586 aa  253  1e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00823842  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4033  alpha-amylase  29.86 
 
 		 586 aa  253  1e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3755  neopullulanase  29.68 
 
 		 586 aa  251  2e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000420185  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0209  alpha amylase catalytic region  32.33 
 
 		 587 aa  251  3e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.214929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2017  Alpha amylase, catalytic region  34.14 
 
 		 488 aa  249  9e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00107336  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4625  alpha amylase catalytic region  33.89 
 
 		 481 aa  249  1e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3419  hypothetical protein  35.11 
 
 		 481 aa  246  9.999999999999999e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.488491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4343  alpha amylase catalytic region  32.49 
 
 		 481 aa  246  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1944  alpha amylase catalytic region  33.63 
 
 		 486 aa  246  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1971  alpha amylase catalytic region  33.41 
 
 		 486 aa  243  6e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0248141  normal  0.0160527 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4392  alpha amylase, catalytic region  34.14 
 
 		 493 aa  243  6e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.47907 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1856  Alpha amylase, catalytic region  31.83 
 
 		 586 aa  243  9e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3073  alpha amylase catalytic region  31.49 
 
 		 477 aa  243  1e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0534  alpha amylase catalytic region  34.5 
 
 		 487 aa  240  5e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.595542  normal  0.941542 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1431  alpha amylase catalytic region  27.73 
 
 		 663 aa  240  5.999999999999999e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.246388  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2092  alpha amylase catalytic subunit  32.3 
 
 		 484 aa  234  3e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0253645  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1318  alpha amylase catalytic region  33.69 
 
 		 486 aa  233  7.000000000000001e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.844059  normal  0.130735 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2916  Alpha-amylase  36.07 
 
 		 472 aa  230  7e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0215  neopullulanase  30.02 
 
 		 574 aa  228  3e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0425343  hitchhiker  0.000179088 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1852  neopullulanase  28.7 
 
 		 584 aa  226  1e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.496782  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1613  alpha amylase, catalytic region  28.28 
 
 		 589 aa  223  9.999999999999999e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.050548  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1313  alpha amylase, catalytic domain protein  32.18 
 
 		 459 aa  216  8e-55  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3180  alpha amylase catalytic region  32.95 
 
 		 635 aa  212  2e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000161809  normal  0.231974 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0794  alpha amylase catalytic region  29.56 
 
 		 562 aa  205  2e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2869  alpha amylase catalytic region  32.37 
 
 		 578 aa  202  9.999999999999999e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21691  glycoside hydrolase family protein  32.79 
 
 		 483 aa  202  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0470032 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2579  alpha amylase catalytic region  31.93 
 
 		 576 aa  200  7e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000456037  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3131  maltodextrin glucosidase  30.77 
 
 		 609 aa  197  7e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3271  maltodextrin glucosidase  30.77 
 
 		 609 aa  196  8.000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0987  alpha amylase catalytic region  31.25 
 
 		 473 aa  194  3e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0969  alpha amylase, catalytic region  31.25 
 
 		 473 aa  194  3e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2350  alpha amylase catalytic region  29.18 
 
 		 583 aa  194  5e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3146  alpha amylase catalytic region  30.68 
 
 		 622 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.476414 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1049  maltodextrin glucosidase  29.98 
 
 		 607 aa  190  7e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0895639 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0475  alpha amylase, catalytic region  32.89 
 
 		 608 aa  189  1e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.350663  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1167  alpha amylase catalytic region  31.36 
 
 		 576 aa  187  6e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.823071  normal  0.49953 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0501  alpha amylase domain-containing protein  30.98 
 
 		 476 aa  186  1.0000000000000001e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.259034  normal  0.140596 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3705  alpha amylase catalytic region  27.73 
 
 		 617 aa  186  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00647332  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002973  maltodextrin glucosidase  30.48 
 
 		 608 aa  185  3e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4463  alpha amylase catalytic region  31.61 
 
 		 442 aa  182  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.469495 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0459  maltodextrin glucosidase  31.5 
 
 		 605 aa  182  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2907  alpha amylase catalytic subunit  28.92 
 
 		 715 aa  181  4e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.245602 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0871  maltodextrin glucosidase  30.43 
 
 		 605 aa  181  4e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0221  alpha amylase catalytic region  29.49 
 
 		 474 aa  179  1e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0440  maltodextrin glucosidase  31.34 
 
 		 605 aa  179  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0446  maltodextrin glucosidase  31.14 
 
 		 605 aa  179  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0434  maltodextrin glucosidase  30.91 
 
 		 605 aa  179  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0501  maltodextrin glucosidase  31.14 
 
 		 605 aa  179  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.524518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0586  alpha amylase catalytic region  29.44 
 
 		 479 aa  178  3e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.532649  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1114  alpha amylase catalytic subunit  29.78 
 
 		 580 aa  177  4e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0144434  normal  0.666267 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0433  maltodextrin glucosidase  30.31 
 
 		 605 aa  177  7e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0473  maltodextrin glucosidase  30.31 
 
 		 605 aa  177  7e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3206  alpha amylase catalytic region  29.86 
 
 		 605 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.608393  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0480  maltodextrin glucosidase  30.06 
 
 		 604 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00351  maltodextrin glucosidase  29.86 
 
 		 605 aa  176  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3230  maltodextrin glucosidase  29.86 
 
 		 605 aa  176  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000268324 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00355  hypothetical protein  29.86 
 
 		 605 aa  176  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1834  alpha amylase domain-containing protein  33.01 
 
 		 480 aa  175  2.9999999999999996e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.108338  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2274  alpha amylase catalytic region  28.96 
 
 		 614 aa  169  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0525857 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1580  alpha amylase, catalytic region  28.21 
 
 		 475 aa  167  8e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0569736  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5858  alpha amylase catalytic region  29.06 
 
 		 569 aa  165  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.364305 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24550  glycosidase  32.47 
 
 		 464 aa  164  4.0000000000000004e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.665242 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  28.69 
 
 		 499 aa  161  4e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  27.14 
 
 		 510 aa  160  8e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2771  alpha amylase, catalytic region  31.7 
 
 		 433 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.473519  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2815  alpha amylase, catalytic region  31.7 
 
 		 433 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.896664  normal  0.115274 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2798  alpha amylase, catalytic region  31.7 
 
 		 433 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.242606  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3272  alpha amylase catalytic region  24.27 
 
 		 1643 aa  158  3e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0729  amylopullulanase  26.61 
 
 		 600 aa  157  4e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00401162  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2149  alpha amylase, catalytic region  30.29 
 
 		 532 aa  158  4e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2452  alpha amylase, catalytic region  29.4 
 
 		 1401 aa  158  4e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0187956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0557  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  25.55 
 
 		 1175 aa  157  5.0000000000000005e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.641532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  28.33 
 
 		 511 aa  156  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0835  alpha amylase catalytic region  28.27 
 
 		 549 aa  156  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2327  alpha amylase catalytic region  29.42 
 
 		 1401 aa  155  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.775797  normal  0.294215 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0938  maltodextrin glucosidase  27.88 
 
 		 590 aa  154  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0369  alpha amylase catalytic region  24.24 
 
 		 659 aa  153  1e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4246  alpha amylase catalytic region  29.21 
 
 		 593 aa  152  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.286976  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1414  alpha amylase catalytic region  29.23 
 
 		 703 aa  152  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0623392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4127  Alpha amylase, catalytic region  29.19 
 
 		 545 aa  152  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4280  alpha amylase catalytic region  28.35 
 
 		 541 aa  152  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>