More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2579 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_2579  alpha amylase catalytic region  100 
 
 
576 aa  1183    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000456037  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2869  alpha amylase catalytic region  42.53 
 
 
578 aa  382  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1187  alpha amylase, catalytic region  41.4 
 
 
574 aa  384  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.649745  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16160  alpha amylase catalytic region  36.89 
 
 
582 aa  363  5.0000000000000005e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.135656  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1510  alpha amylase catalytic region  37.5 
 
 
588 aa  362  7.0000000000000005e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0693  alpha amylase catalytic region  37.55 
 
 
589 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.544256  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0795  alpha amylase, catalytic region  35.33 
 
 
575 aa  352  1e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4033  alpha-amylase  34.35 
 
 
586 aa  351  2e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3923  alpha-amylase  34.18 
 
 
586 aa  350  5e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.077221  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4230  alpha-amylase  34.18 
 
 
586 aa  350  5e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.300485  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3771  neopullulanase  34.18 
 
 
586 aa  350  6e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00823842  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3755  neopullulanase  34.01 
 
 
586 aa  348  2e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000420185  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3842  alpha amylase catalytic region  33.22 
 
 
586 aa  346  5e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000752132  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4139  alpha-amylase  33.45 
 
 
586 aa  344  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00110847  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1119  alpha-amylase  32.83 
 
 
586 aa  343  7e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0181074  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4065  alpha-amylase  33.22 
 
 
586 aa  342  8e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00857502  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2715  alpha amylase catalytic region  34.59 
 
 
586 aa  341  2e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.783965  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4120  alpha-amylase  32.83 
 
 
586 aa  340  4e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000171258  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1852  neopullulanase  35.58 
 
 
584 aa  334  3e-90  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.496782  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0209  alpha amylase catalytic region  35.9 
 
 
587 aa  331  2e-89  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.214929  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1613  alpha amylase, catalytic region  30.81 
 
 
589 aa  320  3.9999999999999996e-86  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.050548  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1856  Alpha amylase, catalytic region  34.93 
 
 
586 aa  314  1.9999999999999998e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0789  cymH protein  37.06 
 
 
610 aa  314  2.9999999999999996e-84  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0215  neopullulanase  35.33 
 
 
574 aa  312  1e-83  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0425343  hitchhiker  0.000179088 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0611  alpha amylase, catalytic region  35.27 
 
 
496 aa  308  2.0000000000000002e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.132901 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0802  glycosy hydrolase family protein  36.36 
 
 
610 aa  308  2.0000000000000002e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.124248  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2350  alpha amylase catalytic region  38.24 
 
 
583 aa  291  2e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1318  alpha amylase catalytic region  36.49 
 
 
486 aa  290  5.0000000000000004e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.844059  normal  0.130735 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1712  alpha amylase, catalytic region  36.14 
 
 
481 aa  288  2e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3419  hypothetical protein  36.09 
 
 
481 aa  286  5.999999999999999e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.488491  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2017  Alpha amylase, catalytic region  38.57 
 
 
488 aa  286  9e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00107336  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1998  alpha amylase catalytic region  35.44 
 
 
481 aa  285  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.722533  normal  0.515841 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3073  alpha amylase catalytic region  37.38 
 
 
477 aa  285  2.0000000000000002e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2092  alpha amylase catalytic subunit  35.1 
 
 
484 aa  276  1.0000000000000001e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0253645  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0534  alpha amylase catalytic region  34.48 
 
 
487 aa  273  5.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.595542  normal  0.941542 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1431  alpha amylase catalytic region  34.39 
 
 
663 aa  270  5e-71  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.246388  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4625  alpha amylase catalytic region  37.84 
 
 
481 aa  270  5.9999999999999995e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4392  alpha amylase, catalytic region  36.53 
 
 
493 aa  269  1e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.47907 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4343  alpha amylase catalytic region  35.78 
 
 
481 aa  268  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2916  Alpha-amylase  37.65 
 
 
472 aa  263  6.999999999999999e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1313  alpha amylase, catalytic domain protein  36.39 
 
 
459 aa  259  7e-68  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1971  alpha amylase catalytic region  33.03 
 
 
486 aa  258  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0248141  normal  0.0160527 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1944  alpha amylase catalytic region  33.26 
 
 
486 aa  258  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21691  glycoside hydrolase family protein  33.99 
 
 
483 aa  249  1e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0470032 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2907  alpha amylase catalytic subunit  33.78 
 
 
715 aa  231  2e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.245602 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1834  alpha amylase domain-containing protein  31.21 
 
 
480 aa  227  6e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.108338  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0586  alpha amylase catalytic region  34.59 
 
 
479 aa  226  1e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.532649  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1414  alpha amylase catalytic region  32.59 
 
 
703 aa  226  1e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0623392  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3705  alpha amylase catalytic region  28.6 
 
 
617 aa  225  2e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00647332  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0987  alpha amylase catalytic region  34.33 
 
 
473 aa  224  3e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0969  alpha amylase, catalytic region  34.33 
 
 
473 aa  224  3e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1580  alpha amylase, catalytic region  37.72 
 
 
475 aa  222  1.9999999999999999e-56  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0569736  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0221  alpha amylase catalytic region  33.26 
 
 
474 aa  218  2.9999999999999998e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1046  4-alpha-glucanotransferase  32.92 
 
 
1145 aa  217  4e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0729  amylopullulanase  31.72 
 
 
600 aa  214  1.9999999999999998e-54  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00401162  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0501  alpha amylase domain-containing protein  31.41 
 
 
476 aa  213  4.9999999999999996e-54  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.259034  normal  0.140596 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  32.92 
 
 
1847 aa  213  5.999999999999999e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002973  maltodextrin glucosidase  31.1 
 
 
608 aa  213  7.999999999999999e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2274  alpha amylase catalytic region  30.46 
 
 
614 aa  213  1e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0525857 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0084  pullulanase  31.01 
 
 
606 aa  211  2e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3271  maltodextrin glucosidase  29.14 
 
 
609 aa  212  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3131  maltodextrin glucosidase  29.14 
 
 
609 aa  211  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0794  alpha amylase catalytic region  32.65 
 
 
562 aa  211  3e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1049  maltodextrin glucosidase  29.39 
 
 
607 aa  209  1e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0895639 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17020  glycosidase  29.62 
 
 
727 aa  207  5e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5858  alpha amylase catalytic region  29.76 
 
 
569 aa  203  6e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.364305 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13890  glycosidase  29.92 
 
 
624 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.496833  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1458  alpha amylase, catalytic region  31.93 
 
 
644 aa  200  6e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.628846  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0480  maltodextrin glucosidase  27.2 
 
 
604 aa  199  9e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3206  alpha amylase catalytic region  27.2 
 
 
605 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.608393  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00351  maltodextrin glucosidase  27.2 
 
 
605 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3328  maltodextrin glucosidase  28.91 
 
 
596 aa  198  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.307817 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00355  hypothetical protein  27.2 
 
 
605 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3230  maltodextrin glucosidase  27.2 
 
 
605 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000268324 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0938  maltodextrin glucosidase  26.75 
 
 
590 aa  197  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275177  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0434  maltodextrin glucosidase  27.18 
 
 
605 aa  197  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0473  maltodextrin glucosidase  26.98 
 
 
605 aa  197  6e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0557  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  28.78 
 
 
1175 aa  196  7e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.641532  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0433  maltodextrin glucosidase  26.98 
 
 
605 aa  196  8.000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0871  maltodextrin glucosidase  29.45 
 
 
605 aa  196  1e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2159  alpha amylase catalytic region  26.63 
 
 
647 aa  194  4e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.826727  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3272  alpha amylase catalytic region  28.87 
 
 
1643 aa  194  5e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1167  alpha amylase catalytic region  29.61 
 
 
576 aa  193  8e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.823071  normal  0.49953 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0501  maltodextrin glucosidase  27.9 
 
 
605 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.524518  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3195  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  28.84 
 
 
1193 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1458  alpha amylase, catalytic region  27 
 
 
651 aa  190  5.999999999999999e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0440  maltodextrin glucosidase  27.11 
 
 
605 aa  189  9e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1265  alpha amylase catalytic region  30.59 
 
 
463 aa  189  9e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0459  maltodextrin glucosidase  28.45 
 
 
605 aa  189  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1114  alpha amylase catalytic subunit  30 
 
 
580 aa  189  1e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0144434  normal  0.666267 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0446  maltodextrin glucosidase  27.11 
 
 
605 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565903  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1524  alpha amylase catalytic region  26.97 
 
 
634 aa  184  6e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.383652 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0475  alpha amylase, catalytic region  30.12 
 
 
608 aa  182  1e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.350663  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4682  alpha amylase catalytic region  27.34 
 
 
609 aa  182  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2327  alpha amylase catalytic region  27 
 
 
1401 aa  175  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.775797  normal  0.294215 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2452  alpha amylase, catalytic region  26.6 
 
 
1401 aa  175  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0187956  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2874  alpha amylase catalytic region  28.57 
 
 
1299 aa  173  7.999999999999999e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2278  alpha amylase catalytic region  27.57 
 
 
1307 aa  172  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.792883  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4336  alpha amylase catalytic region  28.57 
 
 
914 aa  171  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0369  alpha amylase catalytic region  27.37 
 
 
659 aa  170  7e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>