More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1046 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_1046  4-alpha-glucanotransferase  100 
 
 		 1145 aa  2379    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0557  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  34.21 
 
 		 1175 aa  689    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.641532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17010  4-alpha-glucanotransferase  40.03 
 
 		 856 aa  505  1e-141  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3195  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  37.82 
 
 		 1193 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1458  alpha amylase, catalytic region  37.28 
 
 		 651 aa  422  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0084  pullulanase  37.64 
 
 		 606 aa  395  1e-108  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2874  alpha amylase catalytic region  33.24 
 
 		 1299 aa  333  9e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  32.04 
 
 		 1847 aa  324  5e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0729  amylopullulanase  34.62 
 
 		 600 aa  322  1.9999999999999998e-86  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00401162  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17020  glycosidase  35.32 
 
 		 727 aa  321  6e-86  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2333  4-alpha-glucanotransferase  37.58 
 
 		 497 aa  309  2.0000000000000002e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3452  4-alpha-glucanotransferase  35.06 
 
 		 520 aa  307  9.000000000000001e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120069 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2647  4-alpha-glucanotransferase  37.58 
 
 		 497 aa  305  2.0000000000000002e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1002  4-alpha-glucanotransferase  34.83 
 
 		 514 aa  305  3.0000000000000004e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0388229  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0244  4-alpha-glucanotransferase  34.49 
 
 		 504 aa  302  2e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0155  malto-oligosyltrehalose synthase  31.38 
 
 		 1405 aa  303  2e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1575  4-alpha-glucanotransferase  37.84 
 
 		 512 aa  301  4e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.737195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0251  amylomaltase  39.96 
 
 		 483 aa  300  8e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1822  4-alpha-glucanotransferase  36.49 
 
 		 505 aa  299  2e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2645  4-alpha-glucanotransferase  36.75 
 
 		 516 aa  299  2e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.219759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3896  4-alpha-glucanotransferase  37.22 
 
 		 495 aa  297  8e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.979798 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1459  4-alpha-glucanotransferase  36.07 
 
 		 499 aa  296  1e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1486  4-alpha-glucanotransferase  36.58 
 
 		 509 aa  296  2e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.117914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0433  4-alpha-glucanotransferase  37.2 
 
 		 504 aa  295  3e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.459094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3272  alpha amylase catalytic region  33.49 
 
 		 1643 aa  295  3e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1121  4-alpha-glucanotransferase  36.17 
 
 		 501 aa  295  4e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.644339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2452  alpha amylase, catalytic region  31.91 
 
 		 1401 aa  294  8e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0187956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2278  alpha amylase catalytic region  29.45 
 
 		 1307 aa  293  1e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.792883  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1014  4-alpha-glucanotransferase  36.58 
 
 		 495 aa  291  5.0000000000000004e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.129588  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3246  4-alpha-glucanotransferase  36.18 
 
 		 495 aa  290  7e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1182  4-alpha-glucanotransferase  35.74 
 
 		 493 aa  289  2e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.207388  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1296  4-alpha-glucanotransferase  33.86 
 
 		 505 aa  289  2e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.891573  normal  0.349432 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1263  4-alpha-glucanotransferase  35.83 
 
 		 498 aa  289  2e-76  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.572623  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1017  4-alpha-glucanotransferase  35.67 
 
 		 493 aa  288  4e-76  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00219663  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4956  4-alpha-glucanotransferase  36.06 
 
 		 498 aa  288  5e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1439  4-alpha-glucanotransferase  35.4 
 
 		 498 aa  288  5e-76  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0142582  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1738  4-alpha-glucanotransferase  36.85 
 
 		 497 aa  288  5e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0219743  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3264  4-alpha-glucanotransferase  37.45 
 
 		 502 aa  287  7e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2968  4-alpha-glucanotransferase  36.11 
 
 		 525 aa  287  7e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.34566  decreased coverage  0.00000602964 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0608  4-alpha-glucanotransferase  34.62 
 
 		 497 aa  286  1.0000000000000001e-75  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0630977 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3201  4-alpha-glucanotransferase  35.36 
 
 		 518 aa  286  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.127634  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1708  4-alpha-glucanotransferase  34.45 
 
 		 501 aa  286  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.24711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3100  4-alpha-glucanotransferase  35.36 
 
 		 518 aa  286  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.601917  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1690  4-alpha-glucanotransferase  34.45 
 
 		 501 aa  286  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2391  4-alpha-glucanotransferase  36.13 
 
 		 496 aa  285  3.0000000000000004e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000053446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2764  4-alpha-glucanotransferase  35.63 
 
 		 517 aa  285  4.0000000000000003e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2327  alpha amylase catalytic region  31.34 
 
 		 1401 aa  285  4.0000000000000003e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.775797  normal  0.294215 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1102  4-alpha-glucanotransferase  35.64 
 
 		 501 aa  285  4.0000000000000003e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.399608  normal  0.584525 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0816  4-alpha-glucanotransferase  34.08 
 
 		 488 aa  284  5.000000000000001e-75  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0554  4-alpha-glucanotransferase  35.44 
 
 		 501 aa  284  6.000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0239247  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1468  4-alpha-glucanotransferase  36.51 
 
 		 500 aa  283  9e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00033046 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0041  4-alpha-glucanotransferase  35.92 
 
 		 502 aa  282  2e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3111  4-alpha-glucanotransferase  35.64 
 
 		 503 aa  282  2e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.124455 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3250  4-alpha-glucanotransferase  36.87 
 
 		 499 aa  282  2e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000256283  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0906  4-alpha-glucanotransferase  35.86 
 
 		 482 aa  281  4e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1055  4-alpha-glucanotransferase  34.55 
 
 		 500 aa  281  6e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.919868  hitchhiker  0.00474904 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0906  4-alpha-glucanotransferase  35.68 
 
 		 502 aa  281  7e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0786343  hitchhiker  0.000119798 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2041  4-alpha-glucanotransferase  37.24 
 
 		 493 aa  281  7e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0552  4-alpha-glucanotransferase  34.58 
 
 		 497 aa  280  1e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00709308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2071  4-alpha-glucanotransferase  35.8 
 
 		 495 aa  280  2e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3001  4-alpha-glucanotransferase  35.98 
 
 		 518 aa  279  2e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0206  4-alpha-glucanotransferase  37.07 
 
 		 470 aa  279  2e-73  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.539313 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2811  4-alpha-glucanotransferase  35.8 
 
 		 496 aa  279  3e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000526525  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3276  4-alpha-glucanotransferase  35.06 
 
 		 535 aa  277  1.0000000000000001e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.433715  normal  0.229692 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0667  4-alpha-glucanotransferase  35.61 
 
 		 503 aa  277  1.0000000000000001e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.485353  normal  0.13128 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0510  4-alpha-glucanotransferase  35.87 
 
 		 504 aa  271  5e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.855301  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0865  4-alpha-glucanotransferase  35.52 
 
 		 522 aa  271  5.9999999999999995e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1186  4-alpha-glucanotransferase  36.4 
 
 		 502 aa  270  8e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0510  4-alpha-glucanotransferase  34.96 
 
 		 454 aa  270  1e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11871  4-alpha-glucanotransferase  33.6 
 
 		 506 aa  268  5e-70  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1019  4-alpha-glucanotransferase  35.46 
 
 		 499 aa  267  8e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.147534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2921  4-alpha-glucanotransferase  34.12 
 
 		 499 aa  267  8e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1527  4-alpha-glucanotransferase  37.29 
 
 		 489 aa  267  8.999999999999999e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.969905  decreased coverage  0.0000210459 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1316  4-alpha-glucanotransferase  35.22 
 
 		 479 aa  265  3e-69  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0235  4-alpha-glucanotransferase  35.37 
 
 		 479 aa  265  4e-69  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.788709  normal  0.23673 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1054  4-alpha-glucanotransferase  35.34 
 
 		 499 aa  264  8.999999999999999e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00164715  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4336  alpha amylase catalytic region  30.3 
 
 		 914 aa  263  1e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1092  4-alpha-glucanotransferase  32.22 
 
 		 506 aa  262  2e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.533755  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2959  4-alpha-glucanotransferase  32.93 
 
 		 502 aa  263  2e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5282  malto-oligosyltrehalose synthase  29.6 
 
 		 1411 aa  263  2e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.339944 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1505  4-alpha-glucanotransferase  33.94 
 
 		 496 aa  261  4e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.104049 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0514  4-alpha-glucanotransferase  35.14 
 
 		 512 aa  261  5.0000000000000005e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1473  4-alpha-glucanotransferase  34.55 
 
 		 494 aa  260  9e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3444  4-alpha-glucanotransferase  33.4 
 
 		 497 aa  259  2e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81732e-17 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2912  4-alpha-glucanotransferase  33.33 
 
 		 519 aa  259  2e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11711  4-alpha-glucanotransferase  32.28 
 
 		 506 aa  259  2e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0237  4-alpha-glucanotransferase  33.66 
 
 		 503 aa  258  3e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0624172  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1410  4-alpha-glucanotransferase  34.31 
 
 		 515 aa  258  3e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0343019  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2966  4-alpha-glucanotransferase  34.14 
 
 		 508 aa  257  8e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0817  4-alpha-glucanotransferase  32.99 
 
 		 497 aa  257  1.0000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.960729  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0961  4-alpha-glucanotransferase  33.54 
 
 		 491 aa  254  5.000000000000001e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143538 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2387  4-alpha-glucanotransferase  32.53 
 
 		 540 aa  254  8.000000000000001e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0768  4-alpha-glucanotransferase  36.6 
 
 		 468 aa  253  1e-65  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1049  4-alpha-glucanotransferase  33.87 
 
 		 495 aa  252  3e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44779  predicted protein  33.47 
 
 		 560 aa  252  4e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0420  4-alpha-glucanotransferase  33.33 
 
 		 498 aa  250  9e-65  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2290  4-alpha-glucanotransferase  31.36 
 
 		 499 aa  250  1e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.793425  normal  0.0727641 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0413  4-alpha-glucanotransferase  32.87 
 
 		 507 aa  249  3e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4335  alpha amylase catalytic region  29.42 
 
 		 1753 aa  249  3e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.167512  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11881  4-alpha-glucanotransferase  32.41 
 
 		 507 aa  249  3e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>