More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5282 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5282  malto-oligosyltrehalose synthase  100 
 
 
1411 aa  2939    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.339944 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0155  malto-oligosyltrehalose synthase  52.55 
 
 
1405 aa  1571    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2573  malto-oligosyltrehalose synthase  39.69 
 
 
875 aa  649    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4620  malto-oligosyltrehalose synthase  38.35 
 
 
930 aa  649    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.026371 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3112  malto-oligosyltrehalose synthase  80.17 
 
 
935 aa  1539    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1429  malto-oligosyltrehalose synthase  37.47 
 
 
942 aa  630  1e-179  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0930429  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1395  malto-oligosyltrehalose synthase  37.58 
 
 
942 aa  630  1e-179  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1427  Alpha amylase, catalytic region  37.38 
 
 
922 aa  625  1e-177  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.627603  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2602  a-glycosidase, maltooligosyl trehalose synthase, glycoside hydrolase family 13 protein  37.19 
 
 
916 aa  620  1e-176  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2351  malto-oligosyltrehalose synthase  35.74 
 
 
955 aa  600  1e-170  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1811  malto-oligosyltrehalose synthase  35.89 
 
 
955 aa  572  1e-161  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0317  maltooligosyl trehalose synthase  36.29 
 
 
1013 aa  556  1e-157  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.0021368  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2094  maltooligosyl trehalose synthase  34.89 
 
 
986 aa  548  1e-154  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3267  maltooligosyl trehalose synthase  35.55 
 
 
995 aa  549  1e-154  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0115  maltooligosyl trehalose synthase  33.57 
 
 
994 aa  535  1e-150  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.136948 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0039  malto-oligosyltrehalose synthase  37.02 
 
 
909 aa  535  1e-150  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0134  maltooligosyl trehalose synthase  34.07 
 
 
994 aa  536  1e-150  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0319  malto-oligosyltrehalose synthase  35.49 
 
 
913 aa  534  1e-150  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1402  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  34.84 
 
 
1730 aa  531  1e-149  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.701685  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1174  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  35.55 
 
 
1715 aa  522  1e-146  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.814781  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3933  malto-oligosyltrehalose synthase  35.36 
 
 
940 aa  517  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.734301 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4046  malto-oligosyltrehalose synthase  35.36 
 
 
940 aa  517  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.240234  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05188  putative maltooligosyl trehalose synthase transmembrane protein  36.59 
 
 
940 aa  514  1e-144  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3468  maltooligosyl trehalose synthase  33.23 
 
 
994 aa  511  1e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7548  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  36.18 
 
 
1642 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838098  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0539  malto-oligosyltrehalose synthase  35.26 
 
 
944 aa  507  9.999999999999999e-143  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7155  malto-oligosyltrehalose synthase  36.1 
 
 
869 aa  508  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.915282 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2081  alpha-amylase family protein  35.84 
 
 
969 aa  503  1e-141  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2360  maltooligosyl trehalose synthase  32.96 
 
 
996 aa  504  1e-141  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1738  malto-oligosyltrehalose synthase  35.84 
 
 
969 aa  503  1e-141  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.137829  hitchhiker  0.0000132957 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2763  malto-oligosyltrehalose synthase  33.64 
 
 
1007 aa  504  1e-141  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.200258  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2673  malto-oligosyltrehalose synthase  35.15 
 
 
856 aa  504  1e-141  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.299431  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2985  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  35.6 
 
 
1662 aa  503  1e-141  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.149144  normal  0.0261273 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6326  putative glycosyl hydrolase (glycosidase)  35.78 
 
 
934 aa  503  1e-140  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.420864 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0946  alpha amylase  35.7 
 
 
948 aa  499  1e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.206835  normal  0.69662 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5462  malto-oligosyltrehalose synthase  34.54 
 
 
843 aa  498  1e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2156  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  35.97 
 
 
1703 aa  497  1e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.57322  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2938  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  35.21 
 
 
1646 aa  498  1e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00368766 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1460  malto-oligosyltrehalose synthase  35.64 
 
 
918 aa  499  1e-139  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.251406  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4387  malto-oligosyltrehalose synthase  36.17 
 
 
944 aa  498  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.454726 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2711  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  34.89 
 
 
1646 aa  495  9.999999999999999e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0130297 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6809  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  34.93 
 
 
1647 aa  491  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.687353 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2833  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  34.96 
 
 
1650 aa  493  1e-137  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.280468 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2867  putative glycosyl hydrolase  34.67 
 
 
952 aa  493  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6007  malto-oligosyltrehalose synthase  35.02 
 
 
869 aa  489  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.428975  normal  0.074206 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2280  maltooligosyl trehalose synthase  34.94 
 
 
914 aa  487  1e-136  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0184477  hitchhiker  0.00895039 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1984  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  33.23 
 
 
1673 aa  487  1e-136  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.432862  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2012  malto-oligosyltrehalose synthase  34.51 
 
 
945 aa  488  1e-136  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.409828 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1416  malto-oligosyltrehalose synthase  34.18 
 
 
941 aa  488  1e-136  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0169587  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4168  malto-oligosyltrehalose synthase  34.96 
 
 
928 aa  489  1e-136  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.487417  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6827  malto-oligosyltrehalose synthase  34.98 
 
 
951 aa  487  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.554388 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0293  maltooligosyl trehalose synthase  33.07 
 
 
1009 aa  483  1e-135  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3487  malto-oligosyltrehalose synthase  34.61 
 
 
929 aa  485  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0304  maltooligosyl trehalose synthase  33.33 
 
 
1007 aa  486  1e-135  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1600  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  35.84 
 
 
1633 aa  481  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.290516  hitchhiker  0.00115838 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0315  maltooligosyl trehalose synthase  33.5 
 
 
1007 aa  482  1e-134  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6326  malto-oligosyltrehalose synthase  35.75 
 
 
924 aa  483  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0514594  normal  0.0507365 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1461  malto-oligosyltrehalose synthase  35.01 
 
 
950 aa  479  1e-133  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5596  malto-oligosyltrehalose synthase  36.13 
 
 
924 aa  478  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.49211  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1680  (1,4)-alpha-D-glucan 1-alpha-D-glucosylmutase  34.52 
 
 
940 aa  475  1e-132  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.810186  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1879  malto-oligosyltrehalose synthase  34.4 
 
 
928 aa  475  1e-132  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3682  malto-oligosyltrehalose synthase  35.52 
 
 
926 aa  475  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1539  alpha-amylase family protein  35.46 
 
 
930 aa  473  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.604212  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2452  maltooligosyl trehalose synthase  34.53 
 
 
871 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1336  malto-oligosyltrehalose synthase  35.22 
 
 
921 aa  473  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.253875  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6493  malto-oligosyltrehalose synthase  35.22 
 
 
921 aa  472  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.576977  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6082  malto-oligosyltrehalose synthase  35.12 
 
 
922 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.292692 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2995  maltooligosyl trehalose synthase  35.33 
 
 
927 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.506264  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1779  maltooligosyl trehalose synthase  34.75 
 
 
873 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.932691 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1562  malto-oligosyltrehalose synthase  35.78 
 
 
930 aa  465  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.497391  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0816  maltooligosyl trehalose synthase, putative  35.89 
 
 
930 aa  466  1e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.133141  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1733  malto-oligosyltrehalose synthase  35.89 
 
 
967 aa  466  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1115  maltooligosyl trehalose synthase  34.77 
 
 
871 aa  465  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.435651 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0540  malto-oligosyltrehalose synthase  35.89 
 
 
930 aa  466  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24880  maltooligosyl trehalose synthase  35.63 
 
 
917 aa  464  1e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.022043  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1334  malto-oligosyltrehalose synthase  35.89 
 
 
930 aa  466  1e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.929488  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0615  malto-oligosyltrehalose synthase  35.89 
 
 
930 aa  466  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.360061  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3128  glycosyl hydrolase, family 13  35.33 
 
 
927 aa  463  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.216246  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3452  4-alpha-glucanotransferase  45.47 
 
 
520 aa  461  9.999999999999999e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00120069 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0546  malto-oligosyltrehalose synthase  35.02 
 
 
836 aa  458  1e-127  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1055  4-alpha-glucanotransferase  46.71 
 
 
500 aa  456  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.919868  hitchhiker  0.00474904 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2645  4-alpha-glucanotransferase  46.18 
 
 
516 aa  452  1e-125  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.219759  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1575  4-alpha-glucanotransferase  47.39 
 
 
512 aa  453  1e-125  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.737195  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0507  Alpha amylase, catalytic region  34.82 
 
 
939 aa  451  1e-125  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.213544  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3144  maltooligosyl trehalose synthase  33.47 
 
 
926 aa  452  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1002  4-alpha-glucanotransferase  46.65 
 
 
514 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0388229  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5485  malto-oligosyltrehalose synthase  34.72 
 
 
920 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102779 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7028  maltooligosyl trehalose synthase  33.89 
 
 
923 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0187701  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1705  4-alpha-glucanotransferase  43.95 
 
 
512 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36605  maltooligosyl trehalose synthase  33.86 
 
 
926 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.728588 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4234  alpha amylase domain-containing protein  34.29 
 
 
884 aa  447  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116364  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2546  maltooligosyl trehalose synthase  34.6 
 
 
925 aa  444  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.769998 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4211  maltooligosyl trehalose synthase  33.62 
 
 
875 aa  440  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0510  4-alpha-glucanotransferase  41.88 
 
 
504 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.855301  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3652  maltooligosyl trehalose synthase  34.56 
 
 
924 aa  438  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0116704  normal  0.178483 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1054  4-alpha-glucanotransferase  46.53 
 
 
499 aa  439  1e-121  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00164715  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1263  4-alpha-glucanotransferase  43.51 
 
 
498 aa  439  1e-121  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.572623  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0552  4-alpha-glucanotransferase  42.42 
 
 
497 aa  432  1e-119  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00709308  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0206  4-alpha-glucanotransferase  44.85 
 
 
470 aa  431  1e-119  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.539313 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1821  maltooligosyl trehalose synthase  34.65 
 
 
924 aa  429  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.280947 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>