More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2711 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0134  maltooligosyl trehalose synthase  39.74 
 
 		 994 aa  666    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1600  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  74.74 
 
 		 1633 aa  2364    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.290516  hitchhiker  0.00115838 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2094  maltooligosyl trehalose synthase  40.36 
 
 		 986 aa  661    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2938  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  99.21 
 
 		 1646 aa  3274    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368766 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1174  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  39.92 
 
 		 1715 aa  1031    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.814781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0946  alpha amylase  43.08 
 
 		 948 aa  681    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.206835  normal  0.69662 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2081  alpha-amylase family protein  42.08 
 
 		 969 aa  650    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0115  maltooligosyl trehalose synthase  40.14 
 
 		 994 aa  664    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.136948 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6809  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  71.13 
 
 		 1647 aa  2247    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.687353 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1402  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  38.9 
 
 		 1730 aa  1043    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.701685  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0507  Alpha amylase, catalytic region  44.22 
 
 		 939 aa  655    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.213544  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1984  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  41.2 
 
 		 1673 aa  1069    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.432862  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1879  malto-oligosyltrehalose synthase  42.34 
 
 		 928 aa  655    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2985  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  40.19 
 
 		 1662 aa  952    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.149144  normal  0.0261273 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2156  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  39.67 
 
 		 1703 aa  1055    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.57322  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3682  malto-oligosyltrehalose synthase  42.19 
 
 		 926 aa  662    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1738  malto-oligosyltrehalose synthase  42.08 
 
 		 969 aa  650    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.137829  hitchhiker  0.0000132957 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3487  malto-oligosyltrehalose synthase  43.33 
 
 		 929 aa  659    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1461  malto-oligosyltrehalose synthase  43.54 
 
 		 950 aa  654    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6326  putative glycosyl hydrolase (glycosidase)  44.38 
 
 		 934 aa  676    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.420864 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4168  malto-oligosyltrehalose synthase  43.69 
 
 		 928 aa  692    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.487417  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2833  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  93.79 
 
 		 1650 aa  3049    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.280468 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2711  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  100 
 
 		 1646 aa  3291    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0130297 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7548  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  71.6 
 
 		 1642 aa  2316    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838098  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1680  (1,4)-alpha-D-glucan 1-alpha-D-glucosylmutase  40.07 
 
 		 940 aa  627  1e-178  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.810186  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2280  maltooligosyl trehalose synthase  42.87 
 
 		 914 aa  623  1e-177  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0184477  hitchhiker  0.00895039 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3128  glycosyl hydrolase, family 13  41.02 
 
 		 927 aa  626  1e-177  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.216246  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2995  maltooligosyl trehalose synthase  41.35 
 
 		 927 aa  624  1e-177  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.506264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2546  maltooligosyl trehalose synthase  42.95 
 
 		 925 aa  622  1e-176  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769998 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2763  malto-oligosyltrehalose synthase  39.2 
 
 		 1007 aa  621  1e-176  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.200258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1416  malto-oligosyltrehalose synthase  39.16 
 
 		 941 aa  618  1e-175  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0169587  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2360  maltooligosyl trehalose synthase  39.24 
 
 		 996 aa  615  9.999999999999999e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3933  malto-oligosyltrehalose synthase  43.11 
 
 		 940 aa  615  9.999999999999999e-175  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.734301 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4046  malto-oligosyltrehalose synthase  43.11 
 
 		 940 aa  615  9.999999999999999e-175  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.240234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3468  maltooligosyl trehalose synthase  39.42 
 
 		 994 aa  613  1e-173  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3267  maltooligosyl trehalose synthase  38.8 
 
 		 995 aa  610  1e-173  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3652  maltooligosyl trehalose synthase  41.49 
 
 		 924 aa  608  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0116704  normal  0.178483 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0304  maltooligosyl trehalose synthase  39.82 
 
 		 1007 aa  608  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0293  maltooligosyl trehalose synthase  40.18 
 
 		 1009 aa  605  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0315  maltooligosyl trehalose synthase  39.92 
 
 		 1007 aa  604  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4053  maltooligosyl trehalose synthase  41.13 
 
 		 924 aa  600  1e-170  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.114095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1790  maltooligosyl trehalose synthase  41.24 
 
 		 924 aa  600  1e-170  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.571899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0319  malto-oligosyltrehalose synthase  41.75 
 
 		 913 aa  600  1e-170  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0317  maltooligosyl trehalose synthase  38.79 
 
 		 1013 aa  600  1e-170  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.0021368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1811  malto-oligosyltrehalose synthase  38.65 
 
 		 955 aa  597  1e-169  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2867  putative glycosyl hydrolase  40.15 
 
 		 952 aa  597  1e-169  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1460  malto-oligosyltrehalose synthase  41.94 
 
 		 918 aa  596  1e-168  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.251406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2673  malto-oligosyltrehalose synthase  41.41 
 
 		 856 aa  594  1e-168  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.299431  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1821  maltooligosyl trehalose synthase  41.64 
 
 		 924 aa  596  1e-168  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.280947 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6827  malto-oligosyltrehalose synthase  39.87 
 
 		 951 aa  590  1e-167  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.554388 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0539  malto-oligosyltrehalose synthase  38.07 
 
 		 944 aa  591  1e-167  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05188  putative maltooligosyl trehalose synthase transmembrane protein  43.08 
 
 		 940 aa  587  1e-166  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3144  maltooligosyl trehalose synthase  41.18 
 
 		 926 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24880  maltooligosyl trehalose synthase  41.41 
 
 		 917 aa  572  1e-161  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.022043  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4387  malto-oligosyltrehalose synthase  40.11 
 
 		 944 aa  567  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.454726 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36605  maltooligosyl trehalose synthase  41.38 
 
 		 926 aa  568  1e-160  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.728588 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2351  malto-oligosyltrehalose synthase  38.41 
 
 		 955 aa  569  1e-160  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1429  malto-oligosyltrehalose synthase  35.07 
 
 		 942 aa  562  1e-158  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0930429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1395  malto-oligosyltrehalose synthase  34.97 
 
 		 942 aa  559  1e-157  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1779  maltooligosyl trehalose synthase  41.43 
 
 		 873 aa  556  1e-156  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.932691 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2452  maltooligosyl trehalose synthase  39.06 
 
 		 871 aa  556  1e-156  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4620  malto-oligosyltrehalose synthase  35.81 
 
 		 930 aa  555  1e-156  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.026371 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1115  maltooligosyl trehalose synthase  39.27 
 
 		 871 aa  543  1e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.435651 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4561  malto-oligosyltrehalose synthase  38.47 
 
 		 879 aa  546  1e-153  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3378  malto-oligosyltrehalose synthase  40.71 
 
 		 848 aa  545  1e-153  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2012  malto-oligosyltrehalose synthase  38.49 
 
 		 945 aa  543  9.999999999999999e-153  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409828 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1733  malto-oligosyltrehalose synthase  39.55 
 
 		 967 aa  535  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1562  malto-oligosyltrehalose synthase  39.44 
 
 		 930 aa  533  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.497391  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1539  alpha-amylase family protein  39.44 
 
 		 930 aa  536  1e-150  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.604212  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6082  malto-oligosyltrehalose synthase  38.42 
 
 		 922 aa  536  1e-150  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.292692 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0816  maltooligosyl trehalose synthase, putative  40.62 
 
 		 930 aa  533  1e-149  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.133141  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1427  Alpha amylase, catalytic region  35.31 
 
 		 922 aa  530  1e-149  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.627603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1334  malto-oligosyltrehalose synthase  40.62 
 
 		 930 aa  533  1e-149  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.929488  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0615  malto-oligosyltrehalose synthase  40.62 
 
 		 930 aa  533  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.360061  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7155  malto-oligosyltrehalose synthase  39.72 
 
 		 869 aa  531  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.915282 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5596  malto-oligosyltrehalose synthase  39.33 
 
 		 924 aa  531  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.49211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0540  malto-oligosyltrehalose synthase  40.62 
 
 		 930 aa  533  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6007  malto-oligosyltrehalose synthase  39.22 
 
 		 869 aa  531  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.428975  normal  0.074206 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6326  malto-oligosyltrehalose synthase  38.73 
 
 		 924 aa  528  1e-148  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0514594  normal  0.0507365 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1336  malto-oligosyltrehalose synthase  37.93 
 
 		 921 aa  530  1e-148  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.253875  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6493  malto-oligosyltrehalose synthase  37.93 
 
 		 921 aa  528  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.576977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7028  maltooligosyl trehalose synthase  38.35 
 
 		 923 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0187701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3112  malto-oligosyltrehalose synthase  35.71 
 
 		 935 aa  501  1e-140  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5485  malto-oligosyltrehalose synthase  38.38 
 
 		 920 aa  503  1e-140  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102779 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5282  malto-oligosyltrehalose synthase  34.89 
 
 		 1411 aa  495  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.339944 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0155  malto-oligosyltrehalose synthase  35.18 
 
 		 1405 aa  477  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4211  maltooligosyl trehalose synthase  37.84 
 
 		 875 aa  455  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0039  malto-oligosyltrehalose synthase  36.59 
 
 		 909 aa  450  1.0000000000000001e-124  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2602  a-glycosidase, maltooligosyl trehalose synthase, glycoside hydrolase family 13 protein  31.27 
 
 		 916 aa  442  9.999999999999999e-123  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0546  malto-oligosyltrehalose synthase  35.71 
 
 		 836 aa  429  1e-118  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5462  malto-oligosyltrehalose synthase  35.09 
 
 		 843 aa  427  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1607  4-alpha-glucanotransferase  39.31 
 
 		 728 aa  420  9.999999999999999e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1514  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  37.28 
 
 		 1464 aa  419  9.999999999999999e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117562  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0118  4-alpha-glucanotransferase  36.27 
 
 		 726 aa  418  9.999999999999999e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4234  alpha amylase domain-containing protein  38.79 
 
 		 884 aa  416  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116364  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3927  4-alpha-glucanotransferase  37.68 
 
 		 694 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5165  malto-oligosyltrehalose synthase  34.91 
 
 		 864 aa  409  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1349  malto-oligosyltrehalose synthase  34.45 
 
 		 831 aa  408  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0162  4-alpha-glucanotransferase  37.43 
 
 		 698 aa  410  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3992  4-alpha-glucanotransferase  37.43 
 
 		 698 aa  409  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>