More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2280 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4053  maltooligosyl trehalose synthase  60.35 
 
 		 924 aa  1048    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.114095  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05188  putative maltooligosyl trehalose synthase transmembrane protein  49.51 
 
 		 940 aa  726    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3933  malto-oligosyltrehalose synthase  49.35 
 
 		 940 aa  754    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.734301 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3128  glycosyl hydrolase, family 13  59.63 
 
 		 927 aa  1055    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.216246  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6082  malto-oligosyltrehalose synthase  48.42 
 
 		 922 aa  718    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.292692 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0816  maltooligosyl trehalose synthase, putative  47.23 
 
 		 930 aa  676    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.133141  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2280  maltooligosyl trehalose synthase  100 
 
 		 914 aa  1826    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0184477  hitchhiker  0.00895039 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2995  maltooligosyl trehalose synthase  58.91 
 
 		 927 aa  1041    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.506264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4234  alpha amylase domain-containing protein  44.78 
 
 		 884 aa  655    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116364  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0946  alpha amylase  41.47 
 
 		 948 aa  649    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.206835  normal  0.69662 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1733  malto-oligosyltrehalose synthase  47.26 
 
 		 967 aa  674    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2546  maltooligosyl trehalose synthase  59.91 
 
 		 925 aa  1055    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769998 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7028  maltooligosyl trehalose synthase  47.12 
 
 		 923 aa  682    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0187701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1416  malto-oligosyltrehalose synthase  44.27 
 
 		 941 aa  746    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0169587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2867  putative glycosyl hydrolase  49.68 
 
 		 952 aa  840    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4387  malto-oligosyltrehalose synthase  48.99 
 
 		 944 aa  820    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.454726 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1790  maltooligosyl trehalose synthase  60.56 
 
 		 924 aa  1053    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.571899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1336  malto-oligosyltrehalose synthase  48.53 
 
 		 921 aa  719    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.253875  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6326  malto-oligosyltrehalose synthase  47.89 
 
 		 924 aa  690    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0514594  normal  0.0507365 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0615  malto-oligosyltrehalose synthase  47.23 
 
 		 930 aa  676    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.360061  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5596  malto-oligosyltrehalose synthase  48.05 
 
 		 924 aa  691    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.49211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36605  maltooligosyl trehalose synthase  59.59 
 
 		 926 aa  980    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.728588 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3652  maltooligosyl trehalose synthase  59.15 
 
 		 924 aa  1031    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0116704  normal  0.178483 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6493  malto-oligosyltrehalose synthase  48.59 
 
 		 921 aa  719    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.576977  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4046  malto-oligosyltrehalose synthase  49.35 
 
 		 940 aa  754    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.240234  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24880  maltooligosyl trehalose synthase  62.65 
 
 		 917 aa  1031    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.022043  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3144  maltooligosyl trehalose synthase  59.21 
 
 		 926 aa  973    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1460  malto-oligosyltrehalose synthase  48.98 
 
 		 918 aa  730    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.251406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1334  malto-oligosyltrehalose synthase  47.23 
 
 		 930 aa  676    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.929488  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0540  malto-oligosyltrehalose synthase  47.23 
 
 		 930 aa  676    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5485  malto-oligosyltrehalose synthase  48.59 
 
 		 920 aa  690    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102779 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6827  malto-oligosyltrehalose synthase  49.05 
 
 		 951 aa  836    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.554388 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1821  maltooligosyl trehalose synthase  59.33 
 
 		 924 aa  1012    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.280947 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1539  alpha-amylase family protein  47.49 
 
 		 930 aa  679    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.604212  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1562  malto-oligosyltrehalose synthase  47.37 
 
 		 930 aa  675    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.497391  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0546  malto-oligosyltrehalose synthase  42.56 
 
 		 836 aa  632  1e-180  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2833  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  43.24 
 
 		 1650 aa  626  1e-178  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.280468 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2711  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  42.87 
 
 		 1646 aa  625  1e-178  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0130297 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03372  malto-oligosyltrehalose synthase  43.09 
 
 		 869 aa  622  1e-177  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2938  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  43 
 
 		 1646 aa  623  1e-177  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368766 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7548  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  43.05 
 
 		 1642 aa  621  1e-176  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838098  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1174  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  41.6 
 
 		 1715 aa  617  1e-175  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.814781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6326  putative glycosyl hydrolase (glycosidase)  42 
 
 		 934 aa  617  1e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.420864 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6809  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  44 
 
 		 1647 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.687353 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2156  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  41.65 
 
 		 1703 aa  610  1e-173  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.57322  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4168  malto-oligosyltrehalose synthase  42.4 
 
 		 928 aa  606  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.487417  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3682  malto-oligosyltrehalose synthase  42.97 
 
 		 926 aa  606  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1600  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  42.26 
 
 		 1633 aa  600  1e-170  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.290516  hitchhiker  0.00115838 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1402  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  39.87 
 
 		 1730 aa  595  1e-169  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.701685  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3487  malto-oligosyltrehalose synthase  42.03 
 
 		 929 aa  595  1e-168  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3267  maltooligosyl trehalose synthase  37.25 
 
 		 995 aa  592  1e-168  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1984  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  40.86 
 
 		 1673 aa  595  1e-168  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.432862  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1738  malto-oligosyltrehalose synthase  40.87 
 
 		 969 aa  590  1e-167  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.137829  hitchhiker  0.0000132957 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2094  maltooligosyl trehalose synthase  38.8 
 
 		 986 aa  591  1e-167  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2081  alpha-amylase family protein  40.87 
 
 		 969 aa  590  1e-167  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0507  Alpha amylase, catalytic region  42.45 
 
 		 939 aa  586  1e-166  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.213544  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1879  malto-oligosyltrehalose synthase  41.59 
 
 		 928 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0319  malto-oligosyltrehalose synthase  42.53 
 
 		 913 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1461  malto-oligosyltrehalose synthase  40.55 
 
 		 950 aa  582  1e-164  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3468  maltooligosyl trehalose synthase  36.63 
 
 		 994 aa  574  1.0000000000000001e-162  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2985  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  41.52 
 
 		 1662 aa  573  1.0000000000000001e-162  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.149144  normal  0.0261273 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2360  maltooligosyl trehalose synthase  37.01 
 
 		 996 aa  570  1e-161  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0539  malto-oligosyltrehalose synthase  40.06 
 
 		 944 aa  572  1e-161  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1427  Alpha amylase, catalytic region  36.43 
 
 		 922 aa  568  1e-160  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.627603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1811  malto-oligosyltrehalose synthase  38.24 
 
 		 955 aa  563  1.0000000000000001e-159  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2763  malto-oligosyltrehalose synthase  36.85 
 
 		 1007 aa  565  1.0000000000000001e-159  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.200258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2673  malto-oligosyltrehalose synthase  40.66 
 
 		 856 aa  565  1.0000000000000001e-159  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.299431  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1779  maltooligosyl trehalose synthase  41.22 
 
 		 873 aa  559  1e-158  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.932691 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1680  (1,4)-alpha-D-glucan 1-alpha-D-glucosylmutase  38.56 
 
 		 940 aa  561  1e-158  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.810186  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2351  malto-oligosyltrehalose synthase  37.31 
 
 		 955 aa  558  1e-157  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1429  malto-oligosyltrehalose synthase  34.34 
 
 		 942 aa  555  1e-156  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0930429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2452  maltooligosyl trehalose synthase  39.6 
 
 		 871 aa  555  1e-156  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4620  malto-oligosyltrehalose synthase  34.93 
 
 		 930 aa  553  1e-156  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.026371 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1395  malto-oligosyltrehalose synthase  34.13 
 
 		 942 aa  549  1e-155  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0317  maltooligosyl trehalose synthase  37.55 
 
 		 1013 aa  548  1e-154  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.0021368  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0115  maltooligosyl trehalose synthase  36.58 
 
 		 994 aa  546  1e-154  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.136948 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1115  maltooligosyl trehalose synthase  39.82 
 
 		 871 aa  548  1e-154  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.435651 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0134  maltooligosyl trehalose synthase  36.64 
 
 		 994 aa  543  1e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4561  malto-oligosyltrehalose synthase  40.5 
 
 		 879 aa  544  1e-153  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7155  malto-oligosyltrehalose synthase  39.98 
 
 		 869 aa  538  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.915282 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6007  malto-oligosyltrehalose synthase  40.24 
 
 		 869 aa  533  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.428975  normal  0.074206 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1736  malto-oligosyltrehalose synthase  38.52 
 
 		 842 aa  527  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.566419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1671  malto-oligosyltrehalose synthase  38.52 
 
 		 842 aa  523  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1606  malto-oligosyltrehalose synthase  38.52 
 
 		 842 aa  524  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.630708  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1673  malto-oligosyltrehalose synthase  38.47 
 
 		 842 aa  525  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1784  malto-oligosyltrehalose synthase  38.52 
 
 		 842 aa  526  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0155  malto-oligosyltrehalose synthase  35.48 
 
 		 1405 aa  515  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0293  maltooligosyl trehalose synthase  38.03 
 
 		 1009 aa  509  1e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0304  maltooligosyl trehalose synthase  38.1 
 
 		 1007 aa  507  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5462  malto-oligosyltrehalose synthase  37.41 
 
 		 843 aa  505  1e-141  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3112  malto-oligosyltrehalose synthase  35.37 
 
 		 935 aa  504  1e-141  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0315  maltooligosyl trehalose synthase  37.93 
 
 		 1007 aa  501  1e-140  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2012  malto-oligosyltrehalose synthase  37.67 
 
 		 945 aa  498  1e-139  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409828 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5282  malto-oligosyltrehalose synthase  35.15 
 
 		 1411 aa  498  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.339944 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0039  malto-oligosyltrehalose synthase  37.47 
 
 		 909 aa  485  1e-135  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3378  malto-oligosyltrehalose synthase  37.06 
 
 		 848 aa  474  1e-132  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4211  maltooligosyl trehalose synthase  36.42 
 
 		 875 aa  467  9.999999999999999e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2573  malto-oligosyltrehalose synthase  34.32 
 
 		 875 aa  463  1e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2602  a-glycosidase, maltooligosyl trehalose synthase, glycoside hydrolase family 13 protein  31.9 
 
 		 916 aa  442  9.999999999999999e-123  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13820  maltooligosyl trehalose synthase  35.96 
 
 		 860 aa  419  1e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>