More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2360 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0115  maltooligosyl trehalose synthase  53.11 
 
 		 994 aa  1087    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.136948 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2360  maltooligosyl trehalose synthase  100 
 
 		 996 aa  2062    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2081  alpha-amylase family protein  49.19 
 
 		 969 aa  867    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1174  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  46.84 
 
 		 1715 aa  892    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.814781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0946  alpha amylase  41.78 
 
 		 948 aa  712    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.206835  normal  0.69662 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1427  Alpha amylase, catalytic region  41.67 
 
 		 922 aa  770    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.627603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1680  (1,4)-alpha-D-glucan 1-alpha-D-glucosylmutase  45.62 
 
 		 940 aa  839    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.810186  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0315  maltooligosyl trehalose synthase  48.02 
 
 		 1007 aa  855    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2094  maltooligosyl trehalose synthase  49.9 
 
 		 986 aa  939    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1984  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  41.44 
 
 		 1673 aa  733    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.432862  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3468  maltooligosyl trehalose synthase  79.78 
 
 		 994 aa  1653    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1402  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  47.52 
 
 		 1730 aa  912    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.701685  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1811  malto-oligosyltrehalose synthase  45.61 
 
 		 955 aa  811    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0293  maltooligosyl trehalose synthase  48.43 
 
 		 1009 aa  853    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2156  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  43.4 
 
 		 1703 aa  718    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.57322  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0134  maltooligosyl trehalose synthase  53.02 
 
 		 994 aa  1088    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3487  malto-oligosyltrehalose synthase  38.59 
 
 		 929 aa  640    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2763  malto-oligosyltrehalose synthase  45.26 
 
 		 1007 aa  798    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.200258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0317  maltooligosyl trehalose synthase  49.5 
 
 		 1013 aa  893    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.0021368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0539  malto-oligosyltrehalose synthase  41.68 
 
 		 944 aa  700    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0319  malto-oligosyltrehalose synthase  42.21 
 
 		 913 aa  695    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0304  maltooligosyl trehalose synthase  48.38 
 
 		 1007 aa  863    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2012  malto-oligosyltrehalose synthase  41.16 
 
 		 945 aa  683    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409828 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4620  malto-oligosyltrehalose synthase  41.65 
 
 		 930 aa  782    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.026371 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2351  malto-oligosyltrehalose synthase  42.22 
 
 		 955 aa  764    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3267  maltooligosyl trehalose synthase  59.37 
 
 		 995 aa  1191    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1429  malto-oligosyltrehalose synthase  40.61 
 
 		 942 aa  791    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0930429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1395  malto-oligosyltrehalose synthase  40.51 
 
 		 942 aa  790    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2985  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  39.88 
 
 		 1662 aa  687    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.149144  normal  0.0261273 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1738  malto-oligosyltrehalose synthase  49.19 
 
 		 969 aa  867    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.137829  hitchhiker  0.0000132957 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4168  malto-oligosyltrehalose synthase  38.68 
 
 		 928 aa  635  1e-180  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.487417  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3682  malto-oligosyltrehalose synthase  40.66 
 
 		 926 aa  632  1e-180  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6326  putative glycosyl hydrolase (glycosidase)  37.65 
 
 		 934 aa  632  1e-180  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.420864 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6809  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  39.24 
 
 		 1647 aa  632  1e-179  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.687353 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7548  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  38.99 
 
 		 1642 aa  630  1e-179  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838098  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1600  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  39.6 
 
 		 1633 aa  630  1e-179  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.290516  hitchhiker  0.00115838 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1879  malto-oligosyltrehalose synthase  39.93 
 
 		 928 aa  631  1e-179  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2833  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  38.79 
 
 		 1650 aa  622  1e-177  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.280468 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2938  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  39.22 
 
 		 1646 aa  617  1e-175  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368766 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2711  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  39.24 
 
 		 1646 aa  615  9.999999999999999e-175  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0130297 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3128  glycosyl hydrolase, family 13  36.91 
 
 		 927 aa  608  9.999999999999999e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.216246  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2995  maltooligosyl trehalose synthase  37.11 
 
 		 927 aa  606  9.999999999999999e-173  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.506264  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4053  maltooligosyl trehalose synthase  37.94 
 
 		 924 aa  597  1e-169  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.114095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1461  malto-oligosyltrehalose synthase  38.97 
 
 		 950 aa  598  1e-169  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3652  maltooligosyl trehalose synthase  38.04 
 
 		 924 aa  594  1e-168  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0116704  normal  0.178483 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1790  maltooligosyl trehalose synthase  37.74 
 
 		 924 aa  587  1e-166  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.571899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1821  maltooligosyl trehalose synthase  37.39 
 
 		 924 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.280947 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6827  malto-oligosyltrehalose synthase  36.21 
 
 		 951 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.554388 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2546  maltooligosyl trehalose synthase  36.71 
 
 		 925 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769998 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0507  Alpha amylase, catalytic region  37.54 
 
 		 939 aa  570  1e-161  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.213544  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2867  putative glycosyl hydrolase  36.3 
 
 		 952 aa  568  1e-160  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3378  malto-oligosyltrehalose synthase  38.17 
 
 		 848 aa  559  1e-158  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3933  malto-oligosyltrehalose synthase  36.14 
 
 		 940 aa  558  1e-157  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.734301 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2452  maltooligosyl trehalose synthase  37.66 
 
 		 871 aa  556  1e-157  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2280  maltooligosyl trehalose synthase  36.4 
 
 		 914 aa  559  1e-157  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0184477  hitchhiker  0.00895039 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4561  malto-oligosyltrehalose synthase  37.11 
 
 		 879 aa  558  1e-157  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4046  malto-oligosyltrehalose synthase  36.14 
 
 		 940 aa  558  1e-157  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.240234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4387  malto-oligosyltrehalose synthase  36.94 
 
 		 944 aa  555  1e-156  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.454726 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24880  maltooligosyl trehalose synthase  36.02 
 
 		 917 aa  554  1e-156  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.022043  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1460  malto-oligosyltrehalose synthase  37.38 
 
 		 918 aa  552  1e-155  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.251406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1115  maltooligosyl trehalose synthase  37.76 
 
 		 871 aa  550  1e-155  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.435651 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1416  malto-oligosyltrehalose synthase  34.96 
 
 		 941 aa  547  1e-154  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0169587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1779  maltooligosyl trehalose synthase  37.17 
 
 		 873 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.932691 
 
 
-
 
NC_003296  RS05188  putative maltooligosyl trehalose synthase transmembrane protein  35.71 
 
 		 940 aa  533  1e-150  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36605  maltooligosyl trehalose synthase  35.66 
 
 		 926 aa  530  1e-149  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.728588 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3144  maltooligosyl trehalose synthase  35.01 
 
 		 926 aa  521  1e-146  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6007  malto-oligosyltrehalose synthase  34.92 
 
 		 869 aa  513  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.428975  normal  0.074206 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7155  malto-oligosyltrehalose synthase  35.12 
 
 		 869 aa  513  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.915282 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2602  a-glycosidase, maltooligosyl trehalose synthase, glycoside hydrolase family 13 protein  32.45 
 
 		 916 aa  513  1e-144  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1539  alpha-amylase family protein  35.77 
 
 		 930 aa  510  1e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.604212  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1336  malto-oligosyltrehalose synthase  35.08 
 
 		 921 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.253875  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6493  malto-oligosyltrehalose synthase  35.08 
 
 		 921 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.576977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7028  maltooligosyl trehalose synthase  35.62 
 
 		 923 aa  504  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0187701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2573  malto-oligosyltrehalose synthase  32.76 
 
 		 875 aa  503  1e-141  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3112  malto-oligosyltrehalose synthase  33.43 
 
 		 935 aa  503  1e-141  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6082  malto-oligosyltrehalose synthase  35.08 
 
 		 922 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.292692 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0155  malto-oligosyltrehalose synthase  33.27 
 
 		 1405 aa  504  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5282  malto-oligosyltrehalose synthase  32.96 
 
 		 1411 aa  504  1e-141  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.339944 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0816  maltooligosyl trehalose synthase, putative  35.86 
 
 		 930 aa  502  1e-140  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.133141  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1733  malto-oligosyltrehalose synthase  35.66 
 
 		 967 aa  502  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1334  malto-oligosyltrehalose synthase  35.86 
 
 		 930 aa  502  1e-140  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.929488  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0540  malto-oligosyltrehalose synthase  35.86 
 
 		 930 aa  502  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1562  malto-oligosyltrehalose synthase  35.56 
 
 		 930 aa  501  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.497391  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0615  malto-oligosyltrehalose synthase  35.86 
 
 		 930 aa  502  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.360061  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6326  malto-oligosyltrehalose synthase  35.25 
 
 		 924 aa  485  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0514594  normal  0.0507365 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5596  malto-oligosyltrehalose synthase  33.9 
 
 		 924 aa  475  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.49211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5485  malto-oligosyltrehalose synthase  34.58 
 
 		 920 aa  465  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102779 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0039  malto-oligosyltrehalose synthase  33.13 
 
 		 909 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4211  maltooligosyl trehalose synthase  33.77 
 
 		 875 aa  437  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5165  malto-oligosyltrehalose synthase  39.86 
 
 		 864 aa  422  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2673  malto-oligosyltrehalose synthase  35.38 
 
 		 856 aa  413  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.299431  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1349  malto-oligosyltrehalose synthase  38.56 
 
 		 831 aa  409  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5462  malto-oligosyltrehalose synthase  36.87 
 
 		 843 aa  402  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1736  malto-oligosyltrehalose synthase  35.3 
 
 		 842 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.566419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1673  malto-oligosyltrehalose synthase  35.11 
 
 		 842 aa  381  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1784  malto-oligosyltrehalose synthase  35.11 
 
 		 842 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1606  malto-oligosyltrehalose synthase  35.01 
 
 		 842 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.630708  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03372  malto-oligosyltrehalose synthase  34.04 
 
 		 869 aa  378  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1671  malto-oligosyltrehalose synthase  34.37 
 
 		 842 aa  379  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3074  maltooligosyl trehalose synthase  36.1 
 
 		 820 aa  373  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0376434 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>