More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2156 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_1429  malto-oligosyltrehalose synthase  38.43 
 
 
942 aa  665    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0930429  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2360  maltooligosyl trehalose synthase  42.32 
 
 
996 aa  741    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1600  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  40.53 
 
 
1633 aa  1009    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.290516  hitchhiker  0.00115838 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0134  maltooligosyl trehalose synthase  42.59 
 
 
994 aa  723    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3128  glycosyl hydrolase, family 13  40.79 
 
 
927 aa  639    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.216246  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0304  maltooligosyl trehalose synthase  46.62 
 
 
1007 aa  683    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1174  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  48.39 
 
 
1715 aa  1485    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.814781  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0946  alpha amylase  42.8 
 
 
948 aa  674    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.206835  normal  0.69662 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1680  (1,4)-alpha-D-glucan 1-alpha-D-glucosylmutase  46.85 
 
 
940 aa  805    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.810186  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1738  malto-oligosyltrehalose synthase  48.35 
 
 
969 aa  774    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.137829  hitchhiker  0.0000132957 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3468  maltooligosyl trehalose synthase  42.97 
 
 
994 aa  737    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1402  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  46.55 
 
 
1730 aa  1470    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.701685  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2938  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  39.73 
 
 
1646 aa  1063    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00368766 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2711  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  39.7 
 
 
1646 aa  1059    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0130297 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0293  maltooligosyl trehalose synthase  45.81 
 
 
1009 aa  677    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1984  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  62.1 
 
 
1673 aa  1966    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.432862  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2156  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  100 
 
 
1703 aa  3447    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.57322  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2833  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  39.83 
 
 
1650 aa  1061    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.280468 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2763  malto-oligosyltrehalose synthase  40.97 
 
 
1007 aa  693    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.200258  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2985  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  46.51 
 
 
1662 aa  1203    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.149144  normal  0.0261273 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0539  malto-oligosyltrehalose synthase  44.76 
 
 
944 aa  697    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6809  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  41.49 
 
 
1647 aa  1062    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.687353 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7548  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  41.18 
 
 
1642 aa  1092    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838098  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0319  malto-oligosyltrehalose synthase  45.39 
 
 
913 aa  672    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2094  maltooligosyl trehalose synthase  44.76 
 
 
986 aa  775    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2081  alpha-amylase family protein  48.35 
 
 
969 aa  774    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0315  maltooligosyl trehalose synthase  46.62 
 
 
1007 aa  678    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0317  maltooligosyl trehalose synthase  44.83 
 
 
1013 aa  694    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.0021368  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1395  malto-oligosyltrehalose synthase  38.33 
 
 
942 aa  662    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6827  malto-oligosyltrehalose synthase  42.59 
 
 
951 aa  646    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.554388 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3267  maltooligosyl trehalose synthase  42.81 
 
 
995 aa  722    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6326  putative glycosyl hydrolase (glycosidase)  40.92 
 
 
934 aa  639    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.420864 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0115  maltooligosyl trehalose synthase  42.17 
 
 
994 aa  723    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.136948 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2995  maltooligosyl trehalose synthase  40.29 
 
 
927 aa  634  1e-180  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.506264  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2867  putative glycosyl hydrolase  41.81 
 
 
952 aa  635  1e-180  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3933  malto-oligosyltrehalose synthase  43.42 
 
 
940 aa  631  1e-179  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.734301 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4046  malto-oligosyltrehalose synthase  43.42 
 
 
940 aa  631  1e-179  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.240234  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1811  malto-oligosyltrehalose synthase  41.28 
 
 
955 aa  629  1e-178  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4168  malto-oligosyltrehalose synthase  41.41 
 
 
928 aa  627  1e-178  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.487417  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1461  malto-oligosyltrehalose synthase  40.99 
 
 
950 aa  629  1e-178  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3487  malto-oligosyltrehalose synthase  40.7 
 
 
929 aa  622  1e-176  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3682  malto-oligosyltrehalose synthase  41.2 
 
 
926 aa  617  1e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2351  malto-oligosyltrehalose synthase  40.28 
 
 
955 aa  619  1e-175  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3652  maltooligosyl trehalose synthase  41.43 
 
 
924 aa  616  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0116704  normal  0.178483 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4387  malto-oligosyltrehalose synthase  40.74 
 
 
944 aa  615  9.999999999999999e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.454726 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4053  maltooligosyl trehalose synthase  41.54 
 
 
924 aa  612  1e-173  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.114095  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4620  malto-oligosyltrehalose synthase  38.44 
 
 
930 aa  611  1e-173  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.026371 
 
 
-
 
NC_003296  RS05188  putative maltooligosyl trehalose synthase transmembrane protein  42.8 
 
 
940 aa  607  9.999999999999999e-173  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1790  maltooligosyl trehalose synthase  41.43 
 
 
924 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.571899  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2280  maltooligosyl trehalose synthase  41.48 
 
 
914 aa  605  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0184477  hitchhiker  0.00895039 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1336  malto-oligosyltrehalose synthase  42.16 
 
 
921 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.253875  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6326  malto-oligosyltrehalose synthase  43.09 
 
 
924 aa  605  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0514594  normal  0.0507365 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36605  maltooligosyl trehalose synthase  41.06 
 
 
926 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.728588 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6493  malto-oligosyltrehalose synthase  42.16 
 
 
921 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.576977  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1427  Alpha amylase, catalytic region  37.36 
 
 
922 aa  601  1e-170  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.627603  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1879  malto-oligosyltrehalose synthase  39.53 
 
 
928 aa  601  1e-170  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5596  malto-oligosyltrehalose synthase  43.3 
 
 
924 aa  600  1e-170  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.49211  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3144  maltooligosyl trehalose synthase  41.21 
 
 
926 aa  598  1e-169  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2546  maltooligosyl trehalose synthase  39.35 
 
 
925 aa  598  1e-169  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.769998 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6082  malto-oligosyltrehalose synthase  41.93 
 
 
922 aa  597  1e-169  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.292692 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0507  Alpha amylase, catalytic region  41.74 
 
 
939 aa  594  1e-168  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.213544  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7028  maltooligosyl trehalose synthase  41.83 
 
 
923 aa  592  1e-167  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0187701  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1821  maltooligosyl trehalose synthase  41.03 
 
 
924 aa  592  1e-167  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.280947 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1416  malto-oligosyltrehalose synthase  38.2 
 
 
941 aa  593  1e-167  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0169587  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24880  maltooligosyl trehalose synthase  40.94 
 
 
917 aa  587  1e-166  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.022043  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2012  malto-oligosyltrehalose synthase  40.12 
 
 
945 aa  580  1e-164  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.409828 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4561  malto-oligosyltrehalose synthase  41.69 
 
 
879 aa  575  1.0000000000000001e-162  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1514  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  43.13 
 
 
1464 aa  576  1.0000000000000001e-162  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117562  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1539  alpha-amylase family protein  41.32 
 
 
930 aa  561  1e-158  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.604212  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5485  malto-oligosyltrehalose synthase  40.43 
 
 
920 aa  558  1e-157  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102779 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2673  malto-oligosyltrehalose synthase  39.46 
 
 
856 aa  559  1e-157  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.299431  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0816  maltooligosyl trehalose synthase, putative  41.04 
 
 
930 aa  555  1e-156  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.133141  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0615  malto-oligosyltrehalose synthase  41.04 
 
 
930 aa  555  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.360061  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1334  malto-oligosyltrehalose synthase  41.04 
 
 
930 aa  555  1e-156  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.929488  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1733  malto-oligosyltrehalose synthase  41.15 
 
 
967 aa  556  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1460  malto-oligosyltrehalose synthase  39.24 
 
 
918 aa  554  1e-156  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.251406  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0540  malto-oligosyltrehalose synthase  41.04 
 
 
930 aa  555  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1562  malto-oligosyltrehalose synthase  41.04 
 
 
930 aa  556  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.497391  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3378  malto-oligosyltrehalose synthase  40.16 
 
 
848 aa  531  1e-149  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0546  malto-oligosyltrehalose synthase  37.73 
 
 
836 aa  528  1e-148  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0162  4-alpha-glucanotransferase  42.02 
 
 
698 aa  527  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3992  4-alpha-glucanotransferase  42.02 
 
 
698 aa  528  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3751  4-alpha-glucanotransferase  41.88 
 
 
698 aa  526  1e-147  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0039  4-alpha-glucanotransferase  38.65 
 
 
726 aa  521  1e-146  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2452  maltooligosyl trehalose synthase  38.84 
 
 
871 aa  521  1e-146  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0155  malto-oligosyltrehalose synthase  35.65 
 
 
1405 aa  518  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4635  4-alpha-glucanotransferase  42.5 
 
 
696 aa  514  1e-144  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04850  4-alpha-glucanotransferase  40.66 
 
 
726 aa  516  1e-144  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0118  4-alpha-glucanotransferase  40.24 
 
 
726 aa  516  1e-144  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1779  maltooligosyl trehalose synthase  38.66 
 
 
873 aa  511  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.932691 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5282  malto-oligosyltrehalose synthase  36.09 
 
 
1411 aa  513  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.339944 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1115  maltooligosyl trehalose synthase  39.18 
 
 
871 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.435651 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001104  4-alpha-glucanotransferase (amylomaltase)  40.22 
 
 
726 aa  509  9.999999999999999e-143  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01251  4-alpha-glucanotransferase  37.03 
 
 
732 aa  509  9.999999999999999e-143  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03372  malto-oligosyltrehalose synthase  38.34 
 
 
869 aa  506  1e-141  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1635  4-alpha-glucanotransferase  39.4 
 
 
731 aa  506  1e-141  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4120  4-alpha-glucanotransferase  40.56 
 
 
694 aa  498  1e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3927  4-alpha-glucanotransferase  40.7 
 
 
694 aa  499  1e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3883  4-alpha-glucanotransferase  43.08 
 
 
692 aa  494  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3112  malto-oligosyltrehalose synthase  35.58 
 
 
935 aa  496  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>