257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0608 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0608  4-alpha-glucanotransferase  100 
 
 		 497 aa  1040    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0630977 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2647  4-alpha-glucanotransferase  48.69 
 
 		 497 aa  503  1e-141  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2333  4-alpha-glucanotransferase  48.49 
 
 		 497 aa  502  1e-141  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1439  4-alpha-glucanotransferase  48.89 
 
 		 498 aa  500  1e-140  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0142582  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1017  4-alpha-glucanotransferase  50.2 
 
 		 493 aa  496  1e-139  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00219663  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0816  4-alpha-glucanotransferase  46.84 
 
 		 488 aa  462  1e-129  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2645  4-alpha-glucanotransferase  44.58 
 
 		 516 aa  453  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.219759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1575  4-alpha-glucanotransferase  45.2 
 
 		 512 aa  447  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.737195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2968  4-alpha-glucanotransferase  47.2 
 
 		 525 aa  443  1e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.34566  decreased coverage  0.00000602964 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2811  4-alpha-glucanotransferase  45.14 
 
 		 496 aa  444  1e-123  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000526525  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0433  4-alpha-glucanotransferase  45.16 
 
 		 504 aa  439  9.999999999999999e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.459094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3111  4-alpha-glucanotransferase  45.29 
 
 		 503 aa  434  1e-120  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.124455 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0420  4-alpha-glucanotransferase  43.9 
 
 		 498 aa  432  1e-120  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1690  4-alpha-glucanotransferase  43.15 
 
 		 501 aa  430  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1708  4-alpha-glucanotransferase  43.15 
 
 		 501 aa  430  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.24711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1459  4-alpha-glucanotransferase  44.88 
 
 		 499 aa  424  1e-117  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1055  4-alpha-glucanotransferase  42.22 
 
 		 500 aa  422  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.919868  hitchhiker  0.00474904 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1822  4-alpha-glucanotransferase  43.66 
 
 		 505 aa  421  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3452  4-alpha-glucanotransferase  43.86 
 
 		 520 aa  419  1e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120069 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1014  4-alpha-glucanotransferase  44.27 
 
 		 495 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.129588  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3246  4-alpha-glucanotransferase  44.47 
 
 		 495 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3264  4-alpha-glucanotransferase  43.52 
 
 		 502 aa  418  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3250  4-alpha-glucanotransferase  44.35 
 
 		 499 aa  412  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000256283  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0906  4-alpha-glucanotransferase  43.93 
 
 		 502 aa  412  1e-114  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0786343  hitchhiker  0.000119798 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2921  4-alpha-glucanotransferase  42.17 
 
 		 499 aa  414  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4956  4-alpha-glucanotransferase  42.97 
 
 		 498 aa  414  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0865  4-alpha-glucanotransferase  41.67 
 
 		 522 aa  413  1e-114  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0155  malto-oligosyltrehalose synthase  41.05 
 
 		 1405 aa  412  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1468  4-alpha-glucanotransferase  43.46 
 
 		 500 aa  410  1e-113  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00033046 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1486  4-alpha-glucanotransferase  43.39 
 
 		 509 aa  410  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.117914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1121  4-alpha-glucanotransferase  42.97 
 
 		 501 aa  405  1.0000000000000001e-112  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.644339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3276  4-alpha-glucanotransferase  42.83 
 
 		 535 aa  408  1.0000000000000001e-112  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.433715  normal  0.229692 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1002  4-alpha-glucanotransferase  41.45 
 
 		 514 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0388229  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2912  4-alpha-glucanotransferase  42.19 
 
 		 519 aa  408  1.0000000000000001e-112  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0244  4-alpha-glucanotransferase  41.85 
 
 		 504 aa  403  1e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2391  4-alpha-glucanotransferase  43.43 
 
 		 496 aa  404  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000053446  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1182  4-alpha-glucanotransferase  42.11 
 
 		 493 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.207388  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0667  4-alpha-glucanotransferase  42.83 
 
 		 503 aa  402  9.999999999999999e-111  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.485353  normal  0.13128 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1296  4-alpha-glucanotransferase  39.88 
 
 		 505 aa  399  9.999999999999999e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.891573  normal  0.349432 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2387  4-alpha-glucanotransferase  41.51 
 
 		 540 aa  398  1e-109  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5282  malto-oligosyltrehalose synthase  38.91 
 
 		 1411 aa  397  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.339944 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0413  4-alpha-glucanotransferase  39.15 
 
 		 507 aa  395  1e-109  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0554  4-alpha-glucanotransferase  40.2 
 
 		 501 aa  393  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0239247  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1186  4-alpha-glucanotransferase  42.05 
 
 		 502 aa  393  1e-108  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3896  4-alpha-glucanotransferase  42.25 
 
 		 495 aa  390  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.979798 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1102  4-alpha-glucanotransferase  41.28 
 
 		 501 aa  391  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.399608  normal  0.584525 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1054  4-alpha-glucanotransferase  42.14 
 
 		 499 aa  384  1e-105  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00164715  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1263  4-alpha-glucanotransferase  42.05 
 
 		 498 aa  382  1e-105  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.572623  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3201  4-alpha-glucanotransferase  39.21 
 
 		 518 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.127634  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0510  4-alpha-glucanotransferase  38.48 
 
 		 504 aa  379  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.855301  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3100  4-alpha-glucanotransferase  39.41 
 
 		 518 aa  381  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.601917  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1738  4-alpha-glucanotransferase  40.49 
 
 		 497 aa  379  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0219743  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0237  4-alpha-glucanotransferase  39.72 
 
 		 503 aa  379  1e-104  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0624172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2290  4-alpha-glucanotransferase  41.34 
 
 		 499 aa  378  1e-103  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.793425  normal  0.0727641 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2959  4-alpha-glucanotransferase  39.88 
 
 		 502 aa  377  1e-103  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0552  4-alpha-glucanotransferase  39.11 
 
 		 497 aa  375  1e-102  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00709308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0206  4-alpha-glucanotransferase  39.72 
 
 		 470 aa  370  1e-101  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.539313 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0557  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  40.08 
 
 		 1175 aa  371  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.641532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2966  4-alpha-glucanotransferase  38.48 
 
 		 508 aa  371  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2764  4-alpha-glucanotransferase  38.9 
 
 		 517 aa  369  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0251  amylomaltase  41.58 
 
 		 483 aa  369  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2041  4-alpha-glucanotransferase  41.7 
 
 		 493 aa  368  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3001  4-alpha-glucanotransferase  40.58 
 
 		 518 aa  368  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0235  4-alpha-glucanotransferase  38.96 
 
 		 479 aa  363  3e-99  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.788709  normal  0.23673 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1705  4-alpha-glucanotransferase  38.68 
 
 		 512 aa  363  5.0000000000000005e-99  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0906  4-alpha-glucanotransferase  39.44 
 
 		 482 aa  362  6e-99  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1019  4-alpha-glucanotransferase  39.84 
 
 		 499 aa  362  6e-99  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.147534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2071  4-alpha-glucanotransferase  37.2 
 
 		 495 aa  362  1e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0041  4-alpha-glucanotransferase  38.13 
 
 		 502 aa  359  5e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44779  predicted protein  37.38 
 
 		 560 aa  359  5e-98  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1316  4-alpha-glucanotransferase  38.55 
 
 		 479 aa  358  9e-98  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3195  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  37 
 
 		 1193 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1410  4-alpha-glucanotransferase  38.58 
 
 		 515 aa  357  1.9999999999999998e-97  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0343019  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0768  4-alpha-glucanotransferase  38.74 
 
 		 468 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1473  4-alpha-glucanotransferase  40.04 
 
 		 494 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0817  4-alpha-glucanotransferase  38.49 
 
 		 497 aa  355  1e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.960729  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0514  4-alpha-glucanotransferase  39.41 
 
 		 512 aa  352  8.999999999999999e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3444  4-alpha-glucanotransferase  38.56 
 
 		 497 aa  352  1e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81732e-17 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5124  4-alpha-glucanotransferase  35.43 
 
 		 525 aa  341  1e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.642325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1527  4-alpha-glucanotransferase  38.72 
 
 		 489 aa  339  8e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.969905  decreased coverage  0.0000210459 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1431  4-alpha-glucanotransferase  36.94 
 
 		 490 aa  337  2.9999999999999997e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1108  4-alpha-glucanotransferase  37.58 
 
 		 497 aa  337  2.9999999999999997e-91  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.204434  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0778  4-alpha-glucanotransferase  36.84 
 
 		 490 aa  335  1e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.605175  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2349  4-alpha-glucanotransferase  36.65 
 
 		 483 aa  330  5.0000000000000004e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0961  4-alpha-glucanotransferase  36.51 
 
 		 491 aa  328  1.0000000000000001e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143538 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1049  4-alpha-glucanotransferase  36.55 
 
 		 495 aa  324  2e-87  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1505  4-alpha-glucanotransferase  36.95 
 
 		 496 aa  321  1.9999999999999998e-86  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.104049 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11881  4-alpha-glucanotransferase  36.82 
 
 		 507 aa  316  7e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11061  4-alpha-glucanotransferase  38.1 
 
 		 515 aa  315  9.999999999999999e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0171419  normal  0.287417 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11871  4-alpha-glucanotransferase  35.28 
 
 		 506 aa  315  9.999999999999999e-85  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15011  4-alpha-glucanotransferase  37.37 
 
 		 498 aa  313  5.999999999999999e-84  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.854558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17010  4-alpha-glucanotransferase  36.34 
 
 		 856 aa  313  6.999999999999999e-84  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11711  4-alpha-glucanotransferase  36.02 
 
 		 506 aa  312  6.999999999999999e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0669  4-alpha-glucanotransferase  37.32 
 
 		 498 aa  312  7.999999999999999e-84  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.137131  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1092  4-alpha-glucanotransferase  36.61 
 
 		 506 aa  310  2.9999999999999997e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.533755  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0510  4-alpha-glucanotransferase  35.14 
 
 		 454 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1614  4-alpha-glucanotransferase  34.24 
 
 		 522 aa  306  7e-82  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0724988 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09791  4-alpha-glucanotransferase  36.95 
 
 		 521 aa  306  7e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1375  4-alpha-glucanotransferase  34.16 
 
 		 518 aa  300  3e-80  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0364  4-alpha-glucanotransferase  34.79 
 
 		 494 aa  289  9e-77  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>