257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1410 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_1410  4-alpha-glucanotransferase  100 
 
 
515 aa  1057    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0343019  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1822  4-alpha-glucanotransferase  48.82 
 
 
505 aa  455  1e-127  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1708  4-alpha-glucanotransferase  47.06 
 
 
501 aa  452  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.24711  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1690  4-alpha-glucanotransferase  47.06 
 
 
501 aa  452  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1055  4-alpha-glucanotransferase  47.87 
 
 
500 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.919868  hitchhiker  0.00474904 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1575  4-alpha-glucanotransferase  47.98 
 
 
512 aa  447  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.737195  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1459  4-alpha-glucanotransferase  45.31 
 
 
499 aa  445  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0557  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  44.83 
 
 
1175 aa  436  1e-121  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.641532  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4956  4-alpha-glucanotransferase  46.17 
 
 
498 aa  434  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2645  4-alpha-glucanotransferase  46.55 
 
 
516 aa  433  1e-120  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.219759  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1186  4-alpha-glucanotransferase  47.91 
 
 
502 aa  431  1e-119  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0667  4-alpha-glucanotransferase  47.35 
 
 
503 aa  430  1e-119  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.485353  normal  0.13128 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0433  4-alpha-glucanotransferase  46.51 
 
 
504 aa  425  1e-117  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.459094  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0554  4-alpha-glucanotransferase  44.75 
 
 
501 aa  415  9.999999999999999e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0239247  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2391  4-alpha-glucanotransferase  45.6 
 
 
496 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000053446  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1296  4-alpha-glucanotransferase  44.6 
 
 
505 aa  417  9.999999999999999e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.891573  normal  0.349432 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2921  4-alpha-glucanotransferase  43.57 
 
 
499 aa  416  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2912  4-alpha-glucanotransferase  44.73 
 
 
519 aa  411  1e-113  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3100  4-alpha-glucanotransferase  45.84 
 
 
518 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.601917  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3201  4-alpha-glucanotransferase  46.03 
 
 
518 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.127634  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3111  4-alpha-glucanotransferase  44.72 
 
 
503 aa  407  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.124455 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2968  4-alpha-glucanotransferase  46.59 
 
 
525 aa  407  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.34566  decreased coverage  0.00000602964 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1468  4-alpha-glucanotransferase  45.45 
 
 
500 aa  407  1.0000000000000001e-112  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00033046 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1002  4-alpha-glucanotransferase  44.89 
 
 
514 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0388229  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1121  4-alpha-glucanotransferase  44.85 
 
 
501 aa  400  9.999999999999999e-111  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.644339  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1182  4-alpha-glucanotransferase  45.53 
 
 
493 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.207388  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2811  4-alpha-glucanotransferase  41.5 
 
 
496 aa  401  9.999999999999999e-111  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000526525  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1486  4-alpha-glucanotransferase  44.07 
 
 
509 aa  396  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.117914  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2764  4-alpha-glucanotransferase  42.96 
 
 
517 aa  398  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2333  4-alpha-glucanotransferase  42.77 
 
 
497 aa  396  1e-109  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1019  4-alpha-glucanotransferase  47.46 
 
 
499 aa  393  1e-108  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.147534  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2647  4-alpha-glucanotransferase  42.57 
 
 
497 aa  392  1e-108  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1014  4-alpha-glucanotransferase  43.66 
 
 
495 aa  389  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.129588  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3246  4-alpha-glucanotransferase  43.8 
 
 
495 aa  391  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1705  4-alpha-glucanotransferase  45.11 
 
 
512 aa  386  1e-106  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3001  4-alpha-glucanotransferase  46.17 
 
 
518 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3250  4-alpha-glucanotransferase  44.66 
 
 
499 aa  386  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000256283  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3264  4-alpha-glucanotransferase  45.78 
 
 
502 aa  388  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5124  4-alpha-glucanotransferase  42.12 
 
 
525 aa  387  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.642325  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3896  4-alpha-glucanotransferase  44.53 
 
 
495 aa  382  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.979798 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0816  4-alpha-glucanotransferase  41.58 
 
 
488 aa  383  1e-105  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3452  4-alpha-glucanotransferase  44.19 
 
 
520 aa  385  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00120069 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1738  4-alpha-glucanotransferase  44.83 
 
 
497 aa  385  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0219743  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2966  4-alpha-glucanotransferase  45.17 
 
 
508 aa  382  1e-105  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0244  4-alpha-glucanotransferase  41.26 
 
 
504 aa  381  1e-104  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0514  4-alpha-glucanotransferase  43.73 
 
 
512 aa  380  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0906  4-alpha-glucanotransferase  45.44 
 
 
502 aa  379  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0786343  hitchhiker  0.000119798 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0041  4-alpha-glucanotransferase  43.22 
 
 
502 aa  378  1e-103  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0155  malto-oligosyltrehalose synthase  42.5 
 
 
1405 aa  377  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1473  4-alpha-glucanotransferase  43.06 
 
 
494 aa  375  1e-102  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0906  4-alpha-glucanotransferase  40.51 
 
 
482 aa  373  1e-102  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5282  malto-oligosyltrehalose synthase  41.39 
 
 
1411 aa  373  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.339944 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0251  amylomaltase  44.62 
 
 
483 aa  373  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2041  4-alpha-glucanotransferase  46.37 
 
 
493 aa  372  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2959  4-alpha-glucanotransferase  42.41 
 
 
502 aa  371  1e-101  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2071  4-alpha-glucanotransferase  43.2 
 
 
495 aa  367  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0237  4-alpha-glucanotransferase  44.02 
 
 
503 aa  368  1e-100  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0624172  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1102  4-alpha-glucanotransferase  42.31 
 
 
501 aa  364  2e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.399608  normal  0.584525 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1054  4-alpha-glucanotransferase  44.4 
 
 
499 aa  363  3e-99  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00164715  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0206  4-alpha-glucanotransferase  44.58 
 
 
470 aa  363  4e-99  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.539313 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0552  4-alpha-glucanotransferase  40.46 
 
 
497 aa  363  6e-99  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00709308  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1527  4-alpha-glucanotransferase  41.13 
 
 
489 aa  358  9.999999999999999e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.969905  decreased coverage  0.0000210459 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0608  4-alpha-glucanotransferase  38.58 
 
 
497 aa  357  2.9999999999999997e-97  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0630977 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1263  4-alpha-glucanotransferase  42.63 
 
 
498 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.572623  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3276  4-alpha-glucanotransferase  42.77 
 
 
535 aa  356  5e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.433715  normal  0.229692 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0768  4-alpha-glucanotransferase  42.09 
 
 
468 aa  355  1e-96  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3195  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  39.64 
 
 
1193 aa  350  3e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2387  4-alpha-glucanotransferase  37.31 
 
 
540 aa  350  4e-95  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0510  4-alpha-glucanotransferase  41.15 
 
 
504 aa  350  5e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.855301  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2290  4-alpha-glucanotransferase  39.33 
 
 
499 aa  347  2e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.793425  normal  0.0727641 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1108  4-alpha-glucanotransferase  42.03 
 
 
497 aa  345  8.999999999999999e-94  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.204434  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0865  4-alpha-glucanotransferase  42.77 
 
 
522 aa  344  2e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1316  4-alpha-glucanotransferase  40.04 
 
 
479 aa  341  2e-92  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15011  4-alpha-glucanotransferase  38.18 
 
 
498 aa  340  2.9999999999999998e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.854558  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0669  4-alpha-glucanotransferase  37.64 
 
 
498 aa  340  4e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.137131  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11061  4-alpha-glucanotransferase  40.7 
 
 
515 aa  338  9.999999999999999e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0171419  normal  0.287417 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0961  4-alpha-glucanotransferase  41.04 
 
 
491 aa  338  9.999999999999999e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.143538 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0778  4-alpha-glucanotransferase  39.77 
 
 
490 aa  337  3.9999999999999995e-91  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.605175  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0420  4-alpha-glucanotransferase  37.38 
 
 
498 aa  336  5.999999999999999e-91  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1505  4-alpha-glucanotransferase  40.81 
 
 
496 aa  335  9e-91  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.104049 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1431  4-alpha-glucanotransferase  41.63 
 
 
490 aa  335  1e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1017  4-alpha-glucanotransferase  38.9 
 
 
493 aa  334  2e-90  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00219663  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0817  4-alpha-glucanotransferase  38.37 
 
 
497 aa  334  2e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.960729  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44779  predicted protein  39.69 
 
 
560 aa  332  9e-90  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1049  4-alpha-glucanotransferase  39.45 
 
 
495 aa  332  1e-89  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0235  4-alpha-glucanotransferase  39.96 
 
 
479 aa  331  2e-89  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.788709  normal  0.23673 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3444  4-alpha-glucanotransferase  38.22 
 
 
497 aa  330  5.0000000000000004e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81732e-17 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2349  4-alpha-glucanotransferase  36.31 
 
 
483 aa  329  8e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1375  4-alpha-glucanotransferase  39.34 
 
 
518 aa  323  6e-87  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1092  4-alpha-glucanotransferase  35.93 
 
 
506 aa  318  1e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.533755  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0413  4-alpha-glucanotransferase  35.35 
 
 
507 aa  314  1.9999999999999998e-84  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11711  4-alpha-glucanotransferase  34.45 
 
 
506 aa  314  1.9999999999999998e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11871  4-alpha-glucanotransferase  35.5 
 
 
506 aa  313  3.9999999999999997e-84  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0364  4-alpha-glucanotransferase  40.29 
 
 
494 aa  313  4.999999999999999e-84  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09791  4-alpha-glucanotransferase  39.63 
 
 
521 aa  312  7.999999999999999e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1439  4-alpha-glucanotransferase  35.17 
 
 
498 aa  311  2e-83  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0142582  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1614  4-alpha-glucanotransferase  39 
 
 
522 aa  309  5.9999999999999995e-83  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0724988 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0510  4-alpha-glucanotransferase  36.47 
 
 
454 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11881  4-alpha-glucanotransferase  35.73 
 
 
507 aa  303  4.0000000000000003e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17010  4-alpha-glucanotransferase  38.96 
 
 
856 aa  294  3e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>