257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2387 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE2387  4-alpha-glucanotransferase  100 
 
 
540 aa  1117    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3250  4-alpha-glucanotransferase  44.24 
 
 
499 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000256283  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2647  4-alpha-glucanotransferase  45.19 
 
 
497 aa  446  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2333  4-alpha-glucanotransferase  45.74 
 
 
497 aa  443  1e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2811  4-alpha-glucanotransferase  44.13 
 
 
496 aa  442  1e-123  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000526525  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0816  4-alpha-glucanotransferase  43.58 
 
 
488 aa  435  1e-121  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3246  4-alpha-glucanotransferase  43.04 
 
 
495 aa  436  1e-121  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2921  4-alpha-glucanotransferase  43.73 
 
 
499 aa  435  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1014  4-alpha-glucanotransferase  43.23 
 
 
495 aa  435  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.129588  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2645  4-alpha-glucanotransferase  42.38 
 
 
516 aa  433  1e-120  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.219759  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1690  4-alpha-glucanotransferase  41.2 
 
 
501 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0433  4-alpha-glucanotransferase  42.12 
 
 
504 aa  430  1e-119  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.459094  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1708  4-alpha-glucanotransferase  41.2 
 
 
501 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.24711  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1575  4-alpha-glucanotransferase  42.57 
 
 
512 aa  430  1e-119  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.737195  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1121  4-alpha-glucanotransferase  43.65 
 
 
501 aa  426  1e-118  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.644339  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1459  4-alpha-glucanotransferase  43.02 
 
 
499 aa  426  1e-118  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0667  4-alpha-glucanotransferase  42.33 
 
 
503 aa  425  1e-117  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.485353  normal  0.13128 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1822  4-alpha-glucanotransferase  42.3 
 
 
505 aa  420  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2391  4-alpha-glucanotransferase  42.57 
 
 
496 aa  420  1e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000053446  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1486  4-alpha-glucanotransferase  41.9 
 
 
509 aa  419  1e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.117914  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3264  4-alpha-glucanotransferase  43.65 
 
 
502 aa  419  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1182  4-alpha-glucanotransferase  41.82 
 
 
493 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.207388  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0244  4-alpha-glucanotransferase  41.19 
 
 
504 aa  410  1e-113  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2912  4-alpha-glucanotransferase  40.82 
 
 
519 aa  411  1e-113  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1738  4-alpha-glucanotransferase  42.08 
 
 
497 aa  409  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0219743  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1468  4-alpha-glucanotransferase  42.67 
 
 
500 aa  407  1.0000000000000001e-112  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00033046 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1055  4-alpha-glucanotransferase  41.44 
 
 
500 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.919868  hitchhiker  0.00474904 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1002  4-alpha-glucanotransferase  40.67 
 
 
514 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0388229  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0554  4-alpha-glucanotransferase  39.29 
 
 
501 aa  404  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0239247  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3111  4-alpha-glucanotransferase  39.85 
 
 
503 aa  404  1e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.124455 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2041  4-alpha-glucanotransferase  42.67 
 
 
493 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2968  4-alpha-glucanotransferase  40.33 
 
 
525 aa  401  9.999999999999999e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.34566  decreased coverage  0.00000602964 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0251  amylomaltase  40.48 
 
 
483 aa  400  9.999999999999999e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1296  4-alpha-glucanotransferase  38.93 
 
 
505 aa  402  9.999999999999999e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.891573  normal  0.349432 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0906  4-alpha-glucanotransferase  40.52 
 
 
502 aa  398  1e-109  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0786343  hitchhiker  0.000119798 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0608  4-alpha-glucanotransferase  41.51 
 
 
497 aa  398  1e-109  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0630977 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3201  4-alpha-glucanotransferase  39.7 
 
 
518 aa  395  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.127634  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3100  4-alpha-glucanotransferase  39.03 
 
 
518 aa  393  1e-108  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.601917  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1102  4-alpha-glucanotransferase  39.29 
 
 
501 aa  394  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.399608  normal  0.584525 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1019  4-alpha-glucanotransferase  40.93 
 
 
499 aa  389  1e-107  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.147534  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2764  4-alpha-glucanotransferase  40.19 
 
 
517 aa  392  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1186  4-alpha-glucanotransferase  41.37 
 
 
502 aa  390  1e-107  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2966  4-alpha-glucanotransferase  41.36 
 
 
508 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3896  4-alpha-glucanotransferase  40.37 
 
 
495 aa  385  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.979798 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3452  4-alpha-glucanotransferase  39.96 
 
 
520 aa  387  1e-106  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00120069 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4956  4-alpha-glucanotransferase  41.19 
 
 
498 aa  386  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3276  4-alpha-glucanotransferase  39.23 
 
 
535 aa  387  1e-106  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.433715  normal  0.229692 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0557  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  38.96 
 
 
1175 aa  379  1e-104  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.641532  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3001  4-alpha-glucanotransferase  40.58 
 
 
518 aa  381  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2959  4-alpha-glucanotransferase  37.45 
 
 
502 aa  375  1e-103  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0865  4-alpha-glucanotransferase  37.6 
 
 
522 aa  376  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1017  4-alpha-glucanotransferase  38.16 
 
 
493 aa  377  1e-103  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00219663  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2071  4-alpha-glucanotransferase  38.7 
 
 
495 aa  373  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0420  4-alpha-glucanotransferase  41.48 
 
 
498 aa  375  1e-102  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1473  4-alpha-glucanotransferase  38.4 
 
 
494 aa  369  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0413  4-alpha-glucanotransferase  38.15 
 
 
507 aa  370  1e-101  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0906  4-alpha-glucanotransferase  40.38 
 
 
482 aa  365  1e-100  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0510  4-alpha-glucanotransferase  36.85 
 
 
504 aa  367  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.855301  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1527  4-alpha-glucanotransferase  40.66 
 
 
489 aa  369  1e-100  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.969905  decreased coverage  0.0000210459 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0206  4-alpha-glucanotransferase  38.76 
 
 
470 aa  367  1e-100  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.539313 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0237  4-alpha-glucanotransferase  36.85 
 
 
503 aa  365  1e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0624172  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0155  malto-oligosyltrehalose synthase  37.45 
 
 
1405 aa  364  3e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0514  4-alpha-glucanotransferase  38.06 
 
 
512 aa  355  8.999999999999999e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0552  4-alpha-glucanotransferase  37.34 
 
 
497 aa  355  1e-96  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00709308  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0961  4-alpha-glucanotransferase  36.73 
 
 
491 aa  353  2.9999999999999997e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.143538 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1439  4-alpha-glucanotransferase  37.02 
 
 
498 aa  352  7e-96  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0142582  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0768  4-alpha-glucanotransferase  38.2 
 
 
468 aa  352  8e-96  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1263  4-alpha-glucanotransferase  36.41 
 
 
498 aa  352  8.999999999999999e-96  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.572623  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1108  4-alpha-glucanotransferase  35.81 
 
 
497 aa  351  2e-95  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.204434  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1410  4-alpha-glucanotransferase  37.31 
 
 
515 aa  350  4e-95  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0343019  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1705  4-alpha-glucanotransferase  35.28 
 
 
512 aa  349  6e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1054  4-alpha-glucanotransferase  37.84 
 
 
499 aa  348  2e-94  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00164715  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3195  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  34.78 
 
 
1193 aa  347  3e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44779  predicted protein  37.21 
 
 
560 aa  346  5e-94  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1431  4-alpha-glucanotransferase  36.4 
 
 
490 aa  344  2.9999999999999997e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0235  4-alpha-glucanotransferase  36.59 
 
 
479 aa  342  1e-92  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.788709  normal  0.23673 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2290  4-alpha-glucanotransferase  39.42 
 
 
499 aa  340  2.9999999999999998e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.793425  normal  0.0727641 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0669  4-alpha-glucanotransferase  38.85 
 
 
498 aa  339  5.9999999999999996e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.137131  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5282  malto-oligosyltrehalose synthase  33.83 
 
 
1411 aa  338  1.9999999999999998e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.339944 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15011  4-alpha-glucanotransferase  38.77 
 
 
498 aa  337  3.9999999999999995e-91  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.854558  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5124  4-alpha-glucanotransferase  34.55 
 
 
525 aa  336  5e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.642325  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1316  4-alpha-glucanotransferase  36.08 
 
 
479 aa  336  7e-91  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2349  4-alpha-glucanotransferase  39.16 
 
 
483 aa  335  1e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0041  4-alpha-glucanotransferase  35.82 
 
 
502 aa  333  4e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0778  4-alpha-glucanotransferase  35.57 
 
 
490 aa  325  1e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.605175  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1049  4-alpha-glucanotransferase  35.59 
 
 
495 aa  324  3e-87  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1375  4-alpha-glucanotransferase  33.66 
 
 
518 aa  322  8e-87  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0364  4-alpha-glucanotransferase  36.64 
 
 
494 aa  322  9.000000000000001e-87  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11871  4-alpha-glucanotransferase  36.35 
 
 
506 aa  322  9.000000000000001e-87  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1092  4-alpha-glucanotransferase  36.11 
 
 
506 aa  319  1e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.533755  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11061  4-alpha-glucanotransferase  36.75 
 
 
515 aa  318  2e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0171419  normal  0.287417 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11711  4-alpha-glucanotransferase  36.6 
 
 
506 aa  317  3e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1505  4-alpha-glucanotransferase  35.08 
 
 
496 aa  317  4e-85  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.104049 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0510  4-alpha-glucanotransferase  36.55 
 
 
454 aa  316  7e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11881  4-alpha-glucanotransferase  37.31 
 
 
507 aa  316  7e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0817  4-alpha-glucanotransferase  32.53 
 
 
497 aa  315  1.9999999999999998e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.960729  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3444  4-alpha-glucanotransferase  32.35 
 
 
497 aa  313  5.999999999999999e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81732e-17 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1614  4-alpha-glucanotransferase  33.53 
 
 
522 aa  311  1e-83  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0724988 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09791  4-alpha-glucanotransferase  33.85 
 
 
521 aa  311  2e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0165  4-alpha-glucanotransferase  36.63 
 
 
506 aa  304  3.0000000000000004e-81  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00332904  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>