261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_17010 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_17010  4-alpha-glucanotransferase  100 
 
 
856 aa  1747    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1046  4-alpha-glucanotransferase  40.03 
 
 
1145 aa  505  1e-141  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1527  4-alpha-glucanotransferase  40.68 
 
 
489 aa  319  1e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.969905  decreased coverage  0.0000210459 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2333  4-alpha-glucanotransferase  37.53 
 
 
497 aa  318  3e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0251  amylomaltase  42.03 
 
 
483 aa  315  2.9999999999999996e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2391  4-alpha-glucanotransferase  38.4 
 
 
496 aa  314  3.9999999999999997e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000053446  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0155  malto-oligosyltrehalose synthase  37.32 
 
 
1405 aa  313  6.999999999999999e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0608  4-alpha-glucanotransferase  36.34 
 
 
497 aa  313  1e-83  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0630977 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3250  4-alpha-glucanotransferase  38.26 
 
 
499 aa  311  2e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000256283  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1014  4-alpha-glucanotransferase  37.72 
 
 
495 aa  311  2.9999999999999997e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.129588  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2645  4-alpha-glucanotransferase  40.3 
 
 
516 aa  311  2.9999999999999997e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.219759  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2647  4-alpha-glucanotransferase  37.31 
 
 
497 aa  311  2.9999999999999997e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3246  4-alpha-glucanotransferase  37.72 
 
 
495 aa  311  4e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1263  4-alpha-glucanotransferase  38.9 
 
 
498 aa  311  4e-83  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.572623  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1468  4-alpha-glucanotransferase  38.22 
 
 
500 aa  310  5e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00033046 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0244  4-alpha-glucanotransferase  38.22 
 
 
504 aa  310  1.0000000000000001e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0906  4-alpha-glucanotransferase  40.62 
 
 
502 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0786343  hitchhiker  0.000119798 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3452  4-alpha-glucanotransferase  37.66 
 
 
520 aa  308  3e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00120069 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1738  4-alpha-glucanotransferase  37.73 
 
 
497 aa  308  3e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0219743  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3111  4-alpha-glucanotransferase  40.89 
 
 
503 aa  307  5.0000000000000004e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.124455 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1575  4-alpha-glucanotransferase  39.48 
 
 
512 aa  305  2.0000000000000002e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.737195  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0557  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  28.35 
 
 
1175 aa  305  3.0000000000000004e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.641532  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1002  4-alpha-glucanotransferase  38.03 
 
 
514 aa  305  3.0000000000000004e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0388229  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0433  4-alpha-glucanotransferase  38.78 
 
 
504 aa  303  8.000000000000001e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.459094  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1055  4-alpha-glucanotransferase  37.78 
 
 
500 aa  303  1e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.919868  hitchhiker  0.00474904 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1708  4-alpha-glucanotransferase  37.18 
 
 
501 aa  302  2e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.24711  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1690  4-alpha-glucanotransferase  37.18 
 
 
501 aa  302  2e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1316  4-alpha-glucanotransferase  39.2 
 
 
479 aa  302  2e-80  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1822  4-alpha-glucanotransferase  36.42 
 
 
505 aa  301  3e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5282  malto-oligosyltrehalose synthase  38.23 
 
 
1411 aa  301  3e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.339944 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2071  4-alpha-glucanotransferase  37.66 
 
 
495 aa  300  5e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3264  4-alpha-glucanotransferase  39.65 
 
 
502 aa  300  6e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0235  4-alpha-glucanotransferase  39.1 
 
 
479 aa  300  9e-80  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.788709  normal  0.23673 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1486  4-alpha-glucanotransferase  37.53 
 
 
509 aa  300  1e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.117914  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1182  4-alpha-glucanotransferase  37.37 
 
 
493 aa  298  2e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.207388  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1121  4-alpha-glucanotransferase  38.56 
 
 
501 aa  298  3e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.644339  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0816  4-alpha-glucanotransferase  34.97 
 
 
488 aa  297  5e-79  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2290  4-alpha-glucanotransferase  36.72 
 
 
499 aa  296  8e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.793425  normal  0.0727641 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0552  4-alpha-glucanotransferase  37.34 
 
 
497 aa  296  1e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00709308  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2912  4-alpha-glucanotransferase  39.43 
 
 
519 aa  296  1e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0906  4-alpha-glucanotransferase  40.81 
 
 
482 aa  295  2e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2968  4-alpha-glucanotransferase  40.64 
 
 
525 aa  294  4e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.34566  decreased coverage  0.00000602964 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1410  4-alpha-glucanotransferase  38.96 
 
 
515 aa  294  5e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0343019  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2764  4-alpha-glucanotransferase  37.65 
 
 
517 aa  293  7e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0667  4-alpha-glucanotransferase  38.54 
 
 
503 aa  293  7e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.485353  normal  0.13128 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3195  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  42.94 
 
 
1193 aa  292  2e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3100  4-alpha-glucanotransferase  38.22 
 
 
518 aa  292  2e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.601917  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1296  4-alpha-glucanotransferase  36.15 
 
 
505 aa  291  4e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.891573  normal  0.349432 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4956  4-alpha-glucanotransferase  36.9 
 
 
498 aa  291  4e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2811  4-alpha-glucanotransferase  34.7 
 
 
496 aa  290  6e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000526525  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1102  4-alpha-glucanotransferase  39.24 
 
 
501 aa  290  7e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.399608  normal  0.584525 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1459  4-alpha-glucanotransferase  35.31 
 
 
499 aa  290  9e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0514  4-alpha-glucanotransferase  39.09 
 
 
512 aa  290  1e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0206  4-alpha-glucanotransferase  40.22 
 
 
470 aa  290  1e-76  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.539313 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3201  4-alpha-glucanotransferase  38.02 
 
 
518 aa  289  1e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.127634  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2921  4-alpha-glucanotransferase  35.61 
 
 
499 aa  290  1e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1019  4-alpha-glucanotransferase  40.89 
 
 
499 aa  288  2e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.147534  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1017  4-alpha-glucanotransferase  34.98 
 
 
493 aa  288  2.9999999999999996e-76  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00219663  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0865  4-alpha-glucanotransferase  37.63 
 
 
522 aa  288  4e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3001  4-alpha-glucanotransferase  38.36 
 
 
518 aa  287  7e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1473  4-alpha-glucanotransferase  39.39 
 
 
494 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3896  4-alpha-glucanotransferase  37.82 
 
 
495 aa  286  2.0000000000000002e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.979798 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0237  4-alpha-glucanotransferase  39.7 
 
 
503 aa  285  4.0000000000000003e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0624172  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3276  4-alpha-glucanotransferase  37.6 
 
 
535 aa  283  1e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.433715  normal  0.229692 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1439  4-alpha-glucanotransferase  34.65 
 
 
498 aa  282  2e-74  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0142582  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0768  4-alpha-glucanotransferase  38.9 
 
 
468 aa  282  2e-74  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2041  4-alpha-glucanotransferase  36.73 
 
 
493 aa  280  8e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1705  4-alpha-glucanotransferase  37.84 
 
 
512 aa  280  1e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44779  predicted protein  38.2 
 
 
560 aa  280  1e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0961  4-alpha-glucanotransferase  37.56 
 
 
491 aa  275  2.0000000000000002e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.143538 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1054  4-alpha-glucanotransferase  34.96 
 
 
499 aa  276  2.0000000000000002e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00164715  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1431  4-alpha-glucanotransferase  36.31 
 
 
490 aa  275  3e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0510  4-alpha-glucanotransferase  37.02 
 
 
504 aa  274  4.0000000000000004e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.855301  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1186  4-alpha-glucanotransferase  35.64 
 
 
502 aa  272  2e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1108  4-alpha-glucanotransferase  39.26 
 
 
497 aa  272  2e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.204434  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1505  4-alpha-glucanotransferase  39.96 
 
 
496 aa  271  2.9999999999999997e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.104049 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0554  4-alpha-glucanotransferase  36.48 
 
 
501 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0239247  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0510  4-alpha-glucanotransferase  36.01 
 
 
454 aa  271  2.9999999999999997e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0041  4-alpha-glucanotransferase  36.53 
 
 
502 aa  271  5e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0817  4-alpha-glucanotransferase  32.81 
 
 
497 aa  271  5e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.960729  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5124  4-alpha-glucanotransferase  34.65 
 
 
525 aa  270  5.9999999999999995e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.642325  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0778  4-alpha-glucanotransferase  37.1 
 
 
490 aa  271  5.9999999999999995e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.605175  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0413  4-alpha-glucanotransferase  33.62 
 
 
507 aa  270  8e-71  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2966  4-alpha-glucanotransferase  36.66 
 
 
508 aa  269  2e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3444  4-alpha-glucanotransferase  32.68 
 
 
497 aa  268  2.9999999999999995e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81732e-17 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2349  4-alpha-glucanotransferase  34.22 
 
 
483 aa  265  3e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2387  4-alpha-glucanotransferase  32.42 
 
 
540 aa  263  1e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2959  4-alpha-glucanotransferase  35.81 
 
 
502 aa  263  1e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0420  4-alpha-glucanotransferase  32.97 
 
 
498 aa  261  3e-68  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11711  4-alpha-glucanotransferase  31.06 
 
 
506 aa  260  6e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1049  4-alpha-glucanotransferase  39.18 
 
 
495 aa  260  9e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11871  4-alpha-glucanotransferase  31.94 
 
 
506 aa  259  2e-67  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11061  4-alpha-glucanotransferase  33.19 
 
 
515 aa  256  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0171419  normal  0.287417 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11881  4-alpha-glucanotransferase  31.67 
 
 
507 aa  251  3e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1092  4-alpha-glucanotransferase  31.86 
 
 
506 aa  251  4e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.533755  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09791  4-alpha-glucanotransferase  35.78 
 
 
521 aa  249  1e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15011  4-alpha-glucanotransferase  33.47 
 
 
498 aa  248  3e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.854558  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0364  4-alpha-glucanotransferase  35.71 
 
 
494 aa  248  4e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0669  4-alpha-glucanotransferase  33.06 
 
 
498 aa  248  4e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.137131  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2059  4-alpha-glucanotransferase  38.41 
 
 
456 aa  248  4e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.113022  normal  0.335201 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>