258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2071 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2071  4-alpha-glucanotransferase  100 
 
 
495 aa  1008    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1473  4-alpha-glucanotransferase  56.42 
 
 
494 aa  532  1e-150  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0961  4-alpha-glucanotransferase  58.06 
 
 
491 aa  532  1e-150  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.143538 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0906  4-alpha-glucanotransferase  53.04 
 
 
482 aa  519  1e-146  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1527  4-alpha-glucanotransferase  55.03 
 
 
489 aa  514  1e-144  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.969905  decreased coverage  0.0000210459 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1108  4-alpha-glucanotransferase  55.47 
 
 
497 aa  514  1e-144  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.204434  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2391  4-alpha-glucanotransferase  50.81 
 
 
496 aa  496  1e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000053446  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3246  4-alpha-glucanotransferase  50.82 
 
 
495 aa  485  1e-136  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0433  4-alpha-glucanotransferase  49.49 
 
 
504 aa  483  1e-135  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.459094  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1014  4-alpha-glucanotransferase  51.02 
 
 
495 aa  483  1e-135  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.129588  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1182  4-alpha-glucanotransferase  49.8 
 
 
493 aa  481  1e-134  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.207388  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0554  4-alpha-glucanotransferase  50 
 
 
501 aa  480  1e-134  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0239247  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3250  4-alpha-glucanotransferase  49.9 
 
 
499 aa  481  1e-134  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000256283  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1822  4-alpha-glucanotransferase  47.17 
 
 
505 aa  471  1.0000000000000001e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2645  4-alpha-glucanotransferase  48.37 
 
 
516 aa  469  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.219759  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1708  4-alpha-glucanotransferase  47.7 
 
 
501 aa  463  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.24711  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1690  4-alpha-glucanotransferase  47.7 
 
 
501 aa  463  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1296  4-alpha-glucanotransferase  45.54 
 
 
505 aa  463  1e-129  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.891573  normal  0.349432 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0510  4-alpha-glucanotransferase  48.97 
 
 
454 aa  459  9.999999999999999e-129  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3264  4-alpha-glucanotransferase  50.71 
 
 
502 aa  461  9.999999999999999e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1019  4-alpha-glucanotransferase  51.31 
 
 
499 aa  457  1e-127  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.147534  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1575  4-alpha-glucanotransferase  48.37 
 
 
512 aa  454  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.737195  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2041  4-alpha-glucanotransferase  50.41 
 
 
493 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1102  4-alpha-glucanotransferase  48.59 
 
 
501 aa  452  1.0000000000000001e-126  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.399608  normal  0.584525 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0244  4-alpha-glucanotransferase  45.1 
 
 
504 aa  449  1e-125  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1186  4-alpha-glucanotransferase  46.36 
 
 
502 aa  449  1e-125  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2912  4-alpha-glucanotransferase  47.06 
 
 
519 aa  450  1e-125  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0251  amylomaltase  50 
 
 
483 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0557  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  45.29 
 
 
1175 aa  447  1.0000000000000001e-124  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.641532  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1055  4-alpha-glucanotransferase  47.27 
 
 
500 aa  442  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.919868  hitchhiker  0.00474904 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1468  4-alpha-glucanotransferase  48.19 
 
 
500 aa  443  1e-123  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00033046 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1002  4-alpha-glucanotransferase  47.02 
 
 
514 aa  442  1e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0388229  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3896  4-alpha-glucanotransferase  47.45 
 
 
495 aa  442  1e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.979798 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1121  4-alpha-glucanotransferase  48.9 
 
 
501 aa  443  1e-123  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.644339  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1738  4-alpha-glucanotransferase  48.68 
 
 
497 aa  444  1e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0219743  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0816  4-alpha-glucanotransferase  43.76 
 
 
488 aa  439  9.999999999999999e-123  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0778  4-alpha-glucanotransferase  46.94 
 
 
490 aa  436  1e-121  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.605175  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3100  4-alpha-glucanotransferase  49.51 
 
 
518 aa  433  1e-120  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.601917  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3201  4-alpha-glucanotransferase  50.1 
 
 
518 aa  435  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.127634  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1431  4-alpha-glucanotransferase  47.23 
 
 
490 aa  432  1e-120  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2921  4-alpha-glucanotransferase  43.63 
 
 
499 aa  428  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1705  4-alpha-glucanotransferase  46.55 
 
 
512 aa  424  1e-117  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4956  4-alpha-glucanotransferase  44.13 
 
 
498 aa  422  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2811  4-alpha-glucanotransferase  42.19 
 
 
496 aa  423  1e-117  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000526525  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3276  4-alpha-glucanotransferase  45.53 
 
 
535 aa  423  1e-117  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.433715  normal  0.229692 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1459  4-alpha-glucanotransferase  44.13 
 
 
499 aa  422  1e-117  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0667  4-alpha-glucanotransferase  48.4 
 
 
503 aa  421  1e-116  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.485353  normal  0.13128 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3452  4-alpha-glucanotransferase  45.29 
 
 
520 aa  419  1e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00120069 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0514  4-alpha-glucanotransferase  46.76 
 
 
512 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0906  4-alpha-glucanotransferase  45.03 
 
 
502 aa  415  1e-114  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0786343  hitchhiker  0.000119798 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3001  4-alpha-glucanotransferase  49.11 
 
 
518 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0237  4-alpha-glucanotransferase  46.12 
 
 
503 aa  414  1e-114  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0624172  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3111  4-alpha-glucanotransferase  45.47 
 
 
503 aa  410  1e-113  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.124455 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0155  malto-oligosyltrehalose synthase  41.95 
 
 
1405 aa  411  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2764  4-alpha-glucanotransferase  43.03 
 
 
517 aa  409  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2647  4-alpha-glucanotransferase  41.78 
 
 
497 aa  411  1e-113  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2966  4-alpha-glucanotransferase  47.23 
 
 
508 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2333  4-alpha-glucanotransferase  41.58 
 
 
497 aa  406  1.0000000000000001e-112  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1486  4-alpha-glucanotransferase  44.27 
 
 
509 aa  403  1e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.117914  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2959  4-alpha-glucanotransferase  45.66 
 
 
502 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0041  4-alpha-glucanotransferase  44.91 
 
 
502 aa  396  1e-109  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0206  4-alpha-glucanotransferase  44.65 
 
 
470 aa  395  1e-109  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.539313 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0510  4-alpha-glucanotransferase  44.22 
 
 
504 aa  394  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.855301  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2968  4-alpha-glucanotransferase  44.56 
 
 
525 aa  390  1e-107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.34566  decreased coverage  0.00000602964 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1054  4-alpha-glucanotransferase  44.16 
 
 
499 aa  385  1e-106  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00164715  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2059  4-alpha-glucanotransferase  47.37 
 
 
456 aa  384  1e-105  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.113022  normal  0.335201 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0865  4-alpha-glucanotransferase  42.6 
 
 
522 aa  382  1e-105  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0552  4-alpha-glucanotransferase  40.92 
 
 
497 aa  380  1e-104  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00709308  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5124  4-alpha-glucanotransferase  41.11 
 
 
525 aa  380  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.642325  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1263  4-alpha-glucanotransferase  43.31 
 
 
498 aa  379  1e-104  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.572623  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0768  4-alpha-glucanotransferase  43.81 
 
 
468 aa  379  1e-104  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0364  4-alpha-glucanotransferase  46.78 
 
 
494 aa  377  1e-103  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1375  4-alpha-glucanotransferase  43.6 
 
 
518 aa  376  1e-103  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2387  4-alpha-glucanotransferase  38.7 
 
 
540 aa  373  1e-102  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0235  4-alpha-glucanotransferase  43.41 
 
 
479 aa  374  1e-102  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.788709  normal  0.23673 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1614  4-alpha-glucanotransferase  43.38 
 
 
522 aa  370  1e-101  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0724988 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2290  4-alpha-glucanotransferase  39.2 
 
 
499 aa  370  1e-101  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.793425  normal  0.0727641 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1410  4-alpha-glucanotransferase  43.2 
 
 
515 aa  367  1e-100  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0343019  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0669  4-alpha-glucanotransferase  41.44 
 
 
498 aa  363  3e-99  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.137131  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1316  4-alpha-glucanotransferase  40.93 
 
 
479 aa  363  3e-99  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09791  4-alpha-glucanotransferase  43.64 
 
 
521 aa  363  3e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0608  4-alpha-glucanotransferase  37.2 
 
 
497 aa  362  1e-98  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0630977 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5282  malto-oligosyltrehalose synthase  38.63 
 
 
1411 aa  361  2e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.339944 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11061  4-alpha-glucanotransferase  40.12 
 
 
515 aa  359  5e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0171419  normal  0.287417 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15011  4-alpha-glucanotransferase  39.96 
 
 
498 aa  359  5e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.854558  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0413  4-alpha-glucanotransferase  36.33 
 
 
507 aa  358  9.999999999999999e-98  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1092  4-alpha-glucanotransferase  37.24 
 
 
506 aa  353  4e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.533755  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11871  4-alpha-glucanotransferase  37.5 
 
 
506 aa  350  4e-95  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11711  4-alpha-glucanotransferase  35.25 
 
 
506 aa  349  6e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1439  4-alpha-glucanotransferase  36.07 
 
 
498 aa  349  8e-95  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0142582  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44779  predicted protein  39.92 
 
 
560 aa  346  5e-94  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0420  4-alpha-glucanotransferase  38.29 
 
 
498 aa  344  2e-93  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1017  4-alpha-glucanotransferase  37.07 
 
 
493 aa  338  9e-92  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00219663  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1049  4-alpha-glucanotransferase  39.67 
 
 
495 aa  338  9.999999999999999e-92  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11881  4-alpha-glucanotransferase  37.42 
 
 
507 aa  335  1e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3444  4-alpha-glucanotransferase  37.1 
 
 
497 aa  330  4e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81732e-17 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3195  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  35.96 
 
 
1193 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2349  4-alpha-glucanotransferase  37.39 
 
 
483 aa  325  8.000000000000001e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0817  4-alpha-glucanotransferase  36.31 
 
 
497 aa  323  5e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.960729  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0165  4-alpha-glucanotransferase  33.27 
 
 
506 aa  309  6.999999999999999e-83  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00332904  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>