257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0669 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0669  4-alpha-glucanotransferase  100 
 
 
498 aa  1020    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.137131  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15011  4-alpha-glucanotransferase  97.99 
 
 
498 aa  998    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.854558  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11061  4-alpha-glucanotransferase  58.67 
 
 
515 aa  592  1e-168  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0171419  normal  0.287417 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09791  4-alpha-glucanotransferase  55.98 
 
 
521 aa  584  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1375  4-alpha-glucanotransferase  54.56 
 
 
518 aa  574  1.0000000000000001e-162  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1614  4-alpha-glucanotransferase  54.9 
 
 
522 aa  558  1e-158  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0724988 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11711  4-alpha-glucanotransferase  53.12 
 
 
506 aa  536  1e-151  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11871  4-alpha-glucanotransferase  52.85 
 
 
506 aa  534  1e-150  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1092  4-alpha-glucanotransferase  52.24 
 
 
506 aa  528  1e-149  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.533755  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11881  4-alpha-glucanotransferase  52.13 
 
 
507 aa  526  1e-148  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1296  4-alpha-glucanotransferase  41.3 
 
 
505 aa  389  1e-107  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.891573  normal  0.349432 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1182  4-alpha-glucanotransferase  41.67 
 
 
493 aa  386  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.207388  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1690  4-alpha-glucanotransferase  40.08 
 
 
501 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1708  4-alpha-glucanotransferase  40.08 
 
 
501 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.24711  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2391  4-alpha-glucanotransferase  41.56 
 
 
496 aa  380  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000053446  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0251  amylomaltase  41.08 
 
 
483 aa  373  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3250  4-alpha-glucanotransferase  40.95 
 
 
499 aa  369  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000256283  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1002  4-alpha-glucanotransferase  39.96 
 
 
514 aa  367  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0388229  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3246  4-alpha-glucanotransferase  39.16 
 
 
495 aa  365  1e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1014  4-alpha-glucanotransferase  39.2 
 
 
495 aa  364  2e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.129588  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1019  4-alpha-glucanotransferase  42.06 
 
 
499 aa  363  3e-99  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.147534  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2071  4-alpha-glucanotransferase  41.44 
 
 
495 aa  363  3e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1738  4-alpha-glucanotransferase  39.64 
 
 
497 aa  362  1e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0219743  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2041  4-alpha-glucanotransferase  40.12 
 
 
493 aa  359  7e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0433  4-alpha-glucanotransferase  38.66 
 
 
504 aa  358  9.999999999999999e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.459094  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0244  4-alpha-glucanotransferase  39.34 
 
 
504 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1055  4-alpha-glucanotransferase  38.07 
 
 
500 aa  357  2.9999999999999997e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.919868  hitchhiker  0.00474904 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1822  4-alpha-glucanotransferase  39.54 
 
 
505 aa  357  3.9999999999999996e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0667  4-alpha-glucanotransferase  39.22 
 
 
503 aa  356  6.999999999999999e-97  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.485353  normal  0.13128 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2921  4-alpha-glucanotransferase  39.27 
 
 
499 aa  354  2e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2959  4-alpha-glucanotransferase  40.48 
 
 
502 aa  353  4e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2645  4-alpha-glucanotransferase  37.47 
 
 
516 aa  350  5e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.219759  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1575  4-alpha-glucanotransferase  38.3 
 
 
512 aa  349  7e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.737195  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2912  4-alpha-glucanotransferase  39.25 
 
 
519 aa  347  2e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0554  4-alpha-glucanotransferase  39.83 
 
 
501 aa  347  3e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0239247  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0155  malto-oligosyltrehalose synthase  39.71 
 
 
1405 aa  346  4e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4956  4-alpha-glucanotransferase  38.88 
 
 
498 aa  345  8.999999999999999e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0237  4-alpha-glucanotransferase  38.37 
 
 
503 aa  344  2.9999999999999997e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0624172  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3896  4-alpha-glucanotransferase  38.1 
 
 
495 aa  342  7e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.979798 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0778  4-alpha-glucanotransferase  38.3 
 
 
490 aa  342  1e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.605175  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1410  4-alpha-glucanotransferase  37.64 
 
 
515 aa  340  4e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0343019  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1459  4-alpha-glucanotransferase  37.85 
 
 
499 aa  340  4e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1121  4-alpha-glucanotransferase  37.13 
 
 
501 aa  340  5e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.644339  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2387  4-alpha-glucanotransferase  38.85 
 
 
540 aa  339  5.9999999999999996e-92  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2647  4-alpha-glucanotransferase  39.52 
 
 
497 aa  339  7e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0906  4-alpha-glucanotransferase  39.2 
 
 
482 aa  338  9.999999999999999e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1527  4-alpha-glucanotransferase  38.75 
 
 
489 aa  338  9.999999999999999e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.969905  decreased coverage  0.0000210459 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3264  4-alpha-glucanotransferase  37.9 
 
 
502 aa  338  9.999999999999999e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1468  4-alpha-glucanotransferase  39.18 
 
 
500 aa  338  9.999999999999999e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00033046 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2333  4-alpha-glucanotransferase  39.56 
 
 
497 aa  337  2.9999999999999997e-91  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0816  4-alpha-glucanotransferase  37.58 
 
 
488 aa  335  7.999999999999999e-91  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1431  4-alpha-glucanotransferase  36.64 
 
 
490 aa  335  1e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1486  4-alpha-glucanotransferase  35.67 
 
 
509 aa  334  2e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.117914  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1263  4-alpha-glucanotransferase  37.3 
 
 
498 aa  332  1e-89  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.572623  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0961  4-alpha-glucanotransferase  38.45 
 
 
491 aa  330  5.0000000000000004e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.143538 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0514  4-alpha-glucanotransferase  36.65 
 
 
512 aa  328  9e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1102  4-alpha-glucanotransferase  38.04 
 
 
501 aa  328  1.0000000000000001e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.399608  normal  0.584525 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1473  4-alpha-glucanotransferase  37.16 
 
 
494 aa  325  1e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1186  4-alpha-glucanotransferase  37.87 
 
 
502 aa  325  2e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0510  4-alpha-glucanotransferase  38.37 
 
 
504 aa  325  2e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.855301  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2811  4-alpha-glucanotransferase  37.73 
 
 
496 aa  322  9.999999999999999e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000526525  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1108  4-alpha-glucanotransferase  36.9 
 
 
497 aa  321  9.999999999999999e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.204434  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0906  4-alpha-glucanotransferase  35.73 
 
 
502 aa  318  1e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0786343  hitchhiker  0.000119798 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2968  4-alpha-glucanotransferase  37.87 
 
 
525 aa  318  2e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.34566  decreased coverage  0.00000602964 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0552  4-alpha-glucanotransferase  38.22 
 
 
497 aa  315  9.999999999999999e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00709308  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3452  4-alpha-glucanotransferase  37.09 
 
 
520 aa  315  9.999999999999999e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00120069 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0510  4-alpha-glucanotransferase  37.27 
 
 
454 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0608  4-alpha-glucanotransferase  37.32 
 
 
497 aa  312  7.999999999999999e-84  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0630977 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3201  4-alpha-glucanotransferase  36.67 
 
 
518 aa  312  9e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.127634  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0557  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  36.4 
 
 
1175 aa  312  9e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.641532  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3100  4-alpha-glucanotransferase  36.67 
 
 
518 aa  312  9e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.601917  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2966  4-alpha-glucanotransferase  36.49 
 
 
508 aa  312  9e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1705  4-alpha-glucanotransferase  36.4 
 
 
512 aa  312  1e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3276  4-alpha-glucanotransferase  35.83 
 
 
535 aa  311  2e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.433715  normal  0.229692 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1054  4-alpha-glucanotransferase  37.65 
 
 
499 aa  311  2e-83  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00164715  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2764  4-alpha-glucanotransferase  37.3 
 
 
517 aa  309  5.9999999999999995e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5282  malto-oligosyltrehalose synthase  36.19 
 
 
1411 aa  307  2.0000000000000002e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.339944 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0206  4-alpha-glucanotransferase  37.6 
 
 
470 aa  307  3e-82  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.539313 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0420  4-alpha-glucanotransferase  37.07 
 
 
498 aa  307  4.0000000000000004e-82  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0041  4-alpha-glucanotransferase  36.86 
 
 
502 aa  303  5.000000000000001e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0768  4-alpha-glucanotransferase  36.8 
 
 
468 aa  303  6.000000000000001e-81  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2290  4-alpha-glucanotransferase  37.25 
 
 
499 aa  301  2e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.793425  normal  0.0727641 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44779  predicted protein  34.91 
 
 
560 aa  299  7e-80  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3001  4-alpha-glucanotransferase  36.57 
 
 
518 aa  299  8e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0364  4-alpha-glucanotransferase  35.94 
 
 
494 aa  297  2e-79  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1316  4-alpha-glucanotransferase  36.17 
 
 
479 aa  298  2e-79  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1049  4-alpha-glucanotransferase  34 
 
 
495 aa  297  3e-79  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0413  4-alpha-glucanotransferase  35.12 
 
 
507 aa  297  3e-79  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5124  4-alpha-glucanotransferase  33.33 
 
 
525 aa  296  4e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.642325  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2059  4-alpha-glucanotransferase  36.51 
 
 
456 aa  296  8e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.113022  normal  0.335201 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3111  4-alpha-glucanotransferase  35.43 
 
 
503 aa  293  6e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.124455 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1505  4-alpha-glucanotransferase  34.22 
 
 
496 aa  288  1e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.104049 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0235  4-alpha-glucanotransferase  35.19 
 
 
479 aa  286  5e-76  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.788709  normal  0.23673 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2349  4-alpha-glucanotransferase  35.33 
 
 
483 aa  285  1.0000000000000001e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1017  4-alpha-glucanotransferase  35.48 
 
 
493 aa  281  2e-74  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00219663  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0865  4-alpha-glucanotransferase  33.61 
 
 
522 aa  274  3e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0817  4-alpha-glucanotransferase  32.65 
 
 
497 aa  269  1e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.960729  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3444  4-alpha-glucanotransferase  32.79 
 
 
497 aa  266  5.999999999999999e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81732e-17 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1439  4-alpha-glucanotransferase  32.78 
 
 
498 aa  266  7e-70  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0142582  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17010  4-alpha-glucanotransferase  33.06 
 
 
856 aa  248  2e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>