257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0817 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3444  4-alpha-glucanotransferase  93.16 
 
 		 497 aa  974    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81732e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0817  4-alpha-glucanotransferase  100 
 
 		 497 aa  1040    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.960729  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3452  4-alpha-glucanotransferase  46.18 
 
 		 520 aa  468  1.0000000000000001e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120069 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0552  4-alpha-glucanotransferase  44.47 
 
 		 497 aa  461  1e-129  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00709308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1263  4-alpha-glucanotransferase  45.58 
 
 		 498 aa  464  1e-129  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.572623  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1575  4-alpha-glucanotransferase  46.28 
 
 		 512 aa  450  1e-125  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.737195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2645  4-alpha-glucanotransferase  44.87 
 
 		 516 aa  446  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.219759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1822  4-alpha-glucanotransferase  44.87 
 
 		 505 aa  444  1e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1055  4-alpha-glucanotransferase  45.07 
 
 		 500 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.919868  hitchhiker  0.00474904 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1054  4-alpha-glucanotransferase  45.49 
 
 		 499 aa  437  1e-121  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00164715  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4956  4-alpha-glucanotransferase  44.47 
 
 		 498 aa  429  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1690  4-alpha-glucanotransferase  43.06 
 
 		 501 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0155  malto-oligosyltrehalose synthase  42.05 
 
 		 1405 aa  420  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2968  4-alpha-glucanotransferase  44.82 
 
 		 525 aa  420  1e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.34566  decreased coverage  0.00000602964 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1296  4-alpha-glucanotransferase  40.72 
 
 		 505 aa  421  1e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.891573  normal  0.349432 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1708  4-alpha-glucanotransferase  43.06 
 
 		 501 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.24711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3111  4-alpha-glucanotransferase  42.6 
 
 		 503 aa  413  1e-114  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.124455 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0554  4-alpha-glucanotransferase  42.48 
 
 		 501 aa  412  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0239247  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5282  malto-oligosyltrehalose synthase  42.54 
 
 		 1411 aa  414  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.339944 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0510  4-alpha-glucanotransferase  42.54 
 
 		 504 aa  409  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.855301  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1705  4-alpha-glucanotransferase  42.21 
 
 		 512 aa  410  1e-113  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1186  4-alpha-glucanotransferase  43.06 
 
 		 502 aa  406  1.0000000000000001e-112  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1459  4-alpha-glucanotransferase  43.17 
 
 		 499 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1002  4-alpha-glucanotransferase  42.21 
 
 		 514 aa  403  1e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0388229  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0244  4-alpha-glucanotransferase  40.28 
 
 		 504 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0816  4-alpha-glucanotransferase  41.87 
 
 		 488 aa  399  9.999999999999999e-111  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2921  4-alpha-glucanotransferase  41.55 
 
 		 499 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0041  4-alpha-glucanotransferase  42.83 
 
 		 502 aa  395  1e-109  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3250  4-alpha-glucanotransferase  42.97 
 
 		 499 aa  396  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000256283  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1182  4-alpha-glucanotransferase  42.05 
 
 		 493 aa  392  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.207388  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2959  4-alpha-glucanotransferase  40.88 
 
 		 502 aa  392  1e-108  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2764  4-alpha-glucanotransferase  42.74 
 
 		 517 aa  393  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0433  4-alpha-glucanotransferase  41.2 
 
 		 504 aa  394  1e-108  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.459094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2391  4-alpha-glucanotransferase  42.17 
 
 		 496 aa  389  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000053446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2912  4-alpha-glucanotransferase  40.2 
 
 		 519 aa  389  1e-107  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5124  4-alpha-glucanotransferase  39.01 
 
 		 525 aa  387  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.642325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2333  4-alpha-glucanotransferase  41.37 
 
 		 497 aa  388  1e-106  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0206  4-alpha-glucanotransferase  42.28 
 
 		 470 aa  385  1e-106  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.539313 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1738  4-alpha-glucanotransferase  42.35 
 
 		 497 aa  388  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0219743  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1019  4-alpha-glucanotransferase  41.04 
 
 		 499 aa  383  1e-105  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.147534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2647  4-alpha-glucanotransferase  41.16 
 
 		 497 aa  383  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3246  4-alpha-glucanotransferase  40.67 
 
 		 495 aa  380  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2811  4-alpha-glucanotransferase  39.68 
 
 		 496 aa  380  1e-104  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000526525  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0557  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  41.07 
 
 		 1175 aa  376  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.641532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1014  4-alpha-glucanotransferase  40.12 
 
 		 495 aa  378  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.129588  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1486  4-alpha-glucanotransferase  39.64 
 
 		 509 aa  378  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.117914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0251  amylomaltase  43.55 
 
 		 483 aa  375  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1017  4-alpha-glucanotransferase  39.51 
 
 		 493 aa  378  1e-103  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00219663  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0906  4-alpha-glucanotransferase  42.25 
 
 		 502 aa  376  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0786343  hitchhiker  0.000119798 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1121  4-alpha-glucanotransferase  41.77 
 
 		 501 aa  373  1e-102  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.644339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0237  4-alpha-glucanotransferase  39.76 
 
 		 503 aa  372  1e-102  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0624172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3896  4-alpha-glucanotransferase  38.99 
 
 		 495 aa  369  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.979798 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3100  4-alpha-glucanotransferase  41.26 
 
 		 518 aa  366  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.601917  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1439  4-alpha-glucanotransferase  38.4 
 
 		 498 aa  367  1e-100  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0142582  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2041  4-alpha-glucanotransferase  42.25 
 
 		 493 aa  367  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3201  4-alpha-glucanotransferase  41.06 
 
 		 518 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.127634  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0667  4-alpha-glucanotransferase  39.56 
 
 		 503 aa  368  1e-100  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.485353  normal  0.13128 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2966  4-alpha-glucanotransferase  41.34 
 
 		 508 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2290  4-alpha-glucanotransferase  39.83 
 
 		 499 aa  363  4e-99  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.793425  normal  0.0727641 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1468  4-alpha-glucanotransferase  40.84 
 
 		 500 aa  363  5.0000000000000005e-99  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00033046 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0768  4-alpha-glucanotransferase  41.06 
 
 		 468 aa  362  6e-99  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1102  4-alpha-glucanotransferase  39.16 
 
 		 501 aa  360  2e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.399608  normal  0.584525 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0413  4-alpha-glucanotransferase  37.55 
 
 		 507 aa  360  3e-98  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3264  4-alpha-glucanotransferase  39.88 
 
 		 502 aa  360  3e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0865  4-alpha-glucanotransferase  40.25 
 
 		 522 aa  360  5e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0906  4-alpha-glucanotransferase  39.72 
 
 		 482 aa  355  7.999999999999999e-97  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0608  4-alpha-glucanotransferase  38.49 
 
 		 497 aa  355  1e-96  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0630977 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1316  4-alpha-glucanotransferase  40.16 
 
 		 479 aa  352  1e-95  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0235  4-alpha-glucanotransferase  40.85 
 
 		 479 aa  350  4e-95  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.788709  normal  0.23673 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1505  4-alpha-glucanotransferase  38.49 
 
 		 496 aa  349  7e-95  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.104049 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3276  4-alpha-glucanotransferase  37.57 
 
 		 535 aa  342  1e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.433715  normal  0.229692 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3001  4-alpha-glucanotransferase  40.74 
 
 		 518 aa  341  2e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0420  4-alpha-glucanotransferase  39.48 
 
 		 498 aa  340  2.9999999999999998e-92  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0514  4-alpha-glucanotransferase  38.17 
 
 		 512 aa  340  4e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1108  4-alpha-glucanotransferase  39.03 
 
 		 497 aa  335  1e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.204434  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1410  4-alpha-glucanotransferase  38.37 
 
 		 515 aa  334  2e-90  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0343019  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1473  4-alpha-glucanotransferase  36.75 
 
 		 494 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0961  4-alpha-glucanotransferase  37.57 
 
 		 491 aa  326  7e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143538 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2071  4-alpha-glucanotransferase  36.31 
 
 		 495 aa  323  5e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1049  4-alpha-glucanotransferase  35.16 
 
 		 495 aa  322  9.999999999999999e-87  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1431  4-alpha-glucanotransferase  36.29 
 
 		 490 aa  319  7.999999999999999e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3195  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  35.66 
 
 		 1193 aa  318  2e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1527  4-alpha-glucanotransferase  35.77 
 
 		 489 aa  315  9.999999999999999e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.969905  decreased coverage  0.0000210459 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2387  4-alpha-glucanotransferase  32.53 
 
 		 540 aa  315  1.9999999999999998e-84  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44779  predicted protein  35.41 
 
 		 560 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2349  4-alpha-glucanotransferase  33.8 
 
 		 483 aa  301  1e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0364  4-alpha-glucanotransferase  35.33 
 
 		 494 aa  298  2e-79  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0510  4-alpha-glucanotransferase  33.54 
 
 		 454 aa  290  4e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0165  4-alpha-glucanotransferase  32.8 
 
 		 506 aa  285  1.0000000000000001e-75  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00332904  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11061  4-alpha-glucanotransferase  33.6 
 
 		 515 aa  282  1e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0171419  normal  0.287417 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0778  4-alpha-glucanotransferase  31.81 
 
 		 490 aa  275  2.0000000000000002e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.605175  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11711  4-alpha-glucanotransferase  31.24 
 
 		 506 aa  271  2e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17010  4-alpha-glucanotransferase  32.81 
 
 		 856 aa  271  2.9999999999999997e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0669  4-alpha-glucanotransferase  32.65 
 
 		 498 aa  269  1e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.137131  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15011  4-alpha-glucanotransferase  32.99 
 
 		 498 aa  265  1e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.854558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11871  4-alpha-glucanotransferase  30.83 
 
 		 506 aa  264  3e-69  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1092  4-alpha-glucanotransferase  30.37 
 
 		 506 aa  258  2e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.533755  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1046  4-alpha-glucanotransferase  32.99 
 
 		 1145 aa  257  4e-67  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11881  4-alpha-glucanotransferase  30.78 
 
 		 507 aa  253  8.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09791  4-alpha-glucanotransferase  30.82 
 
 		 521 aa  247  4e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>