More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_16160 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_16160  alpha amylase catalytic region  100 
 
 
582 aa  1209    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.135656  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1187  alpha amylase, catalytic region  51.17 
 
 
574 aa  592  1e-168  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.649745  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1510  alpha amylase catalytic region  45.38 
 
 
588 aa  539  9.999999999999999e-153  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0693  alpha amylase catalytic region  47.78 
 
 
589 aa  530  1e-149  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.544256  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0209  alpha amylase catalytic region  47.16 
 
 
587 aa  508  1e-143  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.214929  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2715  alpha amylase catalytic region  44.48 
 
 
586 aa  499  1e-140  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.783965  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4033  alpha-amylase  43.83 
 
 
586 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4065  alpha-amylase  41.81 
 
 
586 aa  491  1e-137  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00857502  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3923  alpha-amylase  43.65 
 
 
586 aa  491  1e-137  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.077221  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3755  neopullulanase  43.47 
 
 
586 aa  489  1e-137  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000420185  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3771  neopullulanase  43.65 
 
 
586 aa  491  1e-137  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00823842  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4230  alpha-amylase  43.65 
 
 
586 aa  491  1e-137  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.300485  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1119  alpha-amylase  41.47 
 
 
586 aa  491  1e-137  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0181074  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3842  alpha amylase catalytic region  41.74 
 
 
586 aa  490  1e-137  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000752132  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4120  alpha-amylase  41.3 
 
 
586 aa  487  1e-136  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000171258  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4139  alpha-amylase  43.65 
 
 
586 aa  488  1e-136  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00110847  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0802  glycosy hydrolase family protein  40.2 
 
 
610 aa  445  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.124248  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0789  cymH protein  40.71 
 
 
610 aa  448  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1856  Alpha amylase, catalytic region  39.66 
 
 
586 aa  431  1e-119  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1852  neopullulanase  40.82 
 
 
584 aa  429  1e-119  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.496782  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3073  alpha amylase catalytic region  47.03 
 
 
477 aa  427  1e-118  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0795  alpha amylase, catalytic region  39.38 
 
 
575 aa  425  1e-117  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1613  alpha amylase, catalytic region  38.16 
 
 
589 aa  423  1e-117  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.050548  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3419  hypothetical protein  43.64 
 
 
481 aa  394  1e-108  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.488491  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0215  neopullulanase  41.65 
 
 
574 aa  394  1e-108  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0425343  hitchhiker  0.000179088 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2350  alpha amylase catalytic region  38.35 
 
 
583 aa  374  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1998  alpha amylase catalytic region  42.95 
 
 
481 aa  365  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.722533  normal  0.515841 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2916  Alpha-amylase  43.11 
 
 
472 aa  366  1e-100  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1712  alpha amylase, catalytic region  42.5 
 
 
481 aa  365  1e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0611  alpha amylase, catalytic region  41.47 
 
 
496 aa  364  2e-99  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.132901 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2579  alpha amylase catalytic region  36.89 
 
 
576 aa  363  6e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000456037  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2869  alpha amylase catalytic region  38.92 
 
 
578 aa  360  3e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2092  alpha amylase catalytic subunit  40.94 
 
 
484 aa  352  7e-96  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0253645  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1318  alpha amylase catalytic region  40.27 
 
 
486 aa  334  3e-90  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.844059  normal  0.130735 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1431  alpha amylase catalytic region  34.17 
 
 
663 aa  330  5.0000000000000004e-89  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.246388  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4392  alpha amylase, catalytic region  39.25 
 
 
493 aa  329  1.0000000000000001e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.47907 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4343  alpha amylase catalytic region  40.37 
 
 
481 aa  325  1e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4625  alpha amylase catalytic region  40.55 
 
 
481 aa  318  3e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1944  alpha amylase catalytic region  38.16 
 
 
486 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1971  alpha amylase catalytic region  38.16 
 
 
486 aa  314  2.9999999999999996e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0248141  normal  0.0160527 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2017  Alpha amylase, catalytic region  37.78 
 
 
488 aa  311  2e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00107336  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0534  alpha amylase catalytic region  37.2 
 
 
487 aa  306  5.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.595542  normal  0.941542 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21691  glycoside hydrolase family protein  37.69 
 
 
483 aa  304  4.0000000000000003e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0470032 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  32.78 
 
 
1847 aa  302  1e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1313  alpha amylase, catalytic domain protein  37.96 
 
 
459 aa  299  9e-80  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3705  alpha amylase catalytic region  31.21 
 
 
617 aa  280  4e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00647332  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0501  alpha amylase domain-containing protein  38.89 
 
 
476 aa  278  2e-73  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.259034  normal  0.140596 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1834  alpha amylase domain-containing protein  35.68 
 
 
480 aa  268  2.9999999999999995e-70  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.108338  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1414  alpha amylase catalytic region  34.69 
 
 
703 aa  267  2.9999999999999995e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0623392  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2874  alpha amylase catalytic region  31.8 
 
 
1299 aa  262  1e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002973  maltodextrin glucosidase  32.2 
 
 
608 aa  260  5.0000000000000005e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4336  alpha amylase catalytic region  29.53 
 
 
914 aa  259  1e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3272  alpha amylase catalytic region  30.78 
 
 
1643 aa  258  2e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2278  alpha amylase catalytic region  32.22 
 
 
1307 aa  257  4e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.792883  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2907  alpha amylase catalytic subunit  32.73 
 
 
715 aa  254  2.0000000000000002e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.245602 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1458  alpha amylase, catalytic region  31.28 
 
 
644 aa  254  4.0000000000000004e-66  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.628846  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0286  alpha amylase catalytic region  31.19 
 
 
611 aa  250  6e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.109454  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2327  alpha amylase catalytic region  31 
 
 
1401 aa  248  2e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.775797  normal  0.294215 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2452  alpha amylase, catalytic region  31.13 
 
 
1401 aa  248  2e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0187956  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4335  alpha amylase catalytic region  28.85 
 
 
1753 aa  243  5e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.167512  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0987  alpha amylase catalytic region  33.47 
 
 
473 aa  239  1e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0969  alpha amylase, catalytic region  33.47 
 
 
473 aa  239  1e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  35.33 
 
 
510 aa  238  3e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1458  alpha amylase, catalytic region  31.62 
 
 
651 aa  237  4e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3146  alpha amylase catalytic region  32.69 
 
 
622 aa  236  9e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.476414 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1580  alpha amylase, catalytic region  35.54 
 
 
475 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0569736  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2274  alpha amylase catalytic region  30.37 
 
 
614 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0525857 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  34.86 
 
 
511 aa  234  5e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0475  alpha amylase, catalytic region  30.41 
 
 
608 aa  233  1e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.350663  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1049  maltodextrin glucosidase  30.15 
 
 
607 aa  231  2e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0895639 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0501  maltodextrin glucosidase  32.15 
 
 
605 aa  230  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.524518  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0446  maltodextrin glucosidase  32.15 
 
 
605 aa  229  9e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565903  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0459  maltodextrin glucosidase  32.15 
 
 
605 aa  228  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0440  maltodextrin glucosidase  31.84 
 
 
605 aa  227  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3131  maltodextrin glucosidase  32.68 
 
 
609 aa  226  6e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0084  pullulanase  30.74 
 
 
606 aa  227  6e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0480  maltodextrin glucosidase  30.81 
 
 
604 aa  226  6e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3271  maltodextrin glucosidase  32.68 
 
 
609 aa  226  8e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0434  maltodextrin glucosidase  30.63 
 
 
605 aa  225  2e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0473  maltodextrin glucosidase  30.63 
 
 
605 aa  224  3e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0221  alpha amylase catalytic region  35.24 
 
 
474 aa  224  3e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0433  maltodextrin glucosidase  30.63 
 
 
605 aa  224  3e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3206  alpha amylase catalytic region  30.63 
 
 
605 aa  224  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.608393  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00351  maltodextrin glucosidase  30.63 
 
 
605 aa  223  6e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3230  maltodextrin glucosidase  30.63 
 
 
605 aa  223  6e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000268324 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00355  hypothetical protein  30.63 
 
 
605 aa  223  6e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0871  maltodextrin glucosidase  31.3 
 
 
605 aa  223  8e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3195  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  29.08 
 
 
1193 aa  218  2e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1167  alpha amylase catalytic region  29.29 
 
 
576 aa  218  2.9999999999999998e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.823071  normal  0.49953 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1114  alpha amylase catalytic subunit  30.43 
 
 
580 aa  218  2.9999999999999998e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0144434  normal  0.666267 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0729  amylopullulanase  30 
 
 
600 aa  217  5e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00401162  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0794  alpha amylase catalytic region  32.16 
 
 
562 aa  217  5.9999999999999996e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0369  alpha amylase catalytic region  26.96 
 
 
659 aa  213  7.999999999999999e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0557  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  29.02 
 
 
1175 aa  213  9e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.641532  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3180  alpha amylase catalytic region  29.77 
 
 
635 aa  211  4e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000161809  normal  0.231974 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0586  alpha amylase catalytic region  30.98 
 
 
479 aa  207  5e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.532649  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1046  4-alpha-glucanotransferase  29.52 
 
 
1145 aa  206  1e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13890  glycosidase  27.97 
 
 
624 aa  202  9.999999999999999e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.496833  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4291  alpha amylase catalytic region  29.36 
 
 
528 aa  200  5e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.57141  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4269  alpha amylase catalytic region  29.36 
 
 
528 aa  200  7.999999999999999e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>