More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0215 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0215  neopullulanase  100 
 
 		 574 aa  1194    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0425343  hitchhiker  0.000179088 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1613  alpha amylase, catalytic region  52.03 
 
 		 589 aa  619  1e-176  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.050548  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1852  neopullulanase  48.91 
 
 		 584 aa  540  9.999999999999999e-153  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.496782  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1510  alpha amylase catalytic region  42.44 
 
 		 588 aa  478  1e-133  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0693  alpha amylase catalytic region  41.75 
 
 		 589 aa  465  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.544256  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3842  alpha amylase catalytic region  44.53 
 
 		 586 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000752132  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2715  alpha amylase catalytic region  43.17 
 
 		 586 aa  449  1e-125  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.783965  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4120  alpha-amylase  42.21 
 
 		 586 aa  449  1e-125  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000171258  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1119  alpha-amylase  42.03 
 
 		 586 aa  450  1e-125  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0181074  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3923  alpha-amylase  42.06 
 
 		 586 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.077221  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3755  neopullulanase  41.88 
 
 		 586 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000420185  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3771  neopullulanase  42.06 
 
 		 586 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00823842  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4230  alpha-amylase  42.06 
 
 		 586 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.300485  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4033  alpha-amylase  42.06 
 
 		 586 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4065  alpha-amylase  42.47 
 
 		 586 aa  442  1e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00857502  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4139  alpha-amylase  42.18 
 
 		 586 aa  442  1e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00110847  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0802  glycosy hydrolase family protein  41.86 
 
 		 610 aa  435  1e-121  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.124248  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0789  cymH protein  41.33 
 
 		 610 aa  430  1e-119  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0209  alpha amylase catalytic region  40.88 
 
 		 587 aa  422  1e-117  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.214929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2350  alpha amylase catalytic region  38.06 
 
 		 583 aa  413  1e-114  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1187  alpha amylase, catalytic region  40.76 
 
 		 574 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.649745  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16160  alpha amylase catalytic region  41.65 
 
 		 582 aa  394  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.135656  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2869  alpha amylase catalytic region  40.04 
 
 		 578 aa  350  4e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3073  alpha amylase catalytic region  43.14 
 
 		 477 aa  344  2.9999999999999997e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0795  alpha amylase, catalytic region  35 
 
 		 575 aa  343  4e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2916  Alpha-amylase  42.58 
 
 		 472 aa  332  8e-90  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3419  hypothetical protein  36.9 
 
 		 481 aa  313  5.999999999999999e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.488491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1856  Alpha amylase, catalytic region  34.84 
 
 		 586 aa  312  1e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2579  alpha amylase catalytic region  35.33 
 
 		 576 aa  312  1e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000456037  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1712  alpha amylase, catalytic region  40.9 
 
 		 481 aa  306  9.000000000000001e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0611  alpha amylase, catalytic region  40.69 
 
 		 496 aa  305  2.0000000000000002e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.132901 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1998  alpha amylase catalytic region  41.16 
 
 		 481 aa  303  6.000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.722533  normal  0.515841 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2092  alpha amylase catalytic subunit  36.91 
 
 		 484 aa  282  1e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0253645  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1318  alpha amylase catalytic region  35.96 
 
 		 486 aa  280  7e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.844059  normal  0.130735 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2017  Alpha amylase, catalytic region  35.79 
 
 		 488 aa  278  2e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00107336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4392  alpha amylase, catalytic region  38.54 
 
 		 493 aa  276  1.0000000000000001e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.47907 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4625  alpha amylase catalytic region  37.36 
 
 		 481 aa  275  2.0000000000000002e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4343  alpha amylase catalytic region  39.68 
 
 		 481 aa  272  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0501  alpha amylase domain-containing protein  34.81 
 
 		 476 aa  271  2.9999999999999997e-71  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.259034  normal  0.140596 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21691  glycoside hydrolase family protein  37.7 
 
 		 483 aa  270  5e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0470032 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0534  alpha amylase catalytic region  39.73 
 
 		 487 aa  269  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.595542  normal  0.941542 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1971  alpha amylase catalytic region  38.5 
 
 		 486 aa  263  4.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0248141  normal  0.0160527 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1944  alpha amylase catalytic region  38.5 
 
 		 486 aa  263  6.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1834  alpha amylase domain-containing protein  38.58 
 
 		 480 aa  262  1e-68  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.108338  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1431  alpha amylase catalytic region  33.07 
 
 		 663 aa  262  1e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.246388  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1313  alpha amylase, catalytic domain protein  34.54 
 
 		 459 aa  255  2.0000000000000002e-66  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  31.5 
 
 		 1847 aa  236  6e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2907  alpha amylase catalytic subunit  34.42 
 
 		 715 aa  235  2.0000000000000002e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.245602 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002973  maltodextrin glucosidase  28.28 
 
 		 608 aa  233  8.000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1458  alpha amylase, catalytic region  30.02 
 
 		 644 aa  228  3e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.628846  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1414  alpha amylase catalytic region  33.33 
 
 		 703 aa  226  9e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0623392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3272  alpha amylase catalytic region  29.79 
 
 		 1643 aa  225  1e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0729  amylopullulanase  31.97 
 
 		 600 aa  220  3.9999999999999997e-56  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00401162  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3705  alpha amylase catalytic region  29.18 
 
 		 617 aa  219  8.999999999999998e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00647332  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2452  alpha amylase, catalytic region  28.76 
 
 		 1401 aa  219  1e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0187956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2327  alpha amylase catalytic region  29.01 
 
 		 1401 aa  216  9.999999999999999e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.775797  normal  0.294215 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0557  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  30.04 
 
 		 1175 aa  208  3e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.641532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2278  alpha amylase catalytic region  29.06 
 
 		 1307 aa  207  4e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.792883  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0286  alpha amylase catalytic region  30.85 
 
 		 611 aa  205  1e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.109454  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0084  pullulanase  29.7 
 
 		 606 aa  204  4e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4335  alpha amylase catalytic region  29.35 
 
 		 1753 aa  202  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.167512  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2274  alpha amylase catalytic region  28.43 
 
 		 614 aa  200  5e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0525857 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0987  alpha amylase catalytic region  32.99 
 
 		 473 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0969  alpha amylase, catalytic region  32.99 
 
 		 473 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3195  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  28.87 
 
 		 1193 aa  198  3e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1049  maltodextrin glucosidase  34.33 
 
 		 607 aa  195  1e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0895639 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1458  alpha amylase, catalytic region  29.24 
 
 		 651 aa  196  1e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1580  alpha amylase, catalytic region  33.25 
 
 		 475 aa  194  3e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0569736  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2874  alpha amylase catalytic region  29.07 
 
 		 1299 aa  194  3e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3271  maltodextrin glucosidase  30.77 
 
 		 609 aa  193  6e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3131  maltodextrin glucosidase  30.77 
 
 		 609 aa  193  6e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0440  maltodextrin glucosidase  29.03 
 
 		 605 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0446  maltodextrin glucosidase  29.22 
 
 		 605 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0501  maltodextrin glucosidase  29.22 
 
 		 605 aa  191  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.524518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0459  maltodextrin glucosidase  28.83 
 
 		 605 aa  189  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0434  maltodextrin glucosidase  28.63 
 
 		 605 aa  188  3e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0369  alpha amylase catalytic region  31.39 
 
 		 659 aa  188  3e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3206  alpha amylase catalytic region  28.63 
 
 		 605 aa  187  5e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.608393  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0433  maltodextrin glucosidase  28.63 
 
 		 605 aa  187  6e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0480  maltodextrin glucosidase  28.63 
 
 		 604 aa  187  6e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17020  glycosidase  28.57 
 
 		 727 aa  187  6e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0473  maltodextrin glucosidase  28.57 
 
 		 605 aa  187  6e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00351  maltodextrin glucosidase  28.63 
 
 		 605 aa  187  7e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3230  maltodextrin glucosidase  28.63 
 
 		 605 aa  187  7e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000268324 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00355  hypothetical protein  28.63 
 
 		 605 aa  187  7e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1265  alpha amylase catalytic region  30.71 
 
 		 463 aa  184  4.0000000000000006e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0871  maltodextrin glucosidase  28.68 
 
 		 605 aa  183  6e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0475  alpha amylase, catalytic region  28.66 
 
 		 608 aa  182  1e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.350663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0221  alpha amylase catalytic region  33.6 
 
 		 474 aa  182  2e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1114  alpha amylase catalytic subunit  29.87 
 
 		 580 aa  181  2e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0144434  normal  0.666267 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1167  alpha amylase catalytic region  30.21 
 
 		 576 aa  181  4e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.823071  normal  0.49953 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  32.71 
 
 		 510 aa  180  5.999999999999999e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  33.7 
 
 		 511 aa  177  4e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0794  alpha amylase catalytic region  29.49 
 
 		 562 aa  176  9.999999999999999e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1046  4-alpha-glucanotransferase  28.09 
 
 		 1145 aa  173  6.999999999999999e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3146  alpha amylase catalytic region  29.75 
 
 		 622 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.476414 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0747  alpha amylase, catalytic region  27.62 
 
 		 655 aa  169  9e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.29476  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2159  alpha amylase catalytic region  29.18 
 
 		 647 aa  169  1e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.826727  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4336  alpha amylase catalytic region  29.09 
 
 		 914 aa  169  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0586  alpha amylase catalytic region  32.81 
 
 		 479 aa  166  1.0000000000000001e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.532649  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>