More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3180 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_3180  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 635 aa  1300    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000161809  normal  0.231974 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3146  alpha amylase catalytic region  42.93 
 
 		 622 aa  511  1e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.476414 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0794  alpha amylase catalytic region  40.11 
 
 		 562 aa  318  2e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1510  alpha amylase catalytic region  33.55 
 
 		 588 aa  248  4e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0693  alpha amylase catalytic region  31.71 
 
 		 589 aa  231  3e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.544256  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0209  alpha amylase catalytic region  30.66 
 
 		 587 aa  220  7.999999999999999e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.214929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3842  alpha amylase catalytic region  30.21 
 
 		 586 aa  213  9e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000752132  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1458  alpha amylase, catalytic region  32.95 
 
 		 644 aa  212  2e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.628846  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  31.98 
 
 		 510 aa  211  3e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16160  alpha amylase catalytic region  29.77 
 
 		 582 aa  211  5e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.135656  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1119  alpha-amylase  29.36 
 
 		 586 aa  210  6e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0181074  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4120  alpha-amylase  29.36 
 
 		 586 aa  209  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000171258  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  31.91 
 
 		 511 aa  207  4e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4258  alpha amylase catalytic region  32.44 
 
 		 541 aa  207  4e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256991  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2715  alpha amylase catalytic region  28.94 
 
 		 586 aa  207  4e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.783965  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4280  alpha amylase catalytic region  32.68 
 
 		 541 aa  206  9e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1187  alpha amylase, catalytic region  29.63 
 
 		 574 aa  205  2e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.649745  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4127  Alpha amylase, catalytic region  33.72 
 
 		 545 aa  205  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3923  alpha-amylase  29.36 
 
 		 586 aa  204  3e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.077221  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4230  alpha-amylase  29.36 
 
 		 586 aa  204  3e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.300485  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4033  alpha-amylase  29.36 
 
 		 586 aa  204  3e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4065  alpha-amylase  29.36 
 
 		 586 aa  204  5e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00857502  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3771  neopullulanase  29.36 
 
 		 586 aa  203  7e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00823842  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3755  neopullulanase  29.15 
 
 		 586 aa  203  9e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000420185  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3073  alpha amylase catalytic region  28.94 
 
 		 477 aa  202  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4139  alpha-amylase  28.94 
 
 		 586 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00110847  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0611  alpha amylase, catalytic region  33.11 
 
 		 496 aa  197  4.0000000000000005e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.132901 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2092  alpha amylase catalytic subunit  29.69 
 
 		 484 aa  197  6e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0253645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1712  alpha amylase, catalytic region  29.65 
 
 		 481 aa  197  7e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0802  glycosy hydrolase family protein  27.07 
 
 		 610 aa  196  1e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.124248  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0795  alpha amylase, catalytic region  27.01 
 
 		 575 aa  195  2e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1998  alpha amylase catalytic region  30.24 
 
 		 481 aa  194  3e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.722533  normal  0.515841 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  28.46 
 
 		 499 aa  194  4e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14740  alpha amylase  29.88 
 
 		 515 aa  194  4e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0597647  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0789  cymH protein  26.42 
 
 		 610 aa  194  6e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2327  alpha amylase catalytic region  29.17 
 
 		 1401 aa  192  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.775797  normal  0.294215 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1856  Alpha amylase, catalytic region  29.94 
 
 		 586 aa  191  2.9999999999999997e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4392  alpha amylase, catalytic region  30.31 
 
 		 493 aa  191  2.9999999999999997e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.47907 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2452  alpha amylase, catalytic region  28.92 
 
 		 1401 aa  191  5e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0187956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1313  alpha amylase, catalytic domain protein  28.57 
 
 		 459 aa  190  5e-47  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2278  alpha amylase catalytic region  32.03 
 
 		 1307 aa  190  8e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.792883  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1318  alpha amylase catalytic region  30.13 
 
 		 486 aa  188  3e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.844059  normal  0.130735 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1114  alpha amylase catalytic subunit  32.86 
 
 		 580 aa  186  1.0000000000000001e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0144434  normal  0.666267 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1944  alpha amylase catalytic region  29.98 
 
 		 486 aa  185  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1613  alpha amylase, catalytic region  28.17 
 
 		 589 aa  184  4.0000000000000006e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.050548  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1167  alpha amylase catalytic region  32.51 
 
 		 576 aa  183  1e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.823071  normal  0.49953 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2940  trehalose synthase  28.87 
 
 		 1088 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795057 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1971  alpha amylase catalytic region  29.73 
 
 		 486 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0248141  normal  0.0160527 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2713  trehalose synthase  28.87 
 
 		 1088 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.352676 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2017  Alpha amylase, catalytic region  30.27 
 
 		 488 aa  181  4e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00107336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4343  alpha amylase catalytic region  28.22 
 
 		 481 aa  180  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2869  alpha amylase catalytic region  31.47 
 
 		 578 aa  180  8e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0084  pullulanase  25.97 
 
 		 606 aa  180  8e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2835  trehalose synthase  28.63 
 
 		 1088 aa  180  9e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0758325  normal  0.0859996 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002973  maltodextrin glucosidase  27.53 
 
 		 608 aa  178  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0586  alpha amylase catalytic region  29.58 
 
 		 479 aa  177  4e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.532649  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1049  maltodextrin glucosidase  31.29 
 
 		 607 aa  176  9e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0895639 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4625  alpha amylase catalytic region  30.77 
 
 		 481 aa  176  9.999999999999999e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0347  alpha amylase catalytic region  27.8 
 
 		 522 aa  175  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.242051  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3419  hypothetical protein  30.54 
 
 		 481 aa  174  3.9999999999999995e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.488491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21691  glycoside hydrolase family protein  33.06 
 
 		 483 aa  173  6.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0470032 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2350  alpha amylase catalytic region  27.1 
 
 		 583 aa  173  7.999999999999999e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4246  alpha amylase catalytic region  29.44 
 
 		 593 aa  173  9e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.286976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0534  alpha amylase catalytic region  30.99 
 
 		 487 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.595542  normal  0.941542 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4335  alpha amylase catalytic region  27.88 
 
 		 1753 aa  172  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.167512  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1580  alpha amylase, catalytic region  28.43 
 
 		 475 aa  172  2e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0569736  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4274  alpha amylase catalytic region  30.78 
 
 		 529 aa  172  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0014  alpha amylase, catalytic region  28.31 
 
 		 595 aa  172  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328102 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3705  alpha amylase catalytic region  30.84 
 
 		 617 aa  171  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00647332  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2274  alpha amylase catalytic region  32.16 
 
 		 614 aa  171  4e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0525857 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2353  alpha amylase domain-containing protein  26.99 
 
 		 1110 aa  171  4e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.544253  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1598  trehalose synthase  29.03 
 
 		 1092 aa  171  5e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0248685 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7546  trehalose synthase  30.31 
 
 		 1088 aa  169  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.455626  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1934  alpha amylase catalytic region  27.85 
 
 		 643 aa  168  2.9999999999999998e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0475  alpha amylase, catalytic region  30.58 
 
 		 608 aa  167  5e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.350663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2446  putative trehalose synthase  28.17 
 
 		 1102 aa  167  6.9999999999999995e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.500894  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5858  alpha amylase catalytic region  33.1 
 
 		 569 aa  166  8e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.364305 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6807  trehalose synthase  27.64 
 
 		 1088 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267695  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4288  alpha amylase catalytic region  32.15 
 
 		 588 aa  166  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.240212  normal  0.162413 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1110  trehalose synthase  28.14 
 
 		 1102 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.531245 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5383  trehalose synthase  27.65 
 
 		 1093 aa  166  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0116468  normal  0.915163 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0987  alpha amylase catalytic region  28.5 
 
 		 473 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0969  alpha amylase, catalytic region  28.5 
 
 		 473 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2978  alpha amylase, catalytic region  29.6 
 
 		 548 aa  165  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.533119  normal  0.0820165 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5098  trehalose synthase  28.02 
 
 		 1093 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436768  decreased coverage  0.00978496 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8808  alpha amylase, catalytic region  30.58 
 
 		 552 aa  164  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2022  trehalose synthase  26.55 
 
 		 1142 aa  164  5.0000000000000005e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0221  alpha amylase catalytic region  26.99 
 
 		 474 aa  164  6e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7974  alpha amylase catalytic region  29.32 
 
 		 547 aa  164  6e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2425  alpha amylase catalytic region  32.72 
 
 		 509 aa  163  8.000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5564  alpha-glucosidase  28.07 
 
 		 1100 aa  163  8.000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.657284  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2579  alpha amylase catalytic region  26.74 
 
 		 576 aa  163  9e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000456037  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0937  alpha amylase domain-containing protein  30.17 
 
 		 548 aa  162  1e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0215  neopullulanase  27.87 
 
 		 574 aa  163  1e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0425343  hitchhiker  0.000179088 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2361  alpha amylase family protein  28.46 
 
 		 1111 aa  162  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.124946  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5528  alpha amylase catalytic region  28.54 
 
 		 545 aa  162  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.283745  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0214  alpha-glucosidase  28.47 
 
 		 552 aa  162  2e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417345 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2596  alpha amylase, catalytic region  29.68 
 
 		 558 aa  162  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1784  trehalose synthase  27.79 
 
 		 1102 aa  162  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3687  alpha amylase, catalytic region  28.1 
 
 		 540 aa  161  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>