More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2907 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_1414  alpha amylase catalytic region  55.01 
 
 		 703 aa  733    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0623392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2907  alpha amylase catalytic subunit  100 
 
 		 715 aa  1447    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.245602 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1431  alpha amylase catalytic region  28.06 
 
 		 663 aa  270  5.9999999999999995e-71  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.246388  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1510  alpha amylase catalytic region  35.31 
 
 		 588 aa  269  1e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2715  alpha amylase catalytic region  35.96 
 
 		 586 aa  268  2e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.783965  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1856  Alpha amylase, catalytic region  36.26 
 
 		 586 aa  264  3e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1712  alpha amylase, catalytic region  35.5 
 
 		 481 aa  261  2e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1998  alpha amylase catalytic region  36.97 
 
 		 481 aa  259  9e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.722533  normal  0.515841 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1187  alpha amylase, catalytic region  33.67 
 
 		 574 aa  259  1e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.649745  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0693  alpha amylase catalytic region  34.17 
 
 		 589 aa  258  2e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.544256  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1613  alpha amylase, catalytic region  36.03 
 
 		 589 aa  258  3e-67  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.050548  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1318  alpha amylase catalytic region  34.95 
 
 		 486 aa  256  1.0000000000000001e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.844059  normal  0.130735 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16160  alpha amylase catalytic region  32.73 
 
 		 582 aa  255  2.0000000000000002e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.135656  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4392  alpha amylase, catalytic region  34.11 
 
 		 493 aa  251  3e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.47907 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3073  alpha amylase catalytic region  38.52 
 
 		 477 aa  249  1e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0611  alpha amylase, catalytic region  36.02 
 
 		 496 aa  248  3e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.132901 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3842  alpha amylase catalytic region  34.49 
 
 		 586 aa  247  4.9999999999999997e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000752132  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0209  alpha amylase catalytic region  36.12 
 
 		 587 aa  247  6e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.214929  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4625  alpha amylase catalytic region  33.75 
 
 		 481 aa  247  6e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1119  alpha-amylase  32.68 
 
 		 586 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0181074  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4120  alpha-amylase  33.8 
 
 		 586 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000171258  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2092  alpha amylase catalytic subunit  34.72 
 
 		 484 aa  244  3.9999999999999997e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0253645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2017  Alpha amylase, catalytic region  34.32 
 
 		 488 aa  244  5e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00107336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4139  alpha-amylase  33.8 
 
 		 586 aa  243  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00110847  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4343  alpha amylase catalytic region  33.41 
 
 		 481 aa  243  9e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3923  alpha-amylase  33.8 
 
 		 586 aa  241  2e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.077221  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3771  neopullulanase  33.8 
 
 		 586 aa  241  2e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00823842  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4230  alpha-amylase  33.8 
 
 		 586 aa  241  2e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.300485  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4033  alpha-amylase  33.8 
 
 		 586 aa  242  2e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4065  alpha-amylase  33.87 
 
 		 586 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00857502  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0534  alpha amylase catalytic region  35.14 
 
 		 487 aa  240  5e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.595542  normal  0.941542 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2350  alpha amylase catalytic region  32.82 
 
 		 583 aa  240  6.999999999999999e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3755  neopullulanase  33.56 
 
 		 586 aa  240  8e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000420185  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1852  neopullulanase  34.23 
 
 		 584 aa  240  8e-62  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.496782  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0215  neopullulanase  34.42 
 
 		 574 aa  234  3e-60  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0425343  hitchhiker  0.000179088 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0789  cymH protein  31 
 
 		 610 aa  233  8.000000000000001e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2579  alpha amylase catalytic region  33.78 
 
 		 576 aa  231  3e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000456037  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1944  alpha amylase catalytic region  32.82 
 
 		 486 aa  231  3e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1971  alpha amylase catalytic region  32.59 
 
 		 486 aa  230  7e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0248141  normal  0.0160527 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0802  glycosy hydrolase family protein  31.21 
 
 		 610 aa  228  3e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.124248  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2916  Alpha-amylase  33.19 
 
 		 472 aa  228  4e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2869  alpha amylase catalytic region  34.72 
 
 		 578 aa  227  7e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3419  hypothetical protein  34.71 
 
 		 481 aa  224  4e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.488491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0795  alpha amylase, catalytic region  30.69 
 
 		 575 aa  223  9.999999999999999e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2452  alpha amylase, catalytic region  32.25 
 
 		 1401 aa  218  4e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0187956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2327  alpha amylase catalytic region  31.96 
 
 		 1401 aa  214  4.9999999999999996e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.775797  normal  0.294215 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21691  glycoside hydrolase family protein  37.86 
 
 		 483 aa  214  4.9999999999999996e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0470032 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  30.67 
 
 		 1847 aa  209  1e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0501  alpha amylase domain-containing protein  36.81 
 
 		 476 aa  207  4e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.259034  normal  0.140596 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1458  alpha amylase, catalytic region  28.96 
 
 		 651 aa  197  5.000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3195  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  28.65 
 
 		 1193 aa  196  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2278  alpha amylase catalytic region  33.41 
 
 		 1307 aa  195  2e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.792883  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1834  alpha amylase domain-containing protein  34.73 
 
 		 480 aa  194  3e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.108338  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0475  alpha amylase, catalytic region  31.6 
 
 		 608 aa  194  5e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.350663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2874  alpha amylase catalytic region  28.45 
 
 		 1299 aa  194  6e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1313  alpha amylase, catalytic domain protein  30.98 
 
 		 459 aa  189  1e-46  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0084  pullulanase  30.23 
 
 		 606 aa  186  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3705  alpha amylase catalytic region  29.66 
 
 		 617 aa  186  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00647332  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2274  alpha amylase catalytic region  30.08 
 
 		 614 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0525857 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0557  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  30.63 
 
 		 1175 aa  186  2.0000000000000003e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.641532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002973  maltodextrin glucosidase  29.9 
 
 		 608 aa  183  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4335  alpha amylase catalytic region  30.36 
 
 		 1753 aa  181  4e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.167512  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1458  alpha amylase, catalytic region  28.92 
 
 		 644 aa  181  4e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.628846  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00351  maltodextrin glucosidase  30.05 
 
 		 605 aa  179  2e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3206  alpha amylase catalytic region  30.05 
 
 		 605 aa  179  2e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.608393  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1049  maltodextrin glucosidase  29.8 
 
 		 607 aa  179  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0895639 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00355  hypothetical protein  30.05 
 
 		 605 aa  179  2e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3230  maltodextrin glucosidase  30.05 
 
 		 605 aa  179  2e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000268324 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3272  alpha amylase catalytic region  28.97 
 
 		 1643 aa  178  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17020  glycosidase  30.11 
 
 		 727 aa  176  9.999999999999999e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0473  maltodextrin glucosidase  30.86 
 
 		 605 aa  176  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0433  maltodextrin glucosidase  30.86 
 
 		 605 aa  176  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0480  maltodextrin glucosidase  29.56 
 
 		 604 aa  174  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1114  alpha amylase catalytic subunit  30.83 
 
 		 580 aa  173  9e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0144434  normal  0.666267 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0440  maltodextrin glucosidase  30.65 
 
 		 605 aa  172  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0987  alpha amylase catalytic region  30.06 
 
 		 473 aa  171  4e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0969  alpha amylase, catalytic region  30.06 
 
 		 473 aa  171  4e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13890  glycosidase  29.06 
 
 		 624 aa  170  9e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.496833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0434  maltodextrin glucosidase  31.26 
 
 		 605 aa  169  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0286  alpha amylase catalytic region  30.65 
 
 		 611 aa  169  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.109454  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0501  maltodextrin glucosidase  30.15 
 
 		 605 aa  168  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.524518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0446  maltodextrin glucosidase  30.15 
 
 		 605 aa  168  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0459  maltodextrin glucosidase  30.14 
 
 		 605 aa  168  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0729  amylopullulanase  27.52 
 
 		 600 aa  166  2.0000000000000002e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00401162  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1580  alpha amylase, catalytic region  29.52 
 
 		 475 aa  163  8.000000000000001e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0569736  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3271  maltodextrin glucosidase  29 
 
 		 609 aa  163  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3131  maltodextrin glucosidase  28.95 
 
 		 609 aa  163  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0871  maltodextrin glucosidase  29.31 
 
 		 605 aa  162  3e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0369  alpha amylase catalytic region  28 
 
 		 659 aa  160  6e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0221  alpha amylase catalytic region  29.06 
 
 		 474 aa  160  9e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3180  alpha amylase catalytic region  30.36 
 
 		 635 aa  159  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000161809  normal  0.231974 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4682  alpha amylase catalytic region  30.51 
 
 		 609 aa  156  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1046  4-alpha-glucanotransferase  28.8 
 
 		 1145 aa  155  2e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2159  alpha amylase catalytic region  29.92 
 
 		 647 aa  155  2.9999999999999998e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.826727  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1167  alpha amylase catalytic region  28.49 
 
 		 576 aa  152  2e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.823071  normal  0.49953 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1524  alpha amylase catalytic region  26.76 
 
 		 634 aa  149  2.0000000000000003e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.383652 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4336  alpha amylase catalytic region  28.05 
 
 		 914 aa  148  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0586  alpha amylase catalytic region  27.86 
 
 		 479 aa  148  4.0000000000000006e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.532649  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2435  alpha amylase catalytic region  31.64 
 
 		 451 aa  146  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  28.27 
 
 		 511 aa  146  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>