More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0747 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1170  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  54.25 
 
 		 1855 aa  728    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1413  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  40.44 
 
 		 1117 aa  719    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  100 
 
 		 1891 aa  3783    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06650  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  54.79 
 
 		 1248 aa  1139    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001089  putative pullulanase precursor  39.64 
 
 		 1329 aa  637    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4105  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  43.14 
 
 		 1035 aa  672    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2329  Alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  45.4 
 
 		 991 aa  689    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0783894  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3338  Type II secretory pathway pullulanase PulA and related glycosidase-like protein  52.66 
 
 		 1942 aa  788    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0998506 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0480  alpha amylase catalytic region  44.64 
 
 		 1017 aa  653    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3513  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  61.53 
 
 		 1331 aa  1305    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0648874  normal  0.682211 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2521  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  64.2 
 
 		 1975 aa  2188    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0096  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  46.11 
 
 		 891 aa  739    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.380747  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0256  alpha amylase, catalytic region  44.9 
 
 		 1005 aa  660    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3767  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  52.03 
 
 		 1025 aa  953    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2488  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  46.06 
 
 		 1176 aa  877    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.331345 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3061  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  50.11 
 
 		 946 aa  795    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.57883  normal  0.116697 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28060  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  58.05 
 
 		 2068 aa  1933    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.329007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04828  pullulanase  40.65 
 
 		 1328 aa  636  1e-180  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2712  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  43.68 
 
 		 2156 aa  617  1e-175  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0197  alpha amylase, catalytic region  46.07 
 
 		 925 aa  620  1e-175  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5150  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  40.1 
 
 		 1124 aa  607  9.999999999999999e-173  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.910447  normal  0.74946 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39745  predicted protein  39.54 
 
 		 1062 aa  588  1e-166  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1481  alpha amylase catalytic region  48.88 
 
 		 723 aa  580  1.0000000000000001e-163  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.653482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1316  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  40.28 
 
 		 1440 aa  573  1e-161  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0748066 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3074  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  40.28 
 
 		 1440 aa  573  1e-161  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000101349 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0996  alpha amylase family protein  36.53 
 
 		 998 aa  567  1e-160  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.621113  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0287  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  40.42 
 
 		 1441 aa  555  1e-156  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0560  putative pullulanase precursor  38.15 
 
 		 1432 aa  510  9.999999999999999e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.594398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01882  putative pullulanase  35.44 
 
 		 1472 aa  493  1e-137  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1890  alpha amylase, catalytic region  44.72 
 
 		 609 aa  484  1e-135  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2273  pullulanase  40.72 
 
 		 717 aa  486  1e-135  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0183  alpha amylase, catalytic region  46.22 
 
 		 600 aa  477  1e-133  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1941  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  34.07 
 
 		 1450 aa  476  1e-132  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4090  alpha amylase catalytic region  48.8 
 
 		 614 aa  470  9.999999999999999e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.904888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2739  alpha amylase, catalytic region  45.11 
 
 		 622 aa  466  1e-129  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48913  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1694  putative pullulanase  34.76 
 
 		 1429 aa  455  1.0000000000000001e-126  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0817  alpha amylase, catalytic region  47.02 
 
 		 599 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1375  alpha amylase, catalytic region  44.67 
 
 		 593 aa  436  1e-120  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0985  putative alpha amylase  43.18 
 
 		 604 aa  406  1e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2304  pullulanase, type I  29.73 
 
 		 1043 aa  275  7e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1522  pullulanase precursor  27.55 
 
 		 655 aa  270  2e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0360874  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1803  pullulanase, type I  27.57 
 
 		 655 aa  267  1e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.248563  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  31 
 
 		 2638 aa  251  1e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2463  pullulanase  29.19 
 
 		 850 aa  250  2e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.116162  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2786  pullulanase, type I  29.18 
 
 		 848 aa  249  3e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0751626  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2498  pullulanase  29.04 
 
 		 852 aa  249  4e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00309415  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2737  putative pullulanase  28.89 
 
 		 852 aa  249  4e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.31165e-23 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2542  pullulanase  28.74 
 
 		 852 aa  248  8e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.814075  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2728  pullulanase  28.74 
 
 		 852 aa  248  8e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00354349  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1317  alpha amylase, catalytic domain protein  32.26 
 
 		 620 aa  244  2e-62  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0609  pullulanase, type I  30.68 
 
 		 1136 aa  238  8e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0177218  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13880  pullulanase, type I  26.48 
 
 		 640 aa  235  8.000000000000001e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2416  pullulanase, type I  28.22 
 
 		 856 aa  235  8.000000000000001e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00697767  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2331  pullulanase, type I  28.97 
 
 		 647 aa  233  2e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0448  pullulanase, type I  27.85 
 
 		 825 aa  234  2e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2741  putative pullulanase  28.68 
 
 		 852 aa  233  3e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0379063  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2761  pullulanase, putative  28.53 
 
 		 848 aa  231  8e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00586404  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2552  putative pullulanase  29.11 
 
 		 852 aa  231  8e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000407246  decreased coverage  0.0000000000706623 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19550  pullulanase, type I  29.06 
 
 		 874 aa  227  2e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0459  pullulanase, type I  27.02 
 
 		 842 aa  227  2e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.712908  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1558  pullulanase precursor  28.77 
 
 		 1064 aa  224  9.999999999999999e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.430377  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  29.14 
 
 		 1888 aa  223  1.9999999999999999e-56  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1839  putative pullulanase  26.24 
 
 		 1064 aa  222  6e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1428  alpha amylase catalytic region  32.02 
 
 		 838 aa  222  6e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000263704  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0959  pullulanase, type I  27.73 
 
 		 843 aa  221  7.999999999999999e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.557051  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0061  pullulanase, type I  27.05 
 
 		 899 aa  221  1e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0681  pullulanase, type I  30.11 
 
 		 718 aa  219  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0978  pullulanase, type I  27.18 
 
 		 843 aa  214  1e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.912818  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1427  pullulanase, type I  28.7 
 
 		 841 aa  214  1e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.671793  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001132  glycosyl hydrolase family 13  31.57 
 
 		 885 aa  211  1e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  31.3 
 
 		 510 aa  210  3e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0057  pullulanase, type I  26.07 
 
 		 928 aa  204  9.999999999999999e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  31.54 
 
 		 511 aa  204  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1683  alpha amylase catalytic region  27.98 
 
 		 836 aa  202  3.9999999999999996e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.332102  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2969  alpha amylase catalytic region  31.55 
 
 		 524 aa  198  7e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0421  pullulanase, type I  27.53 
 
 		 601 aa  197  1e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0948  alpha amylase domain-containing protein  28.96 
 
 		 752 aa  197  2e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.216997  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2452  alpha amylase, catalytic region  50.51 
 
 		 1401 aa  197  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0187956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4837  putative pullulanase  25.68 
 
 		 713 aa  193  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.837132  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0953  alpha amylase, catalytic region  28.62 
 
 		 814 aa  192  4e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0761659  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4844  pullulanase, putative  25.74 
 
 		 713 aa  191  1e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4434  pullulanase  25.07 
 
 		 713 aa  190  3e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4597  pullulanase  25.47 
 
 		 713 aa  189  5e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4953  pullulanase  25.47 
 
 		 713 aa  189  5e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4452  pullulanase  24.93 
 
 		 713 aa  189  6e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03388  alpha-amylase (Eurofung)  29.53 
 
 		 462 aa  188  7e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.792359 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0852  pullulanase, putative  27.47 
 
 		 766 aa  188  8e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.865256  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4814  putative pullulanase  25.96 
 
 		 713 aa  187  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4819  putative pullulanase  25.2 
 
 		 713 aa  187  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1298  pullulanase, type I  28.37 
 
 		 669 aa  187  2.0000000000000003e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01890  cyclomaltodextrin glucanotransferase  31.58 
 
 		 564 aa  186  3e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.773956  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0422  putative pullulanase  25.81 
 
 		 713 aa  186  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4533  pullulanase, type I  25.15 
 
 		 713 aa  183  2.9999999999999997e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0872  pullulanase, type I  25.16 
 
 		 640 aa  183  2.9999999999999997e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1502  alpha amylase  31.39 
 
 		 610 aa  182  4.999999999999999e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3365  pullulanase, type I  24.27 
 
 		 712 aa  181  9e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1746  alpha amylase, catalytic region  35.44 
 
 		 1021 aa  181  9e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0173524 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2327  alpha amylase catalytic region  49.75 
 
 		 1401 aa  180  3e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.775797  normal  0.294215 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1429  glycoside hydrolase, starch-binding  29.28 
 
 		 642 aa  177  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.56449  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1216  pullulanase, putative  25.85 
 
 		 1252 aa  176  5.999999999999999e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0305928  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>