More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_39745 on replicon NC_009355
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_3061  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  40.49 
 
 
946 aa  649    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.57883  normal  0.116697 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0096  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  41.19 
 
 
891 aa  683    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.380747  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39745  predicted protein  100 
 
 
1062 aa  2197    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4105  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  39.42 
 
 
1035 aa  650    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2329  Alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  40.18 
 
 
991 aa  726    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0783894  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1413  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  44 
 
 
1117 aa  823    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3767  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  42.4 
 
 
1025 aa  663    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2488  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  45.8 
 
 
1176 aa  785    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.331345 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3338  Type II secretory pathway pullulanase PulA and related glycosidase-like protein  43.53 
 
 
1942 aa  721    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0998506 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3513  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  40.49 
 
 
1331 aa  610  1e-173  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0648874  normal  0.682211 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1170  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  40.58 
 
 
1855 aa  601  1e-170  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001089  putative pullulanase precursor  35.88 
 
 
1329 aa  597  1e-169  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2521  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  41.77 
 
 
1975 aa  584  1.0000000000000001e-165  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  39.82 
 
 
1891 aa  584  1.0000000000000001e-165  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0287  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  38.95 
 
 
1441 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04828  pullulanase  35.79 
 
 
1328 aa  582  1e-164  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5150  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  38.39 
 
 
1124 aa  576  1.0000000000000001e-163  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.910447  normal  0.74946 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28060  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  39.47 
 
 
2068 aa  566  1e-160  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.329007  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2712  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  40.05 
 
 
2156 aa  555  1e-156  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1316  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  37.32 
 
 
1440 aa  550  1e-155  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0748066 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06650  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  38.65 
 
 
1248 aa  550  1e-155  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3074  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  37.32 
 
 
1440 aa  550  1e-155  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000101349 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01882  putative pullulanase  35.65 
 
 
1472 aa  532  1e-149  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0560  putative pullulanase precursor  37.51 
 
 
1432 aa  520  1e-146  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.594398  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1694  putative pullulanase  34.4 
 
 
1429 aa  513  1e-144  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0996  alpha amylase family protein  35.73 
 
 
998 aa  506  9.999999999999999e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.621113  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1941  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  37.32 
 
 
1450 aa  490  1e-137  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2273  pullulanase  38.53 
 
 
717 aa  472  1.0000000000000001e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2304  pullulanase, type I  33.51 
 
 
1043 aa  344  4e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1522  pullulanase precursor  31.07 
 
 
655 aa  311  4e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0360874  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2331  pullulanase, type I  33.19 
 
 
647 aa  308  5.0000000000000004e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1803  pullulanase, type I  30.32 
 
 
655 aa  305  3.0000000000000004e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.248563  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2786  pullulanase, type I  33.97 
 
 
848 aa  304  7.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0751626  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2542  pullulanase  33.54 
 
 
852 aa  303  1e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.814075  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2728  pullulanase  33.54 
 
 
852 aa  303  1e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00354349  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2463  pullulanase  33.39 
 
 
850 aa  302  2e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.116162  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2737  putative pullulanase  33.39 
 
 
852 aa  301  4e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.31165e-23 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2498  pullulanase  33.23 
 
 
852 aa  300  1e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00309415  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0609  pullulanase, type I  31.13 
 
 
1136 aa  296  1e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0177218  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  30.78 
 
 
2638 aa  291  5.0000000000000004e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0057  pullulanase, type I  32.81 
 
 
928 aa  289  2e-76  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19550  pullulanase, type I  31.49 
 
 
874 aa  288  4e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2761  pullulanase, putative  33.07 
 
 
848 aa  283  1e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00586404  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  30.82 
 
 
1888 aa  283  1e-74  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2416  pullulanase, type I  29.76 
 
 
856 aa  283  1e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00697767  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0959  pullulanase, type I  27.43 
 
 
843 aa  282  2e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.557051  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13880  pullulanase, type I  30.18 
 
 
640 aa  280  9e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2552  putative pullulanase  33.33 
 
 
852 aa  280  1e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000407246  decreased coverage  0.0000000000706623 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0978  pullulanase, type I  27.83 
 
 
843 aa  276  1.0000000000000001e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.912818  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2741  putative pullulanase  33.12 
 
 
852 aa  274  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0379063  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1839  putative pullulanase  29.17 
 
 
1064 aa  270  1e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1558  pullulanase precursor  29.03 
 
 
1064 aa  267  8e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.430377  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0421  pullulanase, type I  33.17 
 
 
601 aa  265  3e-69  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0459  pullulanase, type I  26.03 
 
 
842 aa  262  2e-68  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.712908  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3365  pullulanase, type I  30.65 
 
 
712 aa  259  2e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0448  pullulanase, type I  30.57 
 
 
825 aa  259  2e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1427  pullulanase, type I  27.41 
 
 
841 aa  257  1.0000000000000001e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.671793  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4452  pullulanase  27.77 
 
 
713 aa  254  7e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4597  pullulanase  27.77 
 
 
713 aa  253  2e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4953  pullulanase  27.77 
 
 
713 aa  253  2e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4837  putative pullulanase  28.04 
 
 
713 aa  251  4e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.837132  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4819  putative pullulanase  28.57 
 
 
713 aa  251  5e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4844  pullulanase, putative  29.06 
 
 
713 aa  249  1e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0681  pullulanase, type I  34.55 
 
 
718 aa  248  3e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4434  pullulanase  27.41 
 
 
713 aa  246  9.999999999999999e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0061  pullulanase, type I  26.71 
 
 
899 aa  246  9.999999999999999e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0422  putative pullulanase  29.91 
 
 
713 aa  243  2e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1298  pullulanase, type I  33.7 
 
 
669 aa  242  2.9999999999999997e-62  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4814  putative pullulanase  29.23 
 
 
713 aa  240  9e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4533  pullulanase, type I  28.85 
 
 
713 aa  235  3e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0852  pullulanase, putative  29.04 
 
 
766 aa  211  4e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.865256  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0872  pullulanase, type I  28.83 
 
 
640 aa  209  3e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0868  pullulanase, extracellular  25.79 
 
 
776 aa  200  1.0000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1216  pullulanase, putative  28.9 
 
 
1252 aa  191  5e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0305928  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1982  glycogen debranching enzyme GlgX  25.23 
 
 
721 aa  121  6e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0850587  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7550  glycogen debranching enzyme GlgX  26.18 
 
 
702 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317676  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6067  glycogen debranching enzyme GlgX  26.55 
 
 
701 aa  115  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0573704  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2413  glycogen debranching enzyme GlgX  26.96 
 
 
771 aa  114  7.000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.246896  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0681  glycogen debranching enzyme GlgX  26.56 
 
 
700 aa  114  8.000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3828  glycoside hydrolase family 13 protein  25.34 
 
 
817 aa  114  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.535052 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3439  glycogen debranching enzyme GlgX  24.02 
 
 
708 aa  113  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000156565 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6811  glycogen debranching enzyme GlgX  26.11 
 
 
702 aa  112  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.37065 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2757  glycogen debranching enzyme GlgX  25.43 
 
 
752 aa  112  3e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1812  glycogen debranching enzyme GlgX  33.1 
 
 
718 aa  112  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2835  glycogen debranching enzyme GlgX  25.43 
 
 
752 aa  112  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0567  glycogen debranching enzyme GlgX  26.6 
 
 
722 aa  112  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1495  glycogen operon protein  26.06 
 
 
750 aa  111  9.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2933  glycogen debranching enzyme GlgX  25.12 
 
 
752 aa  109  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0906  glycogen debranching enzyme GlgX  26.06 
 
 
721 aa  108  4e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00297293  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1074  glycogen debranching enzyme GlgX  27.63 
 
 
711 aa  108  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.652944 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1045  glycogen debranching enzyme GlgX  27.63 
 
 
711 aa  108  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1358  glycogen debranching enzyme GlgX  24.88 
 
 
733 aa  108  6e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.173381 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3027  glycogen debranching enzyme GlgX  24.88 
 
 
733 aa  108  7e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0101  alpha-amylase family protein  23.77 
 
 
714 aa  107  8e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1895  glycogen debranching enzyme GlgX  24.39 
 
 
705 aa  107  9e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1332  glycogen debranching enzyme GlgX  24.84 
 
 
733 aa  107  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3315  glycogen debranching enzyme GlgX  25.59 
 
 
711 aa  107  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0822  glycogen debranching enzyme GlgX  23.22 
 
 
706 aa  107  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0317  glycogen debranching protein GlgX  26.15 
 
 
715 aa  106  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0328  glycogen debranching enzyme GlgX  25.65 
 
 
710 aa  105  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>