More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7550 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_1549  glycogen debranching enzyme GlgX  69.65 
 
 
697 aa  964    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.177873 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3315  glycogen debranching enzyme GlgX  50.14 
 
 
711 aa  655    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3335  glycogen debranching enzyme GlgX  50.21 
 
 
755 aa  707    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.242143  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1530  glycogen debranching enzyme GlgX  53.47 
 
 
704 aa  660    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.376415  normal  0.0851861 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4055  glycogen debranching protein GlgX  50.72 
 
 
717 aa  685    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119341  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1249  glycogen debranching enzyme GlgX  47.29 
 
 
735 aa  659    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3146  glycogen debranching enzyme GlgX  52.82 
 
 
716 aa  724    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.371141  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0238  glycogen operon protein GlgX  51.84 
 
 
754 aa  689    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.137822  normal  0.662509 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5289  glycogen debranching enzyme GlgX  50.71 
 
 
738 aa  687    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1495  glycogen operon protein  46.62 
 
 
750 aa  657    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3130  glycogen operon protein GlgX  50.5 
 
 
727 aa  697    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.167727  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6085  glycogen debranching enzyme GlgX  51.56 
 
 
705 aa  668    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0291933  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0819  glycogen operon protein GlgX, putative  52.45 
 
 
702 aa  652    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0962499  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2997  glycoside hydrolase, family alpha amylase catalytic subunit  50.65 
 
 
727 aa  698    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1891  glycogen debranching enzyme GlgX  49.23 
 
 
707 aa  636    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0618  glycogen debranching enzyme GlgX  52.45 
 
 
702 aa  652    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.385691  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4230  glycogen debranching protein GlgX  50.9 
 
 
743 aa  660    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.535158  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1088  glycogen debranching enzyme GlgX  47.87 
 
 
718 aa  656    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.231339 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1206  glycogen debranching enzyme GlgX  49.86 
 
 
692 aa  678    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1736  glycogen debranching enzyme GlgX  52.45 
 
 
702 aa  652    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1740  glycogen debranching protein GlgX  50.28 
 
 
706 aa  684    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.152679  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2544  glycogen debranching protein GlgX  50.22 
 
 
719 aa  687    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2226  glycosidase  53.3 
 
 
694 aa  657    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2449  putative glycosyl hydrolase  53.75 
 
 
688 aa  691    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2884  glycogen debranching enzyme  53.18 
 
 
704 aa  657    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.499516  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7031  glycogen debranching protein GlgX  52 
 
 
708 aa  665    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.261677  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3936  glycogen debranching enzyme GlgX  51.15 
 
 
766 aa  684    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0659462  normal  0.365741 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2937  glycogen debranching enzyme GlgX  51.29 
 
 
703 aa  674    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3733  glycogen debranching enzyme GlgX  48.86 
 
 
733 aa  655    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.635331  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1565  glycogen debranching enzyme GlgX  52.45 
 
 
702 aa  652    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.122779  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3138  glycogen debranching enzyme GlgX  50.5 
 
 
758 aa  704    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.157891 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6824  glycogen debranching enzyme GlgX  51.37 
 
 
739 aa  693    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.100045  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0505  glycogen debranching protein GlgX  51.12 
 
 
714 aa  686    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.299874  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1606  glycogen debranching protein GlgX  51.71 
 
 
729 aa  686    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.333423  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1322  glycogen debranching enzyme GlgX  48.83 
 
 
733 aa  653    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.831141  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5164  glycogen debranching enzyme GlgX  49.85 
 
 
1537 aa  640    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0685376 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1056  glycogen debranching enzyme GlgX  50.5 
 
 
712 aa  669    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03371  glycogen debranching enzyme GlgX  52.37 
 
 
720 aa  684    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.13804  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3654  glycogen debranching enzyme GlgX  50.58 
 
 
717 aa  683    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0348768 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1881  glycogen debranching protein GlgX  49.64 
 
 
691 aa  666    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2254  glycogen debranching protein GlgX  49.28 
 
 
733 aa  660    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6324  glycosyl hydrolase (glycogen debranching enzyme)  49.28 
 
 
691 aa  660    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.24347  normal  0.874434 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3116  glycogen debranching protein GlgX  49.41 
 
 
698 aa  639    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.479948 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1819  glycogen debranching enzyme GlgX  50.21 
 
 
717 aa  678    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.11344  normal  0.553566 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2158  glycogen debranching protein GlgX  51.05 
 
 
719 aa  706    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0345133  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0988  glycogen operon protein  49.2 
 
 
716 aa  658    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.25479 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1227  glycogen debranching protein GlgX  50.78 
 
 
719 aa  692    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000170759 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3626  glycogen debranching protein GlgX  49.29 
 
 
701 aa  667    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0135941 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3681  glycogen debranching protein GlgX  49.5 
 
 
692 aa  652    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1189  glycogen debranching protein GlgX  49.64 
 
 
688 aa  673    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.50354  normal  0.29921 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1322  glycogen operon protein GlgX  50.93 
 
 
738 aa  695    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0099235  normal  0.0986293 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2864  putative glycogen operon protein GlgX  51.71 
 
 
739 aa  677    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3213  glycogen debranching protein GlgX  48.93 
 
 
728 aa  658    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.900215  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3485  glycogen debranching protein GlgX  50.57 
 
 
692 aa  671    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1463  glycogen debranching protein GlgX  49.5 
 
 
692 aa  667    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0543  glycogen debranching enzyme GlgX  50.66 
 
 
704 aa  672    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0247855  normal  0.604467 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1672  glycogen debranching enzyme GlgX  47.13 
 
 
691 aa  640    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.574762  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1333  glycogen debranching protein GlgX  50.97 
 
 
705 aa  666    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0242466  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4390  glycogen debranching enzyme GlgX  52.16 
 
 
737 aa  660    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.497261 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1735  glycogen debranching enzyme GlgX  46.84 
 
 
691 aa  638    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0317  glycogen debranching protein GlgX  50.93 
 
 
715 aa  694    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5488  glycogen debranching enzyme GlgX  52.06 
 
 
708 aa  677    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.168137  decreased coverage  0.0000616357 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2676  glycogen debranching enzyme GlgX  51.66 
 
 
691 aa  702    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0537  glycogen debranching enzyme GlgX  52.45 
 
 
702 aa  652    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1169  glycogen debranching enzyme GlgX  48.18 
 
 
733 aa  642    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.161033 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0902  glycogen debranching enzyme GlgX  52.82 
 
 
694 aa  658    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.934485  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1542  glycogen debranching enzyme GlgX  52.45 
 
 
702 aa  652    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1112  glycogen debranching enzyme GlgX  53.31 
 
 
688 aa  689    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.758297  normal  0.439261 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6323  glycogen debranching enzyme GlgX  51.42 
 
 
704 aa  655    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.431119  normal  0.149748 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1788  glycogen debranching enzyme GlgX  50.58 
 
 
717 aa  684    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1115  glycogen debranching enzyme GlgX  49.72 
 
 
712 aa  657    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5568  glycosyl hydrolase (glycogen debranching enzyme)  51.07 
 
 
745 aa  691    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2757  glycogen debranching enzyme GlgX  47.96 
 
 
752 aa  662    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2835  glycogen debranching enzyme GlgX  47.69 
 
 
752 aa  660    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01859  glycogen debranching enzyme GlgX  51.16 
 
 
710 aa  667    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5593  glycogen debranching enzyme GlgX  51.42 
 
 
704 aa  654    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36630  putative glycosyl hydrolase  52.97 
 
 
716 aa  725    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0278347  normal  0.953744 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4409  glycogen debranching enzyme GlgX  51.02 
 
 
695 aa  637    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.374964 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2909  glycogen debranching enzyme GlgX  47.44 
 
 
751 aa  639    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.506693  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6496  glycogen debranching enzyme GlgX  50.97 
 
 
705 aa  666    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0828061  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1332  glycogen debranching enzyme GlgX  49.27 
 
 
733 aa  651    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1782  glycogen debranching enzyme GlgX  51.37 
 
 
688 aa  684    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1514  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  49.85 
 
 
1464 aa  649    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117562  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2933  glycogen debranching enzyme GlgX  47.76 
 
 
752 aa  656    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5335  glycogen debranching enzyme GlgX  51.21 
 
 
723 aa  719    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0240771 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1607  glycogen debranching enzyme GlgX  46.98 
 
 
691 aa  637    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1136  glycogen debranching enzyme GlgX  54.19 
 
 
704 aa  687    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55158  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4425  glycogen debranching enzyme GlgX  52.02 
 
 
697 aa  660    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1692  glycogen debranching enzyme GlgX  69.21 
 
 
697 aa  971    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1358  glycogen debranching enzyme GlgX  48.83 
 
 
733 aa  654    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.173381 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1486  glycogen debranching enzyme GlgX  71.41 
 
 
705 aa  953    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000700154 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3555  glycogen debranching enzyme GlgX  51.21 
 
 
755 aa  699    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0361037 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4166  glycogen debranching enzyme GlgX  49.71 
 
 
693 aa  669    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.830683  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2267  glycogen debranching enzyme GlgX  53.2 
 
 
691 aa  661    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.138313  normal  0.255699 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1151  glycogen debranching enzyme GlgX  49.93 
 
 
756 aa  694    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.911208  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2282  glycogen debranching enzyme GlgX  52.97 
 
 
704 aa  710    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0218366  hitchhiker  0.000957469 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5729  glycogen debranching enzyme GlgX  47.54 
 
 
723 aa  657    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4873  glycogen debranching enzyme GlgX  52.92 
 
 
757 aa  712    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.325281  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6811  glycogen debranching enzyme GlgX  90.27 
 
 
702 aa  1279    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.37065 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1337  glycogen debranching enzyme GlgX  52.45 
 
 
702 aa  652    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>