More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2304 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_005945  BAS2542  pullulanase  45.77 
 
 		 852 aa  639    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.814075  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2498  pullulanase  46.29 
 
 		 852 aa  645    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00309415  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2463  pullulanase  46.15 
 
 		 850 aa  642    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.116162  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2728  pullulanase  45.77 
 
 		 852 aa  639    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00354349  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2786  pullulanase, type I  45.68 
 
 		 848 aa  636    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0751626  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2304  pullulanase, type I  100 
 
 		 1043 aa  2149    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1803  pullulanase, type I  50.7 
 
 		 655 aa  650    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.248563  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1522  pullulanase precursor  51.49 
 
 		 655 aa  659    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0360874  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2331  pullulanase, type I  51.68 
 
 		 647 aa  684    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2737  putative pullulanase  45.91 
 
 		 852 aa  640    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.31165e-23 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2761  pullulanase, putative  45.75 
 
 		 848 aa  633  1e-180  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00586404  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2416  pullulanase, type I  45.96 
 
 		 856 aa  626  1e-178  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00697767  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2741  putative pullulanase  45.56 
 
 		 852 aa  626  1e-178  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0379063  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2552  putative pullulanase  45.41 
 
 		 852 aa  622  1e-176  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000407246  decreased coverage  0.0000000000706623 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0061  pullulanase, type I  37.4 
 
 		 899 aa  607  9.999999999999999e-173  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13880  pullulanase, type I  45.72 
 
 		 640 aa  571  1e-161  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  38.04 
 
 		 2638 aa  572  1e-161  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0978  pullulanase, type I  41.11 
 
 		 843 aa  562  1e-158  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.912818  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0057  pullulanase, type I  36.3 
 
 		 928 aa  558  1e-157  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0959  pullulanase, type I  40.94 
 
 		 843 aa  554  1e-156  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.557051  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  35.65 
 
 		 1888 aa  537  1e-151  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0459  pullulanase, type I  44.12 
 
 		 842 aa  538  1e-151  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.712908  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0609  pullulanase, type I  40.87 
 
 		 1136 aa  524  1e-147  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0177218  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1427  pullulanase, type I  38.47 
 
 		 841 aa  520  1e-146  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.671793  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4819  putative pullulanase  41.72 
 
 		 713 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4597  pullulanase  41.42 
 
 		 713 aa  513  1e-144  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4953  pullulanase  41.42 
 
 		 713 aa  513  1e-144  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0422  putative pullulanase  41.42 
 
 		 713 aa  515  1e-144  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4814  putative pullulanase  41.42 
 
 		 713 aa  512  1e-143  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4452  pullulanase  41.27 
 
 		 713 aa  509  1e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4844  pullulanase, putative  41.12 
 
 		 713 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4434  pullulanase  41.12 
 
 		 713 aa  508  9.999999999999999e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3365  pullulanase, type I  40.86 
 
 		 712 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4837  putative pullulanase  41.12 
 
 		 713 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.837132  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4533  pullulanase, type I  41.53 
 
 		 713 aa  501  1e-140  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0681  pullulanase, type I  42.99 
 
 		 718 aa  497  1e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19550  pullulanase, type I  39.43 
 
 		 874 aa  490  1e-137  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1839  putative pullulanase  39.59 
 
 		 1064 aa  472  1.0000000000000001e-131  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1558  pullulanase precursor  39.59 
 
 		 1064 aa  469  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.430377  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0421  pullulanase, type I  37.38 
 
 		 601 aa  422  1e-116  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0448  pullulanase, type I  37.08 
 
 		 825 aa  422  1e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0872  pullulanase, type I  40.07 
 
 		 640 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1298  pullulanase, type I  35.26 
 
 		 669 aa  419  9.999999999999999e-116  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0852  pullulanase, putative  38.12 
 
 		 766 aa  416  1e-114  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.865256  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1413  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  32.99 
 
 		 1117 aa  351  4e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2488  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  30.67 
 
 		 1176 aa  347  8e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.331345 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39745  predicted protein  33.29 
 
 		 1062 aa  344  5.999999999999999e-93  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0096  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  29.82 
 
 		 891 aa  319  1e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.380747  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1170  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  32.21 
 
 		 1855 aa  315  1.9999999999999998e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001089  putative pullulanase precursor  29.56 
 
 		 1329 aa  316  1.9999999999999998e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3513  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  31.02 
 
 		 1331 aa  306  1.0000000000000001e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0648874  normal  0.682211 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2712  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  30.27 
 
 		 2156 aa  303  8.000000000000001e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04828  pullulanase  29.26 
 
 		 1328 aa  303  1e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2329  Alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  28.77 
 
 		 991 aa  303  1e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0783894  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3338  Type II secretory pathway pullulanase PulA and related glycosidase-like protein  32.42 
 
 		 1942 aa  303  2e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0998506 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3767  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  31 
 
 		 1025 aa  302  2e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0560  putative pullulanase precursor  29.96 
 
 		 1432 aa  296  1e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.594398  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0996  alpha amylase family protein  31.04 
 
 		 998 aa  290  8e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.621113  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01882  putative pullulanase  29.17 
 
 		 1472 aa  288  4e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4105  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  29.13 
 
 		 1035 aa  282  2e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0868  pullulanase, extracellular  29.47 
 
 		 776 aa  282  2e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2521  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  29.42 
 
 		 1975 aa  281  4e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1694  putative pullulanase  30.08 
 
 		 1429 aa  281  6e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1216  pullulanase, putative  27.25 
 
 		 1252 aa  278  3e-73  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0305928  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3061  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  28.24 
 
 		 946 aa  275  3e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.57883  normal  0.116697 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  29.73 
 
 		 1891 aa  275  5.000000000000001e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1941  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  29.46 
 
 		 1450 aa  273  1e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28060  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  29.28 
 
 		 2068 aa  273  1e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.329007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06650  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  32.23 
 
 		 1248 aa  272  2e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0287  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  29.8 
 
 		 1441 aa  271  5e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1316  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  29.24 
 
 		 1440 aa  267  8.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0748066 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3074  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  29.24 
 
 		 1440 aa  267  8.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000101349 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3828  glycoside hydrolase family 13 protein  28.11 
 
 		 817 aa  216  1.9999999999999998e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535052 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5150  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  30.54 
 
 		 1124 aa  215  2.9999999999999995e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.910447  normal  0.74946 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2273  pullulanase  29.93 
 
 		 717 aa  190  1e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0681  glycogen debranching enzyme GlgX  27.38 
 
 		 700 aa  187  1.0000000000000001e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5016  glycogen debranching enzyme GlgX  25.55 
 
 		 706 aa  183  2e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0893  alpha amylase domain-containing protein  28.57 
 
 		 686 aa  181  5.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0763625  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2859  glycogen debranching enzyme GlgX  27.31 
 
 		 690 aa  181  5.999999999999999e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17491  putative isoamylase  29.06 
 
 		 686 aa  179  2e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1471  glycogen debranching enzyme GlgX  22.85 
 
 		 683 aa  176  2.9999999999999996e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0323823 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1812  glycogen debranching enzyme GlgX  26.56 
 
 		 718 aa  175  3.9999999999999995e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0815  glycogen debranching protein GlgX  26.86 
 
 		 721 aa  175  5e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000104975 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1074  glycogen debranching enzyme GlgX  27.42 
 
 		 711 aa  174  5e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.652944 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1045  glycogen debranching enzyme GlgX  27.42 
 
 		 711 aa  174  9e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1750  glycogen debranching enzyme GlgX  25.71 
 
 		 718 aa  174  1e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0548  glycogen debranching enzyme GlgX  26.37 
 
 		 729 aa  172  2e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3295  glycogen debranching protein GlgX  25.61 
 
 		 695 aa  172  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6707  glycogen debranching protein GlgX  28.43 
 
 		 706 aa  170  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171756  normal  0.694443 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2956  glycogen debranching enzyme GlgX  26.63 
 
 		 697 aa  169  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.490165 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43578  predicted protein  26.48 
 
 		 765 aa  169  2.9999999999999998e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0789627  normal  0.106596 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0101  alpha-amylase family protein  26.83 
 
 		 714 aa  168  5.9999999999999996e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0296  glycogen debranching enzyme GlgX  24.03 
 
 		 724 aa  168  5.9999999999999996e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.76134  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3315  glycogen debranching enzyme GlgX  26.88 
 
 		 711 aa  168  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0667  glycogen debranching enzyme GlgX  27.74 
 
 		 694 aa  167  9e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.432948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0647  glycogen debranching enzyme GlgX  27.74 
 
 		 694 aa  167  9e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0822  glycogen debranching enzyme GlgX  26.41 
 
 		 706 aa  167  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2363  glycogen debranching enzyme GlgX  24.19 
 
 		 701 aa  167  1.0000000000000001e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0149674 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6067  glycogen debranching enzyme GlgX  26.18 
 
 		 701 aa  167  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0573704  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0312  glycosyl hydrolase family protein  27.55 
 
 		 666 aa  166  3e-39  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0426975  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>