More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0548 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0548  glycogen debranching enzyme GlgX  100 
 
 		 729 aa  1506    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1750  glycogen debranching enzyme GlgX  62.2 
 
 		 718 aa  925    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0101  alpha-amylase family protein  46.39 
 
 		 714 aa  623  1e-177  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5016  glycogen debranching enzyme GlgX  46.78 
 
 		 706 aa  624  1e-177  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2956  glycogen debranching enzyme GlgX  45.96 
 
 		 697 aa  624  1e-177  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.490165 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0822  glycogen debranching enzyme GlgX  45.94 
 
 		 706 aa  619  1e-176  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0328  glycogen debranching enzyme GlgX  48.59 
 
 		 710 aa  620  1e-176  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0296  glycogen debranching enzyme GlgX  46.09 
 
 		 724 aa  615  1e-175  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.76134  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1982  glycogen debranching enzyme GlgX  47.69 
 
 		 721 aa  617  1e-175  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0850587  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3439  glycogen debranching enzyme GlgX  45.86 
 
 		 708 aa  615  1e-175  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000156565 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2517  glycogen debranching enzyme  43.81 
 
 		 774 aa  616  1e-175  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.467247 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4442  glycogen debranching enzyme GlgX  45.65 
 
 		 723 aa  608  1e-173  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.405829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0317  glycogen debranching protein GlgX  49.12 
 
 		 715 aa  606  9.999999999999999e-173  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2158  glycogen debranching protein GlgX  47.02 
 
 		 719 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0345133  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2576  glycogen debranching enzyme GlgX  47.67 
 
 		 710 aa  602  1.0000000000000001e-171  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.677524  normal  0.165671 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1895  glycogen debranching enzyme GlgX  45.28 
 
 		 705 aa  604  1.0000000000000001e-171  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1740  glycogen debranching protein GlgX  48.49 
 
 		 706 aa  600  1e-170  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.152679  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0805  glycogen debranching enzyme GlgX  45.77 
 
 		 693 aa  600  1e-170  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3295  glycogen debranching protein GlgX  46.52 
 
 		 695 aa  599  1e-170  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3980  glycogen debranching enzyme GlgX  48 
 
 		 712 aa  600  1e-170  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.524127  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2806  glycogen debranching enzyme GlgX  50.56 
 
 		 718 aa  598  1e-169  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.200191  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3752  glycogen debranching enzyme GlgX  46.18 
 
 		 720 aa  597  1e-169  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.742598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0815  glycogen debranching protein GlgX  46.18 
 
 		 721 aa  596  1e-169  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000104975 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0667  glycogen debranching enzyme GlgX  46.18 
 
 		 694 aa  597  1e-169  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.432948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0647  glycogen debranching enzyme GlgX  46.18 
 
 		 694 aa  597  1e-169  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1885  glycogen debranching enzyme GlgX  51.39 
 
 		 727 aa  595  1e-168  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3784  glycogen debranching enzyme GlgX  44.49 
 
 		 693 aa  591  1e-167  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.695286 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24860  glycogen debranching enzyme  46.08 
 
 		 720 aa  583  1.0000000000000001e-165  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.624836  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0086  isoamylase  43 
 
 		 694 aa  579  1e-164  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2265  glycogen debranching enzyme GlgX  45.91 
 
 		 708 aa  579  1e-164  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00202669 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0396  glycogen debranching enzyme GlgX  47.83 
 
 		 726 aa  579  1e-164  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.153348  normal  0.926984 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0567  glycogen debranching enzyme GlgX  46.72 
 
 		 722 aa  581  1e-164  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2997  glycoside hydrolase, family alpha amylase catalytic subunit  45.55 
 
 		 727 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1606  glycogen debranching protein GlgX  45.01 
 
 		 729 aa  578  1.0000000000000001e-163  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.333423  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1056  glycogen debranching enzyme GlgX  43.8 
 
 		 712 aa  578  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0647  glycogen debranching enzyme GlgX  47.05 
 
 		 722 aa  575  1.0000000000000001e-163  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.539207  normal  0.291924 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3430  glycogen debranching enzyme GlgX  45.45 
 
 		 707 aa  576  1.0000000000000001e-163  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0619  glycogen debranching enzyme GlgX  46.72 
 
 		 709 aa  573  1.0000000000000001e-162  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3146  glycogen debranching enzyme GlgX  44.69 
 
 		 716 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.371141  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1074  glycogen debranching enzyme GlgX  45.82 
 
 		 711 aa  574  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.652944 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0759  glycogen debranching enzyme GlgX  46.7 
 
 		 708 aa  575  1.0000000000000001e-162  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1045  glycogen debranching enzyme GlgX  45.82 
 
 		 711 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1514  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  43.41 
 
 		 1464 aa  573  1.0000000000000001e-162  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117562  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1372  glycogen debranching enzyme GlgX  45.11 
 
 		 712 aa  573  1.0000000000000001e-162  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.296905 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2282  glycogen debranching enzyme GlgX  45.8 
 
 		 704 aa  575  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0218366  hitchhiker  0.000957469 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3130  glycogen operon protein GlgX  44.04 
 
 		 727 aa  571  1e-161  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.167727  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5335  glycogen debranching enzyme GlgX  46.53 
 
 		 723 aa  570  1e-161  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0240771 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1891  glycogen debranching enzyme GlgX  45.52 
 
 		 707 aa  572  1e-161  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1115  glycogen debranching enzyme GlgX  43.5 
 
 		 712 aa  569  1e-161  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1819  glycogen debranching enzyme GlgX  44.29 
 
 		 717 aa  571  1e-161  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.11344  normal  0.553566 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36630  putative glycosyl hydrolase  44.56 
 
 		 716 aa  571  1e-161  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0278347  normal  0.953744 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0419  glycogen debranching enzyme GlgX  43.8 
 
 		 696 aa  569  1e-161  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4055  glycogen debranching protein GlgX  45.4 
 
 		 717 aa  568  1e-160  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119341  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16760  glycogen debranching enzyme GlgX  44.94 
 
 		 709 aa  565  1e-160  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1401  glycogen debranching protein GlgX  44.92 
 
 		 701 aa  566  1e-160  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1088  glycogen debranching enzyme GlgX  46.28 
 
 		 718 aa  566  1e-160  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.231339 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1788  glycogen debranching enzyme GlgX  45.3 
 
 		 717 aa  565  1e-160  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0735  pullulanase  46.45 
 
 		 706 aa  567  1e-160  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0939598  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1184  glycogen debranching enzyme GlgX  43.36 
 
 		 712 aa  567  1e-160  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01859  glycogen debranching enzyme GlgX  44.32 
 
 		 710 aa  566  1e-160  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3315  glycogen debranching enzyme GlgX  44.46 
 
 		 711 aa  567  1e-160  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1106  glycogen debranching enzyme GlgX  44.38 
 
 		 711 aa  564  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.546818  normal  0.380802 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3654  glycogen debranching enzyme GlgX  45.11 
 
 		 717 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0348768 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2253  glycogen debranching enzyme GlgX  45.56 
 
 		 703 aa  565  1.0000000000000001e-159  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.146745 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1775  glycogen debranching enzyme GlgX  47.24 
 
 		 701 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.318288  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5115  glycogen debranching protein GlgX  46.86 
 
 		 714 aa  564  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5495  glycogen debranching enzyme GlgX  46.86 
 
 		 714 aa  565  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1850  glycogen debranching enzyme GlgX  45.94 
 
 		 779 aa  565  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.369764  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0681  glycogen debranching enzyme GlgX  46.07 
 
 		 700 aa  563  1.0000000000000001e-159  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0906  glycogen debranching enzyme GlgX  46.15 
 
 		 721 aa  564  1.0000000000000001e-159  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00297293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5204  glycogen debranching enzyme GlgX  46.86 
 
 		 714 aa  564  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.779499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0893  glycogen debranching enzyme GlgX  43.02 
 
 		 693 aa  565  1.0000000000000001e-159  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.409319  normal  0.933748 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3070  glycogen debranching enzyme GlgX  44.4 
 
 		 686 aa  562  1.0000000000000001e-159  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0162429 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2786  glycogen debranching enzyme GlgX  45.29 
 
 		 714 aa  565  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5729  glycogen debranching enzyme GlgX  44.84 
 
 		 723 aa  564  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3520  alpha amylase catalytic region  41.64 
 
 		 671 aa  561  1e-158  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3631  glycogen debranching enzyme GlgX  44.96 
 
 		 715 aa  558  1e-158  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1227  glycogen debranching protein GlgX  44.91 
 
 		 719 aa  559  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170759 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5568  glycosyl hydrolase (glycogen debranching enzyme)  45.28 
 
 		 745 aa  559  1e-158  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16660  glycogen debranching enzyme GlgX  45.15 
 
 		 720 aa  561  1e-158  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.038626 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03371  glycogen debranching enzyme GlgX  45.77 
 
 		 720 aa  560  1e-158  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.13804  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3459  glycogen debranching enzyme GlgX  45.51 
 
 		 758 aa  556  1e-157  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  unclonable  0.0095234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6707  glycogen debranching protein GlgX  44.88 
 
 		 706 aa  558  1e-157  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171756  normal  0.694443 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2544  glycogen debranching protein GlgX  44.19 
 
 		 719 aa  556  1e-157  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3138  glycogen debranching enzyme GlgX  45.51 
 
 		 758 aa  556  1e-157  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.157891 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3097  glycogen debranching enzyme GlgX  45.05 
 
 		 720 aa  557  1e-157  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.139353  normal  0.0684303 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5164  glycogen debranching enzyme GlgX  44.55 
 
 		 1537 aa  556  1e-157  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0685376 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1463  glycogen debranching protein GlgX  43.99 
 
 		 692 aa  555  1e-157  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3080  glycogen debranching protein GlgX  45.05 
 
 		 722 aa  557  1e-157  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.836331  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3335  glycogen debranching enzyme GlgX  43.95 
 
 		 755 aa  558  1e-157  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.242143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3140  glycogen debranching enzyme GlgX  45.05 
 
 		 720 aa  557  1e-157  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.257674 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2618  glycogen debranching enzyme GlgX  44.7 
 
 		 752 aa  553  1e-156  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0936116 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1206  glycogen debranching enzyme GlgX  43.52 
 
 		 692 aa  554  1e-156  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13830  glycogen debranching enzyme GlgX  44.02 
 
 		 720 aa  553  1e-156  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.844349  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0505  glycogen debranching protein GlgX  43.25 
 
 		 714 aa  555  1e-156  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.299874  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1881  glycogen debranching protein GlgX  43.81 
 
 		 691 aa  552  1e-156  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6129  glycogen debranching enzyme GlgX  45.09 
 
 		 717 aa  554  1e-156  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.872744 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2909  glycogen debranching enzyme GlgX  45.06 
 
 		 751 aa  552  1e-156  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.506693  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2700  glycogen debranching enzyme GlgX  43.59 
 
 		 845 aa  550  1e-155  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2820  glycogen debranching enzyme GlgX  46.03 
 
 		 720 aa  551  1e-155  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.888887 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>