More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_5016 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4442  glycogen debranching enzyme GlgX  65.2 
 
 		 723 aa  956    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.405829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5016  glycogen debranching enzyme GlgX  100 
 
 		 706 aa  1476    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2859  glycogen debranching enzyme GlgX  61.84 
 
 		 690 aa  850    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0815  glycogen debranching protein GlgX  47.11 
 
 		 721 aa  630  1e-179  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000104975 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0548  glycogen debranching enzyme GlgX  47.06 
 
 		 729 aa  621  1e-176  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1750  glycogen debranching enzyme GlgX  46.86 
 
 		 718 aa  618  1e-175  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0296  glycogen debranching enzyme GlgX  45.32 
 
 		 724 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.76134  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2956  glycogen debranching enzyme GlgX  45.65 
 
 		 697 aa  607  9.999999999999999e-173  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.490165 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1895  glycogen debranching enzyme GlgX  46.04 
 
 		 705 aa  603  1.0000000000000001e-171  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3784  glycogen debranching enzyme GlgX  45.96 
 
 		 693 aa  598  1e-169  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.695286 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43578  predicted protein  46.48 
 
 		 765 aa  593  1e-168  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0789627  normal  0.106596 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0893  glycogen debranching enzyme GlgX  45.78 
 
 		 693 aa  590  1e-167  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.409319  normal  0.933748 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0647  glycogen debranching enzyme GlgX  45.85 
 
 		 694 aa  577  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0667  glycogen debranching enzyme GlgX  45.85 
 
 		 694 aa  577  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.432948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0086  isoamylase  44.03 
 
 		 694 aa  570  1e-161  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2517  glycogen debranching enzyme  41.47 
 
 		 774 aa  565  1e-160  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.467247 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0822  glycogen debranching enzyme GlgX  43.63 
 
 		 706 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0419  glycogen debranching enzyme GlgX  44.72 
 
 		 696 aa  560  1e-158  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0805  glycogen debranching enzyme GlgX  45.71 
 
 		 693 aa  558  1e-157  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3439  glycogen debranching enzyme GlgX  43.28 
 
 		 708 aa  558  1e-157  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000156565 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3295  glycogen debranching protein GlgX  42.94 
 
 		 695 aa  553  1e-156  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0317  glycogen debranching protein GlgX  44.3 
 
 		 715 aa  542  1e-153  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0101  alpha-amylase family protein  41.68 
 
 		 714 aa  540  9.999999999999999e-153  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2576  glycogen debranching enzyme GlgX  43.16 
 
 		 710 aa  540  9.999999999999999e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.677524  normal  0.165671 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3520  alpha amylase catalytic region  42.1 
 
 		 671 aa  537  1e-151  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_19757  predicted protein  44.12 
 
 		 715 aa  538  1e-151  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.13703  normal  0.0212411 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1982  glycogen debranching enzyme GlgX  43.41 
 
 		 721 aa  533  1e-150  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0850587  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3752  glycogen debranching enzyme GlgX  42.22 
 
 		 720 aa  529  1e-149  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.742598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0328  glycogen debranching enzyme GlgX  42.16 
 
 		 710 aa  527  1e-148  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5114  glycogen debranching enzyme GlgX  42.04 
 
 		 708 aa  527  1e-148  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.84007  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3430  glycogen debranching enzyme GlgX  42.3 
 
 		 707 aa  528  1e-148  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3070  glycogen debranching enzyme GlgX  42.76 
 
 		 686 aa  528  1e-148  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0162429 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0759  glycogen debranching enzyme GlgX  41.87 
 
 		 708 aa  525  1e-148  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1740  glycogen debranching protein GlgX  42.6 
 
 		 706 aa  524  1e-147  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.152679  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24860  glycogen debranching enzyme  43.1 
 
 		 720 aa  522  1e-147  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.624836  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2265  glycogen debranching enzyme GlgX  41.06 
 
 		 708 aa  521  1e-146  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00202669 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0396  glycogen debranching enzyme GlgX  41.92 
 
 		 726 aa  521  1e-146  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.153348  normal  0.926984 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16760  glycogen debranching enzyme GlgX  40.84 
 
 		 709 aa  519  1e-146  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1056  glycogen debranching enzyme GlgX  40.95 
 
 		 712 aa  519  1e-146  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1891  glycogen debranching enzyme GlgX  42.48 
 
 		 707 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1106  glycogen debranching enzyme GlgX  42.29 
 
 		 711 aa  518  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.546818  normal  0.380802 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16660  glycogen debranching enzyme GlgX  41.92 
 
 		 720 aa  514  1e-144  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.038626 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2618  glycogen debranching enzyme GlgX  41.46 
 
 		 752 aa  512  1e-144  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0936116 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0681  glycogen debranching enzyme GlgX  42.31 
 
 		 700 aa  513  1e-144  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4055  glycogen debranching protein GlgX  41.16 
 
 		 717 aa  510  1e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1045  glycogen debranching enzyme GlgX  42.22 
 
 		 711 aa  509  1e-143  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5164  glycogen debranching enzyme GlgX  40.48 
 
 		 1537 aa  511  1e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0685376 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1788  glycogen debranching enzyme GlgX  41.16 
 
 		 717 aa  509  1e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1606  glycogen debranching protein GlgX  42.46 
 
 		 729 aa  512  1e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.333423  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5568  glycosyl hydrolase (glycogen debranching enzyme)  44.2 
 
 		 745 aa  510  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2158  glycogen debranching protein GlgX  42.54 
 
 		 719 aa  511  1e-143  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0345133  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0567  glycogen debranching enzyme GlgX  41.02 
 
 		 722 aa  509  1e-143  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1819  glycogen debranching enzyme GlgX  42.46 
 
 		 717 aa  511  1e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.11344  normal  0.553566 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1115  glycogen debranching enzyme GlgX  40.47 
 
 		 712 aa  508  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2795  glycogen debranching enzyme GlgX  42.52 
 
 		 779 aa  507  9.999999999999999e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0466072  decreased coverage  0.00000490674 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1074  glycogen debranching enzyme GlgX  42.07 
 
 		 711 aa  508  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.652944 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1514  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  41.2 
 
 		 1464 aa  506  9.999999999999999e-143  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117562  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3654  glycogen debranching enzyme GlgX  41.16 
 
 		 717 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0348768 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2997  glycoside hydrolase, family alpha amylase catalytic subunit  42.11 
 
 		 727 aa  504  1e-141  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2544  glycogen debranching protein GlgX  41.13 
 
 		 719 aa  503  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3980  glycogen debranching enzyme GlgX  44.08 
 
 		 712 aa  504  1e-141  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.524127  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3315  glycogen debranching enzyme GlgX  41.34 
 
 		 711 aa  503  1e-141  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3146  glycogen debranching enzyme GlgX  40.5 
 
 		 716 aa  505  1e-141  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.371141  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36630  putative glycosyl hydrolase  40.5 
 
 		 716 aa  502  1e-141  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0278347  normal  0.953744 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2909  glycogen debranching enzyme GlgX  41.63 
 
 		 751 aa  503  1e-141  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.506693  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1372  glycogen debranching enzyme GlgX  40.42 
 
 		 712 aa  504  1e-141  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.296905 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0906  glycogen debranching enzyme GlgX  40.95 
 
 		 721 aa  503  1e-141  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00297293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5495  glycogen debranching enzyme GlgX  42.53 
 
 		 714 aa  499  1e-140  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209821  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2806  glycogen debranching enzyme GlgX  42.06 
 
 		 718 aa  501  1e-140  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.200191  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5335  glycogen debranching enzyme GlgX  38.9 
 
 		 723 aa  501  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0240771 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3130  glycogen operon protein GlgX  42.11 
 
 		 727 aa  500  1e-140  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.167727  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11596  maltooligosyltrehalose synthase treX  43.36 
 
 		 721 aa  502  1e-140  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13830  glycogen debranching enzyme GlgX  41.25 
 
 		 720 aa  500  1e-140  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.844349  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5115  glycogen debranching protein GlgX  42.53 
 
 		 714 aa  499  1e-140  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3073  glycogen debranching enzyme GlgX  40.98 
 
 		 713 aa  499  1e-140  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0756553 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1775  glycogen debranching enzyme GlgX  41.73 
 
 		 701 aa  499  1e-140  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.318288  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1184  glycogen debranching enzyme GlgX  39.92 
 
 		 712 aa  502  1e-140  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1743  glycogen debranching enzyme GlgX  40.03 
 
 		 730 aa  500  1e-140  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0589275  normal  0.0171762 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5204  glycogen debranching enzyme GlgX  42.53 
 
 		 714 aa  499  1e-140  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.779499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2786  glycogen debranching enzyme GlgX  41 
 
 		 714 aa  500  1e-140  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1401  glycogen debranching protein GlgX  40.78 
 
 		 701 aa  496  1e-139  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1088  glycogen debranching enzyme GlgX  40.71 
 
 		 718 aa  496  1e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.231339 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1958  glycogen debranching enzyme GlgX  41.62 
 
 		 704 aa  498  1e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.182778  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2700  glycogen debranching enzyme GlgX  43.34 
 
 		 845 aa  496  1e-139  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3631  glycogen debranching enzyme GlgX  41.08 
 
 		 715 aa  495  1e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6707  glycogen debranching protein GlgX  41.31 
 
 		 706 aa  498  1e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171756  normal  0.694443 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2282  glycogen debranching enzyme GlgX  39.94 
 
 		 704 aa  498  1e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0218366  hitchhiker  0.000957469 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0619  glycogen debranching enzyme GlgX  40.28 
 
 		 709 aa  495  9.999999999999999e-139  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01859  glycogen debranching enzyme GlgX  41.45 
 
 		 710 aa  495  9.999999999999999e-139  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1850  glycogen debranching enzyme GlgX  42.02 
 
 		 779 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.369764  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1350  glycogen debranching protein GlgX  39.42 
 
 		 776 aa  493  9.999999999999999e-139  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2253  glycogen debranching enzyme GlgX  41.94 
 
 		 703 aa  494  9.999999999999999e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.146745 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1151  glycogen debranching enzyme GlgX  40.8 
 
 		 756 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.911208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2676  glycogen debranching enzyme GlgX  41.28 
 
 		 691 aa  493  9.999999999999999e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0269  glycogen debranching enzyme GlgX  45.35 
 
 		 733 aa  493  9.999999999999999e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.537346  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1973  glycogen debranching enzyme GlgX  41.09 
 
 		 721 aa  493  9.999999999999999e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0990735  hitchhiker  0.000349089 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3335  glycogen debranching enzyme GlgX  41.85 
 
 		 755 aa  491  1e-137  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.242143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1227  glycogen debranching protein GlgX  41.29 
 
 		 719 aa  490  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170759 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5289  glycogen debranching enzyme GlgX  41.28 
 
 		 738 aa  489  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3083  glycogen debranching enzyme GlgX  39.17 
 
 		 730 aa  485  1e-136  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>