More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3784 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0822  glycogen debranching enzyme GlgX  55.39 
 
 		 706 aa  776    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3439  glycogen debranching enzyme GlgX  55.23 
 
 		 708 aa  771    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000156565 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2517  glycogen debranching enzyme  45.51 
 
 		 774 aa  646    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.467247 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0805  glycogen debranching enzyme GlgX  55.15 
 
 		 693 aa  762    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0815  glycogen debranching protein GlgX  48.94 
 
 		 721 aa  672    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000104975 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0086  isoamylase  60.23 
 
 		 694 aa  868    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0647  glycogen debranching enzyme GlgX  70.52 
 
 		 694 aa  1049    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3295  glycogen debranching protein GlgX  56.5 
 
 		 695 aa  795    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1895  glycogen debranching enzyme GlgX  63.28 
 
 		 705 aa  943    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3784  glycogen debranching enzyme GlgX  100 
 
 		 693 aa  1442    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.695286 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0667  glycogen debranching enzyme GlgX  70.52 
 
 		 694 aa  1049    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.432948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2956  glycogen debranching enzyme GlgX  49.71 
 
 		 697 aa  660    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.490165 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0419  glycogen debranching enzyme GlgX  54.45 
 
 		 696 aa  769    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0893  glycogen debranching enzyme GlgX  51.08 
 
 		 693 aa  678    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.409319  normal  0.933748 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3070  glycogen debranching enzyme GlgX  49.42 
 
 		 686 aa  689    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0162429 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1750  glycogen debranching enzyme GlgX  46.52 
 
 		 718 aa  605  1.0000000000000001e-171  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0577  alpha amylase domain-containing protein  46.03 
 
 		 692 aa  603  1.0000000000000001e-171  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0296  glycogen debranching enzyme GlgX  47.42 
 
 		 724 aa  601  1e-170  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.76134  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3520  alpha amylase catalytic region  46.83 
 
 		 671 aa  600  1e-170  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5016  glycogen debranching enzyme GlgX  45.96 
 
 		 706 aa  598  1e-169  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0548  glycogen debranching enzyme GlgX  44.63 
 
 		 729 aa  591  1e-167  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2265  glycogen debranching enzyme GlgX  44.97 
 
 		 708 aa  583  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00202669 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1056  glycogen debranching enzyme GlgX  44.15 
 
 		 712 aa  576  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05691  putative isoamylase  45.33 
 
 		 704 aa  574  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1115  glycogen debranching enzyme GlgX  44.37 
 
 		 712 aa  574  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1372  glycogen debranching enzyme GlgX  45.68 
 
 		 712 aa  573  1.0000000000000001e-162  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.296905 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16660  glycogen debranching enzyme GlgX  44.88 
 
 		 720 aa  568  1e-161  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.038626 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1740  glycogen debranching protein GlgX  46.05 
 
 		 706 aa  571  1e-161  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.152679  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2094  alpha amylase domain-containing protein  46.03 
 
 		 701 aa  571  1e-161  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.159475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0317  glycogen debranching protein GlgX  46.1 
 
 		 715 aa  569  1e-161  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1106  glycogen debranching enzyme GlgX  45.06 
 
 		 711 aa  571  1e-161  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.546818  normal  0.380802 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3752  glycogen debranching enzyme GlgX  44.74 
 
 		 720 aa  566  1e-160  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.742598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4442  glycogen debranching enzyme GlgX  45.12 
 
 		 723 aa  567  1e-160  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.405829  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2253  glycogen debranching enzyme GlgX  47.58 
 
 		 703 aa  568  1e-160  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.146745 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0759  glycogen debranching enzyme GlgX  44.95 
 
 		 708 aa  564  1.0000000000000001e-159  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1184  glycogen debranching enzyme GlgX  43.53 
 
 		 712 aa  563  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3430  glycogen debranching enzyme GlgX  45.24 
 
 		 707 aa  562  1.0000000000000001e-159  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2909  glycogen debranching enzyme GlgX  44.52 
 
 		 751 aa  562  1.0000000000000001e-159  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.506693  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0101  alpha-amylase family protein  44.32 
 
 		 714 aa  561  1e-158  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1775  glycogen debranching enzyme GlgX  47.16 
 
 		 701 aa  561  1e-158  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.318288  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1958  glycogen debranching enzyme GlgX  44.8 
 
 		 704 aa  561  1e-158  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.182778  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0647  glycogen debranching enzyme GlgX  44.21 
 
 		 722 aa  557  1e-157  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.539207  normal  0.291924 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1088  glycogen debranching enzyme GlgX  44.11 
 
 		 718 aa  550  1e-155  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.231339 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0619  glycogen debranching enzyme GlgX  44.48 
 
 		 709 aa  549  1e-155  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0396  glycogen debranching enzyme GlgX  43.69 
 
 		 726 aa  551  1e-155  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.153348  normal  0.926984 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3315  glycogen debranching enzyme GlgX  44.06 
 
 		 711 aa  550  1e-155  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1074  glycogen debranching enzyme GlgX  43.79 
 
 		 711 aa  549  1e-155  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.652944 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1045  glycogen debranching enzyme GlgX  43.79 
 
 		 711 aa  549  1e-155  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0541  glycogen debranching protein GlgX  44.54 
 
 		 727 aa  549  1e-155  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0906  glycogen debranching enzyme GlgX  43.73 
 
 		 721 aa  551  1e-155  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00297293  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1743  glycogen debranching enzyme GlgX  43.02 
 
 		 730 aa  549  1e-155  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0589275  normal  0.0171762 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2618  glycogen debranching enzyme GlgX  43.21 
 
 		 752 aa  547  1e-154  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0936116 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5335  glycogen debranching enzyme GlgX  43.45 
 
 		 723 aa  545  1e-154  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0240771 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1401  glycogen debranching protein GlgX  44.52 
 
 		 701 aa  545  1e-154  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0567  glycogen debranching enzyme GlgX  45.18 
 
 		 722 aa  548  1e-154  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3037  glycogen debranching enzyme GlgX  42.27 
 
 		 730 aa  547  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2576  glycogen debranching enzyme GlgX  43.06 
 
 		 710 aa  546  1e-154  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.677524  normal  0.165671 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1982  glycogen debranching enzyme GlgX  44.55 
 
 		 721 aa  542  1e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0850587  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0735  pullulanase  45.84 
 
 		 706 aa  544  1e-153  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0939598  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5164  glycogen debranching enzyme GlgX  40.99 
 
 		 1537 aa  545  1e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0685376 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1322  glycogen operon protein GlgX  44.4 
 
 		 738 aa  542  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0099235  normal  0.0986293 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6707  glycogen debranching protein GlgX  44.48 
 
 		 706 aa  545  1e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171756  normal  0.694443 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1471  glycogen debranching enzyme GlgX  45.64 
 
 		 683 aa  543  1e-153  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0323823 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3083  glycogen debranching enzyme GlgX  41.8 
 
 		 730 aa  539  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11596  maltooligosyltrehalose synthase treX  43.04 
 
 		 721 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0328  glycogen debranching enzyme GlgX  44.94 
 
 		 710 aa  541  9.999999999999999e-153  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1247  glycoside hydrolase family 13 protein  45.92 
 
 		 703 aa  540  9.999999999999999e-153  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2859  glycogen debranching enzyme GlgX  42.61 
 
 		 690 aa  538  9.999999999999999e-153  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2806  glycogen debranching enzyme GlgX  43.13 
 
 		 718 aa  538  1e-151  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.200191  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3073  glycogen debranching enzyme GlgX  43.05 
 
 		 713 aa  536  1e-151  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0756553 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1891  glycogen debranching enzyme GlgX  44.7 
 
 		 707 aa  536  1e-151  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1350  glycogen debranching protein GlgX  42.39 
 
 		 776 aa  538  1e-151  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5115  glycogen debranching protein GlgX  43.47 
 
 		 714 aa  536  1e-151  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2820  glycogen debranching enzyme GlgX  43.51 
 
 		 720 aa  538  1e-151  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.888887 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5495  glycogen debranching enzyme GlgX  43.47 
 
 		 714 aa  538  1e-151  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5204  glycogen debranching enzyme GlgX  43.47 
 
 		 714 aa  536  1e-151  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.779499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2786  glycogen debranching enzyme GlgX  42.78 
 
 		 714 aa  538  1e-151  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13830  glycogen debranching enzyme GlgX  44.19 
 
 		 720 aa  532  1e-150  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.844349  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1606  glycogen debranching protein GlgX  44.23 
 
 		 729 aa  533  1e-150  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.333423  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5289  glycogen debranching enzyme GlgX  43.77 
 
 		 738 aa  534  1e-150  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5729  glycogen debranching enzyme GlgX  42.96 
 
 		 723 aa  535  1e-150  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43578  predicted protein  43.04 
 
 		 765 aa  529  1e-149  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0789627  normal  0.106596 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14831  putative isoamylase  42.94 
 
 		 668 aa  531  1e-149  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.451746  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5114  glycogen debranching enzyme GlgX  44.26 
 
 		 708 aa  531  1e-149  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.84007  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1358  glycogen debranching enzyme GlgX  43.37 
 
 		 733 aa  530  1e-149  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.173381 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1601  glycogen debranching protein GlgX  43.98 
 
 		 701 aa  532  1e-149  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0827  glycogen debranching enzyme GlgX  44.91 
 
 		 705 aa  529  1e-149  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000125239  normal  0.0549007 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13761  putative isoamylase  40.69 
 
 		 689 aa  531  1e-149  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1973  glycogen debranching enzyme GlgX  44.32 
 
 		 721 aa  531  1e-149  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0990735  hitchhiker  0.000349089 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2983  glycogen debranching enzyme GlgX  45.51 
 
 		 718 aa  531  1e-149  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.602894  normal  0.0199459 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2795  glycogen debranching enzyme GlgX  42.5 
 
 		 779 aa  526  1e-148  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0466072  decreased coverage  0.00000490674 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3027  glycogen debranching enzyme GlgX  43.23 
 
 		 733 aa  526  1e-148  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1850  glycogen debranching enzyme GlgX  43.57 
 
 		 779 aa  526  1e-148  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.369764  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24860  glycogen debranching enzyme  43.98 
 
 		 720 aa  526  1e-148  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.624836  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3080  glycogen debranching protein GlgX  46.15 
 
 		 722 aa  526  1e-148  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.836331  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3097  glycogen debranching enzyme GlgX  46.15 
 
 		 720 aa  526  1e-148  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.139353  normal  0.0684303 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1514  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  42.84 
 
 		 1464 aa  526  1e-148  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117562  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3140  glycogen debranching enzyme GlgX  46.15 
 
 		 720 aa  526  1e-148  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.257674 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1249  glycogen debranching enzyme GlgX  43.07 
 
 		 735 aa  524  1e-147  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1151  glycogen debranching enzyme GlgX  42.96 
 
 		 756 aa  525  1e-147  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.911208  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>